FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0002, 548 aa 1>>>pF1KA0002 548 - 548 aa - 548 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7268+/-0.00103; mu= 15.4965+/- 0.062 mean_var=59.3678+/-11.748, 0's: 0 Z-trim(102.7): 40 B-trim: 57 in 2/47 Lambda= 0.166456 statistics sampled from 7021 (7057) to 7021 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16 Scan time: 3.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 3536 858.0 0 CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 3402 825.8 0 CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 3037 738.2 5.3e-213 CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 911 227.6 3e-59 CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 835 209.4 9.1e-54 CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 828 207.7 2.8e-53 CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 819 205.5 1.2e-52 CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 815 204.6 2.5e-52 CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 761 191.6 2.1e-48 CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 738 186.1 9.4e-47 CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 682 172.6 1e-42 CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 648 164.4 2.7e-40 CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 640 162.5 1.1e-39 CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 639 162.3 1.2e-39 CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 628 159.6 7.9e-39 CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 609 155.1 1.7e-37 CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 609 155.1 1.8e-37 CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 522 134.2 3.8e-31 CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 517 133.0 7.6e-31 CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 516 132.8 1e-30 CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 509 131.1 2.5e-30 CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 499 128.7 1.8e-29 CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 428 111.6 1.5e-24 CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 410 107.3 4.4e-23 CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 397 104.2 3.8e-22 >>CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (548 aa) initn: 3536 init1: 3536 opt: 3536 Z-score: 4584.1 bits: 858.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3536; 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CCDS13 AEQLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 GNEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTS :.::.:.:: .: .: :. . . :: . :. . .: .: :.... . :.... CCDS13 ----HLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMAT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 V-KDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVV : . :..:...::: .. .:. ... .: .:::: ..:.. :: .: .: ::.: CCDS13 VLSGARVALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 TGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYL . :.: . .: :.::.:.... : .. : ... . :::: :: .. :.:. :: CCDS13 VLGEVDEETLTLADKYGIVVIQARSWMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPP--QRPGKCQRVYR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 SEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGG .:.:: .:::. : :.::::.: . . . :.:: :.... : .: ::.::. CCDS13 QELGDGLAVVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 GATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQ ::::. :::.... : : :. :: :.. .:..::::.:. ...:.... .::: CCDS13 GATEMALAKMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQ 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 EGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGG :: .:. :. . .. . :. :: . : ... ...... .. ::.:..:: CCDS13 GGNLLMGVGTEG----IINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAK---- 480 490 500 510 520 540 pF1KA0 PKPPSGKKDWDDDQND : :. .. :. : CCDS13 -KSPTHQEIWNPDSKKTKKHPPPVETKKILGLNN 530 540 550 >>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa) initn: 745 init1: 339 opt: 835 Z-score: 1078.7 bits: 209.4 E(32554): 9.1e-54 Smith-Waterman score: 835; 31.8% identity (66.8% similar) in 509 aa overlap (24-524:30-533) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNK ::: :. .:.: : .:.: ::. ::::..: CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLE-ALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 MVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLEL :.... . ::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: CCDS38 MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 AEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYG ::.:: :. .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: . CCDS38 AEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 N-EVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKE-TEGD . . .:.. ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .. . CCDS38 SCHRQMAEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 VTS-VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN . . :.:::::. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .:::: CCDS38 MPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGAN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 VVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDS ... : : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: CCDS38 LAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 VYLSEVGDTQ--VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR : : :. ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.: CCDS38 VQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNR 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL .: ::::.:: : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... CCDS38 VVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEV 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 YAVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIM : . .: : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.: CCDS38 RARQVKEMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRK 480 490 500 510 520 530 530 540 pF1KA0 AKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND CCDS38 PGESEE 540 >>CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (520 aa) initn: 736 init1: 330 opt: 828 Z-score: 1069.9 bits: 207.7 E(32554): 2.8e-53 Smith-Waterman score: 828; 31.3% identity (65.7% similar) in 508 aa overlap (25-524:9-512) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL .:. .:.: : .:.: ::. ::::..::.... CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR . ::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: ::.:: CCDS82 GDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLD 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGN-EVFL :. .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . . CCDS82 RGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQM 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 AKLIAQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVT--SVK :.. ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:. CCDS82 AEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 DAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGG :::::. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::... CCDS82 DAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQW 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 KVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEV : : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: : CCDS82 GFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISF 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 GDTQ--VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGG : :. ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: ::: CCDS82 GTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 ATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH-Q :.:: : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . . CCDS82 AAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVK 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 EGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGG : : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.: CCDS82 EMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE 470 480 490 500 510 520 540 pF1KA0 PKPPSGKKDWDDDQND >>CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (503 aa) initn: 730 init1: 324 opt: 819 Z-score: 1058.5 bits: 205.5 E(32554): 1.2e-52 Smith-Waterman score: 819; 31.5% identity (65.9% similar) in 498 aa overlap (35-524:2-495) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 VPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLF : : .:.: ::. ::::..::.... . CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVT 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 VTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLRIGLS ::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: ::.:: :. CCDS77 VTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIH 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 VSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGN-EVFLAKLI .