Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8310
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8310, 403 aa
1>>>pF1KB8310 403 - 403 aa - 403 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1233+/-0.0011; mu= -1.3886+/- 0.064
mean_var=253.5153+/-55.788, 0's: 0 Z-trim(110.5): 708 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.080551
statistics sampled from 10864 (11676) to 10864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.359), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 ( 403) 2700 327.2 1.7e-89
CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 345) 1351 170.4 2.4e-42
CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 303) 1348 170.0 2.7e-42
CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 344) 1348 170.0 3e-42
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 1316 166.3 3.6e-41
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 1311 165.6 5.2e-41
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 1309 165.4 5.9e-41
CCDS82065.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 ( 312) 1004 130.0 3e-30
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 663 90.8 5.9e-18
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 593 82.6 1.4e-15
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 470) 580 80.9 2.8e-15
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 472) 580 80.9 2.8e-15
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 576 80.4 3.9e-15
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 579 80.9 4.1e-15
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 579 80.9 4.1e-15
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 579 80.9 4.1e-15
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 579 81.0 4.4e-15
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 572 79.9 5.1e-15
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 575 80.4 5.5e-15
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 575 80.5 5.6e-15
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 575 80.5 5.7e-15
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 575 80.5 5.8e-15
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 575 80.5 5.8e-15
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 575 80.5 5.8e-15
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 572 80.0 6e-15
CCDS54804.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 929) 575 80.6 6.8e-15
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 569 80.0 1.4e-14
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 569 80.0 1.4e-14
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 562 79.0 1.7e-14
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 562 79.0 1.7e-14
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 562 79.0 1.7e-14
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 563 79.2 1.8e-14
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 561 78.9 1.8e-14
CCDS10616.1 PLK1 gene_id:5347|Hs108|chr16 ( 603) 558 78.4 2e-14
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 551 77.4 2.2e-14
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX ( 358) 550 77.3 2.5e-14
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 549 77.2 2.6e-14
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 556 78.3 2.7e-14
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 555 78.1 2.7e-14
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 549 77.2 2.7e-14
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 549 77.2 2.7e-14
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 357) 549 77.2 2.7e-14
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 358) 549 77.2 2.7e-14
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 551 77.5 2.8e-14
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 551 77.5 2.9e-14
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 549 77.2 3e-14
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 551 77.6 3.1e-14
CCDS6625.1 PRKACG gene_id:5568|Hs108|chr9 ( 351) 547 76.9 3.2e-14
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 550 77.6 4.3e-14
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 545 76.8 4.7e-14
>>CCDS13451.1 AURKA gene_id:6790|Hs108|chr20 (403 aa)
initn: 2700 init1: 2700 opt: 2700 Z-score: 1720.2 bits: 327.2 E(32554): 1.7e-89
Smith-Waterman score: 2700; 99.8% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDRSKENCISGPVKATAPVGGPKRVLVTQQFPCQNPLPVNSGQAQRVLCPSNSSQRVPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS13 MDRSKENCISGPVKATAPVGGPKRVLVTQQFPCQNPLPVNSGQAQRVLCPSNSSQRIPLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQKLVSSHKPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 SRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
370 380 390 400
>>CCDS67162.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (345 aa)
initn: 1358 init1: 1331 opt: 1351 Z-score: 873.9 bits: 170.4 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1353; 65.5% identity (81.8% similar) in 313 aa overlap (99-395:31-343)
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
:.:. ::: ..: . : :: :.
CCDS67 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170
pF1KB8 K--------KRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVE
. .:.....::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.:.:: :::
CCDS67 SSGTPDILTRRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVE
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 HQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTAT
::::::.:::.::.::::::::.::.: :.:::::::: : .:.:::: ::::::::
CCDS67 HQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTAT
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 YITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDY
. :::.:: :::.:.:::::::::::::: :::::::::::::::: :: :.::::::
CCDS67 IMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDY
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEG
:::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. :: : :
CCDS67 LPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMG
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB8 ARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
:.::::.::.::::.: : .: :::. ::: . :: :.
