Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5895
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5895, 499 aa
1>>>pF1KB5895 499 - 499 aa - 499 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1001+/-0.000421; mu= 19.0256+/- 0.026
mean_var=65.9754+/-12.874, 0's: 0 Z-trim(110.3): 41 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.157900
statistics sampled from 18584 (18623) to 18584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 8.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepa ( 499) 3359 774.6 0
XP_005254429 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 499) 3359 774.6 0
XP_005254431 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 511) 3170 731.5 1.3e-210
XP_006720565 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 452) 3051 704.4 1.7e-202
XP_016877665 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 398) 2210 512.8 7.4e-145
NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isofor ( 500) 1392 326.5 1.1e-88
XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 536) 1381 324.0 6.6e-88
XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 420) 1313 308.5 2.5e-83
NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein ( 475) 1249 293.9 6.7e-79
XP_016881584 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 303) 893 212.7 1.2e-54
NP_000927 (OMIM: 246600,614338) pancreatic triacyl ( 465) 679 164.1 8.1e-40
NP_006220 (OMIM: 604422) inactive pancreatic lipas ( 467) 649 157.2 9.3e-38
NP_001290064 (OMIM: 604422) inactive pancreatic li ( 467) 649 157.2 9.3e-38
XP_011538170 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 467) 649 157.2 9.3e-38
NP_005387 (OMIM: 604423) pancreatic lipase-related ( 470) 649 157.2 9.3e-38
NP_001294935 (OMIM: 603684) endothelial lipase iso ( 426) 635 154.0 7.9e-37
XP_011524567 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 462) 635 154.0 8.4e-37
XP_016871828 (OMIM: 604423) PREDICTED: pancreatic ( 249) 506 124.5 3.6e-28
XP_011538171 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 318) 497 122.5 1.8e-27
NP_640341 (OMIM: 604379,607365) lipase member H pr ( 451) 437 108.9 3.1e-23
XP_011510833 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408) 426 106.4 1.6e-22
XP_011510832 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408) 426 106.4 1.6e-22
XP_006724028 (OMIM: 145750,609252) PREDICTED: lipa ( 404) 425 106.2 1.9e-22
NP_001289927 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 460) 425 106.2 2.1e-22
NP_945347 (OMIM: 145750,609252) lipase member I is ( 481) 425 106.2 2.2e-22
NP_001289930 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 375) 409 102.5 2.2e-21
NP_001289929 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 454) 396 99.6 2e-20
NP_056984 (OMIM: 607460) phospholipase A1 member A ( 456) 387 97.5 8.4e-20
NP_001280154 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440) 386 97.3 9.6e-20
XP_006713592 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 421) 331 84.8 5.5e-16
NP_001289928 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 430) 323 82.9 2e-15
XP_016862061 (OMIM: 607460) PREDICTED: phospholipa ( 283) 263 69.2 1.8e-11
NP_001193890 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 283) 263 69.2 1.8e-11
NP_001193889 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440) 189 52.4 3.1e-06
XP_016861341 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 417) 152 44.0 0.001
>>NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepatic (499 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 4134.8 bits: 774.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3359; 99.6% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_000 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB5 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
:::::::::::::::::::
NP_000 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
490
>>XP_005254429 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI (499 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 4134.8 bits: 774.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3359; 99.6% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
XP_005 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_005 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
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490
pF1KB5 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
:::::::::::::::::::
XP_005 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
490
>>XP_005254431 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI (511 aa)
initn: 3169 init1: 3169 opt: 3170 Z-score: 3902.0 bits: 731.5 E(85289): 1.3e-210
Smith-Waterman score: 3170; 95.9% identity (98.2% similar) in 490 aa overlap (11-499:22-511)
10 20 30 40
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQS-LKPEPFGRRAQAVETNKTLHEM
.:. . .: . .. .. :::::::::::::::::::
XP_005 MDLITYLNLIFLLLKPQYHPQILITGVTTSSEDMRKAPVSEEPFGRRAQAVETNKTLHEM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FKVYHYQFKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 DIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
430 440 450 460 470 480
470 480 490
pF1KB5 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRKIR
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRKIR
490 500 510
>>XP_006720565 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI (452 aa)
initn: 3051 init1: 3051 opt: 3051 Z-score: 3756.3 bits: 704.4 E(85289): 1.7e-202
