Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9831
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9831, 342 aa
1>>>pF1KB9831 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4864+/-0.0012; mu= 14.8869+/- 0.071
mean_var=88.2313+/-24.174, 0's: 0 Z-trim(101.9): 245 B-trim: 828 in 2/46
Lambda= 0.136541
statistics sampled from 6376 (6696) to 6376 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 2296 463.0 1.6e-130
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 580 125.0 9.2e-29
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 559 120.8 1.6e-27
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 539 116.9 2.7e-26
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 529 114.9 1e-25
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 527 114.6 1.4e-25
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 524 114.0 2e-25
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 517 112.6 5e-25
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 513 111.8 9.1e-25
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 500 109.2 5e-24
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 497 108.6 7.6e-24
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 497 108.7 8.6e-24
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 494 108.0 1.1e-23
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 494 108.0 1.1e-23
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 488 106.8 2.6e-23
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 475 104.3 1.6e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 475 104.3 1.7e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 475 104.3 1.7e-22
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 470 103.3 3.2e-22
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 463 101.9 8.5e-22
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 460 101.4 1.3e-21
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 457 100.7 1.7e-21
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 457 100.8 1.9e-21
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 457 100.8 1.9e-21
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 455 100.4 2.5e-21
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 448 99.0 6.3e-21
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 448 99.0 6.6e-21
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 436 96.6 3.5e-20
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 431 95.6 6.6e-20
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 420 93.5 3.3e-19
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 409 91.3 1.3e-18
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 399 89.3 5.2e-18
CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19 ( 330) 392 87.9 1.3e-17
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 386 86.8 3.1e-17
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 381 85.8 5.9e-17
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 381 85.8 6.2e-17
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 379 85.4 7.7e-17
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 379 85.4 8.2e-17
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 378 85.2 9.5e-17
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 377 85.0 9.8e-17
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 375 84.6 1.2e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 375 84.6 1.4e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 375 84.6 1.5e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 375 84.6 1.5e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 375 84.6 1.5e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 375 84.6 1.5e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 375 84.6 1.5e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 375 84.7 1.5e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 375 84.7 1.5e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 375 84.7 1.6e-16
>>CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 (342 aa)
initn: 2296 init1: 2296 opt: 2296 Z-score: 2456.7 bits: 463.0 E(32554): 1.6e-130
Smith-Waterman score: 2296; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVNLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 MADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYEKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 SVPVLIIHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEVKRRALWMVCTVLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVPVLIIHIFIVFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEVKRRALWMVCTVLAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 FIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYCFLTKKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYCFLTKKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB9 RKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
310 320 330 340
>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 521 init1: 178 opt: 580 Z-score: 629.8 bits: 125.0 E(32554): 9.2e-29
Smith-Waterman score: 580; 29.4% identity (65.5% similar) in 316 aa overlap (5-314:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPHDSSH--MDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVN
.::: ... :.:::. ..:..::::.:.: ....: . . :: .:.:
CCDS94 MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVR--NETTTYMIN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQA
:.:.:.::..:::. : :. .. :: . .::... ::. : : :. :: :. .:: :
CCDS94 LAMSDLLFVFTLPFRIFYFTTR-NWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCISVDRFLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYE
.. :.:. :.. . . .:....:... ....::. : :.. :::..
CCDS94 IVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTH----SQGNNASEACFENFP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 KGSVPVLI--IHIFI-VFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEVKRRALWMVC
... . . : ::: . .::. ... . :. ....:: .:: .:. : ..: :.
CCDS94 EATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLT-KPVTLSRSKINKTKVLKMIF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELG-FQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYC
. : .: .::::... . ..:.. : . . :. . .:::. .:: .::..:
CCDS94 VHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIVYY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB9 FLTKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
: . ... . : .:.: :
CCDS94 FTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
300 310 320 330 340
>>CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX (337 aa)
initn: 444 init1: 239 opt: 559 Z-score: 607.6 bits: 120.8 E(32554): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 559; 31.2% identity (65.9% similar) in 317 aa overlap (4-313:15-316)
10 20 30 40
pF1KB9 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKF
::. .: .:: .. .::.: :.: ..::.::.:. . : .:
CCDS14 MDETGNLTVSSATCHDT--ID-DFRNQVYSTLYSMISVVGFFGNGFVLYVLIKTY--HKK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 NEIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLG
. ....:.::..::.: . :::: .::: ..: :.. ::: .. ...: :::. :.
