FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0300, 1503 aa 1>>>pF1KE0300 1503 - 1503 aa - 1503 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6616+/-0.000444; mu= 3.0707+/- 0.028 mean_var=351.0468+/-75.679, 0's: 0 Z-trim(119.3): 669 B-trim: 0 in 0/58 Lambda= 0.068453 statistics sampled from 32328 (33208) to 32328 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16 Scan time: 21.360 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055731 (OMIM: 610989) serine/threonine-protein (1503) 10027 1006.3 0 XP_011514283 (OMIM: 610989) PREDICTED: serine/thre (1501) 10000 1003.6 0 NP_001073864 (OMIM: 605276) serine/threonine-prote (1374) 1362 150.5 8.8e-35 XP_006722256 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1326) 1330 147.3 7.7e-34 XP_006722259 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1326) 1330 147.3 7.7e-34 XP_011523811 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1333) 1299 144.2 6.5e-33 XP_011523812 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1318) 1284 142.8 1.8e-32 XP_016880910 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1271) 1231 137.5 6.6e-31 NP_004911 (OMIM: 605276) serine/threonine-protein (1271) 1231 137.5 6.6e-31 XP_006722258 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1207) 1012 115.9 2.1e-24 XP_006722257 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1324) 947 109.5 1.9e-22 XP_016880911 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1152) 803 95.2 3.3e-18 XP_011523813 (OMIM: 605276) PREDICTED: serine/thre (1152) 803 95.2 3.3e-18 NP_690620 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein ( 940) 543 69.4 1.5e-10 XP_011513068 (OMIM: 601890) PREDICTED: inactive ty ( 948) 543 69.4 1.5e-10 NP_690621 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1014) 543 69.5 1.6e-10 NP_690619 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1030) 543 69.5 1.6e-10 XP_011513067 (OMIM: 601890) PREDICTED: inactive ty (1038) 543 69.5 1.6e-10 NP_002812 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-protein (1070) 543 69.5 1.7e-10 NP_001257327 (OMIM: 601890) inactive tyrosine-prot (1078) 543 69.5 1.7e-10 XP_011534355 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2299) 525 68.1 9.5e-10 XP_016866662 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2333) 525 68.1 9.6e-10 XP_016866661 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2334) 525 68.1 9.6e-10 XP_006715611 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2342) 525 68.1 9.6e-10 XP_011534354 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2343) 525 68.1 9.6e-10 NP_002935 (OMIM: 165020) proto-oncogene tyrosine-p (2347) 525 68.1 9.6e-10 XP_011534353 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2348) 525 68.1 9.6e-10 XP_011534352 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2356) 525 68.1 9.6e-10 XP_011534351 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2357) 525 68.1 9.7e-10 XP_011519859 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 824) 481 63.2 9.8e-09 XP_011519858 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 880) 481 63.3 1e-08 XP_016877670 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 885) 481 63.3 1e-08 XP_011526291 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1369) 480 63.4 1.5e-08 NP_001073285 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1370) 480 63.4 1.5e-08 XP_011526290 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61 (1381) 480 63.4 1.5e-08 NP_000199 (OMIM: 147670,246200,262190,609968,61054 (1382) 480 63.4 1.5e-08 NP_996844 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 803) 474 62.5 1.6e-08 XP_016877671 (OMIM: 151520) PREDICTED: leukocyte t ( 837) 474 62.5 1.6e-08 NP_002335 (OMIM: 151520) leukocyte tyrosine kinase ( 864) 474 62.6 1.6e-08 NP_055030 (OMIM: 147671) insulin