Smith-Waterman score: 3051; 99.6% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (48-499:1-452)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 IQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGF
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 NSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNT
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAG
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 PLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFL
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 ELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCK
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 KGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
XP_006 KGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQFINQTETPIQTTFTMSLL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 GTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTII
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 PWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRK
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 IR
::
XP_006 IR
>>XP_016877665 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI (398 aa)
initn: 2204 init1: 2204 opt: 2210 Z-score: 2721.7 bits: 512.8 E(85289): 7.4e-145
Smith-Waterman score: 2210; 92.6% identity (96.0% similar) in 351 aa overlap (11-360:22-370)
10 20 30 40
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQS-LKPEPFGRRAQAVETNKTLHEM
.:. . .: . .. .. :::::::::::::::::::
XP_016 MDLITYLNLIFLLLKPQYHPQILITGVTTSSEDMRKAPVSEEPFGRRAQAVETNKTLHEM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_016 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
:: .::. :
XP_016 FK--GFQLEYTFTAENVKLAEEHKEENKNDHSALSRDKHC
370 380 390
>>NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isoform 1 (500 aa)
initn: 1299 init1: 361 opt: 1392 Z-score: 1713.2 bits: 326.5 E(85289): 1.1e-88
Smith-Waterman score: 1392; 42.9% identity (71.4% similar) in 503 aa overlap (6-494:8-494)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNK-TLHEMK--TRFLLF
::: :: . : :. . : :: . .. : : :.: .:: :
NP_006 MSNSVPLLCF---WSLCYCF---AAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GETN---QGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPA
. .:: . ..: . :..:.:: . .:::::...:..:::. ..:.::...
NP_006 TSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAH
. .:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .: ::.:. ..: ..:::::::::::
NP_006 KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSV
:.:.::. . :: .::::::: :::.:::. .:::::::.:::..::.:: .:::.
NP_006 VAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLH
::..:.:: :.:::::.::::: . .. :: ...::...:: :::.::::.:::..
NP_006 GIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVN
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVY
:.:. : : : :..:.::::.:.:::..::.... .......: ::: ::.::
NP_006 QDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 HYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIG
:::.::. : .. :. :: ..: ::. : .:. . . : .: : .::. . :.:
NP_006 HYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB5 ELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
.:. :.. ::. : : :.: .. . . ::. : : .. ::::.::::...:::.
NP_006 DLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCT
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB5 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
:. .. . : .: : ::. .:..::
NP_006 EDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
470 480 490 500
>>XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip (536 aa)
initn: 1296 init1: 361 opt: 1381 Z-score: 1699.2 bits: 324.0 E(85289): 6.6e-88
Smith-Waterman score: 1381; 44.8% identity (75.2% similar) in 444 aa overlap (59-494:97-530)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 PEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIH
..:: . ..: . :..:.:: . .:::
XP_005 PRDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIH
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 GWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALL
::...:..:::. ..:.::... . .:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .:
XP_005 GWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARML
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 RWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNR
::.:. ..: ..::::::::::::.:.::. . :: .::::::: :::.:::. .:
XP_005 DWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKR
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 LSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGF
::::::.:::..::.:: .:::.::..:.:: :.:::::.::::: . .. :: .
XP_005 LSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---Y
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 NAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHV
..::...:: :::.::::.:::.. :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::..
XP_005 GTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNA
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 RQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIP
.. .......: ::: ::.:::::.::. : .. :. :: ..: ::. : .:
XP_005 KKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLP
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 ITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHS
. . . : .: : .::. . :.:.:. :.. ::. : : :.: .. . . ::.
