FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9572, 788 aa 1>>>pF1KB9572 788 - 788 aa - 788 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2991+/- 0.001; mu= 2.9046+/- 0.060 mean_var=217.6038+/-45.590, 0's: 0 Z-trim(111.3): 35 B-trim: 91 in 1/50 Lambda= 0.086944 statistics sampled from 12237 (12256) to 12237 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16 Scan time: 3.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6109.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 805) 3166 410.5 5.6e-114 CCDS83284.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 581) 1996 263.6 6.5e-70 CCDS55224.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 610) 1858 246.3 1.1e-64 CCDS47845.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 ( 395) 1568 209.8 6.9e-54 CCDS76352.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 ( 575) 971 135.1 3.3e-31 CCDS7628.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 ( 996) 971 135.2 5.1e-31 CCDS76351.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1008) 971 135.2 5.1e-31 CCDS7627.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1026) 971 135.2 5.2e-31 CCDS7625.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1094) 971 135.2 5.5e-31 CCDS76348.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2826) 971 135.5 1.2e-30 CCDS76349.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2875) 971 135.5 1.2e-30 CCDS7626.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (2948) 971 135.5 1.2e-30 CCDS3352.1 TACC3 gene_id:10460|Hs108|chr4 ( 838) 677 98.3 5.6e-20 >>CCDS6109.1 TACC1 gene_id:6867|Hs108|chr8 (805 aa) initn: 4660 init1: 3107 opt: 3166 Z-score: 2159.7 bits: 410.5 E(32554): 5.6e-114 Smith-Waterman score: 4949; 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CCDS76 QDYPQPSDLSTFVNETKFSSPTEELDYRNSYEIEYMEKIGSSLPQDDDAPKKQALYLMFD 200 210 220 230 240 250 470 480 490 500 510 pF1KB9 TEQ---VKFLCFLLS----GCKVKKHETQSLALDACSRDEGAVISQISDISNRDGHATDE : : :: .: :. .. : ... .... : .. :...: CCDS76 TSQESPVKSSPVRMSESPTPCSGSSFEETEALVNTAAKNQHPVPRGLA--PNQESHLQVP 260 270 280 290 300 310 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 EKLASTSCGQKSAGAEVKGIE-KETCQKMEEDGSTVLGLLESSAEKAPVSVSCGGESPLD :: .. . :. ..:: .:. . : : : : : : :.: CCDS76 EKSSQKELEAMGLGTPSEAIEIREAAHP--TDVSISKTALYSRIGTAEV------EKPA- 320 330 340 350 360 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 GICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIE :. ... : ..: . : :::::: :..::: ::::.:.::.:::::::::::::::::: CCDS76 GLLFQQPDLDSALQIARAEIITKEREVSEWKDKYEESRREVMEMRKIVAEYEKTIAQMIE 370 380 390 400 410 420 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 DEQRTSMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKK :::: . .:... :::..:::::::::::::.::.:::::::..: :::::.::::.::. CCDS76 DEQREKSVSHQTVQQLVLEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKR 430 440 450 460 470 480 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 CAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVE :::.::.:::.:::::::::.:::::::.:: :::::: ::. :.:: .:.:::::..:. CCDS76 CAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAHQASLRKEQLRVD 490 500 510 520 530 540 760 770 780 pF1KB9 SLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD .:::.:.:::.:::::::::::::::.::. CCDS76 ALERTLEQKNKEIEELTKICDELIAKMGKS 550 560 570 >>CCDS7628.