receptor-related (1297) 477 63.1 1.7e-08 XP_011534356 (OMIM: 165020) PREDICTED: proto-oncog (2200) 475 63.1 2.8e-08 XP_011519819 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu ( 922) 463 61.5 3.6e-08 XP_011519818 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1064) 463 61.6 4e-08 XP_016877628 (OMIM: 147370,270450) PREDICTED: insu (1246) 463 61.7 4.4e-08 NP_006173 (OMIM: 191311,271665) discoidin domain-c ( 855) 459 61.1 4.5e-08 XP_011507888 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.1 4.5e-08 XP_011507889 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.1 4.5e-08 NP_001014796 (OMIM: 191311,271665) discoidin domai ( 855) 459 61.1 4.5e-08 XP_006711407 (OMIM: 191311,271665) PREDICTED: disc ( 855) 459 61.1 4.5e-08 NP_001278787 (OMIM: 147370,270450) insulin-like gr (1366) 463 61.7 4.7e-08 >>NP_055731 (OMIM: 610989) serine/threonine-protein kina (1503 aa) initn: 10027 init1: 10027 opt: 10027 Z-score: 5369.7 bits: 1006.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 10027; 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NP_001 VTADQLWVPLRWIAPELVDEVHSNLLVVDQTKSGNVWSLGVTIWELFELGTQPYPQHSDQ 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE0 DVLNQVIRERDTKLPKPQLEQPYSDRWYEVLQFCWLSPEKRPAAEDVHRLLTYLRLQSQR .:: ..::.. :::::::. :::::::.:::::.::.::.::.:: ::.:: .. NP_001 QVLAYTVREQQLKLPKPQLQLTLSDRWYEVMQFCWLQPEQRPTAEEVHLLLSYLCAKGAT 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE0 DSEVDFEQQWNALKPNTNSRDSSNNAA---------------FPILDHFARDRLGREMEE ..: .::..: .:.:. .. . .:: ::.:..:: : . . .. NP_001 EAEEEFERRWRSLRPGGGGVGPGPGAAGPMLGGVVELAAASSFPLLEQFAGDGFHADGDD 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 VLTVTETSQGLSFEYVWEAAKHDHFDERSRGHLDEGLSYTSIFYPVEVFESSLSDPGPGK ::::::::.::.::: :::. :: .:.: ..:: ::. 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XP_006 PLLGLQAASAQEPGCCPGLPHLCSAQGLAPAPCL-VTPSWTETASSGGDHPQAEPKLATE 680 690 700 710 720 730 840 850 860 870 880 890 pF1KE0 TQGETQPTCLDVIVPEDCLHQDISPDAVTVPVEILSTDARTHSLDNRSQDSPGESEETLR ..: : : :: ::. .:. : .: . . . ::: . XP_006 AEGTTGPRLPLPSVP--------SPSQEGAPLP--SEEASAPDAPDALPDSPTPA----- 740 750 760 770 780 900 910 920 930 940 950 pF1KE0 LTESDSVLADDILASRVSVGSSLPELGQELHNKPFSEDHHSHRRLEKNLEAVETLNQLNS . . .. ::: .. .:: ::. . : ::: : . ::. XP_006 ---TGGEVSAIKLASALNGSSSSPEV-----EAPSSED-------EDTAEAT-------- 790 800 810 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE0 KDAAKEAGLVSALSSDSTSQDSLLEDSLSAPFPASEPSLETPDSLESVDVHEALLDS-LG .:. . :::. . : . : : . . .. :::::.:.:. . :. XP_006 ------SGIFTDTSSDGLQARR--PDVVPA-FRSLQKQVGTPDSLDSLDIPSSASDGGYE 820 830 840 850 860 870 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE0 SHTPQKLVPPD-KPA--DSGYETENLESPEWTLHPAPEGTADSEPATTGDGGHSGLPPNP .:. : .: ::::.::: ::::..:. : :: :: . .. . : :.: XP_006 VFSPSATGPSGGQPRALDSGYDTENYESPEFVLKEAQEGC---EPQAFAELASEGEGPGP 880 890 900 910 920 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE0 VIVISDAGDGHRGTEVTPETFTAGSQGSYRDSAYFSDNDSEPEKRSEEVPGTSPSALVLV .: . .: .: .: ::::::::: ..: : : .: XP_006 ETRLSTSLSGL--NEKNP----------YRDSAYFSDLEAEAEATS------GPEKKCGG 930 940 950 960 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE0 QEQPLPEPVLPEQSPAAQDSCL------EARKSQPDESCLSALHNSSDLELR-ATPEPAQ .. : :: :: . ... :: ::. : : : : : :.:. ..:::. XP_006 DRAPGPELGLPSTGQPSEQVCLRPGVSGEAQGSGPGE-VLPPL-----LQLEGSSPEPST 970 980 990 1000 1010 1020 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE0 TGVPQQVHPTEDEASSPWSVLNAELSSGDDFETQDDRPCTLASTGTNTNELLAYTNSALD :. . : : ..: .: . : ..: : : : : :..:. . . XP_006 C--PSGLVPEPPEPQGPAKVRPGPSPSCSQFFLLT--PVPLRSEG-NSSEFQGPPGL--- 1030 1040 1050 1060 1070 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE0 KSLSSHSEGPKLKEPDIEGKYLGKLGVSGMLDLSEDGMDADEED-ENSDDSDEDLRAFNL ::. . .. : : .:.. :. : . .::: :.::.:::.:: ... 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