Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5782, 769 aa
  1>>>pF1KB5782 769 - 769 aa - 769 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4666+/-0.00135; mu= 16.6211+/- 0.081
 mean_var=193.7878+/-36.457, 0's: 0 Z-trim(108.1): 129  B-trim: 26 in 2/47
 Lambda= 0.092132
 statistics sampled from 9846 (9976) to 9846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time:  3.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21         ( 769) 5450 738.2 1.2e-212
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12          ( 798) 2524 349.3 1.4e-95
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17         ( 788) 2018 282.0 2.5e-75
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10          ( 798) 2009 280.8 5.7e-75
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2           ( 788) 1925 269.7 1.3e-71
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 746) 1854 260.2 8.7e-69
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3           ( 799) 1803 253.5   1e-66
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 693) 1799 252.9 1.3e-66
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1752) 1461 208.5 7.7e-53
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1805) 1461 208.5 7.9e-53
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17         (1822) 1461 208.5 7.9e-53
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2          ( 681) 1436 204.6 4.4e-52
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7           ( 769) 1419 202.4 2.3e-51
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13         ( 494)  499 79.9 1.1e-14
CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 353)  465 75.1 2.1e-13
CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 445)  465 75.3 2.4e-13
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13        ( 401)  453 73.6 6.9e-13


>>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21              (769 aa)
 initn: 5450 init1: 5450 opt: 5450  Z-score: 3931.4  bits: 738.2 E(32554): 1.2e-212
Smith-Waterman score: 5450; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MLGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQAAAFNVTFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQAAAFNVTFR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 NTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 MQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDNLYKRSNEFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDNLYKRSNEFD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 YPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 NKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATEC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 IQEQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCHGKGFLECGICRCDTGYIGKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IQEQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCHGKGFLECGICRCDTGYIGKN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 CECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTIN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 CERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 CECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACPGLQLSNNPVKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACPGLQLSNNPVKGR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760         
pF1KB5 VIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES
              730       740       750       760         

>>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12               (798 aa)
 initn: 1666 init1: 896 opt: 2524  Z-score: 1829.4  bits: 349.3 E(32554): 1.4e-95
Smith-Waterman score: 2524; 48.3% identity (73.9% similar) in 756 aa overlap (32-769:50-793)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB5 LGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSIR
                                     ::..:: : :.:.::..::::. :. .. :
CCDS88 ELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEARR
      20        30        40        50        60        70         

              70        80        90              100       110    
pF1KB5 CDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDH---NG----GQKQLSPQKVTLYLRPGQAAA
       :  : .:: :::  ... .: .  :. .:.   .:    :  ::.::.: . ::::.   
CCDS88 CARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARGEGATQLAPQRVRVTLRPGEPQQ
      80        90       100       110       120       130         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 FNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDK
       ..: : ::.:::.:::::::::::: :::. :..::  ::  :.:.:.: ::::::::::
CCDS88 LQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVRIGFGSFVDK
     140       150       160       170       180       190         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 TVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPE
       ::::::.: :.:::.:::.. ..:: ::.:.:::.::.... :. :::.: .:::::.::
CCDS88 TVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQSVSGNLDSPE
     200       210       220       230       240       250         

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 GGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDN-LY
       ::.::..:.: : :.::::::.:::::..:: :: :::::::.:. :.::.:::..: ::
CCDS88 GGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGHCHLDSNGLY
     260       270       280       290       300       310         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 KRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVV
       .::.:::::::::.:. :.  ::::::::::  . .:..:...:::::::::::::::::
CCDS88 SRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGELSEDSSNVV
     320       330       340       350       360       370         

           360       370       380       390          400       410
pF1KB5 HLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRN---QPRGDCDGVQINVPIT
       .:: .:::.::: : :.:..::  ....:.: : .:  .:.   . ::.:. :.::  .:
CCDS88 QLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQC-EGPEKREGKAEDRGQCNHVRINQTVT
     380       390       400       410        420       430        

              420        430       440       450       460         
pF1KB5 FQVKVTATECIQEQSFV-IRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSLCH-GKGFLECG
       : :.. ::.:. :  .. .:::::.. . :..   :.: : : . .   :  :.: :.::
CCDS88 FWVSLQATHCLPEPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNCSDTQPQAPHCSDGQGHLQCG
      440       450       460       470       480       490        

