Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6572
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6572, 400 aa
  1>>>pF1KB6572 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7933+/-0.000954; mu= 14.9142+/- 0.057
 mean_var=138.9891+/-50.848, 0's: 0 Z-trim(106.8): 235  B-trim: 1119 in 2/48
 Lambda= 0.108789
 statistics sampled from 8787 (9192) to 8787 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.282), width:  16
 Scan time:  2.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400) 2660 429.6 2.4e-120
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367) 1910 311.9 6.2e-85
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  898 153.2 4.6e-37
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  896 152.8 5.4e-37
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11           ( 419)  596 105.7 8.2e-23
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  487 88.6 1.2e-17
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  478 87.1 2.7e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  468 85.7 9.7e-17
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  467 85.5   1e-16
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  467 85.5 1.1e-16
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  467 85.5 1.1e-16
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  455 83.6   4e-16
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  453 83.3 4.9e-16
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  431 79.8 4.9e-15
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  431 79.9 5.4e-15
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  410 76.6 5.4e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  385 72.7 8.2e-13
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  382 72.1 9.5e-13
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  380 71.8 1.3e-12
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  373 70.8 3.1e-12
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  372 70.6 3.2e-12
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  361 68.9 1.1e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  357 68.2 1.6e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  344 66.2   7e-11


>>CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                 (400 aa)
 initn: 2660 init1: 2660 opt: 2660  Z-score: 2274.0  bits: 429.6 E(32554): 2.4e-120
Smith-Waterman score: 2660; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KB6 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
              370       380       390       400

>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                (367 aa)
 initn: 1910 init1: 1910 opt: 1910  Z-score: 1638.3  bits: 311.9 E(32554): 6.2e-85
Smith-Waterman score: 2372; 91.5% identity (91.8% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-367)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTGDPTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::              
CCDS33 QTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSL--------------
              250       260       270       280                    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
                          .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 -------------------MPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHV
                           290       300       310       320       

              370       380       390       400
pF1KB6 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
       330       340       350       360       

>>CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11                (443 aa)
 initn: 1091 init1: 303 opt: 898  Z-score: 779.0  bits: 153.2 E(32554): 4.6e-37
Smith-Waterman score: 1245; 53.4% identity (71.1% similar) in 425 aa overlap (19-394:23-437)

                   10        20         30        40        50     
pF1KB6     MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
                             :.. ..  :::  :::     :: .::::: :::::: 
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
       .:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:  :.:::: ::.::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGE-WKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
               70        80        90        100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
       :::::::::::::::::.::. :.  :  :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS83 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLYN--TRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
     120       130       140         150       160       170       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB6 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQC----
        : . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:.     
CCDS83 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
        180       190       200       210        220       230     

                                  240           250                
pF1KB6 -------NSVRP--------------GFPQQTLSPDPAH----LELK-----------RY
              : ..:              .:: .    . :.    ::..           ::
CCDS83 LRAPLKGNCTHPEDMKLCTVIMKSNGSFPVNRRRVEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRY
         240       250       260       270       280       290     

            260          270       280        290       300        
pF1KB6 YSI---CQDTALGGP---GFQERGGELKREEKTRNSLS-PTIAPKLSLEVRKLSNGRLST
         :    .. .:  :   :..       . ::. .. . : :: :. .:.. . ::.  :
CCDS83 SPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHAKDHPKIA-KI-FEIQTMPNGKTRT
         300       310       320       330        340        350   

      310       320        330       340       350       360       
pF1KB6 SLKLGPLQPRGVPL-REKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSA
       :::   .. : .   .:::::::.:::::.::.::::::.::.:: ::. :.. : ::::
CCDS83 SLKT--MSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSA
             360       370       380       390       400        410

       370       380       390       400
pF1KB6 TTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
        :::::::::.::.:::::::::::::      
CCDS83 FTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC
              420       430       440   

