Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7211
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7211, 313 aa
1>>>pF1KB7211 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2787+/-0.000587; mu= 15.9292+/- 0.036
mean_var=99.4716+/-28.329, 0's: 0 Z-trim(106.5): 370 B-trim: 1759 in 2/49
Lambda= 0.128595
statistics sampled from 14075 (14588) to 14075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.171), width: 16
Scan time: 6.360
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1184 231.0 2.4e-60
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1184 231.0 2.4e-60
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1184 231.1 2.4e-60
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1078 211.4 2e-54
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1052 206.5 5.5e-53
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 933 184.5 2.5e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 906 179.5 7.8e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 901 178.5 1.5e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 881 174.8 2e-43
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 877 174.1 3.3e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 856 170.2 4.9e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 851 169.3 9.3e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 851 169.3 9.4e-42
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 169.3 9.4e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 851 169.3 9.4e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 843 167.8 2.6e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 813 162.2 1.2e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 804 160.5 3.8e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 784 156.8 5.3e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 762 152.7 8.6e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 570 117.1 4.7e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 559 115.1 1.9e-25
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 214 51.2 4.3e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 212 50.7 4.8e-06
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 208 50.1 9.2e-06
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 199 48.4 2.9e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 48.4 2.9e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 48.4 2.9e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 48.4 2.9e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 48.4 2.9e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 196 47.7 3.6e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 196 47.7 3.6e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 196 47.8 3.7e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 196 47.8 4e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 196 47.8 4e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 196 47.9 4.2e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 196 47.9 4.4e-05
NP_000698 (OMIM: 600264) vasopressin V1b receptor ( 424) 195 47.7 5e-05
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 194 47.4 5e-05
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 194 47.4 5e-05
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 194 47.5 5.3e-05
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 194 47.5 5.4e-05
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 194 47.5 5.4e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 188 46.3 0.0001
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 187 46.1 0.00012
NP_004113 (OMIM: 601898) growth hormone secretagog ( 289) 186 45.8 0.00012
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 188 46.4 0.00012
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 186 45.9 0.00013
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 183 45.4 0.00022
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 183 45.4 0.00022
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1203 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 1204.5 bits: 231.0 E(85289): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 1184; 56.8% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
: :. .:..:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1203 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 1204.5 bits: 231.0 E(85289): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 1184; 56.8% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1203 init1: 1184 opt: 1184 Z-score: 1204.4 bits: 231.1 E(85289): 2.4e-60
Smith-Waterman score: 1184; 56.8% identity (82.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:11-320)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQ
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KB7 LDSHLHTPMYFFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDL
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DSFLITSMAYDRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCA
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 ANTIPHVFCDLAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KB7 TKGIHKALSTCGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 SLRNRDMKEALGKLFSRATFFSW
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1078 init1: 1078 opt: 1078 Z-score: 1098.3 bits: 211.4 E(85289): 2e-54
Smith-Waterman score: 1078; 53.2% identity (80.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
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NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 1071 init1: 884 opt: 1052 Z-score: 1072.2 bits: 206.5 E(85289): 5.5e-53
Smith-Waterman score: 1052; 48.9% identity (81.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
:. ::: :::::::. :::: ..: .::.:::.::.::.::.: :. ::.::::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
. .::...::.: .:. :....: .. .:: ...:: : .:::.::.. .::.::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_002 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGA
250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
::.:...
NP_002 LGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 956 init1: 917 opt: 933 Z-score: 952.8 bits: 184.5 E(85289): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 933; 45.7% identity (74.3% similar) in 304 aa overlap (2-305:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTP
. .: . :.::.:::.: ::: : :.: .:: .: ..::. .::::..: ::.::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MYFFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AYDRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDLAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKAL
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 STCGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 EALGKLFSRATFFSW
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 914 init1: 888 opt: 906 Z-score: 925.9 bits: 179.5 E(85289): 7.8e-45
Smith-Waterman score: 906; 43.4% identity (75.5% similar) in 302 aa overlap (5-306:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
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pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
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pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
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pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
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NP_001 IRKVFAFLKH
300
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 885 init1: 751 opt: 901 Z-score: 920.9 bits: 178.5 E(85289): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 901; 46.3% identity (73.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSV--FYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
: :. .:
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 905 init1: 856 opt: 881 Z-score: 900.7 bits: 174.8 E(85289): 2e-43
Smith-Waterman score: 881; 42.6% identity (76.1% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KB7 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LGKLFSRATFFSW
::.:.
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 870 init1: 824 opt: 877 Z-score: 896.6 bits: 174.1 E(85289): 3.3e-43
Smith-Waterman score: 877; 45.1% identity (71.1% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRP-EQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPM
:. : . .:::.:... : : :...: :: .::.:. :: ::.:. : ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YFFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YDRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KB7 DLAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]