CCDS67 AQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
310 320 330 340
>>CCDS58514.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (303 aa)
initn: 1358 init1: 1331 opt: 1348 Z-score: 872.7 bits: 170.0 E(32554): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 1348; 71.4% identity (87.2% similar) in 273 aa overlap (126-395:29-301)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 QKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQS
:.....::::::::::::::::::::::.:
CCDS58 MSRSNVQPTAAPGQKVMENSSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKS
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPL
.::.:::::::.:.:: :::::::::.:::.::.::::::::.::.: :.::::::::
CCDS58 HFIVALKVLFKSQIEKEGVEHQLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPR
60 70 80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADF
: .:.:::: :::::::: . :::.:: :::.:.:::::::::::::: ::::::::
CCDS58 GELYKELQKSCTFDEQRTATIMEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADF
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQ
:::::::: :: :.:::::::::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...
CCDS58 GWSVHAPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHN
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 ETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSN
:::.:: .:.. :: : ::.::::.::.::::.: : .: :::. ::: . ::
CCDS58 ETYRRIVKVDLKFPASVPMGAQDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSA
240 250 260 270 280 290
400
pF1KB8 CQNKESASKQS
:.
CCDS58 LQSVA
300
>>CCDS11134.1 AURKB gene_id:9212|Hs108|chr17 (344 aa)
initn: 1358 init1: 1331 opt: 1348 Z-score: 872.0 bits: 170.0 E(32554): 3e-42
Smith-Waterman score: 1352; 65.7% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (99-395:31-342)
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KPVQNQKQKQLQATSVPHPVSRPLNNTQKSKQPL-PSA----PENNPEEELASKQKNEES
:.:. ::: ..: . : :: :.
CCDS11 MAQKENSYPWPYGRQTAPSGLSTLPQRVLRKEPVTPSALVLMSRSNVQPTAAPGQKVMEN
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170
pF1KB8 KK-------RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEH
.. :.....::::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.:.:: ::::
CCDS11 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKKSHFIVALKVLFKSQIEKEGVEH
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATY
:::::.:::.::.::::::::.::.: :.:::::::: : .:.:::: ::::::::
CCDS11 QLRREIEIQAHLHHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYL
. :::.:: :::.:.:::::::::::::: :::::::::::::::: :: :.:::::::
CCDS11 MEELADALMYCHGKKVIHRDIKPENLLLGLKGELKIADFGWSVHAPSLRRKTMCGTLDYL
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGA
::::::::::.:::::: .::::::.:::.::::. ...:::.:: .:.. :: : ::
CCDS11 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB8 RDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
.::::.::.::::.: : .: :::. ::: . :: :.
CCDS11 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
310 320 330 340
>>CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1300 init1: 1300 opt: 1316 Z-score: 852.5 bits: 166.3 E(32554): 3.6e-41
Smith-Waterman score: 1316; 68.1% identity (86.5% similar) in 282 aa overlap (112-389:18-299)
90 100 110 120 130
pF1KB8 TSVPHPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKK----RQWALEDFEIGR
::::. ... .. . :. ...::::::
CCDS33 MSSPRAVVQLGKAQPAGEELATANQTAQQPSSPAMRRLTVDDFEIGR
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 PLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLY
:::::::::::::: :.:.::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::
CCDS33 PLGKGKFGNVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLY
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 GYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDI
.::::: :::::::::: : .:.:::: :.::::::: : :::.::.:::.:.::::::
CCDS33 NYFHDARRVYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDI
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 KPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGV
:::::::: ::.::::::::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::
CCDS33 KPENLLLGFRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGV
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 LCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREV
::::.::: ::::. ...:::.:: .:. :: . ::::::::::...: .: : ..
CCDS33 LCYELLVGYPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQI
230 240 250 260 270 280
380 390 400
pF1KB8 LEHPWITANSSKPSNCQNKESASKQS
:.:::. :.: .
CCDS33 LKHPWVQAHSRRVLPPCAQMAS
290 300
>>CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 (290 aa)
initn: 1300 init1: 1300 opt: 1311 Z-score: 849.8 bits: 165.6 E(32554): 5.2e-41
Smith-Waterman score: 1311; 69.0% identity (86.1% similar) in 274 aa overlap (116-389:7-280)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HPVSRPLNNTQKSKQPLPSAPENNPEEELASKQKNEESKKRQWALEDFEIGRPLGKGKFG
. :. :. ...::::::::::::::
CCDS46 MATANQTAQQPSSPAMRRLTVDDFEIGRPLGKGKFG
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 NVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATR
:::::: :.:.::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::.::::: :
CCDS46 NVYLARLKESHFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 VYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLG
::::::::: : .:.:::: :.::::::: : :::.::.:::.:.::::::::::::::
CCDS46 VYLILEYAPRGELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLG
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SAGELKIADFGWSVHAPSSRRTTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVG
::.::::::::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::::::.:::
CCDS46 FRGEVKIADFGWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVG
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITA
::::. ...:::.:: .:. :: . ::::::::::...: .: : ..:.:::. :
CCDS46 YPPFESASHSETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQA
220 230 240 250 260 270
390 400
pF1KB8 NSSKPSNCQNKESASKQS
.: .
