Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7382, 313 aa
1>>>pF1KB7382 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5623+/-0.00142; mu= 14.4061+/- 0.083
mean_var=154.7103+/-50.881, 0's: 0 Z-trim(100.6): 411 B-trim: 735 in 2/47
Lambda= 0.103113
statistics sampled from 5641 (6170) to 5641 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.521), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 2032 315.2 4.2e-86
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1218 194.1 1.2e-49
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1216 193.8 1.4e-49
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1202 191.7 6.1e-49
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1185 189.3 3.8e-48
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1171 187.1 1.5e-47
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CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1145 183.2 2.2e-46
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1133 181.5 8e-46
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1131 181.2 9.2e-46
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1128 180.7 1.3e-45
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1124 180.1 1.9e-45
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1121 179.7 2.6e-45
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1112 178.3 6.5e-45
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1096 176.0 3.6e-44
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1095 175.9 4.2e-44
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1087 174.6 8.6e-44
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1087 174.6 8.7e-44
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1081 173.7 1.6e-43
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1080 173.6 1.8e-43
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1076 173.0 2.7e-43
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1075 172.8 3e-43
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CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1068 171.8 6.3e-43
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1067 171.6 6.8e-43
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CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1063 171.0 1e-42
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CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1054 169.7 2.6e-42
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CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1047 168.7 5.3e-42
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1036 167.0 1.6e-41
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1036 167.0 1.7e-41
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1034 166.7 2e-41
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1032 166.4 2.5e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1030 166.1 3.1e-41
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1028 165.8 3.8e-41
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1024 165.2 5.7e-41
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1015 163.9 1.5e-40
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1015 163.9 1.5e-40
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1015 163.9 1.5e-40
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1015 163.9 1.5e-40
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 995 160.9 1.1e-39
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 990 160.2 1.9e-39
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 983 159.1 3.9e-39
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 971 157.4 1.4e-38
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 968 156.9 1.8e-38
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 960 155.7 4.2e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 949 154.1 1.4e-37
>>CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 2032 init1: 2032 opt: 2032 Z-score: 1659.4 bits: 315.2 E(32554): 4.2e-86
Smith-Waterman score: 2032; 99.4% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS41 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIMAY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRQKALSTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS41 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRRKALSTC
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LRQRQVFFTKSYT
:::::::::::::
CCDS41 LRQRQVFFTKSYT
310
>>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa)
initn: 1284 init1: 1210 opt: 1218 Z-score: 1004.9 bits: 194.1 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 1218; 53.1% identity (84.9% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
:: :.. ..:::.:::... :.:.:::.:: .:. :. :: ::.:... : ::.:::
CCDS32 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
:.:.:::.::. .: ..:::. : .::::::.:.::.::::::. .::.::. ...
CCDS32 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
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pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
:::.::: :::: .:.. .::. :: : :. :..::..:..... ::.::: .::.:::
CCDS32 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
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pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRQKALSTC
.:.:..:::.:::. :......:: :.::::... .::...::....::..: .::::::
CCDS32 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTC
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pF1KB7 SAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQ
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CCDS32 TAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LRQRQVFFTKSYT
:..: . :.:.
CCDS32 LKNRFLNFNKAMPS
310
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1216; 55.5% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
:...:. ::::.: ::... .: . :..:: .:.. : ::.::.... .. ...:::
CCDS31 MEKINN--VTEFIFWGLSQSPEIEKVCFVVFSFFYIIILLGNLLIMLTVCLSNLFKSPMY
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pF1KB7 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAY
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pF1KB7 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
::::::: :::: ..:: ..: ..... :.:: .::. :. :...::.:::: :: ::::
CCDS31 DRYVAICKPLHYMTIMNRETCNKMLLGTWVGGFLHSIIQVALVVQLPFCGPNEIDHYFCD
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pF1KB7 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRQKALSTC
: :.:::::.::..:.....:::::.:. :. .. :: .:::::::.:::::.::::::
CCDS31 VHPVLKLACTETYIVGVVVTANSGTIALGSFVILLISYSIILVSLRKQSAEGRRKALSTC
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pF1KB7 SAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQ
..:. .:..::::: :.: ::::.:: ::.:.::::..::.:::.:::::: :::.:::.
CCDS31 GSHIAMVVIFFGPCTFMYMRPDTTFSEDKMVAVFYTIITPMLNPLIYTLRNAEVKNAMKK
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310
pF1KB7 LRQRQVFFTKSYT
: :.::.
CCDS31 LWGRNVFLEAKGK
300 310
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 1202; 55.0% identity (83.8% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHT-PM
:: : . :.:::. :: .: :. .::. : ..:. . ::.::..... : ::. ::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
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pF1KB7 YFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIVA
::.:.::.:.:. .: ..:::.. .: ..: ::: .:..:.::::. . ::. ::. .:
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
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pF1KB7 YDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFC
:::::::: :::: ..:. ..::.::.: :. : :::..:. .:. ::::::: .::.::
CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRKHSAEGRQKALST
:.:::::::: :::. ::.....:: .:::::: .. :: :::...:...: . .:::::
CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMK
::::.:::.::::::::.:.:: . ::.::..:::::. ::::::.::::::::.:.:::
CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
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300 310
pF1KB7 QLRQRQVFFTKSYT
.:..:.: :
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1168 init1: 1168 opt: 1185 Z-score: 977.9 bits: 189.3 E(32554): 3.8e-48
Smith-Waterman score: 1185; 56.2% identity (83.6% similar) in 304 aa overlap (1-304:25-328)
10 20 30
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYM
:. :..::::::.:::...: :. ..:..:: .:.
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDN
: ::.:::.... :::::::.:.::::::.: .: ..:::. .:.::::::::
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 CITQLFFLHLFACAEIFLLIIVAYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHS
:..:.::.:::. .:. ::. .::::::::: :::: .::. :::. ::. :. : .:.
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
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pF1KB7 LGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVT
.: .:. ::.:::: .::.:::.::: :::: :::....:::..:: .::: :: .:.
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
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pF1KB7 SYMVILVSLRKHSAEGRQKALSTCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSIDKVVSVFYT
:: ::::..:..:. . :: :: .::. ::.::::::::::. : .:.:.:::..::::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
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280 290 300 310
pF1KB7 VVTPLLNPFIYTLRNEEVKSAMKQLRQRQVFFTKSYT
. : .::: ::::::.:::.::..:..:
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1208 init1: 1152 opt: 1171 Z-score: 967.2 bits: 187.1 E(32554): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 1171; 53.9% identity (80.7% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
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CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
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CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS31 LWRRKKDPIGPLEHRPLH
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CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
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CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]