Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9864, 422 aa
  1>>>pF1KB9864 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1329+/-0.000806; mu= 18.9027+/- 0.049
 mean_var=141.6542+/-52.573, 0's: 0 Z-trim(109.6): 258  B-trim: 1291 in 2/49
 Lambda= 0.107760
 statistics sampled from 10538 (11033) to 10538 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.339), width:  16
 Scan time:  2.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422) 2821 450.6 1.3e-126
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  753 129.1 7.7e-30
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  721 124.1 2.3e-28
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11           ( 419)  709 122.3 8.8e-28
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  659 114.5 1.8e-25
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365)  648 112.7 5.9e-25
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  646 112.4 7.3e-25
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  582 102.8 9.2e-22
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  568 100.2 3.1e-21
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  568 100.4 3.6e-21
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  568 100.4 3.7e-21
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  568 100.4 3.7e-21
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  568 100.5 3.8e-21
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  567 100.3 4.1e-21
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  558 99.0 1.2e-20
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  550 97.6 2.6e-20
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  541 96.2 6.5e-20
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  541 96.2 6.7e-20
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  541 96.3 6.9e-20
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  528 94.2 2.7e-19
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  520 92.8 5.7e-19
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  491 88.4 1.5e-17
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  487 87.7   2e-17
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400)  487 87.8 2.1e-17
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  486 87.7 2.6e-17
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  483 87.1 3.1e-17
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  483 87.1 3.2e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  464 84.2 2.5e-16
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  462 84.1 3.9e-16
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  455 82.9 7.2e-16
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  448 81.8 1.5e-15
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  440 80.5 3.4e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  436 80.0   6e-15
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  428 78.7 1.3e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  427 78.5 1.4e-14
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  417 77.0 4.4e-14
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  416 76.8 4.8e-14
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  409 75.6 8.9e-14
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  409 75.6 9.1e-14
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  409 75.6 9.3e-14
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  409 75.6 9.3e-14
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  409 75.6 9.6e-14
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  409 75.7 9.8e-14
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  406 75.3 1.4e-13
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  401 74.5 2.4e-13
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3            ( 487)  386 72.2 1.3e-12
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  380 71.0   2e-12
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  372 69.9 5.4e-12
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1         ( 529)  360 68.2 2.2e-11
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 546)  360 68.2 2.2e-11


>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5               (422 aa)
 initn: 2821 init1: 2821 opt: 2821  Z-score: 2386.7  bits: 450.6 E(32554): 1.3e-126
Smith-Waterman score: 2821; 100.0% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
              370       380       390       400       410       420

         
pF1KB9 RQ
       ::
CCDS34 RQ
         

>>CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11                (414 aa)
 initn: 685 init1: 345 opt: 753  Z-score: 649.2  bits: 129.1 E(32554): 7.7e-30
Smith-Waterman score: 753; 33.2% identity (66.6% similar) in 386 aa overlap (42-417:40-414)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 TTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVA
                                     ::  ::   :.::. :  :.. :..::...
CCDS83 DDDLERQNWSRPFNGSDGKADRPHYNYYATLLTLLIAVIVFGNVLVCMAVSREKALQTTT
      10        20        30        40        50        60         

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB9 NYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIA
       :::: ::::.::.:..::.: ..  .:...: .... ::.:..:::. ::.:::.::::.
CCDS83 NYLIVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVVGEWKFSRIHCDIFVTLDVMMCTASILNLCAIS
      70        80        90       100       110       120         

             140         150       160       170       180         
pF1KB9 LDRYWAITDPIDYVNKR--TPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPDACTI
       .::: :.. :. : : :  . ::....::..:...: :: : ..:     . .: . : :
CCDS83 IDRYTAVAMPMLY-NTRYSSKRRVTVMISIVWVLSFTISCPLLFGL----NNADQNECII
     130       140        150       160       170           180    

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB9 SKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQ
       . . ....::.. .::.:... :..: .:. . : : :: :.  ... :   :  .:  .
CCDS83 A-NPAFVVYSSIVSFYVPFIVTLLVYIKIYIVLRRR-RKRVNTKRSSRAFRAHLRAPLKE
           190       200       210        220       230       240  