CCDS46 HSRRVLPPCAQMAS
280 290
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:. ...:::::::::::::::::::: :.:
CCDS46 MRRLTVDDFEIGRPLGKGKFGNVYLARLKES
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPL
.::.:::::::.:.:: :.:::::::.:::.::.::::::::.::::: ::::::::::
CCDS46 HFIVALKVLFKSQIEKEGLEHQLRREIEIQAHLQHPNILRLYNYFHDARRVYLILEYAPR
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: .:.:::: :.::::::: : :::.::.:::.:.:::::::::::::: ::.:::::
CCDS46 GELYKELQKSEKLDEQRTATIIEELADALTYCHDKKVIHRDIKPENLLLGFRGEVKIADF
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:::::.:: :: :.::::::::::::::: .::::::: .::::::.::: ::::. ...
CCDS46 GWSVHTPSLRRKTMCGTLDYLPPEMIEGRTYDEKVDLWCIGVLCYELLVGYPPFESASHS
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:::.:: .:. :: . ::::::::::...: .: : ..:.:::. :.: .
CCDS46 ETYRRILKVDVRFPLSMPLGARDLISRLLRYQPLERLPLAQILKHPWVQAHSRRVLPPCA
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400
pF1KB8 KESASKQS
CCDS46 QMAS
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.. :.....:::::::::: :: :. : ..:
CCDS82 SSGTPDILTRHFTIDDFEIGRPLGK------------------ALLCLWP---EASSV--
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180 190 200 210 220 230
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: ::::::::.::.: :.:::::::: : .:.:::: ::::::::
CCDS82 ---------SSPSHPNILRLYNYFYDRRRIYLILEYAPRGELYKELQKSCTFDEQRTATI
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. :::.:: :::.:.:::::::::::::: :::::::::::::::: :: :.:::::::
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pF1KB8 PPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGA
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CCDS82 PPEMIEGRMHNEKVDLWCIGVLCYELLVGNPPFESASHNETYRRIVKVDLKFPASVPMGA
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400
pF1KB8 RDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSK---PSNCQNKESASKQS
.::::.::.::::.: : .: :::. ::: . :: :.
CCDS82 QDLISKLLRHNPSERLPLAQVSAHPWVRANSRRVLPPSALQSVA
270 280 290 300 310
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.:::..: ::::.:..:: :. .. . .
CCDS37 MATCIGEKIEDFKVGNLLGKGSFAGVYRAESIHTGLEV
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:.:.. : . :::. .... ::.:. .:.::.::.::.::.:.. :::.::. : .
CCDS37 AIKMIDKKAMYKAGMVQRVQNEVKIHCQLKHPSILELYNYFEDSNYVYLVLEMCHNGEMN
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: :. ... :.:... .. .. ... : ::. ..:::. :::: ..:::::: .
CCDS37 RYLKNRVKPFSENEARHFMHQIITGMLYLHSHGILHRDLTLSNLLLTRNMNIKIADFGLA
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.. : .. ::::: .:. ::. : . :.:::: . : .:.:.:::...: ..
CCDS37 TQLKMPHEKHYTLCGTPNYISPEIATRSAHGLESDVWSLGCMFYTLLIGRPPFDTDTVKN
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340 350 360 370 380 390
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: ... ... .:.:.. :.::: .::..::..: : ::.::... ::: :
CCDS37 TLNKVVLADYEMPSFLSIEAKDLIHQLLRRNPADRLSLSSVLDHPFMSRNSSTKSKDLGT
220 230 240 250 260 270
400
pF1KB8 ESASKQS
CCDS37 VEDSIDSGHATISTAITASSSTSISGSLFDKRRLLIGQPLPNKMTVFPKNKSSTDFSSSG
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... . ::.:.:. : :::. . .:.:
CCDS43 MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGEKVAVK
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170 180 190 200 210 220
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CCDS43 VIDKTKLDTLATGH-LFQEVRCMKLVQHPNIVRLYEVIDTQTKLYLILELGDGGDMFDYI
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CCDS43 MKHEEGLNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQGLVKLTDFGFSNK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]