>>CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11                (414 aa)
 initn: 1057 init1: 303 opt: 896  Z-score: 777.6  bits: 152.8 E(32554): 5.4e-37
Smith-Waterman score: 1323; 56.7% identity (75.1% similar) in 402 aa overlap (19-400:23-414)

                   10        20         30        40        50     
pF1KB6     MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPH-AYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
                             :.. ..  :::  :::     :: .::::: :::::: 
CCDS83 MDPLNLSWYDDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVS
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
       .:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:  :.:::: ::.::::::::::
CCDS83 REKALQTTTNYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGE-WKFSRIHCDIFVTLDVMMCT
               70        80        90        100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
       :::::::::::::::::.::. :  .:  :: :::..::. ::::.:..:::::::.:..
CCDS83 ASILNLCAISIDRYTAVAMPMLY--NTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGLNNA
     120       130       140         150       160       170       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB6 GDPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVR
        : . : :.:: ::.:::.::::.:: ::.::: .::.::. :::::. :...:.   ..
CCDS83 -DQNECIIANPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLR-RRRKRVNTKRSSRAFRAH
        180       190       200       210        220       230     

         240       250                     260          270        
pF1KB6 PGFPQQTLSPDPAHLELK-----------RYYSI---CQDTALGGP---GFQERGGELKR
          : .  .    .::..           ::  :    .. .:  :   :..       .
CCDS83 LRAPLKEAARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAK
         240       250       260       270       280       290     

      280        290       300       310       320        330      
pF1KB6 EEKTRNSLS-PTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPL-REKKATQMVAIVLG
        ::. .. . : :: :. .:.. . ::.  ::::   .. : .   .:::::::.:::::
CCDS83 PEKNGHAKDHPKIA-KI-FEIQTMPNGKTRTSLK--TMSRRKLSQQKEKKATQMLAIVLG
         300        310        320         330       340       350 

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB6 AFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLK
       .::.::::::.::.:: ::. :.. : :::: :::::::::.::.:::::::::::::::
CCDS83 VFIICWLPFFITHILNIHCD-CNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLK
             360       370        380       390       400       410

        400
pF1KB6 ILSC
       :: :
CCDS83 ILHC
           

>>CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11                (419 aa)
 initn: 871 init1: 403 opt: 596  Z-score: 523.1  bits: 105.7 E(32554): 8.2e-23
Smith-Waterman score: 884; 40.9% identity (63.7% similar) in 408 aa overlap (16-400:21-418)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB6      MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVL
                           ::  ...:. :   :   ..   :: :.. ::.:::..: 
CCDS77 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAGQGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLVCVSVA
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB6 KERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCT
        :::::: :: ..::::.::::.: ::.:  :: :: ::.: .:   ::.....:::.::
CCDS77 TERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMDVMLCT
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB6 ASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTT
       :::.::::::.::..::..:..:..   :.. ::  :.: :.:.:. ::. :.: :.: .
CCDS77 ASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNR---QGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLNDV
              130       140          150       160       170       

           180       190       200       210          220       230
pF1KB6 -G-DPTVCSISNPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQ---RRRKRILTRQNSQ
        : ::.:: . . :.:.:::: ::.::  . .:.:   .  :..    :: ..  :   .
CCDS77 RGRDPAVCRLEDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGRAPRR
       180       190       200       210       220       230       

              240       250       260             270       280    
pF1KB6 CNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALG------GPGFQERGGELKREEKTRN
        ..  :: :. :  : : .:        :   : :      ::     .  : ..    .
CCDS77 PSG--PGPPSPT-PPAP-RLPQDPCGPDCAPPAPGLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGPD
       240          250        260       270       280       290   

          290       300       310       320                  330   
pF1KB6 SLSPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPL-----------REKKATQMVAI
          :  :: :  .    ::     ... . : :.  :            ::.:: ... .
CCDS77 CAPP--APGLPPDPCG-SNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKAMRVLPV
             300        310       320       330       340       350

