Result of FASTA (ccds) for
pFN21AF0293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0293, 1018 aa
1>>>pF1KF0293 1018 - 1018 aa - 1018 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7030+/-0.00103; mu= 19.1584+/- 0.062
mean_var=69.1735+/-14.144, 0's: 0 Z-trim(103.8): 61 B-trim: 293 in 1/50
Lambda= 0.154207
statistics sampled from 7523 (7584) to 7523 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 6843 1532.3 0
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 3012 680.0 6.8e-195
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 2896 654.1 3.9e-187
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 1360 312.3 1.4e-84
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1353 310.9 8.9e-84
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1353 310.9 9e-84
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1353 310.9 9.2e-84
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1349 310.0 1.7e-83
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1349 310.0 1.8e-83
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1349 310.0 1.8e-83
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 1275 293.6 2.6e-78
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 1269 292.3 6.6e-78
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 1257 289.6 4.2e-77
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 1131 261.5 6.5e-69
CCDS10239.1 MYO9A gene_id:4649|Hs108|chr15 (2548) 1097 254.1 2.8e-66
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 1055 244.6 1e-63
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 1055 244.6 1e-63
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 1057 245.1 1e-63
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 1057 245.1 1.1e-63
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 1040 241.4 1.4e-62
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 1040 241.4 1.4e-62
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1015 235.7 3.9e-61
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 1016 236.0 5.9e-61
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 1013 235.3 9.3e-61
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 1003 233.1 4.3e-60
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 995 231.3 1.5e-59
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 994 231.1 1.7e-59
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 988 229.8 3.7e-59
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 972 226.2 5.1e-58
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 968 225.3 9.4e-58
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 964 224.5 1.8e-57
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 958 223.1 4.4e-57
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 932 217.3 2.5e-55
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 925 215.8 7.3e-55
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 920 214.6 1.5e-54
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 920 214.6 1.5e-54
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 896 209.3 6.8e-53
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 876 204.9 1.3e-51
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 873 204.2 2.2e-51
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 847 198.3 7.3e-50
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 816 191.4 8.7e-48
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 803 188.5 5.8e-47
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 786 184.9 1.5e-45
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 776 182.6 7.2e-45
CCDS75481.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1262) 748 176.3 3.5e-43
CCDS34487.1 MYO6 gene_id:4646|Hs108|chr6 (1285) 748 176.3 3.6e-43
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 714 168.8 9.7e-41
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 677 160.6 2.6e-38
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 669 158.7 6.4e-38
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 669 158.8 1.1e-37
>>CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018 aa)
initn: 6843 init1: 6843 opt: 6843 Z-score: 8218.5 bits: 1532.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6843; 99.8% identity (99.9% similar) in 1018 aa overlap (1-1018:1-1018)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 RIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RIFLQTLDMHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 SSATDNPTASSLFAQRLKTLRDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSATDNPTASSLFAQRLKTLQDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
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pF1KF0 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KF0 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LAAHCQGEGRTLEVRVSDCIPLSHRGVRRLISVEPRPEQPEPDFRCARGSFTLLWPSR
970 980 990 1000 1010
>>CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006 aa)
initn: 3958 init1: 2783 opt: 3012 Z-score: 3612.4 bits: 680.0 E(32554): 6.8e-195
Smith-Waterman score: 4175; 60.1% identity (83.1% similar) in 1016 aa overlap (1-1016:1-1004)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQELPLYGP
: ..:. :.:: ::::.: :.: .:: ::.::::::::::.::::.::::::. : .::
CCDS32 MAEQESLEFGKADFVLMDTVSMPEFMANLRLRFEKGRIYTFIGEVVVSVNPYKLLNIYGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 EAIARYQGRELYERPPHLYAVANAAYKAMKHRSRDTCIVISGESGAGKTEASKHIMQYIA
..: .:.:::::::::::.:.:.:::::::.::.:::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 DTIEQYKGRELYERPPHLFAIADAAYKAMKRRSKDTCIVISGESGAGKTEASKYIMQYIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 AVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
:.:::::::::::::..::::.:::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS32 AITNPSQRAEVERVKNMLLKSNCVLEAFGNAKTNRNDNSSRFGKYMDINFDFKGDPIGGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 IHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQGAGLNMT
:..::::::::. :. :::.::.:::::.:. ...:. :::... . ::. : :: :. .