     250               260       270       280       290       300 
pF1KB9 PKKS--------VNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNS
         .         ... :  .  : .    .   :      ..:  ..     . .. :..
CCDS83 AARRAQELEMEMLSSTSPPERTRYSPIPPSHHQLTLPDPSHHGLHSTPDSPAKPEKNGHA
            250       260       270       280       290       300  

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB9 KEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPF
       :.: :  ..       : .  : . ..  ..::..  .:.:... :.:..:.::.:::::
CCDS83 KDH-PKIAKIFEIQTMPNGKTRTSLKTM-SRRKLSQQKEKKATQMLAIVLGVFIICWLPF
             310       320        330       340       350       360

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB9 FIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCR
       ::. ..   :.  :..: .: . ..:::: :: .::.::. :: .:..:: ::..:    
CCDS83 FITHILNIHCD--CNIPPVLYSAFTWLGYVNSAVNPIIYTTFNIEFRKAFLKILHC    
              370         380       390       400       410        

        
pF1KB9 Q

>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 988 init1: 662 opt: 721  Z-score: 622.6  bits: 124.1 E(32554): 2.3e-28
Smith-Waterman score: 999; 40.0% identity (69.6% similar) in 415 aa overlap (11-420:24-388)

                            10        20        30        40       
pF1KB9              MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLI
                              : .: :.   .. .    ..... ..:.  .::. . 
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB9 FCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQV
       . ..:.:: :.:..   :.:.. :::::.:::::::.::.::.:....: : ..::::::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB9 TCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLI
       .::.... :. :::.::::::.::::::::::: ..:  ::::.:::..:.:.:.... :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
              130       140       150       160       170       180

       170       180       190        200       210       220      
pF1KB9 SIPPMLGWRTPEDRSDPDACTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRI
       :.::.. ::  . . . . :... ::  ::.::: ::::.: ::...:::::.  :: ::
CCDS49 SLPPFF-WRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRI
               190       200       210       220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB9 RKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDD
        : .                   :...     :.:  :  . . . :.  .  ..     
CCDS49 LKQT-------------------PNRT-----GKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSI-----
     240                               250       260       270     

        290       300        310       320       330          340  
pF1KB9 GAALEVIEVHRVGNSKEHLP-LPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEA---KRKMALARERK
                    ::.  .: .:::.:    .:.  .. . : ..:   :.:.  :::::
CCDS49 -------------NSR--VPDVPSESG----SPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERK
                             280           290       300       310 

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB9 TVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAY
       ..::::::.:.::.:::::::..::.:.:...: .   .  ...:::: :::.::.::..
CCDS49 ATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTM
             320       330       340       350       360       370 

            410       420  
pF1KB9 FNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
        :.::..::.:.:. : :  
CCDS49 SNEDFKQAFHKLIRFK-CTS
             380        390

>>CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11                (419 aa)
 initn: 651 init1: 195 opt: 709  Z-score: 612.2  bits: 122.3 E(32554): 8.8e-28
Smith-Waterman score: 709; 32.5% identity (62.0% similar) in 418 aa overlap (16-417:18-418)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB9   MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVL-GNACV
                        ::   ..: ..:..      :  ..:. :.:.. ::: ::. :
CCDS77 MGNRSTADADGLLAGRGPAAGASAGASAGLAG-----QGAAALVGGVLLIGAVLAGNSLV
               10        20        30             40        50     

        60        70        80        90       100        110      
pF1KB9 VAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLN-KWTLGQVTCDLFIALD
        ...: ::.::. .: .: :::..::....::::. .  .: .  : :.   :: ..:.:
CCDS77 CVSVATERALQTPTNSFIVSLAAADLLLALLVLPLFVYSEVQGGAWLLSPRLCDALMAMD
          60        70        80        90       100       110     

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB9 VLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWR
       :. ::.::..::::..::. :.. :. :  .   ::   ::. :::..  .. : . :  
CCDS77 VMLCTASIFNLCAISVDRFVAVAVPLRYNRQGGSRRQLLLIGATWLLSAAVAAPVLCGLN
         120       130       140       150       160       170     

