Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7400, 305 aa
1>>>pF1KB7400 305 - 305 aa - 305 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8739+/-0.000467; mu= 17.8512+/- 0.029
mean_var=96.5962+/-27.294, 0's: 0 Z-trim(106.8): 246 B-trim: 909 in 1/51
Lambda= 0.130495
statistics sampled from 14472 (14838) to 14472 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 6.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 952 190.5 3.7e-48
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 898 180.3 4.2e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 837 168.8 1.2e-41
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 837 168.9 1.2e-41
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 834 168.3 1.8e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 834 168.3 1.8e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 825 166.6 5.8e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 813 164.3 2.9e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 808 163.4 5.4e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 804 162.6 9e-40
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 799 161.7 1.7e-39
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 789 159.8 6.3e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 781 158.3 1.8e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 770 156.2 7.5e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 759 154.1 3.2e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 758 154.0 3.6e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 743 151.1 2.6e-36
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 731 148.9 1.2e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 452 96.4 8.1e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 432 92.6 1.1e-18
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 216 52.0 1.9e-06
XP_011529100 (OMIM: 300253) PREDICTED: probable G- ( 373) 189 46.9 7.2e-05
NP_061842 (OMIM: 300253) probable G-protein couple ( 373) 189 46.9 7.2e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 186 46.3 0.0001
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 184 45.9 0.00013
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 174 44.1 0.00049
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 173 43.9 0.00054
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 172 43.7 0.00066
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 170 43.5 0.001
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 170 43.5 0.0011
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 163 41.9 0.0019
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 163 42.0 0.002
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 162 41.8 0.0023
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 162 41.8 0.0023
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 161 41.6 0.0026
NP_005675 (OMIM: 604106) probable G-protein couple ( 361) 157 40.9 0.0046
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 155 40.5 0.0055
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 155 40.6 0.0065
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 155 40.6 0.0065
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 155 40.6 0.0065
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 155 40.6 0.0065
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 155 40.6 0.0065
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 155 40.7 0.007
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NP_056542 (OMIM: 162323) substance-P receptor isof ( 311) 151 39.7 0.0091
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 151 39.7 0.0096
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 152 40.0 0.0098
XP_011543934 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 359) 151 39.8 0.01
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 952; 49.8% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:6-307)
10 20 30 40 50
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300
pF1KB7 KEALKKLLP
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300
pF1KB7 LKKLLP
: ...
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
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pF1KB7 LKKLLP
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
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pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
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pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KB7 LKKLLP
:::..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
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pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLIC
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pF1KB7 ENIIDDFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISS
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pF1KB7 SKGYLKAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KB7 SLRNKDVKEALKKLLP
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XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 829 init1: 829 opt: 834 Z-score: 865.5 bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
:: :::..:. :.. .:..:. ..: :.: : .: :.::: .:. : :::..::
XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KB7 LKKLLP
.:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 829 init1: 829 opt: 834 Z-score: 865.5 bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)
10 20 30 40 50
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KB7 LKKLLP
.:::
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 829 init1: 829 opt: 834 Z-score: 865.5 bits: 168.3 E(85289): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 834; 45.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (1-304:1-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MQRSNHT-VTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KB7 LLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KB7 CSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KB7 LKKLLP
.:::
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 842 init1: 818 opt: 825 Z-score: 856.4 bits: 166.6 E(85289): 5.8e-41
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pF1KB7 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPM
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pF1KB7 YFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KB7 YDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KB7 DLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KB7 TCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKE
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300
pF1KB7 ALKKLLP
:::.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 800 init1: 584 opt: 813 Z-score: 844.0 bits: 164.3 E(85289): 2.9e-40
Smith-Waterman score: 813; 41.8% identity (70.6% similar) in 306 aa overlap (1-300:1-306)
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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pF1KB7 AAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIID
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pF1KB7 KAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNK
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pF1KB7 DVKEALKKLLP
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310 320
305 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:25:53 2016 done: Fri Nov 4 07:25:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]