Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5895
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5895, 499 aa
1>>>pF1KB5895 499 - 499 aa - 499 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6593+/-0.000995; mu= 15.6537+/- 0.060
mean_var=65.8797+/-13.169, 0's: 0 Z-trim(103.5): 20 B-trim: 27 in 1/51
Lambda= 0.158015
statistics sampled from 7448 (7461) to 7448 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 ( 499) 3359 775.0 0
CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 500) 1392 326.6 3.8e-89
CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 ( 475) 1249 294.0 2.4e-79
CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 ( 467) 708 170.7 3.1e-42
CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 ( 465) 679 164.1 3.1e-40
CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 ( 467) 649 157.2 3.5e-38
CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 ( 426) 635 154.0 3e-37
CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3 ( 451) 437 108.9 1.2e-23
CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21 ( 481) 425 106.2 8.5e-23
CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 456) 387 97.5 3.3e-20
CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 440) 386 97.3 3.7e-20
CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3 ( 283) 263 69.2 6.9e-12
>>CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15 (499 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359 Z-score: 4137.3 bits: 775.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3359; 99.6% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
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CCDS10 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
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CCDS10 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
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CCDS10 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQF
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CCDS10 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB5 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
:::::::::::::::::::
CCDS10 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
490
>>CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18 (500 aa)
initn: 1299 init1: 361 opt: 1392 Z-score: 1713.9 bits: 326.6 E(32554): 3.8e-89
Smith-Waterman score: 1392; 42.9% identity (71.4% similar) in 503 aa overlap (6-494:8-494)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNK-TLHEMK--TRFLLF
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CCDS11 MSNSVPLLCF---WSLCYCF---AAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GETN---QGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPA
. .:: . ..: . :..:.:: . .:::::...:..:::. ..:.::...
CCDS11 TSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAH
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CCDS11 KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSV
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CCDS11 VAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLH
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CCDS11 GIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVN
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVY
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CCDS11 QDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 HYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIG
:::.::. : .. :. :: ..: ::. : .:. . . : .: : .::. . :.:
CCDS11 HYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB5 ELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
.:. :.. ::. : : :.: .. . . ::. : : .. ::::.::::...:::.
CCDS11 DLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCT
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB5 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR
:. .. . : .: : ::. .:..::
CCDS11 EDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
470 480 490 500
>>CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8 (475 aa)
initn: 1308 init1: 794 opt: 1249 Z-score: 1538.0 bits: 294.0 E(32554): 2.4e-79
Smith-Waterman score: 1353; 44.3% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (38-495:27-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 FSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQG---CQI
:.. . . .....: : . . :..
CCDS60 MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAAL-KSQPAQPVNVGLVDWI
. ... : :: : :.::::.: :. :.:. ..:::: : .: . :: .:::.
CCDS60 IPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDS--NVIVVDWL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGG
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CCDS60 SRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTN-
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 THKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDF
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CCDS60 -KKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCG
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CCDS60 YPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFIN-
. ..: .::::::.:.:::.:::.. . ..:....: ::.: :.::.:::.::.: .
CCDS60 SKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN
..:: . .: .:: :: . ..::.:: . ...:::::::: .::::::.:.:.::..
CCDS60 ESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEK
.. .. :. : ..: :.... :::::::::... :::.. . : .
CCDS60 DSYFS--WS------DWWSSP---GFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPA
420 430 440 450 460
490
pF1KB5 IFVKCEIKSKTSKRKIR
.::::. :: ..:
CCDS60 VFVKCHDKSLNKKSG
470
>>CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 394 init1: 166 opt: 708 Z-score: 871.6 bits: 170.7 E(32554): 3.1e-42
Smith-Waterman score: 708; 35.4% identity (64.9% similar) in 387 aa overlap (47-421:51-421)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 FIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQGCQIRIN--HPDTLQE
...:::::. : . .:. . .:.:
CCDS31 CYERLGCFKDGLPWTRTFSTELVGLPWSPEKINTRFLLYTIHNPNAYQEISAVNSSTIQA
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 CGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAV
:... . : ::..:: .: .: .: . . .: .:::. ... : ::
CCDS31 SYFGTDKITRINIAGWKTDG---KWQRDMCNVLLQL--EDINCINLDWINGSRE-YIHAV
90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLD
: :.:: ::: .. : .. . : :.:::::.:::::..: ::: : : .:::::::
CCDS31 NNLRVVGAEVAYFIDVLMKKFEYSPSKVHLIGHSLGAHLAGEAGSRIPG---LGRITGLD
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 AAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHT-FTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPG
:::.:... ::.:.::.:::.::: .: . :.:: . :: :::::::. .::
CCDS31 PAGPFFHNTPKEVRLDPSDANFVDVIHTNAARILFELGVGTIDACGHLDFYPNGGKHMPG
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300
pF1KB5 CHFLELYRHIAQHGFNAITQTIK----CSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFS
:. .: . . .::: . . :.: :: ... .:.:. . .:::: ...::.