      470       480       490       500        510       520       
pF1KB5 ICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNS-IICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGK
       .: :  : .:. :::..   :: .::..::  :..  .::: : : ::.: :  ..    
CCDS88 VCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGRCSCSGQSS---
      500       510       520       530       540       550        

       530       540       550       560       570       580       
pF1KB5 LIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRR
          :. ::::  .:::..: .::: ::  : :: :.:: .  : ::.:    ..:..:. 
CCDS88 ---GHLCECDDASCERHEGILCGGFGR--CQCGVCHCHANRTGRACECSGDMDSCISPEG
            560       570         580       590       600       610

       590       600       610       620       630       640       
pF1KB5 VECSGRGRCRCNVCECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAAC
         :::.:::.:: :.: .::   ::..:::: .:: .. .::::  :. ::.. :::.::
CCDS88 GLCSGHGRCKCNRCQCLDGYYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTGPLATNCSTAC
              620       630       640       650       660       670

         650       660        670       680       690       700    
pF1KB5 P--GLQLSNNPVKGRT-CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAI
          .. :.  :.     ::::  ..  . . : ..:.    .. :  ...  .. .  ::
CCDS88 AHTNVTLALAPILDDGWCKERTLDN-QLFFFLVEDDARGTVVLRVRPQEK--GADHTQAI
              680       690        700       710         720       

          710       720       730       740       750        760   
pF1KB5 VGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMN
       : : :.::: .:. :.. ..  ... : ::: :::::. . .:..: :::.::: ::..:
CCDS88 VLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNWKQDSNPLYKSAITTTIN
       730       740       750       760       770       780       

                  
pF1KB5 PKFAES     
       :.: :.     
CCDS88 PRFQEADSPTL
       790        

>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17              (788 aa)
 initn: 1251 init1: 374 opt: 2018  Z-score: 1465.9  bits: 282.0 E(32554): 2.5e-75
Smith-Waterman score: 2075; 40.3% identity (68.3% similar) in 791 aa overlap (5-763:6-782)

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pF1KB5  MLGLRP-PL----LALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGP
            :: ::    ::: .: ..:    . ::   ::::..:.  .: :.::.   .  :
CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEAL--P
               10        20        30        40        50          

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pF1KB5 -GDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK---------QLSPQKVT
        :.:   ::: . .::  .:: ..:  :.: :.. ::.  ..:         :.:::...
CCDS11 LGSP---RCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQVTQVSPQRIA
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pF1KB5 LYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESG
       : ::: ..  :..  :... ::.:.:::::::::: ::: ....::  :   . ..: . 
CCDS11 LRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTSNL
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pF1KB5 RIGFGSFVDKTVLPFVN-THPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK
       :::::.:::: : :..  . :. :.::: . .  : : :...::: ::.. ..:. :: :
CCDS11 RIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNEEVKK
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pF1KB5 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRN-VTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN
       : .: : ::::::.::.::...: :.::::: ...::::.::   :.: ::.:..:. ::
CCDS11 QSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGIVQPN
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pF1KB5 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
       ::.::.  :: :. :. .::::.: ...::...::. :::::  .:. :.. .:.:: ..
CCDS11 DGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELIPGTT
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pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
       :: :: :::::..:: .::.:. :.: :.   ::. :...... : :. .  .    .: 
CCDS11 VGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLK--SCM
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pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQ--SFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL-
       :..:.  ..:.... .  : ::.  ::.:. .:: : . :::  .:.: :. :..  :  
CCDS11 GLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPNSHR
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KB5 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQG-RSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQ
       :. :.: .:::.:::  :..:..:::. .  : ::. :  :   ... .::  :.:.:::
CCDS11 CNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE--CSPREGQPVCSQRGECLCGQ
           480       490       500       510         520       530 

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pF1KB5 CLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCE
       :.::.::  :: : :.::::: ..: ::.:..:.: :.  : :: : :   . :  :.: 
CCDS11 CVCHSSDF-GK-ITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQ--CSCGDCLCDSDWTGYYCNCT
              540        550       560         570       580       

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pF1KB5 RTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFE
         :. :..   . :::::.:.:. : : . :     :..:: ::. :     :.:: ::.
CCDS11 TRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFD
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pF1KB5 KGPFG--KNCSAACPGLQLSNNPVK--GR---TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIY
       .: .   ..:.  :     : . .:  :.   .:  .. . : : .    .:.  . ..:
CCDS11 RGALHDENTCNRYCRDEIESVKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQY-YEDSSGKSILY
       650       660       670       680       690        700      

