Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9778
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9778, 798 aa
1>>>pF1KB9778 798 - 798 aa - 798 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7801+/-0.00137; mu= 14.9600+/- 0.082
mean_var=180.1803+/-35.287, 0's: 0 Z-trim(106.1): 136 B-trim: 37 in 2/47
Lambda= 0.095548
statistics sampled from 8665 (8798) to 8665 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 3.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 5589 784.1 0
CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 2408 345.6 1.9e-94
CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 2309 332.0 2.4e-90
CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2226 320.5 6.7e-87
CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 2009 290.6 6.6e-78
CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 1877 272.4 1.9e-72
CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 1877 272.4 2e-72
CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 1804 262.3 2e-69
CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 1695 247.3 6.5e-65
CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1515 222.9 3.5e-57
CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1515 222.9 3.6e-57
CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1515 223.0 3.6e-57
CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1101 165.4 3.1e-40
CCDS9499.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 494) 481 79.8 1.3e-14
CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 465 77.4 5.1e-14
>>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa)
initn: 5589 init1: 5589 opt: 5589 Z-score: 4179.0 bits: 784.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5589; 100.0% identity (100.0% similar) in 798 aa overlap (1-798:1-798)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPT
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CCDS71 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLV
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CCDS71 SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDF
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CCDS71 LRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQR
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CCDS71 RIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQ
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CCDS71 ISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPNDGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 CHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTL
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CCDS71 CHLENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISI
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CCDS71 SANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCSNISI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPKCHEG
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CCDS71 GDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPKCHEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRK
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CCDS71 NGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQCVCRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 RDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDTSTCE
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CCDS71 RDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDTSTCE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRAFNKGEKKDT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 CTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVHVVEN
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CCDS71 CTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVHVVEN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGEN
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB9 PIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS71 PIYKSAVTTVVNPKYEGK
790
>>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa)
initn: 1701 init1: 479 opt: 2408 Z-score: 1809.3 bits: 345.6 E(32554): 1.9e-94
Smith-Waterman score: 2480; 45.1% identity (73.7% similar) in 778 aa overlap (25-797:29-787)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQE
: : ...:: .:. ..: :.::.. :
CCDS11 MRARPRPRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSD-----E
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 GMPT-SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQ
..: : ::: : : : .: :..:: : . . ... ......: . . .::..
CCDS11 ALPLGSPRCDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSSQ-----VTQVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 PQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRR
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CCDS11 PQRIALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 ITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAK-LRNPCTSEQN-CTSPFSYKNVLSLTNKGEVFN
.::..:::::.::.: : ::. .: . :.::: . .. : :.::.::.::.. ::
CCDS11 LTSNLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPCYDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ELVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRN-VTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGG
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CCDS11 EEVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 IVLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNL
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CCDS11 IVQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 IPKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGEN
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CCDS11 IPGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLN--NEVIPG
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 GRKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI
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CCDS11 LKSCMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCPQEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGEC
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CCDS11 PNSHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDE-CSPREGQPVCSQRGEC
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 VCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACD
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CCDS11 LCGQCVCHSSD-FGKI-TGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 CSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCRA
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CCDS11 CTTRTDTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKK
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 FNKGEKKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNN
:..: .: : :. . ..:: .: . . : :. : :. ::: : : ....
CCDS11 FDRGALHDENT--CNRYCRDEIESVKEL-KDTGKDAVN-CTYKNEDDCVVRFQYYEDSSG
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 EVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKM
. ...:::.:::: ::::. .. .:...:.::::: :::::::. ::::.::::::.:.
CCDS11 KSILYVVEEPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERA
710 720 730 740 750 760
780 790
pF1KB9 NAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS11 RAKWDTANNPLYKEATSTFTNITYRGT
770 780
>>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa)
initn: 1489 init1: 468 opt: 2309 Z-score: 1735.5 bits: 332.0 E(32554): 2.4e-90
Smith-Waterman score: 2309; 43.7% identity (71.0% similar) in 775 aa overlap (25-789:26-780)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMP
: : ...: :: ::. :.:.::.. : : :
CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 TS--ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ
: .::: : :.:: .::.: .: . .. ......:.: :. :. ::
CCDS30 RSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSA----GWDVIQMTPQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT
.... :: :. :: :. ...::::.::::::::: ::::::.:..:::: : .:::..:
CCDS30 EIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQ---NCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNE
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CCDS30 SNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 LVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWR-NVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGI
: :::.: : :.:::::::..:.::: :::: .. .::::.:: :.: ::::::.
