Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8560, 910 aa
1>>>pF1KB8560 910 - 910 aa - 910 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1039+/- 0.001; mu= 22.2717+/- 0.060
mean_var=65.5904+/-12.716, 0's: 0 Z-trim(104.1): 61 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.158363
statistics sampled from 7688 (7749) to 7688 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 910) 6121 1408.0 0
CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 726) 4889 1126.5 0
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 1045 248.2 4.2e-65
CCDS56546.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 117) 697 168.2 8e-42
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 485 120.5 2.4e-26
CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250) 476 118.4 8.6e-26
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 474 117.9 1e-25
CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10 (1849) 476 118.5 1.2e-25
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 426 106.9 2.1e-22
CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9 ( 712) 404 101.8 4.9e-21
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 391 98.8 3.8e-20
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 391 98.8 3.8e-20
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 391 98.8 4e-20
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 391 98.8 4.4e-20
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 395 100.0 4.5e-20
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 395 100.0 4.5e-20
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 391 98.9 4.6e-20
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 394 99.9 8.1e-20
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 391 99.1 8.7e-20
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 391 99.1 8.8e-20
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 391 99.1 9.1e-20
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 390 98.8 1e-19
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 387 98.1 1.5e-19
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 386 97.9 1.8e-19
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 387 98.2 1.9e-19
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 387 98.2 2e-19
CCDS892.1 TTF2 gene_id:8458|Hs108|chr1 (1162) 381 96.6 2.8e-19
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 377 95.8 6.8e-19
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 377 95.8 6.8e-19
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 377 95.8 6.8e-19
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 377 95.8 6.8e-19
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 369 93.7 1.1e-18
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 369 93.8 1.2e-18
CCDS58914.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 ( 596) 368 93.5 1.3e-18
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 369 93.8 1.4e-18
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 372 94.7 1.5e-18
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 369 93.8 1.5e-18
CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467) 370 94.2 1.9e-18
CCDS3639.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1026) 368 93.6 2e-18
CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1028) 368 93.6 2e-18
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 370 94.2 2.1e-18
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 367 93.7 5.3e-18
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 367 93.7 5.3e-18
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 364 93.0 8.2e-18
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 363 92.8 1e-17
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 351 89.9 4e-17
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 351 89.9 4.1e-17
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 351 89.9 4.1e-17
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 316 81.8 7.6e-15
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 316 81.8 7.7e-15
>>CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 (910 aa)
initn: 6121 init1: 6121 opt: 6121 Z-score: 7548.7 bits: 1408.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6121; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVHSAPKEVAVSKEQEEKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVHSAPKEVAVSKEQEEKSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 PKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 SIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 KAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 SLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIF
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 QNITTQATGT
::::::::::
CCDS62 QNITTQATGT
910
>>CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 (726 aa)
initn: 4889 init1: 4889 opt: 4889 Z-score: 6028.9 bits: 1126.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4889; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (185-910:1-726)
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEEGQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGS
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 TAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQW
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTL
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 QCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKV
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 EEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEK
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 RIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGER
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 RAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQG
340 350 360 370 380 390
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 LLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPL
400 410 420 430 440 450
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 LFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQT
460 470 480 490 500 510
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 PISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRV
520 530 540 550 560 570
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 WRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFT
580 590 600 610 620 630
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 LHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQW
640 650 660 670 680 690
880 890 900 910
pF1KB8 KHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT
700 710 720
>>CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 (747 aa)
initn: 1572 init1: 554 opt: 1045 Z-score: 1282.3 bits: 248.2 E(32554): 4.2e-65
Smith-Waterman score: 1673; 43.1% identity (66.8% similar) in 708 aa overlap (218-901:68-736)
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKE---NR
:. :. .:.::: : :. . .:
CCDS53 SSETQIQECFLSPFRKPLSQLTNQPPCLDSSQHEAFIRSILSKPFK-VPIPNYQGPLGSR
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290
pF1KB8 QNDFQNCKPR---HDPYTPNSLVM--PRPDKNH-QWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRP
.. : ::: ..::. : : . : : ..:. .: : ::.:: : :::
CCDS53 ALGLKRAGVRRALHDPLEKDALVLYEPPPLSAHDQLKLDKEKLP-VHVVVDPILSKVLRP
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 HQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKT
::.::. ::.::: . :. : : :.:::::::::::::.:.::: :.: :: : :.
