Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8998
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8998, 412 aa
1>>>pF1KB8998 412 - 412 aa - 412 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4550+/-0.000859; mu= 17.6224+/- 0.051
mean_var=182.5200+/-78.592, 0's: 0 Z-trim(109.2): 260 B-trim: 1260 in 2/48
Lambda= 0.094933
statistics sampled from 10220 (10728) to 10220 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 2793 395.4 5.1e-110
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 ( 332) 1274 187.2 1.9e-47
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 ( 326) 1015 151.7 9.1e-37
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 582 92.4 6.4e-19
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 427 71.3 1.6e-12
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 401 67.7 1.9e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 397 67.3 3.1e-11
>>CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 (412 aa)
initn: 2793 init1: 2793 opt: 2793 Z-score: 2088.7 bits: 395.4 E(32554): 5.1e-110
Smith-Waterman score: 2793; 100.0% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (1-412:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAI
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CCDS13 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAI
10 20 30 40 50 60
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CCDS13 PFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYF
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190 200 210 220 230 240
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CCDS13 NFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAIIVG
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CCDS13 LFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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CCDS13 KIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 YALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS
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CCDS13 YALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS
370 380 390 400 410
>>CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 (332 aa)
initn: 1234 init1: 824 opt: 1274 Z-score: 965.2 bits: 187.2 E(32554): 1.9e-47
Smith-Waterman score: 1274; 59.4% identity (82.1% similar) in 330 aa overlap (7-328:8-329)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLA
..:...::.::.:.. :::::: :: ..::. ::::.:::::::.:::..:
CCDS11 MLLETQDALYVALELVIAALSVAGNVLVCAAVGTANTLQTPTNYFLVSLAAADVAVGLFA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGT
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CCDS11 IPFAITISLGFCTDFYGCLFLACFVLVLTQSSIFSLLAVAVDRYLAICVPLRYKSLVTGT
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWN-------NCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVV
::.:.::. :::.:.:::::.:::: :: .: .: .. . : : ::::.::
CCDS11 RARGVIAVLWVLAFGIGLTPFLGWNSKDSATNNCTEPWDGTTNESCC---LVKCLFENVV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAA
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CCDS11 PMSYMVYFNFFGCVLPPLLIMLVIYIKIFLVACRQLQRTELM----DHSRTTLQREIHAA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCP-DCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYR
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CCDS11 KSLAMIVGIFALCWLPVHAVNCVTLFQPAQGKNKPKWAMNMAILLSHANSVVNPIVYAYR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSA
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CCDS11 NRDFRYTFHKIISRYLLCQAD-VKSGNGQAGVQPALGVGL
300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGV
>>CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 (326 aa)
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Smith-Waterman score: 1015; 51.8% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (7-313:10-313)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGV
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CCDS14 MPPSISAFQAAYIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVAVGA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVT
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CCDS14 LVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKMVVT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYM
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CCDS14 PRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISMEYM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAI
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CCDS14 VYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSAS-SGD-PQKYYGKELKIAKSLAL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 IVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQ
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CCDS14 ILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSC-HKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERR
:: :: .: : :
CCDS14 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
300 310 320
>>CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 770 init1: 474 opt: 582 Z-score: 453.1 bits: 92.4 E(32554): 6.4e-19
Smith-Waterman score: 811; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (4-308:10-302)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIA
... .:::.:. :.. ::.::::: .: :: .::..: ::.:::: ::::
CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNG
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CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPM
..: : ...::..:: .:::::.::: . .: . ..: : .:. :
CCDS83 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTF------LSCQFVSVMRM
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKS
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CCDS83 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSN---SKETGAFYGREFKTAKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIRE
: ... :::: :::: ::::. .: . .: ..:..:.:::.::..::..:::.:..
CCDS83 LFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFNGE---VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKK
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHP
:..:. :... :.
CCDS83 FKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
290 300 310
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 366 init1: 138 opt: 427 Z-score: 338.1 bits: 71.3 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 427; 32.5% identity (58.8% similar) in 323 aa overlap (5-309:30-332)
10 20 30
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAI-AVLAILGNVLVCWAVWLN
:: : . . ... ::::..::.:: ..
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHG---CLFIACFVLVLTQSS
..:.. ::..:.::: ::. ::: ..::... .. : : : : .: ... ::
CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWY-FGRSFCTFHTCCDVAFCYSS
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB8 IFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGI-IAICWVLSFAI-GLTPMLGWNNCGQP
.: : :.::::::. :: : : . ..:: :.. :.: . : . . : . :
CCDS51 LFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFT-VSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL-
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 KEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMV--YFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQ
: . . .: : : . :: .:... ...:: .: ..:. .: :::.::::
CCDS51 -EELSDALNCIGG---C--QTVVNQNWVLTDFLSFF----IPTFIMIILYGNIFLVARRQ
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KB8 LKQMESQPLPGERARSTLQ-----KEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHI---INCFT-FF
:..:. : . . . .: .:::.:.. : : . ::: : :. : :.