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pF1KB5 VDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN
       : :  ::  ::.: ... .....:.:::.  :.::: :: . : .:. .::.:. ...:.
CCDS11 VVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWD
        710       720       730       740       750       760      

       750       760         
pF1KB5 N-DNPLFKSATTTVMNPKFAES
       . .:::.: ::.:  :      
CCDS11 TANNPLYKEATSTFTNITYRGT
        770       780        

>>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10               (798 aa)
 initn: 2051 init1: 885 opt: 2009  Z-score: 1459.4  bits: 280.8 E(32554): 5.7e-75
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pF1KB5 MLGLRPPLLALVGLLS-LGCVLSQ----ECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPG
        ..:.:  .  .::.: . ::..:    .: : ...:: :::..::.: :: . .:   :
CCDS71  MNLQP--IFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEG
                  10        20        30        40        50       

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pF1KB5 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK--------------QLSPQ
        : : :::    :  .::  ::: .: .  . ....:  ..              :..::
CCDS71 MPTSARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ
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pF1KB5 KVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEIT
       ...: :: :.  .:.. :.::. ::::::::::::::: :::.:::.:: ::.  . .::
CCDS71 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB5 ESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEV
        . ::::::::.:::.:...: : :::::: ..:..:  ::....::.:::... :.  :
CCDS71 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPC-TSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELV
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pF1KB5 GKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTP
       ::: ::::::.::::.::.::::.:   ::::::::::::.:: :::::::::::.:. :
CCDS71 GKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLP
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pF1KB5 NDGRCHLEDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
       :::.::::.:.:  :. .::::...:..::.::::: ::::: ..  .:..: ..:::::
CCDS71 NDGQCHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSA
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pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
       :: :: .::::..:: .:::.:::.:.:... : . . ..: :.:.:::.  ..    :.
CCDS71 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS
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pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQS--FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRS-L
       ...:.  . :....:...: ...:  : :: ::::. : : .   :::.:....  .:  
CCDS71 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK
        420       430       440       450       460       470      

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pF1KB5 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC
       :: :.: .::: :::. : .:..:::.:.  .:..... :::.:.: :::. :.::::::
CCDS71 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC
        480       490       500       510       520       530      

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pF1KB5 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER
       .:.  :  ...  :..::::..::.: :: .:::   :.: :  :.:.:.. ::::.:  
CCDS71 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGG--NGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSL
        540       550       560       570         580       590    

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pF1KB5 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECHSG-YQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK
        :  :       :.::: :.:.::.: .  .:   :. :  : . :...  :..:  :.:
CCDS71 DTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNK
          600       610       620       630       640       650    

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pF1KB5 GPFGKNCSAACPGLQLSN--------NPVKGRT---CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRY
       :    .:.  :  .....        .::.      :::.: . ::  .:  . .: .. 
CCDS71 GEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTY-SVNGNNEV
          660       670       680       690       700        710   

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB5 LIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKS
       ...: :. :: .::.:  ::.:.::::::::. ::.::: :. . : ::. .:::::...
CCDS71 MVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNA
           720       730       740       750       760       770   

          750       760         
pF1KB5 QWNN-DNPLFKSATTTVMNPKFAES
       .:.. .::..:::.:::.:::.   
CCDS71 KWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
           780       790        

>>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2                (788 aa)
 initn: 1418 init1: 579 opt: 1925  Z-score: 1399.1  bits: 269.7 E(32554): 1.3e-71
Smith-Waterman score: 2003; 39.3% identity (68.0% similar) in 763 aa overlap (25-763:23-771)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSI
                               :.   . .:..:.  :: :.:: . ::: :.     
CCDS22   MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPSGVGE-
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90                100       110 
pF1KB5 RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHN---GGQK------QLSPQKVTLYLRPGQ
       ::::  .:: .::  . : .:.: .:  ...    : ::      :..::.. : :::: 
CCDS22 RCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGG
        60        70        80        90       100       110       

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB5 AAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSF
       : ...:  :... ::.::::::::: :: ::: ..:.::. : . ....: . :.:::::
CCDS22 AQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSF
       120       130       140       150       160       170       

