Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6564
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6564, 400 aa
1>>>pF1KB6564 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7057+/-0.00093; mu= 6.9714+/- 0.055
mean_var=246.8607+/-54.926, 0's: 0 Z-trim(112.7): 629 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.081630
statistics sampled from 12660 (13410) to 12660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19 ( 400) 2665 327.0 1.9e-89
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 ( 393) 2130 264.0 1.8e-70
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 412) 781 105.1 1.2e-22
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 448) 781 105.2 1.3e-22
CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 438) 760 102.7 7e-22
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 334) 640 88.4 1.1e-17
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 318) 620 86.0 5.2e-17
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 347) 620 86.1 5.5e-17
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 399) 612 85.2 1.2e-16
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 410) 612 85.2 1.2e-16
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 278) 606 84.3 1.5e-16
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 419) 579 81.4 1.8e-15
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 435) 579 81.4 1.8e-15
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 426) 543 77.1 3.4e-14
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 509 73.2 6.1e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 508 73.1 6.4e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 508 73.1 6.4e-13
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 476 69.2 8e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 469 68.4 1.5e-11
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 464 67.8 2.1e-11
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 445 65.6 9.9e-11
>>CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19 (400 aa)
initn: 2665 init1: 2665 opt: 2665 Z-score: 1719.3 bits: 327.0 E(32554): 1.9e-89
Smith-Waterman score: 2665; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB6 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
370 380 390 400
>>CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 (393 aa)
initn: 2120 init1: 1539 opt: 2130 Z-score: 1378.8 bits: 264.0 E(32554): 1.8e-70
Smith-Waterman score: 2130; 80.4% identity (92.0% similar) in 398 aa overlap (2-399:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
. ..::. : . .::. .: . .. ...:.:: ::::::::::::::.:::::::::
CCDS10 MPKKKPT-P-IQLNPA-PDGSAVNGTSSAETNLEALQKKLEELELDEQQRKRLEAFLTQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
: :::::::::::.:::::::::::: ::.:.::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::.:::::::::..:
CCDS10 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
:.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS10 LTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::: .:: : ::. ::::
CCDS10 GTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCQV----EGDAAETPPRPRT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
::::.:..:::::: :::::::::::::::::::.:::. .::.::::::::::::::::
CCDS10 PGRPLSSYGMDSRPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KB6 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
:.: :.:::::..::::::::::.:. ::::.:::..:
CCDS10 KQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLNQPSTPTHAAGV
360 370 380 390
>>CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (412 aa)
initn: 712 init1: 388 opt: 781 Z-score: 520.0 bits: 105.1 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 863; 40.6% identity (68.3% similar) in 347 aa overlap (52-395:110-412)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
:. : : . :.....:.. . :: :
CCDS55 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
:::.: :. : ::: :.: :.: :.: ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS55 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
.:::: : ::::::: ...::..::....::..::.:: . .:.::::::::.:
CCDS55 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:::
CCDS55 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
.::.: : .. ..: :. : ..:
CCDS55 LGRFPYPQ--------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
:. ::.: : :: : :. : .:...:. :.: :: . : .: :: . .. . . .
CCDS55 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
340 350 360 370 380 390
390 400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
:.:..: : .: : :
CCDS55 MWVCRALEERRSQQGPP
400 410
>>CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (448 aa)
initn: 712 init1: 388 opt: 781 Z-score: 519.6 bits: 105.2 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 863; 40.6% identity (68.3% similar) in 347 aa overlap (52-395:146-448)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
:. : : . :.....:.. . :: :
CCDS10 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
:::.: :. : ::: :.: :.: :.: ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS10 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
.:::: : ::::::: ...::..::....::..::.:: . .:.::::::::.:
CCDS10 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:::
CCDS10 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
.::.: : .. ..: :. : ..:
CCDS10 LGRFPYPQ--------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
:. ::.: : :: : :. : .:...:. :.: :: . : .: :: . .. . . .
CCDS10 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
380 390 400 410 420 430
390 400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
:.:..: : .: : :
CCDS10 MWVCRALEERRSQQGPP
440
>>CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (438 aa)
initn: 770 init1: 353 opt: 760 Z-score: 506.4 bits: 102.7 E(32554): 7e-22
Smith-Waterman score: 795; 38.9% identity (66.0% similar) in 347 aa overlap (52-395:146-438)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
:. : : . :.....:.. . :: :
CCDS42 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
:::.: :. : ::: :.: :.: :.: ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS42 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
.:::: : ::::::: ...::..::....::..::.:: . .:.::::::::.:
CCDS42 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:
CCDS42 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFME--
300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
.. ..: :. : ..:
CCDS42 ----------------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
:. ::.: : :: : :. : .:...:. :.: :: . : .: :: . .. . . .
CCDS42 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
370 380 390 400 410 420
390 400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
:.:..: : .: : :
CCDS42 MWVCRALEERRSQQGPP
430
>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (334 aa)
initn: 753 init1: 281 opt: 640 Z-score: 431.3 bits: 88.4 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 697; 37.2% identity (62.8% similar) in 328 aa overlap (66-383:47-328)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 DLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSG
:.: ::.: : ::: : ::: :..: :::
CCDS11 KEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSG
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGS
::: : :. .. ..... .:.. .. . :. : ::::.. .:.. :::: :: :
CCDS11 QIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-S
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 LD----QVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKL
:: ::. ... :::.::::........: .:. : ...::::::::.:.:. :..:.
CCDS11 LDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKM
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260
pF1KB6 CDFGVSGQLIDSMANSF-VGTRSYMAPER----LQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRY
::::.:: :.::.:... .: . :::::: :. :::.:::::.:....:::. :.
CCDS11 CDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRF
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 PIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYI
: :. .: : :. : .
CCDS11 PY---DS------WGTP------------------------------------FQQLKQV
260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 VNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCK
:.:: :.:: :. .: .:...:: :: :: : .: :. : . .: :...
CCDS11 VEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKL
280 290 300 310 320 330
390 400
pF1KB6 TLRLNQPGTPTRTAV
CCDS11 ILGD
>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 (318 aa)
initn: 729 init1: 273 opt: 620 Z-score: 418.8 bits: 86.0 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 693; 35.8% identity (62.5% similar) in 341 aa overlap (57-387:20-314)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 EGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVV
:.: . :.. ::. ::::: : :::
CCDS11 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 TKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISI
::.: :: ::: : :. .. ..... .:.. .. . : : ::::.. .:.. :
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210 220 230 240 250
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..:.:. :.: .: :
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380 390 400
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310
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CCDS11 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
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CCDS11 INKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGIT
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CCDS11 MIEMAILRFPYES---------WGTP----------------------------------
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CCDS11 --FQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKK
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CCDS11 TDIAAFVKEILGEDS
340
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.. .:. : .:.
CCDS11 KWNS---------------------------------------------VFDQLTQVVKG
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CCDS11 DPPQLSNSEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCK
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CCDS11 ILD-QMPATPSSPMYVD
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CCDS62 NPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]