CCDS53 HQREGVKFLWECVTSRRIPGSHGCIMADEMGLGKTLQCITLMWTLLRQSPEC-KPEIDKA
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400
pF1KB8 LIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQ------DHKVEEFIKS----IFYSVLII
..:.:.:::.:: .: ::::. ::. ...: :.:.: :... . .:::
CCDS53 VVVSPSSLVKNWYNEVGKWLGG-RIQPLAIDGGSKDEIDQKLEGFMNQRGARVSSPILII
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 SYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQ
::: . . ... . :.::::::::::: .: :: ::. .:....::::::::
CCDS53 SYETFRLHVGVLQKGSVGLVICDEGHRLKNSENQTYQALDSLNTSRRVLISGTPIQNDLL
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 EFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFIL
:.:.:. ::: ::::. ..: .: ::. .:. .::: ...:::.: ::: ... ..
CCDS53 EYFSLVHFVNSGILGTAHEFKKHFELPILKGRDAAASEADRQLGEERLRELTSIVNRCLI
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 RRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLL-NSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGA
:::..:..:::: :::.:: :: :: :::...: ... .. :.: . : : : .
CCDS53 RRTSDILSKYLPVKIEQVVCCRLTPLQTELYKRFLRQAKPAEELLEGKMSVSS-LSSITS
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pF1KB8 LKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVL
:::::::: :... .: ::.. . : :..:: :. . . :::. ::
CCDS53 LKKLCNHPALIYD-----KCV------EEEDGFVGALDLFPPGYSSKALEPQLSGKMLVL
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pF1KB8 SKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFN
. .::: . : ..::::::::::::......:. . : :.:::: :..: ..:. ::
CCDS53 DYILAVTRS-RSSDKVVLVSNYTQTLDLFEKLCRARRYLYVRLDGTMSIKKRAKVVERFN
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pF1KB8 SQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYR
: : :.:.::::::: ::::::...:...: :::::.: :::.:::::::: .:::
CCDS53 SPSSPDFVFMLSSKAGGCGLNLIGANRLVMFDPDWNPANDEQAMARVWRDGQKKTCYIYR
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pF1KB8 LLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLL
::..:::::::.::: :..: . ::: . :. .::. :::.:: : :.: ::: :
CCDS53 LLSAGTIEEKIFQRQSHKKALSSCVVDEEQDVER-HFSLGELKELFILDEASLSDTHDRL
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pF1KB8 DCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDP
:. . . :: :. : . :. :.: :.: . :. .: :
CCDS53 HCR-------------RCVNSR--QIRPPPDGSDCT-----SDLAGWNHCT-DKWGLRDE
680 690 700 710
890 900 910
pF1KB8 FLERI----TENVSFIFQNITTQATGT
:. . ..:.:.
CCDS53 VLQAAWDAASTAITFVFHQRSHEEQRGLR
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CCDS56 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..
CCDS56 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVQTWMRRHRLVPVHYR
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pF1KB8 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE
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CCDS72 VKEFHTWWPPFRVAILHETGSYTHKKEKLIRDVAHCHGILITSYSYIRLMQDDISRYDWH
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. . . :: .. .:: . . . . : : . ..::: . .. : : : :
CCDS72 VFMEQFSVPITMGGYSNASPVQVKTAYKCACVLRDTINPYLLRRMKSDVKMSLSLPDKNE
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.:.::: : ..:.....:. : :.: .. :: ::.:.:::: :. :
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:. .. : . :.. . : :.:::. :. .:: . : . ..:.
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pF1KB8 LVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGG
: :. : :.::. . . :.: ..:: : :..:: .. .: . .:.:.:::....::
CCDS72 LFSQSRQMLDILEVFLRAQKYTYLKMDGTTTIASRQPLITRYN-EDTSIFVFLLTTRVGG
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pF1KB8 VGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQIS
.:.:: :......:: ::::.:: :: :.:: ::: : .:::::.::::::::.:::
CCDS72 LGVNLTGANRVVIYDPDWNPSTDTQARERAWRIGQKKQVTVYRLLTAGTIEEKIYHRQIF
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pF1KB8 KQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEK
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CCDS72 KQFLTNRVLKDPKQRRF--FKSNDLYELFTLTSPDASQSTETSAIFAGTGSDVQTPKCHL
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CCDS72 KRRIQPAFGADHDVPKRKKFPASNISVNDATSSEEKSEAKGAEVNAVTSNRSDPLKDDPH
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CCDS35 CNSGLLLYRELHNQLFEHQKEGIAFLY----SLYRDGRKGGILADDMGLGKTVQIIAFL-
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pF1KB8 TLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFT-VDQDHKVEEFIK-
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CCDS35 ----SGMFDAS-LVNHVLLIMPTNLINTWVKEFIKWTPGMRVKTFHGPSKDERTRNLNRI
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. . .: . ..::::.: ..: .: : . ...
