Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7317
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7317, 1005 aa
  1>>>pF1KB7317 1005 - 1005 aa - 1005 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1530+/-0.00111; mu= 2.9641+/- 0.065
 mean_var=312.8356+/-68.588, 0's: 0 Z-trim(110.6): 619  B-trim: 119 in 1/52
 Lambda= 0.072513
 statistics sampled from 10953 (11722) to 10953 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.36), width:  16
 Scan time:  5.060

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005) 6866 733.6 4.8e-211
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998) 3903 423.6 9.7e-118
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1          ( 495) 3026 331.5 2.5e-90
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1       (1008) 2739 301.9 4.5e-81
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986) 2626 290.0 1.6e-77
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055) 2626 290.1 1.7e-77
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987) 2625 289.9 1.7e-77
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3        (1130) 2614 288.8 4.1e-77
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984) 2524 279.4 2.6e-74
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037) 2319 257.9 7.6e-68
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038) 2317 257.7 8.8e-68
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015) 2313 257.3 1.2e-67
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016) 2311 257.1 1.3e-67
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3          ( 539) 2212 246.4 1.2e-64
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004) 2207 246.2 2.5e-64
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986) 1789 202.5 3.6e-51
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3           ( 998) 1735 196.8 1.8e-49
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983) 1700 193.2 2.3e-48
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987) 1645 187.4 1.2e-46
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976) 1598 182.5 3.7e-45
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976) 1310 152.4 4.4e-36
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7           (1022) 1189 139.7 2.9e-32
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6          ( 279) 1128 132.7   1e-30
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1         ( 295) 1015 120.9 3.9e-27
CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7          ( 729)  879 107.1 1.3e-22
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  739 92.7 4.4e-18
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  739 92.7 4.4e-18
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504)  718 90.1 1.2e-17
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505)  718 90.1 1.2e-17
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525)  718 90.1 1.3e-17
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526)  718 90.1 1.3e-17
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4             ( 527)  710 89.3 2.3e-17
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543)  708 89.1 2.7e-17
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537)  704 88.7 3.6e-17
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  705 88.9 3.7e-17
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509)  702 88.4   4e-17
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 694)  704 88.8 4.2e-17
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 752)  704 88.8 4.5e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491)  700 88.2 4.5e-17
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 764)  704 88.8 4.5e-17
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512)  700 88.2 4.6e-17
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15           ( 822)  704 88.9 4.7e-17
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534)  696 87.8 6.4e-17
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536)  693 87.5 7.9e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 619)  693 87.6 8.7e-17
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX             ( 659)  692 87.5 9.8e-17
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX             ( 693)  692 87.5   1e-16
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20          ( 488)  688 86.9 1.1e-16
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5            ( 453)  682 86.3 1.6e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 482)  681 86.2 1.8e-16


>>CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1                 (1005 aa)
 initn: 6866 init1: 6866 opt: 6866  Z-score: 3902.4  bits: 733.6 E(32554): 4.8e-211
Smith-Waterman score: 6866; 100.0% identity (100.0% similar) in 1005 aa overlap (1-1005:1-1005)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 DESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 TFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 FYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEER
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 APAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 APAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 TYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 DKEMQSYSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVFQVRARTSAGCGRFSQAMEVETGKPRPRYDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DKEMQSYSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVFQVRARTSAGCGRFSQAMEVETGKPRPRYDT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 RTIVWICLTLITGLVVLLLLLICKKRHCGYSKAFQDSDEEKMHYQNGQAPPPVFLPLHHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RTIVWICLTLITGLVVLLLLLICKKRHCGYSKAFQDSDEEKMHYQNGQAPPPVFLPLHHP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 PGKLPEPQFYAEPHTYEEPGRAGRSFTREIEASRIHIEKIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PGKLPEPQFYAEPHTYEEPGRAGRSFTREIEASRIHIEKIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 DVPVAIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 DVPVAIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 LDTFLRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKVSDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LDTFLRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKVSDFG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 LSRVLEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGERPYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LSRVLEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGERPYW
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 NMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALIRSPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALIRSPE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 SLRATATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFAAGGYSSLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SLRATATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFAAGGYSSLG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000     
pF1KB7 MVLRMNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGPRRHL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MVLRMNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGPRRHL
              970       980       990      1000     

>>CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6                (998 aa)
 initn: 3088 init1: 1564 opt: 3903  Z-score: 2227.2  bits: 423.6 E(32554): 9.7e-118
Smith-Waterman score: 4001; 57.6% identity (80.5% similar) in 1004 aa overlap (12-1000:16-993)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB7     MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDS
                      .:..  : ..   ..::. :: :::... . .  :.. : .::. 
CCDS50 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGE--AQAAK-EVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEE
               10        20          30         40        50       

