Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6566
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6566, 400 aa
  1>>>pF1KB6566 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6238+/-0.00121; mu= 1.7832+/- 0.072
 mean_var=194.6790+/-38.925, 0's: 0 Z-trim(108.3): 91  B-trim: 64 in 1/50
 Lambda= 0.091921
 statistics sampled from 10010 (10100) to 10010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.31), width:  16
 Scan time:  2.630

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17         ( 400) 2525 347.6 1.2e-95
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17         ( 432) 1635 229.6 4.4e-60
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472) 1578 222.0 8.9e-58
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473) 1565 220.3 2.9e-57
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456) 1554 218.8 7.9e-57
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458) 1516 213.8 2.6e-55
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420) 1515 213.6 2.7e-55
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494) 1421 201.2 1.7e-51
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584) 1414 200.3 3.7e-51
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17       ( 525) 1322 188.1 1.6e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17         ( 467) 1301 185.3   1e-46
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17         ( 455) 1242 177.5 2.2e-44
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17          ( 623) 1227 175.6 1.1e-43
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17       ( 450) 1218 174.3   2e-43
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17       ( 464) 1213 173.6 3.3e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17       ( 459) 1209 173.1 4.7e-43
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17         ( 448) 1208 173.0   5e-43
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17        ( 404) 1174 168.4 1.1e-41
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17         ( 416) 1174 168.4 1.1e-41
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17        ( 404) 1173 168.3 1.2e-41
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17        ( 424) 1168 167.6 1.9e-41
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17         ( 436) 1157 166.2 5.4e-41
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17       ( 468) 1157 166.2 5.7e-41
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12         ( 430) 1108 159.7 4.8e-39
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 422) 1061 153.4 3.5e-37
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17       ( 431) 1054 152.5 6.9e-37
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17       ( 491) 1027 149.0 9.1e-36
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17         ( 456) 1022 148.3 1.4e-35
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17         ( 449)  998 145.1 1.2e-34
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 285)  700 105.4 6.7e-23
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470)  645 98.3 1.6e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916)  647 98.8 2.2e-20
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466)  637 97.2 3.2e-20
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431)  628 96.0   7e-20
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432)  628 96.0   7e-20
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438)  628 96.0 7.1e-20
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543)  625 95.7 1.1e-19
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499)  616 94.5 2.4e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469)  588 90.7 2.9e-18
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3          ( 415)  577 89.2 7.3e-18
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  572 88.6 1.3e-17
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  572 88.6 1.4e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12         ( 638)  571 88.6 1.8e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600)  566 87.9 2.7e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12          ( 551)  564 87.6   3e-17
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020)  560 87.3 7.1e-17
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12         ( 564)  550 85.8 1.1e-16
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493)  546 85.2 1.5e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12        ( 564)  547 85.4 1.5e-16
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12          ( 507)  546 85.2 1.5e-16


>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17              (400 aa)
 initn: 2525 init1: 2525 opt: 2525  Z-score: 1830.5  bits: 347.6 E(32554): 1.2e-95
Smith-Waterman score: 2525; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KB6 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL
              370       380       390       400

>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17              (432 aa)
 initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635  Z-score: 1192.2  bits: 229.6 E(32554): 4.4e-60
Smith-Waterman score: 1635; 66.4% identity (87.6% similar) in 396 aa overlap (1-390:1-394)

               10           20        30          40         50    
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGSVRFGPGVA--FRAPSIHGGS-GGRGVSVSSARFVS
       ::. : :: ...::.   .:::::: : .  ..  . : : . :: :: : ..... . :
CCDS11 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSS
                10        20        30        40        50         

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB6 SSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRD
         : :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS11 CYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRD
      60         70        80        90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB6 WYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
       :::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.::::::::::::::::::::::
CCDS11 WYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQA
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB6 LRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVS
       ::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::...
CCDS11 LRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEIN
      180       190       200       210       220       230        

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB6 VEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRS
       ::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..:
CCDS11 VEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKS
      240       250       260       270       280       290        

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB6 EVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRA
       :...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...: 
CCDS11 EISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRC
      300       310       320       330       340       350        

          360       370       380       390       400              
pF1KB6 DSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL              
       . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :                        
CCDS11 EMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDG
      360       370       380       390       400       410        