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB6 VLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKA
       :.:::..:: :::..:. .. : .: : :.: ::.::::::::::::::::.:: :::..
CCDS77 VVGAFLLCWTPFFVVHITQALCPACSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVFNAEFRNV
              360       370       380       390       400       410

            400 
pF1KB6 FLKIL-SC 
       : : : .: 
CCDS77 FRKALRACC
                

>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5               (422 aa)
 initn: 602 init1: 185 opt: 487  Z-score: 430.6  bits: 88.6 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 734; 32.8% identity (65.7% similar) in 408 aa overlap (19-400:24-417)

                    10        20          30        40        50   
pF1KB6      MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARP--HAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMA
                              :.:: :..    ..  .:   .::.  :.::. :  :
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 VLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMM
       .  ::.::...:::. ::::.::.:..::.: ..  .: .  :..... ::.:..:::. 
CCDS34 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNK-WTLGQVTCDLFIALDVLC
               70        80        90       100        110         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 CTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFN
       ::.:::.::::..::: :.. :. :   ... . ::.: .:. .:...: .: : ..:. 
CCDS34 CTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDY---VNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR
     120       130       140          150       160       170      

              180        190       200       210       220         
pF1KB6 TT---GDPTVCSIS-NPDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNS
       :    .:: .:.:: .  ..:::.  .::.:. . ...:.::. . . : :: .   ...
CCDS34 TPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKT
        180       190       200       210       220       230      

     230            240             250       260         270      
pF1KB6 QCNSVRPGF-----PQQTLSPDPAH------LELKRYYSICQDTAL--GGPGFQERGGEL
         .. : :      :..... . .       .: :   ..: . :.  :  :   .  :.
CCDS34 GADT-RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEV
        240        250       260       270       280       290     

        280             290       300       310       320       330
pF1KB6 KREEKTRNSL------SPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQM
       .:  .... :      .::     :.: ..  :.. . .. :.         ::.:... 
CCDS34 HRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALA---------RERKTVKT
         300       310       320       330                340      

              340       350        360       370       380         
pF1KB6 VAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQT-CHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIE
       ..:..:.::.::::::.. ..   :.. ::.   : .  .:::: :: ::::::. :: .
CCDS34 LGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKD
        350       360       370       380       390       400      

     390       400     
pF1KB6 FRKAFLKILSC     
       :..:: ::..:     
CCDS34 FQNAFKKIIKCKFCRQ
        410       420  

>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (342 aa)
 initn: 363 init1: 250 opt: 478  Z-score: 424.0  bits: 87.1 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 520; 34.0% identity (61.9% similar) in 312 aa overlap (39-347:36-290)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB6 GHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLV
                                     :::  :.:: :: ..:  .: :...:.: .
CCDS83 GNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYI
          10        20        30        40        50        60     

       70        80        90       100       110       120        
pF1KB6 VSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDR
       :.:::::::... :.:. . .:: :  : :.:. :......::. :::::..:: :::::
CCDS83 VNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLG-YWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDR
          70        80        90        100       110       120    

      130       140       150       160       170         180      
pF1KB6 YTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFGFNTTG--DPTVCSISN-
       : .: .:..:   . :   ::  . .  ::.:....:   :::.   .  : :.:.:.. 
CCDS83 YIGVSYPLRYPTIVTQ---RRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEE
          130       140          150       160       170       180 

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB6 PDFVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQQTLSP
       : .:..:.. :::::... ...: :.::: :.. :            ... :.  .  . 
CCDS83 PGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESR------------GLKSGLKTDKSDS
             190       200       210                   220         

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB6 DPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRKLSNGR
       . . :...:     ...  :: :.           ::.. .:          :: :   .
CCDS83 EQVTLRIHR-----KNAPAGGSGMA--------SAKTKTHFS----------VRLL---K
     230            240               250                 260      