CCDS51 AKKIENTGSKTESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFI
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 CPDCSHAPL-WLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAA
: : . : : ::..::.::: ::.... :. ..::.
CCDS51 TPACIYEICCWCAYY-------NSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNL
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 GTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGN
CCDS51 FSEHI
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 353 init1: 128 opt: 401 Z-score: 318.8 bits: 67.7 E(32554): 1.9e-11
Smith-Waterman score: 401; 30.5% identity (58.8% similar) in 308 aa overlap (17-309:43-332)
10 20 30 40
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVV
:::: .::.:: :. ..:.. ::....
CCDS75 LCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHFKQLHTPTNFLIA
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SLAAADIAVGVLAIPFAITISTGFCAACHG--CLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYI
::: ::. ::: ..::. . :. : : : .:: . .:.: : :..::::
CCDS75 SLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASLFHLCCISVDRYI
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110 120 130 140 150 160
pF1KB8 AIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNH---SQGCGE
:. :: : : . . .:: :::. ...: .. : .:: .. . :
CCDS75 AVTDPLTYPTKFTVS----VSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEELVVALTCVG
140 150 160 170 180
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pF1KB8 GQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERA
: : : .. : . ....: .: . :. .: .:::.:..: ...:: .. .
CCDS75 GCQAPLNQNWVLLCFLLFF-------IPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQSS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB8 RSTLQKEV-----HAAKSLAIIVGLFALCWLPL---HIINCF-TFFCPDCSHAPL-WLMY
. ...: .:::.:.: .. : . ::: .:. . .:. : . : : .:
CCDS75 SESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCVY
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDG
::..::.:::. . : .... :. ..:::
CCDS75 Y-------NSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 EQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELK
>>CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 (408 aa)
initn: 471 init1: 164 opt: 397 Z-score: 315.2 bits: 67.3 E(32554): 3.1e-11
Smith-Waterman score: 508; 34.6% identity (59.0% similar) in 376 aa overlap (14-345:44-407)
10 20 30 40
pF1KB8 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILG-NVLVCWAVWLNSNLQNVTN
::.:::: .: :.:: :. . ::..::
CCDS60 WPDLPTLAPNTANTSGLPGVPWEAALAGALLALAVLATVGGNLLVIVAIAWTPRLQTMTN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90
pF1KB8 YFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITIS-TG-FCAACHGC-LFIACFVLVLTQSSIFSLLAIA
::.::::::...:.:..: : :.. :: . . :: :. . :: .: .:: .: :.:
CCDS60 VFVTSLAAADLVMGLLVVPPAATLALTGHWPLGATGCELWTSVDVLCVT-ASIETLCALA
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 IDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLG-WNNCGQPKEGKNHSQG
.:::.:. ::::..::: :. ... ::.: :....:... : : : .:
CCDS60 VDRYLAVTNPLRYGALVTKRCARTAVVLVWVVSAAVSFAPIMSQWWRVGADAE----AQR
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 CGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQM-------
: . : : . .: .: .. . .:::.:: :: :.:..: :::. .
CCDS60 CHSNPRCCAFASNMP---YVLLSSSVSFYLPLLVMLFVYARVFVVATRQLRLLRGELGRF
190 200 210 220 230 240
220 230 240
pF1KB8 ---ESQPLP---------------------GER-ARSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCW
:: : : :.: :: .: .: .:..:.: :.:::
CCDS60 PPEESPPAPSRSLAPAPVGTCAPPEGVPACGRRPARLLPLREHRALCTLGLIMGTFTLCW
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LPLHIINCFTFFC-PDCSHAPLWLMYLAIV-LSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKII-
::. . : . . :. .: .::. :...::. ::.:: : .::..::...
CCDS60 LPFFLANVLRALGGPSLVPGP---AFLALNWLGYANSAFNPLIYC-RSPDFRSAFRRLLC
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350
pF1KB8 RSHVLRQQEPFKAAGTS---ARVLAAHGSDGE-QVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPN
: :: :: . . : ::..: .. .. ::.: ::
CCDS60 RCGRRLPPEPCAAARPALFPSGVPAARSSPAQPRLCQRLDGASWGVS
370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 GYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDDPLAQDGAGVS
412 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]