CCDS11 KVISSREQVHQTTR
      420       430  

>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17              (472 aa)
 initn: 1685 init1: 1522 opt: 1578  Z-score: 1150.8  bits: 222.0 E(32554): 8.9e-58
Smith-Waterman score: 1584; 61.3% identity (81.2% similar) in 432 aa overlap (7-398:6-430)

               10               20           30        40        50
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSA
             :: ...::.       ::.:::: :..    : . :::: .::    :.::::.
CCDS11  MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGG----GLSVSSS
                10        20        30        40            50     

                                     60                70        80
pF1KB6 RF---------------VSSSSS-------GAYGGG--------YGGVLTASDGLLAGNE
       ::                :::::       :.::::        .:: ....::::.:.:
CCDS11 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSE
          60        70        80        90       100       110     

               90       100       110       120       130       140
pF1KB6 KLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDK
       :.:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :.  .::: :. ::.:::.:
CCDS11 KVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNK
         120       130       140       150       160       170     

              150       160       170       180       190       200
pF1KB6 ILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDL
       :: ::..:. ..::::::::::::::::.:::  :::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 ILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADL
         180       190       200       210       220       230     

              210       220       230       240       250       260
pF1KB6 EMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMA
       :::::.:::::::::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: ::
CCDS11 EMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMA
         240       250       260       270       280       290     

              270       280       290       300       310       320
pF1KB6 EQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAAL
       :.:::::: :: ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.:
CCDS11 EKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASL
         300       310       320       330       340       350     

              330       340       350       360       370       380
pF1KB6 EDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATY
       :..: ::..:.  :::.:: .:...: ::...: . :.:::::. :.:.:.:::::::::
CCDS11 ENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATY
         360       370       380       390       400       410     

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pF1KB6 RSLLEGQEDHYNNLSASKVL                                        
       : ::::.. :   ::.:.                                          
CCDS11 RRLLEGEDAH---LSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
         420          430       440       450       460       470  

>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17              (473 aa)
 initn: 1575 init1: 1536 opt: 1565  Z-score: 1141.4  bits: 220.3 E(32554): 2.9e-57
Smith-Waterman score: 1587; 60.6% identity (82.1% similar) in 429 aa overlap (7-397:6-434)

               10               20           30        40          
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFGP---GVAFRAPSIHGGS----------
             :: ...::.       ::.:::: :..    : . :::: .::.          
CCDS11  MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
                10        20        30        40        50         

                     50        60                    70        80  
pF1KB6 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGAYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
             :: : . ::.   .:. .:.::::            .:: ....::::.:.::.
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
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pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
       :::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :.  .::: :. ::.:::.::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
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            150       160       170       180       190       200  
pF1KB6 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
       .:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
     180       190       200       210       220       230         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB6 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
       ::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
     240       250       260       270       280       290         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KB6 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
       ::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
     300       310       320       330       340       350         

            330       340       350       360       370       380  
pF1KB6 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
       .: ::..:.  ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.:::::::::: 
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
     360       370       380       390       400       410         

            390       400                                    
pF1KB6 LLEGQEDHYNNLSASKVL                                    
       ::::.. : .. .::                                       
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
     420       430       440       450       460       470   

>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17              (456 aa)
 initn: 1505 init1: 1227 opt: 1554  Z-score: 1133.8  bits: 218.8 E(32554): 7.9e-57
Smith-Waterman score: 1614; 63.3% identity (85.4% similar) in 417 aa overlap (1-388:1-414)

               10          20        30        40        50        
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLG--GGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSS
       ::. .. :.: .:.::: .  :::.  : : .: . :. ::.:.:..:.::::::::.:.
CCDS11 MTT-TFLQTS-SSTFGGGSTRGGSLLAGGG-GFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSG
                 10        20         30        40        50       

       60                                 70         80        90  
pF1KB6 GAYGGG-------------------------YGGVLTASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
       :.::::                         .:: . ..:: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLA
        60        70        80        90       100       110       

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGP-GPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
       :::::::::: ::..:::::.:::::: : .:  :::.:. ::..:::::...::.:::.
CCDS11 SYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRV
       120       130       140       150       160       170       

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
       .:.:::::::::::: :.:.: :::..:::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEEL
       180       190       200       210       220       230       

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
       ::::::::::.. . .:..:::.::.:.:::.::...:..:: :::.:::.::.:.::::
CCDS11 AYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWF
       240       250       260       270       280       290       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
        :.:::::.:::..::..: :..:.::::::.: :::::::::::::.::..::::: :.
CCDS11 FSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRY
       300       310       320       330       340       350       