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (996 aa) initn: 1322 init1: 943 opt: 971 Z-score: 670.4 bits: 135.2 E(32554): 5.1e-31 Smith-Waterman score: 1078; 33.1% identity (57.9% similar) in 841 aa overlap (37-787:179-996) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 QILSPVQWAKWTWSAVRGGAAGEDEAGGPEGDPEEEDSQAETKSLSFSSDSEGNFETPEA :.:: .. : . :: : .: . CCDS76 KSTDSVPISKSTLSRSLSLQASDFDGASSSGNPEAVALAPDAYSTGSSSASSTLKRTKKP 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 ETPIRSPFKESCDPSLGLAGPGAKSQESQEADEQLVAEVVEKCSSKTCSKPSENEVPQQA . : . . . :. : .: . .:: ::. .. :. .:.: .. ...: :. : CCDS76 RPPSLKKKQTTKKPT---ETPPVK-ETQQEPDEESLVPSGENLASETKTESAKTEGPSPA 210 220 230 240 250 260 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 IDSHS-----VKNFREEPEHDFSKISIVRPFSIETKDSTDISAVLGTKAAHGCVTAVSGK . .. : : . : ..: : : .. : .: :. .. .:. CCDS76 LLEETPLEPAVGPKAACPLDSESAEGVVPPAS--GGGRVQNSPPVGRKTLPLTTAPEAGE 270 280 290 300 310 320 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 ALPSSPPDALQDEAMTEGSMGVTLEASAEADLKAGNSCPELVPSRRSKLRKP-KPVPLRK . ::. :... ..: ..: :: . : .. .. : : .. .:: .:::. CCDS76 VTPSDSGG--QEDSPAKG-LSVRLEFDYSEDKSSWDNQQENPPPTKKIGKKPVAKMPLRR 330 340 350 360 370 250 260 270 280 pF1KB9 ---KAIGGEFSDTNAAVEGTP-----LP--KASYHFSPEELDE-NTSPLLGDARFQKSPP : ....: :. .: .: :..: :. .. :. : .:. . ...:.:: CCDS76 PKMKKTPEKLDNTPASPPRSPAEPNDIPIAKGTYTFDIDKWDDPNFNPFSSTSKMQESPK 380 390 400 410 420 430 290 300 310 320 330 340 pF1KB9 DLKETPGTLSSDTNDSGVE---LGEESRSSPLKLEFDFTEDTGNIEARKALPRKLGRKLG : . ... :: : .:. . .. ::: : .: .. .:: . :.. CCDS76 -LPQQSYNFDPDTCDESVDPFKTSSKTPSSPSKSPASFEIPASAMEANGVDGDGLNK--- 440 450 460 470 480 490 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 STLTPKIQKDGISKSAGLEQPTDPVARDGPLSQTSSKPDPSQWESPSFNPFGS---HSVL : .: :. .. .: . .:::. :. ::. .: : : :.. CCDS76 ----PAKKKKTPLKTDTFRVKKSP--KRSPLSDPPSQ-DPTPAATPETPPVISAVVHATD 500 510 520 530 540 410 420 430 440 pF1KB9 QNSPPLSSEGSYHFDPDNFDESMDPFKPT---TTLTSSDFCSPT---------------- ... .... . : ...: .:. : .. . : ::: CCDS76 EEKLAVTNQKWTCMTVDLEADKQDYPQPSDLSTFVNETKFSSPTEELDYRNSYEIEYMEK 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 pF1KB9 -GNHVNEILESPKKAKSRLITTTEQ---VKFLCFLLS----GCKVKKHETQSLALDACSR :. . . ..::: :. : : :: .: :. .. : ... .. CCDS76 IGSSLPQDDDAPKKQALYLMFDTSQESPVKSSPVRMSESPTPCSGSSFEETEALVNTAAK 610 620 630 640 650 660 500 510 520 530 540 pF1KB9 DEGAVISQISDISNRDGH-----ATDEEKLASTSCGQKSAGAEVKGIE------KETCQK .. : .. :...: .....: . . : : . :. . : .. CCDS76 NQHPVPRGLAP--NQESHLQVPEKSSQKELEAMGLGTPSEAIEITAPEGSFASADALLSR 670 680 690 700 710 720 550 560 570 pF1KB9 