FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3289, 745 aa 1>>>pF1KE3289 745 - 745 aa - 745 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1886+/-0.00098; mu= 15.9769+/- 0.059 mean_var=84.0662+/-17.196, 0's: 0 Z-trim(105.5): 17 B-trim: 16 in 1/49 Lambda= 0.139883 statistics sampled from 8447 (8452) to 8447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 3.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5208.1 FBXO30 gene_id:84085|Hs108|chr6 ( 745) 5095 1038.6 0 CCDS33835.1 FBXO40 gene_id:51725|Hs108|chr3 ( 709) 601 131.7 4e-30 >>CCDS5208.1 FBXO30 gene_id:84085|Hs108|chr6 (745 aa) initn: 5095 init1: 5095 opt: 5095 Z-score: 5555.4 bits: 1038.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5095; 100.0% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:1-745) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEEELQHSHCVNCVSRRCMTRPEPGISCDLIGCPLVCGAVFHSCKADEHRLLCPFERVPC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 MEEELQHSHCVNCVSRRCMTRPEPGISCDLIGCPLVCGAVFHSCKADEHRLLCPFERVPC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 LNSDFGCPFTMARNKVAEHLEMCPASVVCCTMEWNRWPVSYADRKSYENLSRDVDEVAQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 LNSDFGCPFTMARNKVAEHLEMCPASVVCCTMEWNRWPVSYADRKSYENLSRDVDEVAQL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 DMALALQDQRMLLESLKVATMMSKATDKVSKPREQISVKSSVPEIPHANGLVSVDEESYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 DMALALQDQRMLLESLKVATMMSKATDKVSKPREQISVKSSVPEIPHANGLVSVDEESYG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 ALYQATVETTRSLAAALDILNTATRDIGMLNTSVPNDMDEQQNARESLEDQNLKDQDHLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 ALYQATVETTRSLAAALDILNTATRDIGMLNTSVPNDMDEQQNARESLEDQNLKDQDHLY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 EEEIGAVGGIDYNDTNQNAQSEQNGSSDLLCDLNTSSYDTSALCNGFPLENICTQVIDQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 EEEIGAVGGIDYNDTNQNAQSEQNGSSDLLCDLNTSSYDTSALCNGFPLENICTQVIDQN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 QNLHGDSKQSNLTNGDCVASSDGTSKPSSSLAVAAQLREIIPSSALPNGTVQHILMPDDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 QNLHGDSKQSNLTNGDCVASSDGTSKPSSSLAVAAQLREIIPSSALPNGTVQHILMPDDE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 GEGELCWKKVDLGDVKNVDVLSFSHAPSFNFLSNSCWSKPKEDKAVDTSDLEVAEDPMGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 GEGELCWKKVDLGDVKNVDVLSFSHAPSFNFLSNSCWSKPKEDKAVDTSDLEVAEDPMGL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 QGIDLITAALLFCLGDSPGGRGISDSRMADIYHIDVGTQTFSLPSAILATSTMVGEIASA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 QGIDLITAALLFCLGDSPGGRGISDSRMADIYHIDVGTQTFSLPSAILATSTMVGEIASA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 SACDHANPQLSNPSPFQTLGLDLVLECVARYQPKQRSMFTFVCGQLFRRKEFSSHFKNVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 SACDHANPQLSNPSPFQTLGLDLVLECVARYQPKQRSMFTFVCGQLFRRKEFSSHFKNVH 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 GDIHAGLNGWMEQRCPLAYYGCTYSQRRFCPSIQGAKIIHDRHLRSFGVQPCVSTVLVEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 GDIHAGLNGWMEQRCPLAYYGCTYSQRRFCPSIQGAKIIHDRHLRSFGVQPCVSTVLVEP 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 ARNCVLGLHNDHLSSLPFEVLQHIAGFLDGFSLCQLSCVSKLMRDVCGSLLQSRGMVILQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 ARNCVLGLHNDHLSSLPFEVLQHIAGFLDGFSLCQLSCVSKLMRDVCGSLLQSRGMVILQ 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 WGKRKYPEGNSSWQIKEKVWRFSTAFCSVNEWKFADILSMADHLKKCSYNVVEKREEAIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 WGKRKYPEGNSSWQIKEKVWRFSTAFCSVNEWKFADILSMADHLKKCSYNVVEKREEAIP 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 LPCMCVTRELTKEGRSLRSVLKPVL ::::::::::::::::::::::::: CCDS52 LPCMCVTRELTKEGRSLRSVLKPVL 730 740 >>CCDS33835.1 FBXO40 gene_id:51725|Hs108|chr3 (709 aa) initn: 1544 init1: 578 opt: 601 Z-score: 654.3 bits: 131.7 E(32554): 4e-30 Smith-Waterman score: 1464; 35.6% identity (65.8% similar) in 748 aa overlap (6-742:11-700) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEEELQHSHCVNCVSRRCMTRPEPGISCDLIGCPLVCGAVFHSCKADEHRLLCPF .: :: .: .:.: ::. :: .:.: :.:::.:: :: ::.::::. 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CCDS33 KSCPFNIVEHKTDPILLTSMCQPREQARE--SLVSTFRIRPRGRYVS 670 680 690 700 745 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 03:37:18 2016 done: Mon Nov 7 03:37:19 2016 Total Scan time: 3.920 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]