Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8111
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8111, 556 aa
1>>>pF1KB8111 556 - 556 aa - 556 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7600+/-0.00107; mu= 3.8752+/- 0.064
mean_var=273.0385+/-58.925, 0's: 0 Z-trim(112.6): 681 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.077618
statistics sampled from 12561 (13370) to 12561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.411), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 3764 435.2 9.8e-122
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 2986 348.0 1.4e-95
CCDS10473.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 429) 2194 259.3 6.9e-69
CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX ( 358) 734 95.7 1e-19
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 732 95.6 1.3e-19
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 732 95.6 1.4e-19
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 732 95.6 1.4e-19
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 732 95.7 1.5e-19
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 719 94.0 3.1e-19
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 719 94.0 3.1e-19
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 719 94.0 3.2e-19
CCDS55610.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 355) 719 94.0 3.2e-19
CCDS72815.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 357) 719 94.0 3.2e-19
CCDS55609.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 358) 719 94.0 3.2e-19
CCDS693.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 398) 719 94.1 3.4e-19
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 711 93.1 5.8e-19
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 711 93.1 5.9e-19
CCDS6625.1 PRKACG gene_id:5568|Hs108|chr9 ( 351) 710 93.0 6.4e-19
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 708 92.9 8.5e-19
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 690 90.8 3.1e-18
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 686 90.4 4.9e-18
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 686 90.5 5e-18
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 686 90.5 5.4e-18
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 683 90.1 6.4e-18
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 676 89.4 1.1e-17
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 670 88.7 1.8e-17
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 667 88.4 2.5e-17
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 667 88.5 2.9e-17
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 662 87.8 3.2e-17
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 662 87.8 3.3e-17
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 661 87.8 4.4e-17
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 655 87.2 7.5e-17
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 648 86.4 1.2e-16
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 648 86.4 1.3e-16
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 648 86.4 1.3e-16
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 648 86.4 1.3e-16
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 648 86.4 1.3e-16
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 641 85.4 1.7e-16
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 643 85.9 1.9e-16
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 628 84.1 5.3e-16
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 629 84.3 5.6e-16
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 629 84.3 5.7e-16
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 629 84.3 5.7e-16
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 626 83.9 7.1e-16
CCDS72814.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 264) 615 82.2 8.3e-16
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 623 83.6 8.5e-16
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 622 83.5 9.4e-16
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 619 83.0 1e-15
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 671) 620 83.2 1.1e-15
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10 ( 686) 620 83.2 1.1e-15
>>CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 (556 aa)
initn: 3764 init1: 3764 opt: 3764 Z-score: 2299.0 bits: 435.2 E(32554): 9.8e-122
Smith-Waterman score: 3764; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-556)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPWHQFVENNLILKMGPVDKRKGLFARRRQLLLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPWHQFVENNLILKMGPVDKRKGLFARRRQLLLTE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 GPHLYYVDPVNKVLKGEIPWSQELRPEAKNFKTFFVHTPNRTYYLMDPSGNAHKWCRKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPHLYYVDPVNKVLKGEIPWSQELRPEAKNFKTFFVHTPNRTYYLMDPSGNAHKWCRKIQ