CCDS14 SAFQVYMINLAVADLLCVCTLPLRVVYYVHKGIWLFGDFLCRLSTYALYVNLYCSIFFMT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 VITYNRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGN
.... : :.. :... . :.:.. . . ::. .. ..: ::. :.. ..:
CCDS14 AMSFFRCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSPFLMAK-----PQKDEKNN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 VTRCFEHYEKGSVP--VLIIHIFIVFSFFLV-FLIILFCNLVIIRTLLMQPVQQQRNAEV
:.::: . ... ::..: .: :.. :.::. : .:: ::: . .. .:
CCDS14 -TKCFEPPQDNQTKNHVLVLHYVSLFVGFIIPFVIIIVCYTMIILTLLKKSMK--KNLSS
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 KRRALWMVCTVLAVFIICFVPHHV---VQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLS
...:. :. .: :.:.. :.:.:. ..: . : :: .. .. . .:: : .
CCDS14 HKKAIGMIMVVTAAFLVSFMPYHIQRTIHLHFLHNETKPCDSVLR--MQKSVVITLSLAA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 TNCVLDPVIYCFLTKKFRKHL-TEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
.:: .::..: : .:::.: : . .:. :
CCDS14 SNCCFDPLLYFFSGGNFRKRLSTFRKHSLSSVTYVPRKKASLPEKGEEICKV
290 300 310 320 330
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 458 init1: 280 opt: 539 Z-score: 585.6 bits: 116.9 E(32554): 2.7e-26
Smith-Waterman score: 540; 30.0% identity (65.3% similar) in 337 aa overlap (9-342:48-367)
10 20 30
pF1KB9 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLW
:: .. :.. ::.::..:...: .:.
CCDS14 YSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPMDEKLLSTVLTTSYSVIFIVGLVGNIIALY
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 VFARLYPCKKFNEIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFF
:: .. .: : :.:...:...::.:... ::. :.:. ::..: : .::.:.: ::.
CCDS14 VFLGIH--RKRNSIQIYLLNVAIADLLLIFCLPFRIMYHINQNKWTLGVILCKVVGTLFY
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 INTYCSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDST
.: : :. .:: :. .:. ..: :. .: : :..: . ..:. .:. ..::
CCDS14 MNMYISIILLGFISLDRYIKINRSIQQRKAITTKQSIYVCCIVWMLALGGFLTMIIL---
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NTVPDSAGSGNVTRCFEHYEKGSVPVLIIHIFI-VFSFFLVFLIILFCNLVIIRTLLMQP
:. . :. : : ::.. .: .. : :: : :.:.::.:.. . : ..::
CCDS14 -TL--KKGGHNSTMCFHYRDKHNAKGEAIFNFILVVMFWLIFLLIILSYIKIGKNLLRIS
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 VQQQRNAEVKRRALWMVCT--VLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQDSKFHQAINDAH
.... . . : . :: .: :::::.:. .. . ..:. .. ... .. ..
CCDS14 KRRSKFPNSGKYATTARNSFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQLNVSSCYWKEIVHKTN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 QVTLCLLSTNCVLDPVIYCFLTKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQI
.. : : : : ::::.: ......:: . . .. : . . :: .....: :.
CCDS14 EIMLVLSSFNSCLDPVMYFLMSSNIRKIMCQLLFR-RFQGEPSR--SESTSE----FK--
310 320 330 340 350 360
340
pF1KB9 PGNSLKN
:: ::..
CCDS14 PGYSLHDTSVAVKIQSSSKST
370 380
>>CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 (362 aa)
initn: 431 init1: 310 opt: 529 Z-score: 575.2 bits: 114.9 E(32554): 1e-25
Smith-Waterman score: 529; 28.9% identity (65.0% similar) in 311 aa overlap (5-311:7-304)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPHDSSHMDSEFRYTLFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFNEIKIFMVN
.. :.::. . . : .: ... .:. .: .::. : .. ::. ....:
CCDS12 MGNHTWEGCHVDSRVDHLFPPSLYIFVIGVGLPTNCLALWAAYR--QVQQRNELGVYLMN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGVITYNRFQA
:..::.:.. :::::. :. .. ::: :.. : .:. : : :.::: :. .:. :
CCDS12 LSIADLLYICTLPLWVDYFLHHDNWIHGPGSCKLFGFIFYTNIYISIAFLCCISVDRYLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVPDSAGSGNVTRCFEHYE
:..:.. :. : ....: :.:.. .:: : :. : . : : : :::..
