Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7432, 328 aa
1>>>pF1KB7432 328 - 328 aa - 328 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4160+/-0.000617; mu= 21.5036+/- 0.038
mean_var=81.0562+/-19.193, 0's: 0 Z-trim(104.7): 275 B-trim: 815 in 1/47
Lambda= 0.142456
statistics sampled from 12685 (13010) to 12685 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.467), E-opt: 0.2 (0.153), width: 16
Scan time: 6.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1057 227.8 2.3e-59
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 965 208.9 1.2e-53
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 924 200.5 3.9e-51
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 872 189.8 6.5e-48
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 872 189.8 6.6e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 836 182.4 1.1e-45
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 817 178.5 1.6e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 814 177.9 2.5e-44
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 784 171.7 1.8e-42
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 777 170.2 4.9e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 759 166.5 6.2e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 759 166.5 6.4e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 746 163.9 4.2e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 743 163.3 6.2e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 737 162.0 1.5e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 716 157.7 3e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 716 157.7 3e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 716 157.7 3e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 705 155.4 1.4e-37
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 493 111.9 1.9e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 456 104.3 3.6e-22
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 212 54.1 4.6e-07
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 198 51.2 3.2e-06
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 198 51.3 3.5e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 193 50.2 6.7e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 185 48.6 2.2e-05
XP_005251838 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869877 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869876 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869878 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869892 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869873 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869886 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869872 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
NP_476500 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869895 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869880 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869874 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
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XP_016869890 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869888 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869896 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869881 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869887 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869894 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869879 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869883 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
XP_016869884 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 181 47.8 4e-05
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 1066 init1: 1045 opt: 1057 Z-score: 1186.6 bits: 227.8 E(85289): 2.3e-59
Smith-Waterman score: 1057; 51.9% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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:.: :..:: :. ... :: : .. :: ..::. :: ::....::. : ::..:.:
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:: .:.. .:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 965; 48.1% identity (78.9% similar) in 308 aa overlap (3-310:1-308)
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pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
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pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:. ..:. :
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
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pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
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pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
::.... . :
NP_001 DALKRLQKRKCC
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
.. : .: . : :::.: . : :: ::..: .:.::: .:. ..:. ::::
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
:::::..:::::.:.: .: ::.: ..: .:::: :::.:..: :: . .:.:::
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pF1KB7 FFCELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRK
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XP_011 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
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pF1KB7 VKDAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
.: :..:... : .
XP_011 LKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 872; 44.6% identity (74.8% similar) in 314 aa overlap (3-314:1-312)
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pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
.. : .: . : :::.: . : :: ::..: .:.::: .:. ..:. ::::
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
:::::..:::::.:.: .: ::.: ..: .:::: :::.:..: :: . .:.:::
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSAL--KLSFHGFNTINH
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NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGL--WVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITH
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pF1KB7 FFCELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRK
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NP_036 FFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
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NP_036 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
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pF1KB7 VKDAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
.: :..:... : .
NP_036 LKGALKKVVGRVVFSV
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>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 872; 44.6% identity (74.8% similar) in 314 aa overlap (3-314:11-322)
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pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIK
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KB7 INPKLHTPMYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVT
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ELILFAVMAYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSAL--KLSF
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGL--WVVANLNVLLHTLLMAPLSF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HGFNTINHFFCELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKM
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XP_011 CADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PSASGHRKVFSTCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPL
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XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPF
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 IYSLRNKDVKDAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
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XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 885 init1: 666 opt: 836 Z-score: 941.2 bits: 182.4 E(85289): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 836; 42.3% identity (75.1% similar) in 305 aa overlap (7-311:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTP
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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NP_003 MYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVM
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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NP_003 SYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFF
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pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
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NP_003 CEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAF
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pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
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NP_003 STCGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVK
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310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
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NP_003 AALRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 844 init1: 808 opt: 817 Z-score: 920.1 bits: 178.5 E(85289): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 817; 39.5% identity (74.1% similar) in 301 aa overlap (7-307:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KB7 PMYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KB7 MAYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KB7 FCELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKV
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FSTCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310 320
pF1KB7 KDAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 834 init1: 798 opt: 814 Z-score: 916.7 bits: 177.9 E(85289): 2.5e-44
Smith-Waterman score: 814; 41.5% identity (74.8% similar) in 301 aa overlap (7-307:5-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTP
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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NP_001 MYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVM
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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NP_001 AYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFL
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pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
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NP_001 REMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
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pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
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pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:. ...
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 803 init1: 761 opt: 784 Z-score: 883.4 bits: 171.7 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 784; 40.9% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (3-308:1-306)
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTP
10 20 30 40 50
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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NP_001 MYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSAL--KLSFHGFNTINH
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NP_001 AYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLV--LASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPH
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pF1KB7 FFCELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRK
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NP_001 FFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYK
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NP_001 VKGALERLLSRADSCP
300 310
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:44:59 2016 done: Fri Nov 4 07:45:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]