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
       ..:: .::.::.:.::::...: . : :::::. :.:::.::::::::::::::::.   
CCDS11 ATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
       360       370       380       390       400       410       

             400                              
pF1KB6 NNLSASKVL                              
                                              
CCDS11 AGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
       420       430       440       450      

>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (458 aa)
 initn: 1487 init1: 1201 opt: 1516  Z-score: 1106.5  bits: 213.8 E(32554): 2.6e-55
Smith-Waterman score: 1533; 61.3% identity (82.1% similar) in 419 aa overlap (8-397:6-422)

               10        20        30           40         50      
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
              :::..:  ::.:::: ..: : .  . :   . ::: :: : .:: . : ...
CCDS11   MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
                 10        20        30        40        50        

         60        70                                80        90  
pF1KB6 SSGAYGGGYGGVLT-----------------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
       .:: .:::::: :                        : :: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GSG-FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLA
        60         70        80        90       100       110      

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
       :::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:.
CCDS11 SYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRV
        120       130       140       150       160       170      

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
       .:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.:::
CCDS11 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEEL
        180       190       200       210       220       230      

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
       ::.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: ::
CCDS11 AYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWF
        240       250       260       270       280       290      

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
        ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :.
CCDS11 HTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRY
        300       310       320       330       340       350      

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
       . :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. ..
CCDS11 ALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
        360       370       380       390       400       410      

             400                                 
pF1KB6 NNLSASKVL                                 
        .. .:                                    
CCDS11 IGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
        420       430       440       450        

>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (420 aa)
 initn: 1487 init1: 1201 opt: 1515  Z-score: 1106.3  bits: 213.6 E(32554): 2.7e-55
Smith-Waterman score: 1532; 62.4% identity (82.4% similar) in 410 aa overlap (8-388:6-413)

               10        20        30           40         50      
pF1KB6 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
              :::..:  ::.:::: ..: : .  . :   . ::: :: : .:: . : ...
CCDS11   MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG-FGGGA
                 10        20        30        40        50        

         60        70                                80        90  
pF1KB6 SSGAYGGGYGGVLT-----------------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
       .:: .:::::: :                        : :: ::.::::.::::::::::
CCDS11 GSG-FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLA
        60         70        80        90       100       110      

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
       :::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:.
CCDS11 SYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRV
        120       130       140       150       160       170      

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
       .:.:::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.:::
CCDS11 ILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEEL
        180       190       200       210       220       230      

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
       ::.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: ::
CCDS11 AYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWF
        240       250       260       270       280       290      

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
        ... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :.
CCDS11 HTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRY
        300       310       320       330       340       350      

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
       . :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::.   
CCDS11 ALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKK
        360       370       380       390       400       410      

             400
pF1KB6 NNLSASKVL
                
CCDS11 RQPP     
        420     

>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17              (494 aa)
 initn: 1407 init1: 1119 opt: 1421  Z-score: 1037.9  bits: 201.2 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1429; 58.6% identity (81.5% similar) in 406 aa overlap (7-387:31-436)

                                       10        20          30    
pF1KB6                         MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGP--GVAFRAP
                                     :  ::.:  .: ::..  ::   : .: : 
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAA
               10        20        30        40        50        60

           40            50              60                70      
pF1KB6 SIHGGS----GGRGVSVSSA------RFVSSSSSGAYGGGYGG--------VLTASDG-L
       :. :.:    :: : :....      : ....: :. : :.::        .:...:: :
CCDS11 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
               70        80        90       100       110       120

          80        90       100       110       120           130 
pF1KB6 LAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPS----RDYSHYY
       :.:.:: :::::::::::::::::::: :: ::: :::.::. .: : .     :::.::
CCDS11 LSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYY
              130       140       150       160       170       180

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB6 TTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLD
         :.:::.::..:.: :....::::::::::.::: :.:.: :::..:::::::::::::
CCDS11 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
              190       200       210       220       230       240

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB6 ELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSD
       ::::.:::::::::.:.:::::.:::::.:....:    :.::::.:.:::.::...:.:
CCDS11 ELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLND
              250       260       270       280       290       300

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB6 MRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQ
       ::.:::..::::::::::::  .. :: .:.. .::::: :.::::::::..:.::::::
CCDS11 MRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQ
              310       320       330       340       350       360