MEEDGST--VLGLLESS-AEKAP----------------VSVSCGG----------ESPL . . : .: :: . ::: : ::.: . :.: CCDS76 LAHPVSLCGALDYLEPDLAEKNPPLFAQKLQREAAHPTDVSISKTALYSRIGTAEVEKPA 730 740 750 760 770 780 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 DGICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMI :. ... : ..: . : :::::: :..::: ::::.:.::.::::::::::::::::: CCDS76 -GLLFQQPDLDSALQIARAEIITKEREVSEWKDKYEESRREVMEMRKIVAEYEKTIAQMI 790 800 810 820 830 840 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 EDEQRTSMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALK ::::: . .:... :::..:::::::::::::.::.:::::::..: :::::.::::.:: CCDS76 EDEQREKSVSHQTVQQLVLEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLK 850 860 870 880 890 900 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 KCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKV .:::.::.:::.:::::::::.:::::::.:: :::::: ::. :.:: .:.:::::..: CCDS76 RCAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAHQASLRKEQLRV 910 920 930 940 950 960 760 770 780 pF1KB9 ESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD ..:::.:.:::.:::::::::::::::.::. CCDS76 DALERTLEQKNKEIEELTKICDELIAKMGKS 970 980 990 >>CCDS76351.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1008 aa) initn: 1322 init1: 943 opt: 971 Z-score: 670.3 bits: 135.2 E(32554): 5.1e-31 Smith-Waterman score: 1082; 35.6% identity (54.3% similar) in 749 aa overlap (252-787:264-1008) 230 240 250 260 270 pF1KB9 LVPSRRSKLRKPKPVPLRKKAIGGEFSDTNAAVEGTPL-----PKASYHFSPEELDENTS : .: ::: :::. .. : . . CCDS76 EPDEESLVPSGENLASETKTESAKTEGPSPALLEETPLEPAVGPKAACPLDSESAEGVVP 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 PLLGDARFQKSPPDLKET-PGTLSSDT-----NDSGVELGEESRSSPLKLEFDFTEDTGN : : .: :.::: ..: : : . .. .::: . ... ..::::..:: .. CCDS76 PASGGGRVQNSPPVGRKTLPLTTAPEAGEVTPSDSGGQEDSPAKGLSVRLEFDYSEDKSS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 pF1KB9 IEARKALP---RKLGRKLGSTLT---PKIQK-----DGISKSAGLEQPTDPVARDGPLSQ . .. : .:.:.: . . ::..: :. : ..:..: : :... CCDS76 WDNQQENPPPTKKIGKKPVAKMPLRRPKMKKTPEKLDNTPASPP-RSPAEP--NDIPIAK 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KB9 TSSKPDPSQWESPSFNPFGSHSVLQNSPPLSSEGSYHFDPDNFDESMDPFKPTTTLTSSD . : ..:..:.::::.: : .:.:: : .. ::.::::. :::.:::: .. :: CCDS76 GTYTFDIDKWDDPNFNPFSSTSKMQESPKLPQQ-SYNFDPDTCDESVDPFKTSSKTPSSP 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 pF1KB9 FCSPTG----------NHVN-EILESP-KKAKSRLITTTEQVKFLCFLLSGCKVKKHETQ ::.. : :. . :..: :: :. : : .:.: .: :.. .::: . CCDS76 SKSPASFEIPASAMEANGVDGDGLNKPAKKKKTPLKTMVEDVMSVCSLFDTFRVKKSPKR 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 SLALDACSRDEG-AVISQISDISNRDGHATDEEKLAST----SCGQKSAGAEVKGIEKET : : :.: :. . . . ::::::::: : .: . :. . . . CCDS76 SPLSDPPSQDPTPAATPETPPVISAVVHATDEEKLAVTNQKWTCMTVDLEADKQDYPQPS 530 540 550 560 570 580 550 560 pF1KB9 -------------------------CQKMEEDGSTV-----------LGLLESSAEKAPV . ::. ::.. : :. ......:: CCDS76 DLSTFVNETKFSSPTEELDYRNSYEIEYMEKIGSSLPQDDDAPKKQALYLMFDTSQESPV 590 600 610 620 630 640 570 