Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7432, 328 aa
1>>>pF1KB7432 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9388+/-0.00146; mu= 18.1869+/- 0.086
mean_var=113.8692+/-32.709, 0's: 0 Z-trim(99.5): 384 B-trim: 689 in 2/44
Lambda= 0.120191
statistics sampled from 5307 (5759) to 5307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 2138 382.7 2.3e-106
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1657 299.2 2.8e-81
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1393 253.5 1.7e-67
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1164 213.7 1.5e-55
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1057 195.2 5.9e-50
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1044 192.9 2.8e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1023 189.3 3.5e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1014 187.7 1e-47
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1012 187.4 1.3e-47
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1006 186.3 2.7e-47
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1005 186.3 3.3e-47
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 998 185.0 7.2e-47
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 995 184.4 1e-46
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 991 183.7 1.6e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 987 183.1 2.6e-46
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 987 183.1 2.7e-46
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 983 182.3 4.2e-46
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 983 182.4 4.5e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 980 181.8 6.1e-46
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 977 181.3 8.7e-46
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 971 180.3 1.9e-45
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 965 179.2 3.7e-45
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 964 179.1 4.3e-45
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 956 177.7 1.1e-44
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 955 177.5 1.2e-44
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 953 177.2 1.6e-44
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 949 176.5 2.5e-44
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 947 176.1 3.2e-44
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 946 175.9 3.6e-44
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 944 175.6 4.6e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 941 175.1 6.6e-44
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 940 174.9 7.4e-44
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 932 173.5 2e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 930 173.2 2.5e-43
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 928 172.8 3.2e-43
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 926 172.5 4e-43
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 925 172.3 4.6e-43
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 924 172.1 5.1e-43
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 921 171.6 7.4e-43
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 919 171.3 9.3e-43
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 919 171.3 9.3e-43
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 917 171.0 1.3e-42
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 916 170.7 1.3e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 915 170.5 1.5e-42
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 914 170.4 1.7e-42
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 907 169.2 4e-42
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 904 168.7 5.9e-42
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 901 168.1 8.1e-42
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 900 168.0 9.1e-42
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 899 167.8 1.1e-41
>>CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 2138 init1: 2138 opt: 2138 Z-score: 2023.2 bits: 382.7 E(32554): 2.3e-106
Smith-Waterman score: 2138; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
310 320
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1701 init1: 1635 opt: 1657 Z-score: 1572.7 bits: 299.2 E(32554): 2.8e-81
Smith-Waterman score: 1657; 80.8% identity (93.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
:.::.::: : .:::::::::: :::.:::.::::.:. .:.::.:.:::::::::::::
CCDS31 MLLTDRNT-SGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
:::::..:::::::::::::: :::::::.:::::: ::.::::::::::::: .:.:::
CCDS31 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
:::.:::::::::::: .:::::..::: :::::.::: :.:::::: :::::::::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
::.:::.::: :.:..: ::: .:::::::::::.:::::::.:: ::: :.::.::.:
CCDS31 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:.. .:..:: :
CCDS31 DTVTEILDTKVFSY
300 310
>>CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1409 init1: 1381 opt: 1393 Z-score: 1325.3 bits: 253.5 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 1393; 68.5% identity (87.6% similar) in 314 aa overlap (1-313:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
:... :: . : ::.::::.:: .::::::.::: .: ..::::::::.:::::::.:::
CCDS31 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
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pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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CCDS31 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
:::.:::::::::::::.::.:::.::. : ::. :.: : ::.:.: : :.:::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
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pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
:: ..:::.: : . .::::. :::::. :::::::::.::.::.::. :.::..:.:
CCDS31 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
:: :::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::::::::::::::
CCDS31 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKY-FHIKHRHWYPFNFVIEQ
::. :.:.:. ::
CCDS31 DAFWKLIHTQVPFH
310
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1177 init1: 1141 opt: 1164 Z-score: 1110.7 bits: 213.7 E(32554): 1.5e-55
Smith-Waterman score: 1164; 57.8% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (3-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
. ..: :. : : :::.:: ::.. ::..:: .:: ....:::: ..:... .::::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
.::::.:::::::::::::.: ::.:. .:..::: ::.:::..::: :::..:.:::
CCDS31 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
:::.:::::::::: :..:::: . :. : :..::: . ::.. :. :.:::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
:.: :.::. : ... ::: :::.:: :..:::::: .:..: ::. :: ...:.:
CCDS31 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
:::::::::::. :::::..:: :.: :: . :::.::::::::.:::::::::::::.
CCDS31 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:.::....:
CCDS31 KALRKVMGSKIHS
300 310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1066 init1: 1045 opt: 1057 Z-score: 1010.4 bits: 195.2 E(32554): 5.9e-50
Smith-Waterman score: 1057; 51.9% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
: .:.:: : . : :::: :::: ::..::..:.. ..::.:....:.:.:.:.::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
:::::..:::::.:: : :.: ::::.. :...::. :: .::.:::::. :: ...:.:
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
:.: :..:: :. ... :: : .. :: ..::. :: ::....::. : ::..:.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
::::::::..::..::.::.: :. : .: :. :::::. ::.::::::::::::::
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
:: .:.. .:
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1079 init1: 1012 opt: 1044 Z-score: 998.3 bits: 192.9 E(32554): 2.8e-49
Smith-Waterman score: 1044; 51.0% identity (78.2% similar) in 308 aa overlap (3-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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CCDS31 NALMKLLRRKISLSPG
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CCDS41 STCGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVK
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CCDS31 CDIPPLLLLSRSDTQVNELVLFTVFGFIELSTISGVFISYCYIILSVLEIHSAEGRFKAL
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