CCDS31 CE--DLITPLLKFNFNAYKKEMASFFDCNHARSYQFYAESILNPDA-FIAYPCRSYTSFK
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QGLCLSCKKGRCNTLG-----YHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFINQT
: :. :.: : :.: .: .. ...... :: : . ::: ....:... .. .
CCDS31 AGNCFFCSKEGCPTMGHFADRFHFKNM-KTNGSHYFLNTGSLSPFARWRHKLSVK-LSGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSA
:. :.: . . :. .: .. :. :: . . ::. :: ::..:.. ..: :.
CCDS31 EVTQGTVF-LRVGGAVRKTGEFAIVSGK-LEPGMTYTKLIDADVNVGNITSVQFIWKKHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIF
CCDS31 FEDSQNKLGAEMVINTSGKYGYKSTFCSQDIMGPNILQNLKPC
430 440 450 460
>>CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10 (465 aa)
initn: 518 init1: 186 opt: 679 Z-score: 835.9 bits: 164.1 E(32554): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 679; 33.2% identity (63.1% similar) in 385 aa overlap (47-425:50-424)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 FIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETN-QGCQIRINHPDTLQEC
...:::::. . : .. : ....
CCDS75 CYERLGCFSDDSPWSGITERPLHILPWSPKDVNTRFLLYTNENPNNFQEVAADSSSISGS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 GFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVR
.:... .::::. .: :::. .. : . .. :: ::: .. :: : .
CCDS75 NFKTNRKTRFIIHGF-IDKGEENWLANVCKNLFK--VESVNCICVDWKGGSRTGYTQASQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 NTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDA
: :.:: ::: ....:. . : :.::.::.:::::..: :: .:: ::::::::
CCDS75 NIRIVGAEVAYFVEFLQSAFGYSPSNVHVIGHSLGAHAAGEAGRRTNGT--IGRITGLDP
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 AGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM-GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGC
: : :.:. ::.:.::.:::.::: . .:. :..: .:: ::.:::: .:::
CCDS75 AEPCFQGTPELVRLDPSDAKFVDVIHTDGAPIVPNLGFGMSQVVGHLDFFPNGGVEMPGC
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 HFLELYRHIAQHGFNAITQTIK-CSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLC
. : . . :. :. . :.: :: . . ::... . ..::...: :. . :
CCDS75 KKNILSQIVDIDGIWEGTRDFAACNHLRSYKYYTDSIVNPDGFA-GFPCASYNVFTANKC
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKS---KRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFINQTETPIQT
. : .: : .:... . : . . ....: : : : ..:.... . .. .
CCDS75 FPCPSGGCPQMGHYADRYPGKTNDVGQKFYLDTGDASNFARWRYKVSVTLSGKK---VTG
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 TFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSAVWANVW
. .::.:.: . .. : : . ..:.: . :::.:.: :.:: : :...
CCDS75 HILVSLFGNKGNSKQYEIFKGT-LKPDSTHSNEFDSDVDVGDLQMVKFIWYNNVINPTLP
380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 DTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIK
CCDS75 RVGASKIIVETNVGKQFNFCSPETVREEVLLTLTPC
430 440 450 460
>>CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10 (467 aa)
initn: 367 init1: 185 opt: 649 Z-score: 798.9 bits: 157.2 E(32554): 3.5e-38
Smith-Waterman score: 669; 33.0% identity (58.7% similar) in 467 aa overlap (23-476:25-462)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTL----HEMKTRFLL
:: ::.: . :.. : : ... :::::
CCDS75 MLIFWTITLFLLGAAKGKEVCYEDLGCFSDTEPWG--GTAIRPLKILPWSPEKIGTRFLL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FGETN-QGCQIRI-NHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPA
. . : .. :: . . :.:.. .:. . .::::. .: :.:. .: : .
CCDS75 YTNENPNNFQILLLSDPSTIEASNFQMDRKTRFIIHGF-IDKGDESWVTDMCKKLFE--V
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAH
. :: ::: .. :: :. :.:.:: .:: .: : . :.:::::.:::::
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CCDS75 VAGEAGSKTPG---LSRITGLDPVEASFESTPEEVRLDPSDADFVDVIHTDAAPLIPFLG
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: ..: ..: . ..: : . ..:.:.: . .. : : . ..:.:. .
CCDS75 NFARWRYGVSITLSGRTAT---GQIKVALFGNKGNTHQYSIFRGI-LKPGSTHSYEFDAK
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CCDS75 LDVGTIEKVKFLWNN-----NV------INP--TLPKVGA---TKITVQKGEEKTVYNFC
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CCDS75 SEDTVREDTLLTLTPC
460
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CCDS77 EDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
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CCDS32 TVFQPILCPELQL
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CCDS29 GQLFGG--QLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTD-----NLGIRIP
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CCDS29 MHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKIT-IPKQQRYGKGIIAHATPQCQIN-
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499 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 18:37:33 2016 done: Sat Nov 5 18:37:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]