CCDS32 INNYLLEKSRVIVQQPGERSFHSFYQLLQGGSEQMLRSLHLQKSLSSYNYIHVGAQLKSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 VHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFVETEEGGLQKEGL
...: . ..:..::.::::.:::...:..::::::::::..:: . : ..:
CCDS32 INDAAE-----FRVVADAMKVIGFKPEEIQTVYKILAAILHLGNLKFVVDGDTPLIENG-
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 AVAEEALVDHVAELTATPRDLVLRSLLARTVASGGRELIEKGHTAAEASYARDACAKAVY
.:. .::: .: :.: ..:: ::::.: :..:.: :: ::::.::: :::.:
CCDS32 -----KVVSIIAELLSTKTDMVEKALLYRTVATG-RDIIDKQHTEQEASYGRDAFAKAIY
300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 QRLFEWVVNRINSVMEPRGRDPRRDGKDTVIGVLDIYGFEVFPVNSFEQFCINYCNEKLQ
.::: :.:.:::...: .. : ::.::::::::::::.: ::::::::::::::::
CCDS32 ERLFCWIVTRINDIIEVKNYDTTIHGKNTVIGVLDIYGFEIFDNNSFEQFCINYCNEKLQ
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 QLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACSSAGTITD
::::::.::::::::.:::: :. ..:::: ::::::. :.::.:.::.:: ..: .::
CCDS32 QLFIQLVLKQEQEEYQREGIPWKHIDYFNNQIIVDLVEQQHKGIIAILDDACMNVGKVTD
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 RIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQLCPTDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVEGFIDKNRDFLF
..::..:... .: :..::.:: .:: .:: :::::.::::::.::: ::::::.: ::
CCDS32 EMFLEALNSKLGKHAHFSSRKLCASDKILEFDRDFRIRHYAGDVVYSVIGFIDKNKDTLF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 QDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLFKNSMVALVENLASKEPFYVR
::::::.:::..:.:. :::.:. .:::::::::::.:::::::.:::.:::::::.:::
CCDS32 QDFKRLMYNSSNPVLKNMWPEGKLSITEVTKRPLTAATLFKNSMIALVDNLASKEPYYVR
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 CIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFASRQPYSRFLLRYKMTCEYTWP
:::::. : .:...::::: :::::::::::::::: :: : .:: :::: :.:::
CCDS32 CIKPNDKKSPQIFDDERCRHQVEYLGLLENVRVRRAGFAFRQTYEKFLHRYKMISEFTWP
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 NHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRARLIPIIVLLLQKA
:: : ::: ::. :.:. :.: :::.:..:.:::.:::: :::. ::... :::.:::.
CCDS32 NHDLPSDKEAVKKLIERCGFQDDVAYGKTKIFIRTPRTLFTLEELRAQMLIRIVLFLQKV
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KF0 WRGTLARWRCRRLRAIYTIMRWFRRHKVRAHLAELQRRFQAARQPPLYGRDLVWPLPPAV
::::::: : .: .: ::.:..::.::.... :. :::.... ::. . :: :: :
CCDS32 WRGTLARMRYKRTKAALTIIRYYRRYKVKSYIHEVARRFHGVKTMRDYGKHVKWPSPPKV
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KF0 LQPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYL
:. :... ...: :::: ::.:.:: ::.::..:::::. :.: : : : .::: .::
CCDS32 LRRFEEALQTIFNRWRASQLIKSIPASDLPQVRAKVAAVEMLKGQRADLGLQRAWEGNYL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KF0 SSATDNPTASSLFAQRLKTLRDKDGFGAVLFSSHVRKVNRFHKIRNRALLLTDQHLYKLD
.: :.: .:. :. . :. :: . :::: :::::::: :...::...::.::::.:
CCDS32 ASKPDTPQTSGTFVPVANELKRKDKYMNVLFSCHVRKVNRFSKVEDRAIFVTDRHLYKMD
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KF0 PDRQYRVMRAVPLEAVTGLSVTSGGDQLVVLHARGQDDLVVCLHRSRPPLDNRVGELVGV
: .::.::...:: .:::::..: :::::.:.. . ::.::: ..: ..:.::::::
CCDS32 PTKQYKVMKTIPLYNLTGLSVSNGKDQLVVFHTKDNKDLIVCLFSKQPTHESRIGELVGV
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010
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CCDS11 KIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWAAQTIRRLIRGFVLRHA
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: : ... : . :: : : :: :: .:. .. . : . . .