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pF1KB5 VDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLD
       :.: : :::.: :... ::: .    : : :.:.:.: :::....:.  : .: ::.:.:
CCDS22 VEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANID
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pF1KB5 APEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVT-RLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED
       .::::.::.::.:.: :.::::: . .::::..:   ::. :.::..:. :::: :::..
CCDS22 TPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDS
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pF1KB5 -NLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDS
        : :. :. ..::..:::  ::..::.  :::::...:. ::. ...:: ..:: :..::
CCDS22 KNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDS
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pF1KB5 SNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDT--LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINV
       .:...:: .::..: :.: :.  .: ::  :.... ..:.::.  ..: .  :. .... 
CCDS22 GNILQLIISAYEELRSEVELE--VLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGD
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pF1KB5 PITFQVKVTATECIQE-QSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGF
         .:.: :.  .: .. . ..:. .:. : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: 
CCDS22 TASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGS
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pF1KB5 LECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDV
       ..::.: :  :..:  :::  .  :..    ::..  .   ::: ::: ::::.:: :  
CCDS22 FQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTD----SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS--
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pF1KB5 PGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLN
       :   ::: ::.::...: :..: .::: :   : ::.: :. :. :  :.:  .:..:..
CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVS
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pF1KB5 PRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNC
          : ::::: : :. : : . : . : :..:: : .::..  :: ::     :   ..:
CCDS22 EDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREEC
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pF1KB5 SAACP--GLQLSNNPVKGR----TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVA
          :   :  .:..   ..    .:. .  . : ... :   :.  . .:.  . ..:  
CCDS22 VDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQGENECLITF-LITTDNEGKTIIHSINEKDCPK
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pF1KB5 GPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKS
        :::  :. :.  .:.:::..:: ::: :. . : .:  .:: :. :..:..  :::...
CCDS22 PPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRG
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        760                    
pF1KB5 ATTTVMNPKFAES           
       .:.:  :                 
CCDS22 STSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
          770       780        

>>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (746 aa)
 initn: 1430 init1: 579 opt: 1854  Z-score: 1348.4  bits: 260.2 E(32554): 8.7e-69
Smith-Waterman score: 1919; 39.4% identity (68.2% similar) in 738 aa overlap (50-763:6-729)

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pF1KB5 VLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIM
                                     ::: :.     ::::  .:: .::  . : 
CCDS74                          MITYKNFTHPSGVGE-RCDTPANLLAKGCQLNFIE
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pF1KB5 DPTSLAETQEDHN---GGQK------QLSPQKVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLY
       .:.: .:  ...    : ::      :..::.. : :::: : ...:  :... ::.:::
CCDS74 NPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLY
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pF1KB5 YLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNP
       :::::: :: ::: ..:.::. : . ....: . :.::::::.: : :::.: :... ::
CCDS74 YLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANP
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pF1KB5 CPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEI
       : .    : : :.:.:.: :::....:.  : .: ::.:.:.::::.::.::.:.: :.:
CCDS74 CSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKI
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pF1KB5 GWRNVT-RLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED-NLYKRSNEFDYPSVGQLA
       :::: . .::::..:   ::. :.::..:. :::: :::.. : :. :. ..::..::: 
CCDS74 GWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLI
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pF1KB5 HKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVF
        ::..::.  :::::...:. ::. ...:: ..:: :..::.:...:: .::..: :.: 
CCDS74 DKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVE
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pF1KB5 LDHNALPDT--LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATECIQE-QS
       :.  .: ::  :.... ..:.::.  ..: .  :. ....   .:.: :.  .: .. . 
CCDS74 LE--VLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRH
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pF1KB5 FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCEC
       ..:. .:. : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: ..::.: :  :..:  :::
CCDS74 IIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC
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pF1KB5 QTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCER
         .  :..    ::..  .   ::: ::: ::::.:: :  :   ::: ::.::...: :
CCDS74 GEDMLSTD----SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS--PYGNIYGPYCQCDNFSCVR
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pF1KB5 YNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC
       ..: .::: :   : ::.: :. :. :  :.:  .:..:..   : ::::: : :. : :
CCDS74 HKGLLCGGNGD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVC
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pF1KB5 -HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACP--GLQLSNNPVKGR
        . : . : :..:: : .::..  :: ::     :   ..:   :   :  .:..   ..
CCDS74 TNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSK
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pF1KB5 ----TCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIG
           .:. .  . : ... .   :.  . .:.  . ..:   :::  :. :.  .:.:::
CCDS74 DGSVSCSLQGENECLITFLITT-DNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIG
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pF1KB5 ILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMNPKFAES      
       ..:: ::: :. . : .:  .:: :. :..:..  :::....:.:  :            
CCDS74 VVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVD
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CCDS74 LSTDC
            