CCDS30 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 VLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLI
: :.:::::: : : :: :. .::::.: : .::.::::. :::::.. .::.. ::
CCDS30 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 PKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENG
: ..: :...:.:.:::::.::::. :.: : : ... . . :..::. :.
CCDS30 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQ--
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 RKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDS-FKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI
::: ...::: ..::.:. . .::.. .. : .::.:: . .:: . : : : : : :.
CCDS30 RKCEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGC-SVGL
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 -PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGE
:.: .:. :.::. :: :.:. : .: .:::. : :. .. ::. ... .::. :.
CCDS30 EPNSARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGE-NQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 CVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSAC
: :.:: : . . ..:: : :::::::.: :..:..:.:.: :.: :.:. .: :. :
CCDS30 CSCNQCSCFESE-FGKIY-GPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 DCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCR
.:: : :::.. .::::. :: : :: :.::.: :. :: : :: .:. ...::.:
CCDS30 NCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700
pF1KB9 AFNKGEKKD-TCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNG
...:. . :: . : :: :.. : : . : : . :: ..:::
CCDS30 LLHSGKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQE-----AVLCFYKTAKDCVMMFTYVELP
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 NNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKE
... . :...::: . :. . :. .::..:.:.::::: :::::. ::::::::::..:
CCDS30 SGKSNLTVLREPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSE
710 720 730 740 750 760
770 780 790
pF1KB9 KMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
. :... . ::.:.. ..:
CCDS30 RSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD
770 780 790
>>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 (798 aa)
initn: 2029 init1: 506 opt: 2226 Z-score: 1673.6 bits: 320.5 E(32554): 6.7e-87
Smith-Waterman score: 2477; 45.0% identity (72.9% similar) in 771 aa overlap (32-796:48-791)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 NLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMPTS
: :: .:: . :.:.:: . .: : .
CCDS88 ESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQPAPSCQKCILSHPSCAWCKQLNFTASGEAEA
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVL
:: : : .::: ...:.:::.... ... ... ..: : ::. ::.. .
CCDS88 RRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQGARG-------EGATQLAPQRVRV
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFR
:: :::: . ..: ::: ::.::::::::::::::::: :..:: :. .....: . :
CCDS88 TLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVRLQEVTHSVR
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 IGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSE-QNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGKQR
:::::::.:::.:..::.:.:::.:: .. . : ::::...:::::. ...:.. ::.:
CCDS88 IGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTRLERCQSPFSFHHVLSLTGDAQAFEREVGRQS
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
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CCDS88 VSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWRNVSRLLVFTSDDTFHTAGDGKLGGIFMPSDGH
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310 320 330 340 350
pF1KB9 CHLENN-MYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLIPKSAVGT
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CCDS88 CHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQELSKLIPKSAVGE
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360 370 380 390 400 410
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CCDS88 LSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKREGKAEDRGQCNH
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420 430 440 450 460 470
pF1KB9 ISIGDEVQFEISITSNKC-PKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK
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CCDS88 VRINQTVTFWVSLQATHCLP--EPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCDCNC-SDTQPQAPH
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CCDS88 CSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTGPLCSGKGHCQCGR
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pF1KB9 CVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLD
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CCDS88 CSCSGQS------SGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHANRTGRACECSGD
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..: . .: .:.:.: :.:. :.: : . : :..: : : .:..:..: :: :
CCDS88 MDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLDG-YYGALCDQCPGCKTPCERHRDCAECGAFRTG
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CCDS88 PLATNCSTACAHTNVTLALA------PILDD--GWCKERTLDNQLFFFLVEDDARGTVVL
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CCDS88 RV--RPQEKGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFEKEQQQLNW
720 730 740 750 760 770
780 790
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CCDS88 KQDSNPLYKSAITTTINPRFQEADSPTL
780 790
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CCDS13 DPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQK--------------QLSPQ
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CCDS13 KVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEIT
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CCDS13 ESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEV
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CCDS13 GKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTP
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CCDS13 NDGRCHLEDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA
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CCDS13 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD
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CCDS13 GVQINVPITFQVKVTATECIQEQS--FVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCRDQSRDRS-L
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CCDS13 CH-GKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC
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CCDS13 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER
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CCDS13 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCECHSG-YQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK
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: .:. : ..... .::. :::.: . :: .: . .: ..