        180       190       200       210       220        230     
pF1KB9 TPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRA-ARFRIRKTVK---K
         . : :: .: . .:. :..::.  .:..:  :::.::   ::.  :... . .:   .
CCDS77 DVRGR-DPAVCRL-EDRDYVVYSSVCSFFLPCPLMLLLYWATFRGLQRWEVARRAKLHGR
         180         190       200       210       220       230   

              240       250       260       270       280       290
pF1KB9 VEK--TGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAAL
       . .  .:      . :::.  ..  : . .     :.     :  :: .:    .:  . 
CCDS77 APRRPSGPGPPSPTPPAPRLPQDPCGPDCAPPAP-GLPRGPCGPDCAPAAPSLPQDPCGP
           240       250       260        270       280       290  

              300       310             320       330        340   
pF1KB9 EVIEVHRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAP------ASFERKNERNAEAKRKMALA-RERKT
       .       .     :: :.  : . :::      :..  ..  ... .:.  .. ::::.
CCDS77 D------CAPPAPGLP-PDPCG-SNCAPPDAVRAAALPPQTPPQTRRRRRAKITGRERKA
                  300         310       320       330       340    

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 VKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYF
       ...: ...:.:.::: :::.: ..  .: . : .:  : . ..:::: :: ::::::. :
CCDS77 MRVLPVVVGAFLLCWTPFFVVHITQALCPA-CSVPPRLVSAVTWLGYVNSALNPVIYTVF
          350       360       370        380       390       400   

           410        420  
pF1KB9 NKDFQNAFKKIIK-CKFCRQ
       : .:.:.:.: .. :     
CCDS77 NAEFRNVFRKALRACC    
           410             

>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 968 init1: 637 opt: 659  Z-score: 570.7  bits: 114.5 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 950; 40.8% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (36-415:38-371)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
                                     ..  ...:... . .::.:: :...: : :
CCDS23 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
        10        20        30        40        50        60       

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB9 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
       .:.. :::::::::.:::.::.::.:..  : . . :..::. ::.... :. :::.:::
CCDS23 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
        70        80        90       100       110       120       

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
       :::.::::::::::: ..: ..::  .::..:...: :.. :::::.. ::  . . . .
CCDS23 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLF-WRQAKAQEEMS
       130       140       150       160       170        180      

         190        200       210       220       230       240    
pF1KB9 ACTISKDH-GYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
        : .. .. .:::::: :::::: .:...:::::.:::: :: .                
CCDS23 DCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNP---------------
        190       200       210       220       230                

          250       260       270        280       290       300   
pF1KB9 SPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCA-NGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKE
        :.   :. ....         . ..::..::. :.....: .         : .:.   
CCDS23 -PSLYGKRFTTAHL--------ITGSAGSSLCSLNSSLHEGHS---------HSAGS---
              240               250       260                270   

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB9 HLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFI
         ::  .      : ...:::         ... :::::..: ::::.:.::.::::::.
CCDS23 --PLFFNHVKIKLADSALERK---------RISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFV
                280                290       300       310         

           370       380       390       400       410       420  
pF1KB9 VALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
       :.::::.:..:: .   :  ...:::: :::.::.::. ::..:..::.::.       
CCDS23 VSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS 
     320       330       340       350       360       370        

>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6                (365 aa)
 initn: 878 init1: 487 opt: 648  Z-score: 561.6  bits: 112.7 E(32554): 5.9e-25
Smith-Waterman score: 845; 37.6% identity (67.2% similar) in 396 aa overlap (25-418:11-362)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAA
                               . .:   :.. ...  . : ..   ..: :  :. :
CCDS50               MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMA
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCC
       :.  ..:.. ::::: :::::::.:.:::.:.. .: :...: ::   :......:. ::
CCDS50 IGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCC
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPED
       : ::::::.::::::::::. :.:. ::: .::: .:  .: :...::.::.. ::. . 
CCDS50 TCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLF-WRSHRR
        110       120       130       140       150        160     