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB7 INEVDESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLG
       :. .::.. ::.:::::.:: :::::::::.:. . .:.:...:.:::::::::.:::::
CCDS50 ISGLDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLG
        60        70        80        90       100       110       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB7 TCKETFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPL
       :::::::::: :.: : : . .:. ..:::::::::::: .::: :..::::::: .:::
CCDS50 TCKETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPL
       120       130       140       150       160       170       

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 SKRGFYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRH
       ::.::::::::.:::.:..:...::::: ....::: : ..:::.. :::::::: ::  
CCDS50 SKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVSS
       180       190       200       210       220       230       

        240         250       260       270       280       290    
pF1KB7 SEER--DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCP
       .::.  ..:.:.::::::::::::::.:.:::... :.:  :  :::::.  :  :.:::
CCDS50 AEEEAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCP
       240       250       260       270       280       290       

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB7 PHSHSAAPAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDP
        :: :   ... :.:. .::::  :::  ::::::::: ::: ..: :.:.:::.:: : 
CCDS50 THSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADN
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KB7 GGRSDITYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEA
       :::.:.::  .:.:: :  ..:  :::.  ..::::.: .  . : .:::: ::.: .::
CCDS50 GGRNDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEA
       360       370       380       390       400       410       

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pF1KB7 VNGVSDLSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYE
       ::::::::   :  :.:.:::.:::::::  . .::. : :: : :::::.:::.: :::
CCDS50 VNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYE
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pF1KB7 IKYYEKDKEMQSYSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVFQVRARTSAGCGRFSQAMEVET---
       :::::::.. ..:::.:. .: :....::::: ::::.:: :.:: : .:  ..: :   
CCDS50 IKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEE
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pF1KB7 --GK----PRPRYDTRTIVWICLTLITGLVVLLLLL---ICKKRHCGYSKAFQDSDEEKM
         ::         .   .. : .. ..: ..:....   :  .:::::::: :..:::  
CCDS50 ATGKMFEATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEE--
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pF1KB7 HYQNGQAPPPVFLPLHHPPGKLPEPQFYAEPHTYEEPGRAGRSFTREIEASRIHIEKIIG
                   : .:    :.:  . : .:.:::.:.:: ..:..:..:: :.::..::
CCDS50 ------------LYFHF---KFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIG
                     600          610       620       630       640

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pF1KB7 SGDSGEVCYGRLRVPGQRDVPVAIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGV
       .:. :::: :::..::.::: ::::.::.::::.:::::: ::::::::::::...::::
CCDS50 AGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGV
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pF1KB7 VTRGRLAMIVTEYMENGSLDTFLRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLA
       ::::. .::: :.::::.::.::: ::::::..::::::::..::::::.:.::::::::
CCDS50 VTRGKPVMIVIEFMENGALDAFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLA
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pF1KB7 ARNVLVDSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVW
       :::.::.:::::::::::::::.::::.:.:::::::::.:::::::: .: :.::::::
CCDS50 ARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVW
              770       780       790       800       810       820

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pF1KB7 SFGVVMWEVLAYGERPYWNMTNRDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQR
       :.:.:::::..:::::::.:.:.:::...:::::::::: :: .:::::::::.:.::.:
CCDS50 SYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAER
              830       840       850       860       870       880

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pF1KB7 PRFSQIVSVLDALIRSPESLRAT-ATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDS
       :.: :::..:: .::.:.::..  .: ::   : . ..  :.          .::.::..
CCDS50 PKFEQIVGILDKMIRNPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFC------SVGEWLQA
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pF1KB7 IRMGRYRDHFAAGGYSSLGMVLRMNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGP
       :.: ::.:.:.:.::.::  : ::. .:: .:::::.::::::..::::::::.   .: 
CCDS50 IKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIEDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGT
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pF1KB7 RRHL
           
CCDS50 GIQV
           

>>CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1               (495 aa)
 initn: 3026 init1: 3026 opt: 3026  Z-score: 1735.0  bits: 331.5 E(32554): 2.5e-90
Smith-Waterman score: 3026; 100.0% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEV
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pF1KB7 DESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKE
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pF1KB7 TFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRG
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pF1KB7 FYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEER
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pF1KB7 DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSA
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pF1KB7 APAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 APAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDI
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pF1KB7 TYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSD
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pF1KB7 LSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEK
       ::::::::::::::::::                                          
CCDS30 LSPEPRRAAVVNITTNQAGRRRNSVPQRPGPPASPASDPSRDQSSAGDVLWAFRQVPLWP
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1            (1008 aa)
 initn: 2714 init1: 551 opt: 2739  Z-score: 1569.1  bits: 301.9 E(32554): 4.5e-81
Smith-Waterman score: 2960; 45.9% identity (72.4% similar) in 992 aa overlap (31-1000:35-1003)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAPARGRLPPALWVVTAAAAAATCVSAARGEVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEV
                                     :: :::... ... :: . :..::. :. :
CCDS41 AGPHPLRLFLCRMQLCLALLLGPWRPGTAEEVILLDSKASQAELGWTALPSNGWEEISGV
           10        20        30        40        50        60    