XP_005 LEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB5 G--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
: : .. ::::.::::...:::.:. .. . : .: : ::. .:..::
XP_005 GRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
480 490 500 510 520 530
>>XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip (420 aa)
initn: 1231 init1: 361 opt: 1313 Z-score: 1617.0 bits: 308.5 E(85289): 2.5e-83
Smith-Waterman score: 1313; 46.0% identity (75.8% similar) in 417 aa overlap (86-494:8-414)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPV
:::::...:..:::. ..:.::... . .
XP_011 MTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-KDA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSG
:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .: ::.:. ..: ..::::::::::::.:
XP_011 NVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIK
.::. . :: .::::::: :::.:::. .:::::::.:::..::.:: .:::.::.
XP_011 YAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSIGIQ
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGT
.:.:: :.:::::.::::: . .. :: ...::...:: :::.::::.:::..
XP_011 MPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 QSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQ
:.:. : : : :..:.::::.:.:::..::.... .......: ::: ::.:::::
XP_011 PSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQ
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELI
.::. : .. :. :: ..: ::. : .:. . . : .: : .::. . :.:.:.
XP_011 MKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 MIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENT
:.. ::. : : :.: .. . . ::. : : .. ::::.::::...:::.:.
XP_011 KIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDP
340 350 360 370 380
480 490
pF1KB5 DDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
.. . : .: : ::. .:..::
XP_011 ENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
390 400 410 420
>>NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein lip (475 aa)
initn: 1308 init1: 794 opt: 1249 Z-score: 1537.4 bits: 293.9 E(85289): 6.7e-79
Smith-Waterman score: 1353; 44.3% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (38-495:27-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 FSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQG---CQI
:.. . . .....: : . . :..
NP_000 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAAL-KSQPAQPVNVGLVDWI
. ... : :: : :.::::.: :. :.:. ..:::: : .: . :: .:::.
NP_000 IPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDS--NVIVVDWL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGG
. :..:: ... :.:::..:: .. :.:: . ..:::.:::::::..:.::: .
NP_000 SRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTN-
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 THKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDF
.:..:::::: ::: :: . .:::::::.:::..::::: : :.::..:.:: :.
NP_000 -KKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCG
:::::.:::::.. : : ::..:.. . : .:::::::.::::::::. . : :: :.
NP_000 YPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFIN-
. ..: .::::::.:.:::.:::.. . ..:....: ::.: :.::.:::.::.: .
NP_000 SKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN
..:: . .: .:: :: . ..::.:: . ...:::::::: .::::::.:.:.::..
NP_000 ESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEK
.. .. :. : ..: :.... :::::::::... :::.. . : .
NP_000 DSYFS--WS------DWWSSP---GFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPA
420 430 440 450 460
490
pF1KB5 IFVKCEIKSKTSKRKIR
.::::. :: ..:
NP_000 VFVKCHDKSLNKKSG
470
>>XP_016881584 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip (303 aa)
initn: 812 init1: 361 opt: 893 Z-score: 1102.0 bits: 212.7 E(85289): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 893; 42.8% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (199-494:1-297)
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
.:::. .:::::::.:::..::.:: .
XP_016 MFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-F
10 20
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
:::.::..:.:: :.:::::.::::: . .. :: ...::...:: :::.::::.:
XP_016 GLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVD
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
::.. :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::.... .......: ::: :
XP_016 SLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMP
90 100 110 120 130 140
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FKVYHYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLD
:.:::::.::. : .. :. :: ..: ::. : .:. . . : .: : .::. .
XP_016 FRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTE
150 160 170 180 190 200
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VDIGELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRM
:.:.:. :.. ::. : : :.: .. . . ::. : : .. ::::.::::...
XP_016 EDLGDLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKL
210 220 230 240 250 260
470 480 490
pF1KB5 TFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
:::.:. .. . : .: : ::. .:..::
XP_016 TFCTEDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
270 280 290 300
499 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 18:37:34 2016 done: Sat Nov 5 18:37:35 2016
Total Scan time: 8.290 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]