CCDS11 PRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPALREASELLRELCIKNMVWKY
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CCDS11 CRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYP--QSVPRLFISTRLGTDEISPRVLQAL---
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CCDS11 ----GSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVE---DAKVKQRIDYANLTGI
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CCDS11 SVSSLSDSLFVLHVQRADNKQKGDVVLQSDHVIETLTKTALSANRVNSININQGSITFAG
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CCDS45 MRYRASALGSDGVRVTMESALTARDRVGVQDFVLLENFTSEAAFIENLRRRFRENLIYTY
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CCDS45 IGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAVMIS
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CCDS45 FGKYMDVQFDFKGAPVGGHILSYLLEKSRVVHQNHGERNFHIFYQLLEGGEEETLRRLGL
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CCDS45 ERNPQSYLYLVKGQCAKV---SSIN-DKSDWKVVRKALTVIDFTEDEVEDLLSIVASVLH
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CCDS45 FQHNSFEQFCINYCNEKLQQLFIELTLKSEQEEYEAEGIAWEPVQYFNNKIICDLVEEKF
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CCDS45 KGIISILDEECLRPGEATDLTFLEKLEDTVKHHPHFLTHKLADQRTRKSLGRGEFRLLHY
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pF1KF0 AGDVTYSVEGFIDKNRDFLFQDFKRLLYNSTDPTLRAMWPDGQQDITEVTKRPLTAGTLF
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CCDS45 AGEVTYSVTGFLDKNNDLLFRNLKETMCSSKNPIMSQCFD--RSELSD-KKRPETVATQF
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pF1KF0 KNSMVALVENLASKEPFYVRCIKPNEDKVAGKLDENHCRHQVAYLGLLENVRVRRAGFAS
: :.. ::: : :::: ::::::::. : :..:: :::: :::::::.::::::::
CCDS45 KMSLLQLVEILQSKEPAYVRCIKPNDAKQPGRFDEVLIRHQVKYLGLLENLRVRRAGFAY
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KF0 RQPYSRFLLRYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQGD-VAFGHSKLFIRSPRTL
:. : :: ::: : :::. : . .:..:... : . . .:..:.::: :.::
CCDS45 RRKYEAFLQRYKSLCPETWPT-WAGRPQDGVAVLVRHLGYKPEEYKMGRTKIFIRFPKTL
650 660 670 680 690 700
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pF1KF0 VT----LEQSRARLIPII-------------------VLLLQKAWRGTLARWRC-RRLRA
. :: : : : .. .:. :::::.: . .: :
CCDS45 FATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKRKWA
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740 750 760 770 780
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:: : .: :: : : ... : . :: : : :: :: .:.
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.. . : . . . ..: : :.. :..: ..: .... .. : ..:.
CCDS45 SELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYP--QSVPRLFISTRL
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. : : : : . .. : : .: .: :.: :::: . . ..
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. .: . . .::.::.: .:.: :::.. :.
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40 50 60 70 80 90
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CCDS42 YTYIGPVLVSVNPYRDLQIYSRQHMERYRGVSFYEVPPHLFAVADTVYRALRTERRDQAV
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:::::::::..::::: :.:::: :::::::::..:. :::::: :::::.:.:.. :..
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220 230 240 250 260 270
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: ::::: : . .: .. :... :... ..: .:. :: :. .:::.. :.:.
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.::::::.:. .::.. : :. : . ....: .. . . ..: : . . :.::
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. . .:.::::: :::::.: : :.:..:: . . . . ::.:.:::::
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700 710 720 730
pF1KF0 RTLVT----LEQSRARLIPII-------------------VLLLQKAWRGTLARWRC-RR
.:: . :: : : : .. .:. :::::.: . .:
CCDS42 KTLFATEDALEVRRQSLATKIQAAWRGFHWRQKFLRVKRSAICIQSWWRGTLGRRKAAKR
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: :: : .: :: : : ... : . :: : : :: :: .:
CCDS42 KWAAQTIRRLIRGFVLRHAPRCPENAFFLDHVRTSFLLNLRRQLPQNVLDTSWPTPPPAL
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790 800 810 820 830 840
pF1KF0 QPFQDTCHALFCRWRARQLVKNIPPSDMPQIKAKVAAMGALQGLRQDWGCRRAWARDYLS
. .. . : . . . ..: : :.. :..: ..: .... .. : ..:
CCDS42 REASELLRELCIKNMVWKYCRSISPEWKQQLQQKAVASEIFKGKKDNYP--QSVPRLFIS
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. . : : : : . .. : : .: .: :.: :::: . . ..