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB6 LSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELY
       .:               :::::.. ..::.: :..:::::::                  
CCDS83 FS---------------REKKAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIDEETEAQEGKNDSP
                          270       280       290       300        

         370       380       390       400
pF1KB6 SATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC
                                          
CCDS83 SFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW 
      310       320       330       340   

>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10               (465 aa)
 initn: 722 init1: 164 opt: 468  Z-score: 414.0  bits: 85.7 E(32554): 9.7e-17
Smith-Waterman score: 660; 34.5% identity (58.4% similar) in 449 aa overlap (1-393:16-451)

                              10        20        30             40
pF1KB6                MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYA-LSY-CA---LI
                      :.::.  .:. ... :.:   :...: :..  . :.  :    :.
CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASWN-GTEAPGGGARATPYSLQVTLTLVCLAGLLM
               10        20         30        40        50         

               50        60        70        80        90       100
pF1KB6 LAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSR
       :  :::: :: .::.  :::..  : ..:::: ::.::::::.:. .  :: :  : :..
CCDS75 LLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEVMG-YWYFGK
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KB6 ICCDVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVL
         :.....:::..::.::..:::::.::: .... ..:.    . . ::.  .: .:::.
CCDS75 AWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNL---KRTPRRIKAIIITVWVI
      120       130       140       150          160       170     

              170            180         190        200       210  
pF1KB6 AFAVSCPLLFGFNTTG-----DPTV--CSISNPDFVIYSSVV-SFYLPFGVTVLVYARIY
       . ..: : :....  :     .:.   : :..  . . :: . ::. :  . .:::.:::
CCDS75 SAVISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEINDQKWYVISSCIGSFFAPCLIMILVYVRIY
         180       190       200       210       220       230     

            220                        230             240         
pF1KB6 VVLKQRRR----KR-----------ILTRQNS--QCNSVRPG------FPQQTLS----P
        . :.: :    .:              : :.     :. ::      .: :  .    :
CCDS75 QIAKRRTRVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQLNGAPGEP
         240       250       260       270       280       290     

               250       260       270       280       290         
pF1KB6 DPAH------LELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEKTRNSLSPTIAPKLSLEVR
        ::       :.:..  :  .     ::   ::: . :   :.: :    . :  ::  :
CCDS75 APAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKG--KARAS---QVKPGDSLPRR
         300       310       320       330            340       350

     300       310                 320       330       340         
pF1KB6 KLSNGRLSTSLKLGPLQPR----------GVPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTH
         .   ..:    :: . :          :   :::. : ..:.:.:.:.:::.:::.:.
CCDS75 GPGATGIGTP-AAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFTY
              360        370       380       390       400         

     350       360       370       380       390       400       
pF1KB6 VLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC       
       .:..    : :   :..   :.:: ::.::::::: :: .::.:              
CCDS75 TLTA--VGCSVPRTLFKFFFWFGYCNSSLNPVIYTIFNHDFRRAFKKILCRGDRKRIV
     410         420       430       440       450       460     

>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 649 init1: 320 opt: 467  Z-score: 413.5  bits: 85.5 E(32554): 1e-16
Smith-Waterman score: 622; 36.1% identity (57.8% similar) in 396 aa overlap (15-400:70-401)

                               10        20        30        40    
pF1KB6                 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALI-LAI
                                     :: . . :    : .     :  .:: :  
CCDS74 VAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYG----RVEKVVIGSILTLITLLT
      40        50        60        70            80        90     

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB6 VFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICC
       . :: :: ..:   . :.  .:::.::::.::: ::. :::.:   .. :: : :... :
CCDS74 IAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFC
         100       110       120       130       140       150     

           110       120       130          140       150       160
pF1KB6 DVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHY---QHGTGQSSCRRVALMITAVWVL
       .::...::: :::::..::.:::::: ... :. :   :.:    .:  .: :: .::.:
CCDS74 NVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNG----KC--MAKMILSVWLL
         160       170       180       190             200         