CCDS35 KISENLMAIIKPYFLRRTKEDVQKKKSSNPEARLNEKNPDVDAICEMPSLSRKNDLIIWI
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: :: :.:::... . .. . :.:. : .:.:::::.:: :: . . :
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CCDS35 LNLGTFSAQDGNEGED-SPDVDHIDQVTDDTLM---EESGKMIFLMDLL---KRLRDEGH
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pF1KB8 VVLV-SNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQ-TPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
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CCDS35 QTLVFSQSRQILNIIERLLKNRHFKTLRIDGTVTHLLEREKRINLFQ-QNKDYSVFLLTT
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CCDS35 QVGGVGLTLTAATRVVIFDPSWNPATDAQAVDRVYRIGQKENVVVYRLITCGTVEEKIYR
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pF1KB8 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
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CCDS35 RQVFKDSLIRQTTG-EKKNPFRYFSKQELRELFTIEDLQNSVTQLQLQSLHAAQRKSDIK
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CCDS35 LDEHIAYLQSLGIAGISDHDLMYTCDLSVKEELDVVEESHYIQQRVQKAQFLVEFESQNK
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CCDS76 EDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWL----ISLYENGVNG-ILA
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CCDS76 DEMGLGKTLQTIALLGYLK---HYRNIP--GPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVIC
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CCDS76 FVGDKDARAA-FIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKS
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pF1KB8 KTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSRE
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CCDS76 KLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLG--
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pF1KB8 PSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRK
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CCDS76 ------DQKLVERLHAVLKP----FLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTK
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CCDS76 ILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHP-YLFDGA-EPGPPYTTDEH-------
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pF1KB8 GLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCK
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CCDS76 -IVS--------------NSGKMVVLDKLLAKLKE--QGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCM
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pF1KB8 RHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDID
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CCDS76 WRGYEYCRLDGQTPHEEREEAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD
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CCDS76 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ
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CCDS76 QSNKLAKEEMLQMIR-HGATHVFASK--ESELTDEDITT--ILERG-EKKTAEMNERLQK
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pF1KB8 --SNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT
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CCDS76 MGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRV
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pF1KB8 PRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILA
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CCDS74 LKAKERHFLEQLLDGKKLENYKIPVPINAELRKYQQDGVNWL-AFLNKYKLHG----ILC
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pF1KB8 DEMGLGKTLQCISLIWTLQCQ--GPYGGKPVIK----KTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLG
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CCDS74 DDMGLGKTLQSICILAGDHCHRAQEYARSKLAECMPLPSLVVCPPTLTGHWVDEVGKFCS
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pF1KB8 SERIKI--FTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLK
: .. .: .... . ..... ::... ..: ..::::. : :::: .:
CCDS74 REYLNPLHYTGPPTERIRLQHQVKRHNLIVASYDVVRNDIDFFRNIKFNYCILDEGHVIK
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pF1KB8 NSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPII
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CCDS74 NGKTKLSKAVKQLTANYRIILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTERQFAARYGKPIL
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CCDS74 ASRDARSSSREQEAGVLAMDALHRQVLPFLLRRMKEDVLQDLPPKIIQDYYCTLSPLQVQ
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::. . .: ..: . ..:.: : :.:::::: :... .
CCDS74 LYEDFAKSRAKCDVDETVSSATLSEETEKPKLKATGHVFQALQYLRKLCNHPALVLTP-Q
1540 1550 1560 1570 1580
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. : ..: .: ...::. . . . ::. .. : .:. . :
CCDS74 HPEFKTTAEKLAVQNSSLHDIQHAPKLSALKQLLLDCGLGNGSTSESGTESVVAQHR---
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pF1KB8 KVVLVSNYTQTLNILQ-EVCKRH--GYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLL
... . . :.:.. .. : : . .: ::::. : .::..::. ::.. :. ..::
CCDS74 -ILIFCQLKSMLDIVEHDLLKPHLPSVTYLRLDGSIPPGQRHSIVSRFNND-PSIDVLLL
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pF1KB8 SSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]