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pF1KB7 DESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVPRDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKE
       ::  .::.:::::::. :::.:::.:.:. :  ..:...:..::::::.:.::. :::::
CCDS41 DEHDRPIRTYQVCNVLEPNQDNWLQTGWISRGRGQRIFVELQFTLRDCSSIPGAAGTCKE
           70        80        90       100       110       120    

              130          140       150       160       170       
pF1KB7 TFNLYYLESDRDLGASTQE---SQFLKIDTIAADESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLS
       :::.::::.. ::: .  .   :.  :::::::::::: .::: :..::::::: .::::
CCDS41 TFNVYYLETEADLGRGRPRLGGSRPRKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLS
          130       140       150       160       170       180    

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 KRGFYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRNLAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHS
       .:::.:::::.:::.:..:.:.:::.: : ::.::.:  ... .  :.:::: : :: ::
CCDS41 RRGFHLAFQDVGACVALVSVRVYYKQCRATVRGLATFPATAAESAFSTLVEVAGTCVAHS
          190       200       210       220       230       240    

       240         250       260       270       280       290     
pF1KB7 EER--DTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERRDACVACELGFYKSAPGDQLCARCPP
       : .  . :.:.:.:.::::::.:.: ::::..:: : : ::  :::: .:   ::. :: 
CCDS41 EGEPGSPPRMHCGADGEWLVPVGRCSCSAGFQERGDFCEACPPGFYKVSPRRPLCSPCPE
          250       260       270       280       290       300    

         300       310       320       330       340         350   
pF1KB7 HSHSAAPAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPSAPVNLISSVNGTSVTLE--WAPPLD
       ::..   :.  : :. :: :.  ::::..:::::::: .:  :.. . ..:.  : :: :
CCDS41 HSRALENASTFCVCQDSYARSPTDPPSASCTRPPSAPRDLQYSLSRSPLVLRLRWLPPAD
          310       320       330       340       350       360    

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pF1KB7 PGGRSDITYNAVCRRC--PWALSRCEACGSGTRFVPQQTSLVQASLLVANLLAHMNYSFW
        :::::.::. .: ::      . :: ::  . :.:.:..: . .  . .:     :.  
CCDS41 SGGRSDVTYSLLCLRCGREGPAGACEPCGPRVAFLPRQAGLRERAATLLHLRPGARYTVR
          370       380       390       400       410       420    

             420        430       440       450       460          
pF1KB7 IEAVNGVSD-LSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQERAGQTSVSLLWQEP---EQPN
       . :.::::   .      : :...:. .:: .   ::..:.   :::: :.::     :.
CCDS41 VAALNGVSGPAAAAGTTYAQVTVSTGPGAPWEEDEIRRDRVEPQSVSLSWREPIPAGAPG
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CCDS41 LEALDLCRYKDSFAAAGYGSLEAVAEMTAQDLVSLGISLAEHREALLSGISALQARVLQL
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CCDS22 SGGREDLVYNIICKSCGSGRGACTRCGDNVQYAPRQLGLTEPRIYISDLLAHTQYTFEIQ
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CCDS22 AVNGVTDQSPFSPQFASVNITTNQAAPSAVSIMHQVSRTVDSITLSWSQPDQPNGVILDY
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CCDS22 ELQYYEKELSEYNATAIKSPTNTVTVQGLKAGAIYVFQVRARTVAGYGRYSGKMYFQT-M
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CCDS22 TEAEYQTSIQEKLPLIIGSSAAGLVFLIAVVVIAIVCNRR--GFERADSEYTDKLQHYTS
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CCDS22 G----------HMTPGM----KIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDISCVKIEQVIGAGEF
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CCDS22 GEVCSGHLKLPGKREIFVAIKTLKSGYTEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNVIHLEGVVTKS
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CCDS22 TPVMIITEFMENGSLDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLADMNYVHRDLAARNI
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CCDS22 LVNSNLVCKVSDFGLSRFLEDDTSDPTYTSALGGKIPIRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSY
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pF1KB7 HL

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pF1KB7 HL

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CCDS46 ETSDMAAEQGQILVIATAAVGGFTLLVILTLFFLITGRCQWYIKAKMKSEEKRRNHLQNG
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CCDS46 GGRDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHTPYTFDIQA
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CCDS46 IRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGMVYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTD
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CCDS46 D---DYKSELREQLPLIAGSAAAGVVFVVSLVAISIVCSRKR-AYSKEAVYSDKLQ-HYS
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CCDS46 TGRGSPGM--------------KIYIDPFTYEDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGE
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CCDS46 FGEVYKGRLKLPGKREIYVAIKTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTK
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CCDS46 SRPVMIITEFMENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARN
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CCDS46 ILVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRKFTSASDVWS
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CCDS46 YGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCPAALHQLMLDCWQKDRNSRP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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