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . .:.. CCDS77 PIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIA 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KA0 AQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVT--SVKDAKI ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:.:::: CCDS77 VNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 AVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVAD :. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::... : CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KA0 MALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQ : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: : : :. CCDS77 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTK 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KA0 --VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEI ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: ::::.:: CCDS77 DKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KA0 ELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH-QEGNK : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . .: : CCDS77 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KA0 NVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPP .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.: CCDS77 ALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE 450 460 470 480 490 500 540 pF1KA0 SGKKDWDDDQND >>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa) initn: 634 init1: 303 opt: 815 Z-score: 1052.8 bits: 204.6 E(32554): 2.5e-52 Smith-Waterman score: 815; 29.2% identity (66.5% similar) in 511 aa overlap (30-528:35-539) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINH . ::.: : .:.. ::. ::.::.::. . CCDS33 VAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 LEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELL . .:::.::::....: ::::.:.: :. :. :.::::. :...::.::. .:: CCDS33 KGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 RIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSK---QYGNE . :. . . :... : .:. ::: .. .: : . . . ::. :: ::.. CCDS33 QKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDM--SRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSS- 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 VFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVD--NIRVCKILGSGISSSSVLHGMVF-KKETEGDVTS .:. . ..: .... . .:: .:.. : ::. :.. ...:.:. .: ... .: CCDS33 -LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVT :. :::.. . ... :. . .... .. . :. . :: : :: ::.. CCDS33 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KA0 GGKV-----ADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCD .. .:.:::. ::..::... . :.. .:::.:. . .. . . .: . CCDS33 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 -SVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR . .. :. ... . : :::.:::. .... ::.. :.. ... :.. . CCDS33 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL :. :::: ::::: ..: :..: :.:.: .. ::.:.:.:: .::::.:.. ....: CCDS33 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 YAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA : .:.:..:.... .....:: ... : . :. :::... ..:..:... . CCDS33 RNRHAQGEKTAGINVRK--GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNT 490 500 510 520 530 530 540 pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND . CCDS33 R >>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa) initn: 750 init1: 326 opt: 761 Z-score: 982.6 bits: 191.6 E(32554): 2.1e-48 Smith-Waterman score: 769; 30.5% identity (62.5% similar) in 547 aa overlap (14-547:9-534) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL .:....:. :: ... ::.: : .:. :: ::..: ::... . CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESG-RKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR . .:::. .::::..::::::: .. :. :..::::::. :...:: .: .::..:. CCDS11 GGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKA-HEILPNLVCCSAK-NLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVF . . :: .: ::: ... .: : .. : : . ... .:: .: . CCDS11 QQMHPTVVISAY----RKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 LAKLIAQACVSI--FPDSGHFNVD---NIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTS :: :: :.. : ..:. ..: :: :: :. : .: ::.:....:.. CCDS11 LACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA0 --VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVV .:. .:.. . .. :.. . : :.. . . ::. .. . : . .:: CCDS11 RYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 VTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEE--MGHCDS .: ..:.: :: . :: .: : : :. .. :: . : : :.: .: . CCDS11 ITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSR--PEELREDDVGTGAG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 VY-LSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRL . ....:: . .: . .: ::.:::.. ......:: ..:.... . . : .: CCDS11 LLEIKKIGD-EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQL 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 VPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLY ::::::.:. .:. .: ... :.::. . :.:.:.:::.: .: :... .....: CCDS11 VPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLR 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 AVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA : : ::. .. : ...:. .. :: : :: . : . : :...:: .::.:.:. CCDS11 AKHTQENCETWG--VNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV-- 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND ::.: :::. CCDS11 ---------SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE 530 540 >>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa) initn: 522 init1: 274 opt: 738 Z-score: 952.8 bits: 186.1 E(32554): 9.4e-47 Smith-Waterman score: 738; 27.7% identity (62.7% similar) in 528 aa overlap (9-525:3-520) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL : . .::::. .:. . : ::.::. .:...::. :: ::.:.... CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLV-SNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGR 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR : ..::.::::. :.: ::::: .: .. :. ::::::. : ..:. .:. .. .. CCDS46 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KA0 IGLSVSEVIEGY----EIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSL--LRTSIMSKQYG :: . .:... ..: : .:: .. . . : . : .. : ....:.: CCDS46 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQ-- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 NEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKET-----EG ..:.::....: : .. : .... .:. :. :... .:... :..::: : CCDS46 -KAFFAKMVVDA-VMMLDDLLQLKMIGIK--KVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 DVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN . . .. :::. . .. . .. . ..:.:. . . .: :.. ... : .::. CCDS46 QPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 VVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDS ::.. ..:.: .: ... . . ::.: . :.. .. . .:.:. CCDS46 VVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQV 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 VYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLV ...: . : . . :..:::.....:.. ::.. :.. . .. .: CCDS46 FEETQIGGERYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVV 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 PGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYA :::: :.::.: . .:..: :: .: : .:.:.: ::: : .:.: :.....:: : CCDS46 AGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 VHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKP : .:. :.::. : . : .:: . . . . :. :..:: .. ::. : CCDS46 RHAQGGTWYGVDINNE--DIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPR 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 AGGPKPPSGKKDWDDDQND CCDS46 STVDAPTAAGRGRGRGRPH 530 540 548 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 14:27:32 2016 done: Mon Nov 7 14:27:32 2016 Total Scan time: 3.220 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]