               190        200       210       220       230        
pF1KB9 RSDPDA-CTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
        : : . :::..::  ::::::.::::::: :.:.:: ::..::.       .  .: :.
CCDS50 LSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRGS
         170       180       190       200       210               

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB9 DTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRV
        .:: .. . . ..:  .             :   ..:..      : ...  . : .. 
CCDS50 -SRHLSNRSTDSQNSFAS------------CKLTQTFCVS------DFSTSDPTTEFEKF
       220       230                   240             250         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
         : .  :. ..          ... .::     .... .::::... ::.:.:.::: :
CCDS50 HASIRIPPFDND----------LDHPGER-----QQISSTRERKAARILGLILGAFILSW
     260       270                      280       290       300    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCK
       :::::  :.. .  :   . . .. ...:::: :::.::..:. ::.::. ::::.:.:.
CCDS50 LPFFIKELIVGL--SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCR
          310         320       330       340       350       360  

      420  
pF1KB9 FCRQ
           
CCDS50 EHT 
           

>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3                (366 aa)
 initn: 904 init1: 484 opt: 646  Z-score: 559.9  bits: 112.4 E(32554): 7.3e-25
Smith-Waterman score: 901; 40.2% identity (69.7% similar) in 386 aa overlap (36-420:23-366)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
                                     ....:: :. : . ..  :. :.::: . :
CCDS29         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                       10        20        30        40        50  

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB9 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
       .:.. ::::: ::::::..:.:::.:.. .: : ..: .:::.::.....:. ::: :::
CCDS29 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
             60        70        80        90       100       110  

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
       :: ::::::: :::: ..:. ::::..:. .:...:.:. .::.::.. ::  .  :  :
CCDS29 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF-WRH-QGTSRDD
            120       130       140       150       160         170

         190        200       210       220       230       240    
pF1KB9 ACTISKDHGY-TIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
        : :..::   ::::::::::::: :.:.:: .:.:::.   .:            :...
CCDS29 ECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHK------------RQAS
              180       190       200       210                    

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB9 SPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKEH
         :   :. :::.       :    :.  .. .. ..... .  . .  ..: .  :   
CCDS29 RIA---KEEVNGQV-----LLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRS---
      220               230       240       250       260          

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB9 LPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIV
         : ::          :  :.:.. . ..:.. .::::.. :::.:.:.:..::::::. 
CCDS29 --LRSE----------F--KHEKSWR-RQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVK
         270                    280       290       300       310  

          370       380       390       400       410       420  
pF1KB9 ALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
        ::.  :.. :..   .. .. :::: :::.::.::. ::.::..::.:...:. :  
CCDS29 ELVVNVCDK-CKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCR-C  
            320        330       340       350       360         

>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20              (572 aa)
 initn: 783 init1: 429 opt: 582  Z-score: 504.2  bits: 102.8 E(32554): 9.2e-22
Smith-Waterman score: 743; 32.9% identity (64.1% similar) in 429 aa overlap (3-422:56-423)

                                           10           20         
pF1KB9                             MDVLSPGQGNNTTSP---PAPFETGGNTTG--
                                     :.. :.:... :    :.   .::...:  
CCDS13 GGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTA
          30        40        50        60        70        80     

         30         40        50        60        70        80     
pF1KB9 -ISDVTVSYQ-VITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMV
        .. ..:: : : ....:...:. :: ::  :. ..: .: ::.:.::.: .:::.::..
CCDS13 AVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLL
          90       100       110       120       130       140     

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB9 SVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYV
       :. :::..: ..::. :..:.. ::.. :.::::::.::: ::.:..::: ..   . : 
CCDS13 SATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYP
         150       160       170       180       190       200     

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB9 NKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFY
          : :.:::...: :......:. :.:::. :    :   : :... ::...:.  .::
CCDS13 AIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP-PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFY
         210       220       230       240        250       260    