              170        180         190       200       210       
pF1KB6 AFAVSCPLLFGF-NTTGDPTVCSISNPDF--VIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQ
       . ... : :::. ....:  :: ::. ::  .:::..:.::.:..: ...: .::   : 
CCDS74 SASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQ-DFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIY---KA
     210       220       230        240       250       260        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB6 RRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELK
        :.        :  .   ::::.  . :: .              ::.:           
CCDS74 ARK--------SAAKHKFPGFPR--VEPDSV-------------IALNG-----------
                 270       280                      290            

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB6 REEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGA
                      ::. ::.. .:  ::  ::    .  ..  ::.::.  ..:..::
CCDS74 -------------IVKLQKEVEECAN--LSRLLK-HERKNISIFKREQKAATTLGIIVGA
                          300         310        320       330     

       340       350         360        370       380       390    
pF1KB6 FIVCWLPFFLTHVLNTH-CQT-CHVSPELYSAT-TWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAF
       : ::::::::  .     : : :   :     :  ::::.:: .:: ::. :: ..: ..
CCDS74 FTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTY
         340       350       360       370       380       390     

          400                               
pF1KB6 LKILSC                               
        ..:.:                               
CCDS74 RSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
         400       410       420       430  

>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (445 aa)
 initn: 649 init1: 320 opt: 467  Z-score: 413.4  bits: 85.5 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 622; 36.1% identity (57.8% similar) in 396 aa overlap (15-400:70-401)

                               10        20        30        40    
pF1KB6                 MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALI-LAI
                                     :: . . :    : .     :  .:: :  
CCDS74 VAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYG----RVEKVVIGSILTLITLLT
      40        50        60        70            80        90     

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB6 VFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSRICC
       . :: :: ..:   . :.  .:::.::::.::: ::. :::.:   .. :: : :... :
CCDS74 IAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFC
         100       110       120       130       140       150     

           110       120       130          140       150       160
pF1KB6 DVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHY---QHGTGQSSCRRVALMITAVWVL
       .::...::: :::::..::.:::::: ... :. :   :.:    .:  .: :: .::.:
CCDS74 NVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNG----KC--MAKMILSVWLL
         160       170       180       190             200         

              170        180         190       200       210       
pF1KB6 AFAVSCPLLFGF-NTTGDPTVCSISNPDF--VIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQ
       . ... : :::. ....:  :: ::. ::  .:::..:.::.:..: ...: .::   : 
CCDS74 SASITLPPLFGWAQNVNDDKVCLISQ-DFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIY---KA
     210       220       230        240       250       260        

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB6 RRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELK
        :.        :  .   ::::.  . :: .              ::.:           
CCDS74 ARK--------SAAKHKFPGFPR--VEPDSV-------------IALNG-----------
                 270       280                      290            

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB6 REEKTRNSLSPTIAPKLSLEVRKLSNGRLSTSLKLGPLQPRGVPLREKKATQMVAIVLGA
                      ::. ::.. .:  ::  ::    .  ..  ::.::.  ..:..::
CCDS74 -------------IVKLQKEVEECAN--LSRLLK-HERKNISIFKREQKAATTLGIIVGA
                          300         310        320       330     

       340       350         360        370       380       390    
pF1KB6 FIVCWLPFFLTHVLNTH-CQT-CHVSPELYSAT-TWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAF
       : ::::::::  .     : : :   :     :  ::::.:: .:: ::. :: ..: ..
CCDS74 FTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTY
         340       350       360       370       380       390     

          400                                            
pF1KB6 LKILSC                                            
        ..:.:                                            
CCDS74 RSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGHDS
         400       410       420       430       440     




400 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 18:12:31 2016 done: Sat Nov  5 18:12:31 2016
 Total Scan time:  2.950 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com