CCDS12 VAHPLRFARLRRVKTAVAVSSVVWATELGANSAPLFHD--ELFRDRY---NHTFCFEKFP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 -KGSVPVLIIH-IFIVFSFFLVFLIILFCNLV-IIRTLLMQPVQQQRNAEVKRRALWMVC
.: : . .. .:. : : ..... . ... .: . ...:..:..:: ::
CCDS12 MEGWVAWMNLYRVFVGFLFPWALMLLSYRGILRAVRGSV--STERQEKAKIKRLAL----
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 TVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQ-DSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCVLDPVIYC
...:. ..::.:.::. : . :: : :.. . .:.. .: . : ::: ::..::
CCDS12 SLIAIVLVCFAPYHVLLLSRSAIYLGRPWDCGFEERVFSAYHSSLAFTSLNCVADPILYC
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB9 FLTKKFRKHLTEKFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIPGNSLKN
.... :. ... ....
CCDS12 LVNEGARSDVAKALHNLLRFLASDKPQEMANASLTLETPLTSKRNSTAKAMTGSWAATPP
290 300 310 320 330 340
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 369 init1: 189 opt: 527 Z-score: 572.9 bits: 114.6 E(32554): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 527; 28.1% identity (62.9% similar) in 334 aa overlap (13-340:49-373)
10 20 30 40
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:.. .: :: ..:..: ..:. ..:.:
CCDS31 AGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMF--
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50 60 70 80 90 100
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.. : .. :...: ::..::.:...::: : :: :. .::. .:.. .: .: :
CCDS31 VFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLY
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110 120 130 140 150 160
pF1KB9 CSVAFLGVITYNRFQAVTRPIKTAQANTRKRGISLSLVIWVAIVGAASYFLILDSTNTVP
:. :: :. .:...:. :.:. .: .: .:...:. .: : : .:. ..:..
CCDS31 GSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISPILFYSGTGVRK
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170 180 190 200 210 220
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... . : :. .. .: . . ..: : :. :: : .:.:.:... ..
CCDS31 NKTITCYDTTSDEYLRS----YFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLD--
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230 240 250 260 270
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CCDS31 -NSPLRRKSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVT
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280 290 300 310 320 330
pF1KB9 LCLLSTNCVLDPVIYCFLTKKFRKHLTE--KFYSMRSSRKCSRATTDTVTEVVVPFNQIP
: : : .::..: . ::..:.. . : :: . . . : . ... :.:
CCDS31 RGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNG
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340
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.::
CCDS31 DTSL
370
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10 20 30
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CCDS14 DRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVSLF
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40 50 60 70 80 90
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: : :. :: :. .:: :.. :... ::. . . .:. ..... ....:
CCDS14 TNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTT
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:. .. .: ::: . : . . : ::: : .:.. ... . :. :..:::
CCDS14 NV------NNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTL-R
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220 230 240 250 260 270
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.:. .. . :...: :. . .:::..::::.. : . ..:.. . : . .
CCDS14 KPATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNCFLERFAKIM
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280 290 300 310 320 330
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. .:::: . :: .:: :: : ..:.:
CCDS14 YPITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEE
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPHDSSHMDSEFRYT--LFPIVYSIIFVLGVIANGYVLWVFARLYPCKKFN
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CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIR--SKSN
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pF1KB9 EIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGV
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CCDS31 FI-IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGL
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CCDS31 ITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMIL--TNRQPRDK---NV
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CCDS31 KKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRK
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pF1KB9 ALWM-VCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAEL-GFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCV
. . : ..:::.::::: : ...:.::.. : .... ... :: : : :
CCDS31 KVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNAC
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CCDS31 LDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
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CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
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CCDS14 IFRLRP---WDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYW
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CCDS14 LPGSAQSSSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEADCRVLNIVNVVYKV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]