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB9 IPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRL
       .:. ...:.: :.. .::    .:....: .:.             :   :...    :.
CCDS13 LPMAVIVVMYCRVYVVAR----STTRSLE-AGV-------------KRERGKASEVVLRI
          270       280            290                    300      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB9 GVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKN
         .. : ::           :::       : . ..: :               .:    
CCDS13 HCRGAATGA-----------DGA-------HGMRSAKGH---------------TF----
        310                         320                            

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB9 ERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGA--
        :.. . : . ..::.:..:::.:..:.:.:::.:::   .:::.     ..    :.  
CCDS13 -RSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFF---FVLPLGSLFPQLKPSEGVFK
      330       340       350       360          370       380     

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pF1KB9 IINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ                     
       .: :::: :: .::.::   ...:. :: ....:. ::.                     
CCDS13 VIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ-CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSG
         390       400       410       420        430       440    

CCDS13 LRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFR
          450       460       470       480       490       500    

>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (342 aa)
 initn: 681 init1: 420 opt: 568  Z-score: 494.6  bits: 100.2 E(32554): 3.1e-21
Smith-Waterman score: 624; 32.6% identity (59.7% similar) in 365 aa overlap (10-374:12-298)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB9   MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVV
                  .: :.::::            :..:  .. ...:: ::. .::::  :.
CCDS83 MVFLSGNASDSSNCTQPPAP------------VNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVI
               10        20                    30        40        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 AAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVL
        ..: .: :..:..: : .:::.::...  :::..:...::. :..:.: :... :.:::
CCDS83 LSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVL
       50        60        70        80        90       100        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 CCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTP
       :::.::. :: :..::: ... :. : .  : ::.   .  .: ....::: :..::: :
CCDS83 CCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQP
      110       120       130       140       150       160        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB9 EDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
         . :   : :... ::...:..:.::.:: ..::.: :.. .:. . :       :.: 
CCDS83 APE-DETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGL-----KSGL
      170        180       190       200       210            220  

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pF1KB9 DTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRV
        :                .: :..  : .. : . :         : .: :         
CCDS83 KT---------------DKSDSEQVTLRIHRKNAPA---------GGSGMA--------S
                           230       240                        250

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
       ...: :. .                         : . ..::.:..:::::..: :.:::
CCDS83 AKTKTHFSV-------------------------RLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCW
                                       260       270       280     

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCK
       ::::   ::.:. : .                                            
CCDS83 LPFF---LVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW
            290       300       310       320       330       340  

>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (429 aa)
 initn: 807 init1: 439 opt: 568  Z-score: 493.6  bits: 100.4 E(32554): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 731; 32.8% identity (60.5% similar) in 415 aa overlap (10-422:12-349)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB9   MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVV
                  .: :.::::            :..:  .. ...:: ::. .::::  :.
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAP------------VNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVI
               10        20                    30        40        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB9 AAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVL
        ..: .: :..:..: : .:::.::...  :::..:...::. :..:.: :... :.:::
CCDS60 LSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVL
       50        60        70        80        90       100        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB9 CCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTP
       :::.::. :: :..::: ... :. : .  : ::.   .  .: ....::: :..::: :
CCDS60 CCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLFGWRQP
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KB9 EDRSDPDACTISKDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGA
         . :   : :... ::...:..:.::.:: ..::.: :.. .:. . :       :.: 
CCDS60 APE-DETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGL-----KSGL
      170        180       190       200       210            220  

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pF1KB9 DTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRV
        :                .: :..  : .. : . :         : .: :         
CCDS60 KT---------------DKSDSEQVTLRIHRKNAPA---------GGSGMA--------S
                           230       240                        250

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB9 GNSKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCW
       ...: :. .                         : . ..::.:..:::::..: :.:::
CCDS60 AKTKTHFSV-------------------------RLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFVLCW
                                       260       270       280     

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pF1KB9 LPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKI--IK
       ::::.:  .  :  .     :..  :. :::: :: .::.::   ...:..::...  :.
CCDS60 LPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVF-KIVFWLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVLRIQ
         290       300        310       320       330       340    

        420                                                        
pF1KB9 CKFCRQ                                                      
       : .::.                                                      
CCDS60 C-LCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFSSM
           350       360       370       380       390       400   




422 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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