>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3                (799 aa)
 initn: 1363 init1: 332 opt: 1803  Z-score: 1311.4  bits: 253.5 E(32554): 1e-66
Smith-Waterman score: 1930; 39.1% identity (66.7% similar) in 786 aa overlap (7-760:7-780)

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pF1KB5 MLGLRPPLLA-LVGLLSLGCVLS--QECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDP
             :: : :.:: .:   :.  . ::. ...::.::.   : :.::.: .:   :.:
CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP
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pF1KB5 DSI--RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQK------QLSPQKVTL
        ::  ::: : .:.  ::... : .:.:    :     . .:. .      :..::....
CCDS30 RSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAV
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pF1KB5 YLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGR
        ::::. ..:..  :... ::.::::::::: :: ::: :...::  : . . ..: . :
CCDS30 NLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFR
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pF1KB5 IGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKE--KECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK
       .:::::::: . ::  : :    ::: . .   .: : :.:::.: ::.  ..:. :: :
CCDS30 LGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRK
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pF1KB5 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN
       : .: : ::::::.::..:.:.: :.:::: .. .::::.:::  :.: :::::... :.
CCDS30 QRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPH
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pF1KB5 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
       ::.::: : : :  ::..::::.. :..:::::::. :::::.     :...: .:: ..
CCDS30 DGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTT
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pF1KB5 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
       :  :. ::.:...:: ::::.. :.: :.    :. :.. . . :..::.. .: .  :.
CCDS30 VEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK--CE
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pF1KB5 GVQINVPITFQVKVTATECIQ---EQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRSL
       :..:.   .:.:.. :  : .   :. :..: .:: : . : :  .: : :    .  : 
CCDS30 GLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSA
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pF1KB5 -CHGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC
        :.:.:   ::.:.:. ::.:  :::: .:....  .. ::. ... .::: ::: :.::
CCDS30 RCNGSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQ-DGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQC
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pF1KB5 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER
        :  :.  :: ::: .::::...: : .: .:.: :.  : ::.:.:: :. :. :.:  
CCDS30 SCFESEF-GK-IYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGE--CHCGECKCHAGYIGDNCNCST
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pF1KB5 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK
           : .     :: ::.: :. :.: . :    .:..:: ::. :.   .:.::: ...
CCDS30 DISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHS
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pF1KB5 G-PFGKNCSAACPGLQLS--NNPVKGRT----CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYV
       : : ...: . :    ..  .. ::       :  . .. : . .:  .  .    :  .
CCDS30 GKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVL
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pF1KB5 DESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN-
        :  ::   ::  .:. ..:..:.:.:. ::.::: :. . : ::. .:..:. ..... 
CCDS30 REP-ECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEM
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pF1KB5 NDNPLFKSATTTVMNPKFAES          
        .:::...  .:                   
CCDS30 ASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
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>>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2               (693 aa)
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CCDS74           MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM
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pF1KB5 LDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQ
        ::: ..:.::. : . ....: . :.::::::.: : :::.: :... ::: .    : 
CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL
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pF1KB5 PPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVT-RL
       : :.:.:.: :::....:.  : .: ::.:.:.::::.::.::.:.: :.::::: . .:
CCDS74 PTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHL
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pF1KB5 LVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLED-NLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQ
       :::..:   ::. :.::..:. :::: :::.. : :. :. ..::..:::  ::..::. 
CCDS74 LVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVL
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pF1KB5 PIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDT
        :::::...:. ::. ...:: ..:: :..::.:...:: .::..: :.: :.  .: ::
CCDS74 LIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELE--VLGDT
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pF1KB5 --LKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGVQINVPITFQVKVTATECIQE-QSFVIRALGFT
         :.... ..:.::.  ..: .  :. ....   .:.: :.  .: .. . ..:. .:. 
CCDS74 EGLNLSFTAICNNGTLFQHQKK--CSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERRSRHIIIKPVGLG
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pF1KB5 DIVTVQVLPQCECRCRDQSR-DRSLCH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQE
       : . . : :.:.: :. . . . : :: :.: ..::.: :  :..:  :::  .  :.. 
CCDS74 DALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTD-
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pF1KB5 LEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGP
          ::..  .   ::: ::: ::::.:: :  :   ::: ::.::...: :..: .::: 
CCDS74 ---SCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS--PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGN
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pF1KB5 GRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPL
       :   : ::.: :. :. :  :.:  .:..:..   : ::::: : :. : : . : . : 
CCDS74 GD--CDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPT
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pF1KB5 CQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACP--GLQLSNNPVKGR----TCKER
       :..:: : .::..  :: ::     :   ..:   :   :  .:..   ..    .:. .
CCDS74 CERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEEDFSKDGSVSCSLQ
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pF1KB5 DSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKA
         . : ... :   :.  . .:.  . ..:   :::  :. :.  .:.:::..:: ::: 
CCDS74 GENECLITF-LITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKL
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pF1KB5 LIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND-NPLFKSATTTVMNPKFAES           
       :. . : .:  .:: :. :..:..  :::....:.:  :                 
CCDS74 LVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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>>CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17              (1752 aa)
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Smith-Waterman score: 1471; 34.4% identity (62.0% similar) in 805 aa overlap (1-756:1-781)