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB8 EVWRQRYQSHPDAAVQ
::::::::::::::::
CCDS10 EVWRQRYQSHPDAAVQ
550
>>CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 (454 aa)
initn: 2986 init1: 2986 opt: 2986 Z-score: 1829.2 bits: 348.0 E(32554): 1.4e-95
Smith-Waterman score: 2986; 100.0% identity (100.0% similar) in 447 aa overlap (1-447:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDET
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPWHQFVENNLILKMGPVDKRKGLFARRRQLLLTE
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPCLTGRII
430 440 450
>>CCDS10473.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 (429 aa)
initn: 2192 init1: 2192 opt: 2194 Z-score: 1350.2 bits: 259.3 E(32554): 6.9e-69
Smith-Waterman score: 2664; 77.0% identity (77.2% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MARTTSQLYDAVPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAGSLQHAQPPPQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYA-----------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ENKVPYVTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDET
CCDS10 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CTRFYTAEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARAN
.:::
CCDS10 --------------------------------------------------------TRAN
110
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SFVGTAQYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYD
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FPEKFFPKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQTPPKLTA
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YLPAMSEDDEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLD
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPWHQFVENNLILKMGPVDKRKGLFARRRQLLLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNSFELDLQFSEDEKRLLLEKQAGGNPWHQFVENNLILKMGPVDKRKGLFARRRQLLLTE
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 GPHLYYVDPVNKVLKGEIPWSQELRPEAKNFKTFFVHTPNRTYYLMDPSGNAHKWCRKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPHLYYVDPVNKVLKGEIPWSQELRPEAKNFKTFFVHTPNRTYYLMDPSGNAHKWCRKIQ
360 370 380 390 400 410
550
pF1KB8 EVWRQRYQSHPDAAVQ
::::::::::::::::
CCDS10 EVWRQRYQSHPDAAVQ
420
>>CCDS14125.1 PRKX gene_id:5613|Hs108|chrX (358 aa)
initn: 654 init1: 362 opt: 734 Z-score: 467.6 bits: 95.7 E(32554): 1e-19
Smith-Waterman score: 734; 36.4% identity (68.2% similar) in 343 aa overlap (42-376:4-336)
20 30 40 50 60
pF1KB8 VPIQSSVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGT--AAEPRP-GAGSLQHA
:: .. . : . . .:: : :: .: .
CCDS14 MEAPGLAQAAAAESDSRKVAEETPDGAPALCPS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 QPP--PQPRKKRPEDFKFGKILGEGSFSTVVLARELATSREYAIKILEKRHIIKENKVPY
:.: .:: .: :.:. : :..: .... .:.:.. .:. .. .
CCDS14 PEALSPEPPVYSLQDFDTLATVGTGTFGRVHLVKEKTAKHFFALKVMSIPDVIRLKQEQH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VTRERDVMSRLDHPFFVKLYFTFQDDEKLYFGLSYAKNGELLKYIRKIGSFDETCTRFYT
: :..:.....:::...:..:..:.. ::. . :. .:::..:.:. : :. : ::.
CCDS14 VHNEKSVLKEVSHPFLIRLFWTWHDERFLYMLMEYVPGGELFSYLRNRGRFSSTTGLFYS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 AEIVSALEYLHGKGIIHRDLKPENILLNEDMHIQITDFGTAKVLSPESKQARANSFVGTA
:::. :.::::.: :..::::::::::..: ::..:::: :: : :. .. ::
CCDS14 AEIICAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDRDGHIKLTDFGFAKKLVD-----RTWTLCGTP
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QYVSPELLTEKSACKSSDLWALGCIIYQLVAGLPPFRAGNEYLIFQKIIKLEYDFPEKFF
.:..::.. :. .. : :::: .:.....:.::: : . :.:::. . :::...
CCDS14 EYLAPEVIQSKGHGRAVDWWALGILIFEMLSGFPPFFDDNPFGIYQKILAGKIDFPRHLD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PKARDLVEKLLVLDATKRLGCEEMEGYGPLKAHPFFESVTWENLHQQT--PPKLTAYLPA
...::..::::.: :.::: . .: . .: : .:.:: :: . :. :: .:
CCDS14 FHVKDLIKKLLVVDRTRRLGNMK-NGANDVKHHRWFRSVDWEAVPQRKLKPP----IVPK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 MSED-DEDCYGNYDNLLSQFGCMQVSSSSSSHSLSASDTGLPQRSGSNIEQYIHDLDSNS
.. : : . . .:
CCDS14 IAGDGDTSNFETYPENDWDTAAPVPQKDLEIFKNF
330 340 350
>>CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 (431 aa)
initn: 580 init1: 315 opt: 732 Z-score: 465.4 bits: 95.6 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 732; 38.3% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (47-356:64-371)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SVVLCSCPSPSMVRTQTESSTPPGIPGGSRQGPAMDGTAAEPRPGAGSLQHAQPPPQPRK
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CCDS72 IYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLK-NGVSDIKTHKWFATTDWIA
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CCDS72 IYQR---KVEAPFIPKFRGSGDTSNFDDYEEEDIRVSITEKCAKEFGEF
300 310 320 330
556 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:37:09 2016 done: Fri Nov 4 09:37:10 2016
Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]