CCDS42 TRLGTDEISPRVLQAL-------GSEPIQYAVPVVKYDRKGYKPRSRQLLLTPNAVVIVE
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CCDS23 ALAKNLYSRLFSWLVNRINESIKAQTKVRKK-----VMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIIN
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CCDS23 YCNEKLQQIFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECL
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CCDS23 RPGTVTDETFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSC-FRIQHYAGKVLYQVE
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CCDS23 GFVDKNNDLLYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINL-KRPPTAGSQFKASVATLMK
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:: .:.: :.::::::. :.: ..: ::. ::::::::::::::.: :: : :
CCDS23 NLQTKNPNYIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLE
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pF1KF0 RYKMTCEYTWPNHLLGSDKAAVSALLEQHGLQ-GDVAFGHSKLFIRSPRTLVTLEQSRAR
:::: :. ::: : : ...: .:... . . .::.::.:::.:::: ::. : .
CCDS23 RYKMLCKQTWP-HWKGPARSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQ
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CCDS23 RLEDLATLIQKIYRG----WKCRTHFLLMKKSQIVIAAWYRRYA-------QQKRYQQTK
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. :
CCDS23 SSALVIQSYIRGWKARKILRELKHQKRCKEAVTTIAAYWHGTQVRREYRKFFRANAGKKI
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pF1KF0 MEDEEGPEYGKPDFVLLDQVTMEDFMRNLQLRFEKGRIYTYIGEVLVSVNPYQE
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CCDS82 MAKMEVKTSLLDNMIGVGDMVLLEPLNEETFINNLKKRFDHSEIYTYIGSVVISVNPYRS
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CCDS82 LPIYSPEKVEEYRNRNFYELSPHIFALSDEAYRSLRDQDKDQCILITGESGAGKTEASKL
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pF1KF0 IMQYIAAVTNPSQRAEVERVKDVLLKSTCVLEAFGNARTNRNHNSSRFGKYMDINFDFKG
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CCDS82 VMSYVAAVCGKG--AEVNQVKEQLLQSNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYMDIEFDFKG
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pF1KF0 DPIGGHIHSYLLEKSRVLKQHVGERNFHAFYQLLRGSEDKQLHELHLERNPAVYNFTHQG
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CCDS82 DPLGGVISNYLLEKSRVVKQPRGERNFHVFYQLLSGASEELLNKLKLERDFSRYNYL---
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pF1KF0 AGLNMTVHSALDSDEQSHQAVTEAMRVIGFSPEEVESVHRILAAILHLGNIEFV-ETEEG
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CCDS82 -SLDSAKVNGVD-DAANFRTVRNAMQIVGFMDHEAESVLAVVAAVLKLGNIEFKPESRVN
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CCDS82 GLDES--KIKDKNELKEICELTGIDQSVLERAFSFRTVEAK-QEKVSTTLNVAQAYYARD
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CCDS82 ALAKNLYSRLFSWLVNRINESIKAQTKVRKK-----VMGVLDIYGFEIFEDNSFEQFIIN
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pF1KF0 YCNEKLQQLFIQLILKQEQEEYEREGITWQSVEYFNNATIVDLVERPHRGILAVLDEACS
::::::::.::.: ::.::::: :: : : ..::::: : ::.: ::::.::: :
CCDS82 YCNEKLQQIFIELTLKEEQEEYIREDIEWTHIDYFNNAIICDLIENNTNGILAMLDEECL
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pF1KF0 SAGTITDRIFLQTLDTHHRHHLHYTSRQL-CP---TDKTMEFGRDFRIKHYAGDVTYSVE
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CCDS82 RPGTVTDETFLEKLNQVCATHQHFESRMSKCSRFLNDTSLPHSC-FRIQHYAGKVLYQVE
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CCDS82 GFVDKNNDLLYRDLSQAMWKASHALIKSLFPEGNPAKINL-KRPPTAGSQFKASVATLMK
530 540 550 560 570 580
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CCDS82 NLQTKNPNYIRCIKPNDKKAAHIFNEALVCHQIRYLGLLENVRVRRAGYAFRQAYEPCLE
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CCDS82 RYKMLCKQTWP-HWKGPARSGVEVLFNELEIPVEEYSFGRSKIFIRNPRTLFKLEDLRKQ
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. .. :.:: .:: :.:: .. .: :.::. :.:.: ..
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