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       : : :: :    ::: .  .::. .:...: :  :.:: ::..    :..:    :    
CCDS58 MAGPRPSPWARLLLAALISVSLSGTLANRCKKAPVKSCTECVRVDKDCAYCTDEMFR---
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pF1KB5 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQKQLSPQKVTLYLRPGQ
         :  ::.:. .::  ::  ..:.   :      ::: : .  ..:.::: . . ::::.
CCDS58 --DR-RCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDTTLRRSQMSPQGLRVRLRPGE
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pF1KB5 AAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGRIGFGSF
          :..   .    :.::: :::.: :: ::: :.::.: .: :.:...: .  ::::.:
CCDS58 ERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLTSDYTIGFGKF
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pF1KB5 VDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLD
       :::. .: .. .:.::..: ::..    :::.:..:..::.. ..:....  . ::::::
CCDS58 VDKVSVPQTDMRPEKLKEPWPNSD----PPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQGERISGNLD
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pF1KB5 APEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGK--LGAILTPNDGRCHL
       :::::.::..:.:.: ..:::: . :.::::.:...::. .::   :..:.. :: ::::
CCDS58 APEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGIMSRNDERCHL
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pF1KB5 EDN-LYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSE
       . .  : .    :::::  :.. ::..:: ::::::.   . ::::   .: :..: :.:
CCDS58 DTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYFPVSSLGVLQE
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pF1KB5 DSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNAL--PDTLK--VTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCDGV
       ::::.:.:...:.:.. :   ::  ::  :  :.  ::   : .. .   .  ::.    
CCDS58 DSSNIVELLEEAFNRIRSN--LDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQKTRTGSFHIRRGEVGIY
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pF1KB5 QINVPITFQVKVT-ATECIQEQSFVIRAL-GFTDIVTVQVLPQCE-CRCRDQSRDRSL-C
       :...    .:  : . .  ..:.  :.   .:.: . ...   :. : :. :.. ::  :
CCDS58 QVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKPSFSDGLKMDAGIICDVCTCELQKEVRSARC
      410       420       430       440       450       460        

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pF1KB5 HGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQCLC
         .: . :: : :. :. :..:.:.: . :. .    : .....  ::: :.: ::.:.:
CCDS58 SFNGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSLSDIQ---PCLREGEDKPCSGRGECQCGHCVC
      470       480       490       500          510       520     

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pF1KB5 HTSDVPGKLIY-GQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERT
       .     :.  : ::.:: :...: : .: .:.   :: :  :.: :.::. : .:.:  .
CCDS58 Y-----GEGRYEGQFCEYDNFQCPRTSGFLCN--DRGRCSMGQCVCEPGWTGPSCDCPLS
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pF1KB5 TEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECH--SGYQLPLCQECPGCPSP--CGKYISCAECLKF
       .  :..     :.:::.:.:. :.::  : :   .:.   .   :  :    ::..:  .
CCDS58 NATCIDSNGGICNGRGHCECGRCHCHQQSLYTDTICEINYSAIHPGLCEDLRSCVQCQAW
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pF1KB5 EKGPF-GKNCSAACPGLQLSNNPVKGRT----CKERD-SEGCWVAYTLEQQDGMD--RYL
         :   :..:      ... ..  ...     :. :: .. :  .::.:  ::       
CCDS58 GTGEKKGRTCEECNFKVKMVDELKRAEEVVVRCSFRDEDDDCTYSYTMEG-DGAPGPNST
      640       650       660       670       680        690       

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pF1KB5 IYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWK---------ALI------HLSD
       . : ....:  : ..  ..   .  . :...:::. ::         ::.      :.  
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