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB6 SQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKS
       :::.:: .:::.:::.:. . :::...: :::..:::: .::::.:::: ..:::...:.
CCDS11 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
              370       380       390       400       410       420

             380       390       400                               
pF1KB6 RLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL                               
       ::: :: ::: ::.:.                                            
CCDS11 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNG
              430       440       450       460       470       480

>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17              (584 aa)
 initn: 1456 init1: 1082 opt: 1414  Z-score: 1031.9  bits: 200.3 E(32554): 3.7e-51
Smith-Waterman score: 1424; 60.5% identity (82.9% similar) in 387 aa overlap (5-387:84-456)

                                         10        20        30    
pF1KB6                           MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAP
                                     :.: : ..:::::  ::   :: : .: . 
CCDS11 GGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGI--FGGG-SFGGG
            60        70        80        90       100          110

           40         50        60        70        80        90   
pF1KB6 SIHGGS-GGRGVSVSSARFVSSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLAS
       :. ::: :: : .           .:..:::.:: . .. :::.::::.:::::::::::
CCDS11 SFGGGSFGGGGFG-----------GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLAS
              120                  130       140       150         

           100       110       120          130       140       150
pF1KB6 YLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQG---PGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSR
       ::::::::: .: ::: ::..::.:.:    :  ::::.:: ::.::...::. : .:. 
CCDS11 YLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNAN
     160       170       180       190       200       210         

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 IVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEE
       :.:::::::::::::: :.:.: :::.::::::::::::::::::...:::::::.: ::
CCDS11 ILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEE
     220       230       240       250       260       270         

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 LAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAW
       :::::::::::.. ::.   :.:.::...:::.::...:..:::::: .:::::::::::
CCDS11 LAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAW
     280       290       300       310       320       330         

              280       290       300       310       320       330
pF1KB6 FTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEAR
       :. ...::. :. .. ::..  .::.:.:::..:.:::::::::..: .:: .:::::.:
CCDS11 FNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGR
     340       350       360       370       380       390         

              340       350       360       370       380       390
pF1KB6 FGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDH
       . .::..::: ::..: :: ..::..: :: :::.:.::: :::.:: ::::::::.   
CCDS11 YCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSS
     400       410       420       430       440       450         

              400                                                  
pF1KB6 YNNLSASKVL                                                  
                                                                   
CCDS11 GGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSS
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17            (525 aa)
 initn: 1232 init1: 996 opt: 1322  Z-score: 966.6  bits: 188.1 E(32554): 1.6e-47
Smith-Waterman score: 1324; 56.0% identity (83.8% similar) in 382 aa overlap (16-387:75-452)

                              10        20        30         40    
pF1KB6                MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGG-SG-GR
                                     ::.::.:   : :..: . :  :: :: ::
CCDS11 GGASSCSLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGAS---GSGTGFGGGSSFGGVSGFGR
           50        60        70        80           90       100 

             50          60        70        80        90       100
pF1KB6 GVSV-SSARFVSSSSSG--AYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRA
       : .  .:.:: :....:  .::::.:: . .. ::..:.:: ::::::::::.:::::::
CCDS11 GSGFCGSSRFSSGATGGFYSYGGGMGGGV-GDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRA
             110       120       130        140       150       160

              110       120            130       140       150     
pF1KB6 LEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPS-----RDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQI
       :: :: .:: ::..::.: ::: .     ::::.::. :.:::..:..::.::. :.:.:
CCDS11 LEEANTDLENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHI
              170       180       190       200       210       220

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB6 DNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLK
       ::::::::::: :.:.:  ::.::::::::::.:::.::..:.:::::::.. ::::::.
CCDS11 DNARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLR
              230       240       250       260       270       280

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB6 KNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRT
       ::::::.....:. ::.:.::...::::::.:.:.:::.::: .:::::..::  :....
CCDS11 KNHEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQS
              290       300       310       320       330       340

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB6 EELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQL
         :. ...  .     ...:.:.:.::::.:::::::::.::..:: :::.::: . :::
CCDS11 ASLQAQISTDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQL
              350       360       370       380       390       400

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB6 AHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLS
       ..::. ::..: .. .. .... :: ::..:.:::.::: :: ::: ::.:.        
CCDS11 SEIQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAE
              410       420       430       440       450       460

         400                                                       
pF1KB6 ASKVL                                                       
                                                                   
CCDS11 FGGRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSIS
              470       480       490       500       510       520




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 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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