CCDS13 GPFGKNCSAACPGLQLSN--------NPVKG---RTCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRY
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CCDS13 LIYVDESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKS
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CCDS13 QWNN-DNPLFKSATTTVMNPKFAES
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CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKN
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CCDS74 KPLSVGRQKNSS------DIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDL
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CCDS74 SASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIP
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CCDS74 YFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRND
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CCDS74 SLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQ
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CCDS74 NNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLG
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CCDS74 DTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPV
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CCDS74 GLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLS
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CCDS74 TDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLC
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CCDS74 GGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGP
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CCDS74 TCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGS
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pF1KB9 SHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALL
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CCDS74 VSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLL
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pF1KB9 LIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
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CCDS74 CIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTD
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CCDS74 C
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CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPS-GV
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pF1KB9 SARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVT-NRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQL
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CCDS22 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSVGRQKNSS------DIVQIAPQSL
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pF1KB9 VLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSD
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CCDS22 ILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSN
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pF1KB9 FRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNELVGK
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CCDS22 FRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKN
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pF1KB9 QRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWRNVT-RLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGIVLPN
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CCDS22 QKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPN
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CCDS22 DGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGAT
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pF1KB9 VGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENGRKCS
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CCDS22 VGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCS
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pF1KB9 NISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDSFKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGIPESPK
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CCDS22 HMKVGDTASFSVTVNIPHCERR-SRHIIIKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSK
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pF1KB9 CHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGECVCGQC
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CCDS22 CHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQC
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 VCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSACDCSLDT
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CCDS22 ICHLSPYGN-IY-GPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTST
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CCDS22 DSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQ
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pF1KB9 KKDTCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNGNNEVMVH
.. :...:. . : : .: . : :. . ..: . : ..........:
CCDS22 AREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGSVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIH
650 660 670 680 690
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pF1KB9 VVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKEKMNAKWD
... .:: :.: :. :: .:.:::..:: :::::. .:::.: :::: :. .:::.
CCDS22 SINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQ
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pF1KB9 TGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK
:: ::.:.....: : :. .
CCDS22 TGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
760 770 780
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pF1KB9 TNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQQLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSM
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CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM
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pF1KB9 KDDLENVKSLGTDLMNEMRRITSDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTS-EQNCT
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CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYFCL
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CCDS74 PTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHL
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CCDS74 LVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVL
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CCDS74 LIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEG
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CCDS74 ALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS-
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CCDS74 DCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCER
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CCDS74 CPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREECVDKCKLAGATISEEED-----FSKDGSVSCS
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CCDS74 LQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWK
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CCDS74 LLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC
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CCDS63 QKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPN
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CCDS63 DGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGAT
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CCDS63 VGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGT--LFQHQKKCS
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CCDS63 CHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCECGEDMLSTDS----CKEAPDHPSCSGRGDCYCGQC
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CCDS63 SINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQ
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CCDS58 --RDRRCNTQAELLAAGCQRESIVVMESSFQITEETQIDTTLRRS----------QMSPQ
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CCDS58 GLRVRLRPGEERHFELEVFEPLESPVDLYILMDFSNSMSDDLDNLKKMGQNLARVLSQLT
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CCDS58 SDYTIGFGKFVDKVSVPQTDMRPEKLKEP---WPNSDPPFSFKNVISLTEDVDEFRNKLQ
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CCDS58 G-ERISGNLDAPEGGFDAILQTAVCTRDIGWRPDSTHLLVFSTESAFHYEADGANVLAGI
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CCDS58 MSRNDERCHLDTTGTYTQYRTQDYPSVPTLVRLLAKHNIIPIFAVTNYSYSYYEKLHTYF
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CCDS58 PVSSLGVLQEDSSNIVELLEEAFNRIRSNLDIRALDSPRGLRTEVTSKMFQK---TRTGS
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CCDS58 FHIRRGEVGIY-QVQLRALEHVDGTHVCQLPEDQKGNIHLKP-SFSDGLKMDAGIICDVC
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CCDS58 TCELQKEVRSARCSF-NGDFVCGQCVCSEGWSGQTCNCSTGSLS--DIQP-CLREGEDKP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]