pF1KB9 SVS----------CGGES------------------------------------------ . : :.: : CCDS76 KSSPVRMSESPTPCSGSSFEETEALVNTAAKNQHPVPRGLAPNQESHLQVPEKSSQKELE 650 660 670 680 690 700 pF1KB9 ------------------------------------------------------------ CCDS76 AMGLGTPSEAIEITAPEGSFASADALLSRLAHPVSLCGALDYLEPDLAEKNPPLFAQKLQ 710 720 730 740 750 760 580 590 600 pF1KB9 -----PLD---------------------GICLSESDKTAVLTLIREEIITKEIEANEWK : : :. ... : ..: . : :::::: :..::: CCDS76 REAAHPTDVSISKTALYSRIGTAEVEKPAGLLFQQPDLDSALQIARAEIITKEREVSEWK 770 780 790 800 810 820 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 KKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTSMTSQKSFQQLTMEKEQALADLNSVE ::::.:.::.:::::::::::::::::::::: . .:... :::..::::::::::::: CCDS76 DKYEESRREVMEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQREKSVSHQTVQQLVLEKEQALADLNSVE 830 840 850 860 870 880 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 RSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQRYQALKIHAEEKLDKAN .::.:::::::..: :::::.::::.::.:::.::.:::.:::::::::.:::::::.:: CCDS76 KSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKRCAQEYLSRVKKEEQRYQALKVHAEEKLDRAN 890 900 910 920 930 940 730 740 750 760 770 780 pF1KB9 EEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEELTKICDELIAKLGKTD :::::: ::. :.:: .:.:::::..:..:::.:.:::.:::::::::::::::.::. CCDS76 AEIAQVRGKAQQEQAAHQASLRKEQLRVDALERTLEQKNKEIEELTKICDELIAKMGKS 950 960 970 980 990 1000 >>CCDS7627.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1026 aa) initn: 1322 init1: 943 opt: 971 Z-score: 670.2 bits: 135.2 E(32554): 5.2e-31 Smith-Waterman score: 1015; 32.4% identity (57.1% similar) in 825 aa overlap (87-787:226-1026) 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 SEGNFETPEAETPIRSPFKESCDPSLGLAGPGAKSQESQEADEQLVAEVVEKCSSKTCSK : .: . .:: ::. .. :. .:.: .. CCDS76 SSASSTLKRTKKPRPPSLKKKQTTKKPTETPPVK-ETQQEPDEESLVPSGENLASETKTE 200 210 220 230 240 250 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PSENEVPQQAIDSHSVKNFREEPEHDFSKISIVRPFSIETKDSTDISAVLGTKAAHGCVT ...: :. :. ..: : . . . :.. :. ... : : .. .. CCDS76 SAKTEGPSPAL-------LEETPLEPAVGPKAACPLDSESAEGVVPPASGGGRVQNS--P 260 270 280 290 300 180 190 200 210 220 pF1KB9 AVSGKALP-SSPPDALQ----DEAMTEGS----MGVTLEASAEADLKAGNSCPELVPSRR :. :.:: .. :.: . : . : : ..: :: . : .. .. : : . CCDS76 PVGRKTLPLTTAPEAGEVTPSDSGGQEDSPAKGLSVRLEFDYSEDKSSWDNQQENPPPTK 310 320 330 340 350 360 230 240 250 260 270 pF1KB9 SKLRKP-KPVPLRK---KAIGGEFSDTNAAVEGTP-----LP--KASYHFSPEELDE-NT . .:: .:::. : ....: :. .: .: :..: :. .. :. : CCDS76 KIGKKPVAKMPLRRPKMKKTPEKLDNTPASPPRSPAEPNDIPIAKGTYTFDIDKWDDPNF 370 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 SPLLGDARFQKSPPDLKETPGTLSSDTNDSGVE---LGEESRSSPLKLEFDFTEDTGNIE .:. . ...:.:: : . ... :: : .:. . .. ::: : .: .. .: CCDS76 NPFSSTSKMQESPK-LPQQSYNFDPDTCDESVDPFKTSSKTPSSPSKSPASFEIPASAME 430 440 450 460 470 480 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 ARKALPRKLGRKLGSTLTPKIQKDGISKSAGLEQPTDPVARDGPLSQTSSKPDPSQWESP : . :.. : .: :. .. .: . .:::. :. ::. .: CCDS76 ANGVDGDGLNK-------PAKKKKTPLKTDTFRVKKSP--KRSPLSDPPSQ-DPTPAATP 490 500 510 520 530 400 410 420 430 440 pF1KB9 SFNPFGS---HSVLQNSPPLSSEGSYHFDPDNFDESMDPFKPT---TTLTSSDFCSPT-- : : :.. ... .... . : ...: .:. : .. . : ::: CCDS76 ETPPVISAVVHATDEEKLAVTNQKWTCMTVDLEADKQDYPQPSDLSTFVNETKFSSPTEE 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 pF1KB9 ---------------GNHVNEILESPKKAKSRLITTTEQ---VKFLCFLLS----GCKVK :. . . ..::: :. : : :: .: :. . CCDS76 LDYRNSYEIEYMEKIGSSLPQDDDAPKKQALYLMFDTSQESPVKSSPVRMSESPTPCSGS 600 610 620 630 640 650 490 500 510 520 530 pF1KB9 KHETQSLALDACSRDEGAVISQISDISNRDGH-----ATDEEKLASTSCGQKSAGAEVKG . : ... .... : .. :...: .....: . . : : . :. . CCDS76 SFEETEALVNTAAKNQHPVPRGLAP--NQESHLQVPEKSSQKELEAMGLGTPSEAIEITA 660 670 680 690 700 710 540 550 pF1KB9 IEKE----------------TC-------------------QKMEEDGSTVLGLLES--- : : ::..:. .. .:. CCDS76 PEGSFASADALLSRLAHPVSLCGALDYLEPDLAEKNPPLFAQKLQEELEFAIMRIEALKL 720 730 740 750 760 770 560 570 580 590 pF1KB9 -----------------SAEKAPVSVSCGG----------ESPLDGICLSESDKTAVLTL .:. . ::.: . :.: :. ... : ..: . CCDS76 ARQIALASRSHQDAKREAAHPTDVSISKTALYSRIGTAEVEKPA-GLLFQQPDLDSALQI 780 790 800 810 820 830 600 610 620 630 640 650 pF1KB9 IREEIITKEIEANEWKKKYEETRQEVLEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQRTSMTSQKSFQQ : :::::: :..::: ::::.:.::.:::::::::::::::::::::: . .:... :: CCDS76 ARAEIITKEREVSEWKDKYEESRREVMEMRKIVAEYEKTIAQMIEDEQREKSVSHQTVQQ 840 850 860 870 880 890 660 670 680 690 700 710 pF1KB9 LTMEKEQALADLNSVERSLSDLFRRYENLKGVLEGFKKNEEALKKCAQDYLARVKQEEQR :..:::::::::::::.::.:::::::..: :::::.::::.::.:::.::.:::.:::: CCDS76 LVLEKEQALADLNSVEKSLADLFRRYEKMKEVLEGFRKNEEVLKRCAQEYLSRVKKEEQR 900 910 920 930 940 950 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 YQALKIHAEEKLDKANEEIAQVRTKAKAESAALHAGLRKEQMKVESLERALQQKNQEIEE :::::.:::::::.:: :::::: ::. :.:: .:.:::::..:..:::.:.:::.:::: CCDS76 YQALKVHAEEKLDRANAEIAQVRGKAQQEQAAHQASLRKEQLRVDALERTLEQKNKEIEE 960 970 980 990 1000 1010 780 pF1KB9 LTKICDELIAKLGKTD :::::::::::.::. CCDS76 LTKICDELIAKMGKS 1020 >>CCDS7625.1 TACC2 gene_id:10579|Hs108|chr10 (1094 aa) initn: 1322 init1: 943 opt: 971 Z-score: 669.8 bits: 135.2 E(32554): 5.5e-31 Smith-Waterman score: 1015; 32.4% identity (57.1% similar) in 825 aa overlap (87-787:294-1094) 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 SEGNFETPEAETPIRSPFKESCDPSLGLAGPGAKSQESQEADEQLVAEVVEKCSSKTCSK : .: . .:: ::. .. :. .:.: .. CCDS76 SSASSTLKRTKKPRPPSLKKKQTTKKPTETPPVK-ETQQEPDEESLVPSGENLASETKTE 270 280 290 300 310 320 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PSENEVPQQAIDSHSVKNFREEPEHDFSKISIVRPFSIETKDSTDISAVLGTKAAHGCVT ...: :. :. ..: : . . . :.. :. ... : : .. .. CCDS76 SAKTEGPSPAL-------LEETPLEPAVGPKAACPLDSESAEGVVPPASGGGRVQNS--P 330 340 350 360 370 180 190 200 210 220 pF1KB9 AVSGKALP-SSPPDALQ----DEAMTEGS----MGVTLEASAEADLKAGNSCPELVPSRR :. :.:: .. :.: . : . : : ..: :: . : .. .. : : . 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