Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7361
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7361, 309 aa
1>>>pF1KB7361 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2019+/-0.000497; mu= 22.1895+/- 0.031
mean_var=132.6741+/-41.393, 0's: 0 Z-trim(108.2): 365 B-trim: 977 in 1/49
Lambda= 0.111348
statistics sampled from 15695 (16257) to 15695 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 6.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 854 149.5 8e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 820 144.1 3.5e-34
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 798 140.5 4.1e-33
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 798 140.5 4.1e-33
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 798 140.6 4.1e-33
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 788 138.9 1.2e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 788 138.9 1.3e-32
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 770 136.0 9.2e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 764 135.1 1.8e-31
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 752 133.1 6.8e-31
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 751 133.0 7.7e-31
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 749 132.6 9.5e-31
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 741 131.4 2.3e-30
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 739 131.1 2.9e-30
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 739 131.1 2.9e-30
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 739 131.1 2.9e-30
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 734 130.2 5e-30
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 721 128.2 2.2e-29
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 701 125.0 2e-28
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 690 123.2 6.8e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 479 89.3 1.1e-17
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 468 87.5 3.7e-17
XP_011531037 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 221 48.1 3.8e-05
XP_011531038 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 431) 221 48.1 3.8e-05
XP_011531036 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 618) 221 48.4 4.5e-05
NP_852111 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 669) 221 48.4 4.7e-05
NP_000136 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) foll ( 695) 221 48.5 4.7e-05
XP_011531035 (OMIM: 136435,233300,276400,608115) P ( 729) 221 48.5 4.8e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 216 47.3 6.7e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 216 47.3 6.8e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 214 46.7 7.2e-05
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 215 47.2 7.5e-05
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 215 47.3 8e-05
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 211 46.3 0.0001
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 211 46.8 0.00014
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 211 46.9 0.00015
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 211 46.9 0.00015
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 208 45.9 0.00016
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 204 45.3 0.00024
XP_011531136 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 203 45.1 0.00027
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 203 45.1 0.00027
XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 203 45.1 0.00027
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 203 45.3 0.0003
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 203 45.3 0.0003
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 203 45.5 0.00033
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 203 45.5 0.00035
NP_000224 (OMIM: 152790,176410,238320) lutropin-ch ( 699) 203 45.6 0.00035
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 199 44.4 0.0004
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 199 44.4 0.0004
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 199 44.5 0.00042
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 872 init1: 705 opt: 854 Z-score: 764.1 bits: 149.5 E(85289): 8e-36
Smith-Waterman score: 854; 41.3% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (3-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTP
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pF1KB7 SFDRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFF
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pF1KB7 CDIPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAY
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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240 250 260 270 280 290
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300
pF1KB7 VALGMLIKGKLTKK
: ....:.
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 820; 41.0% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (3-305:6-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFST-NKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTP
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pF1KB7 VYFFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVM
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pF1KB7 SFDRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFF
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
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pF1KB7 CDIPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAY
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NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
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pF1KB7 SICLPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB7 VALGMLIKGKLTKK
:: : : :
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVY
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:::.::::.:.:. .:.:: .:: ......::: ::..:..... .. . .::.::..
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pF1KB7 CLPHLLVVL-FLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVA
: :: ::: : :: . .:..: : . :.. .:.::.. : .::.::::::. .: :
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300
pF1KB7 LGMLIKGKLTKK
: ..
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 811 init1: 685 opt: 798 Z-score: 715.5 bits: 140.5 E(85289): 4.1e-33
Smith-Waterman score: 798; 38.9% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (3-302:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KB7 FFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSF
:::.::::.:.:. .:.:: .:: ......::: ::..:..... .. . .::.::..
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KB7 DRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCD
:...:.:::::: . : .. :. .. :. ..: ...:: ::.:..: . .::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 IPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSI
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KB7 CLPHLLVVL-FLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVA
: :: ::: : :: . .:..: : . :.. .:.::.. : .::.::::::. .: :
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 LGMLIKGKLTKK
: ..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 798; 38.9% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (3-302:15-315)
10 20 30 40
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITT
: . :.::.:.:.: . .. : ..:: .:: ...::.:::. ..
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pF1KB7 LDHHLHTPVYFFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASA
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pF1KB7 ELLLLTVMSFDRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCG
. .::.::..:...:.:::::: . : .. :. .. :. ..: ...:: ::.:.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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.: . .::::. :: .:::.. . :. .. .... . :. :. .:.:. :: :.::
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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:.:. ::.: : :: ::: : :: . .:..: : . :.. .:.::.. : .::.::
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pF1KB7 SLRNKAIKVALGMLIKGKLTKK
::::. .: :: ..
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 801 init1: 619 opt: 788 Z-score: 706.8 bits: 138.9 E(85289): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 788; 40.1% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (3-307:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 IPQLLAISCSENLIRE-IALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYS
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNI-VGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
190 200 210 220 230
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pF1KB7 ICLPHLL-VVLFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKV
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB7 ALGMLIKGKLTKK
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NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 680 init1: 634 opt: 788 Z-score: 706.8 bits: 138.9 E(85289): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 788; 42.4% identity (73.5% similar) in 302 aa overlap (1-298:3-302)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFST-NKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPV
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YFFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KB7 FDRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DIPQLLAISCSENLIREIALIL--INVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPC--LLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YSICLPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAI
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB7 KVALGMLIKGKLTKK
: ::
NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 768 init1: 645 opt: 770 Z-score: 691.2 bits: 136.0 E(85289): 9.2e-32
Smith-Waterman score: 770; 37.8% identity (72.8% similar) in 294 aa overlap (10-302:15-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 PVYFFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KB7 MSFDRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 FCDIPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YSICLPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAI
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 KVALGMLIKGKLTKK
. :. :.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 632 init1: 632 opt: 764 Z-score: 686.0 bits: 135.1 E(85289): 1.8e-31
Smith-Waterman score: 764; 39.5% identity (72.4% similar) in 301 aa overlap (3-302:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSF
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 IPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSI
:.: ..::..:. .:.: . ...: :...: .. :.. . ::.:. ::.:
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CLPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 LGMLIKGKLTKK
: :.
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 738 init1: 624 opt: 752 Z-score: 675.6 bits: 133.1 E(85289): 6.8e-31
Smith-Waterman score: 752; 37.9% identity (71.1% similar) in 298 aa overlap (3-298:2-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVF
10 20 30 40 50
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pF1KB7 LKNLSFLDL-CLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFD
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NP_001 LLTLAVVDIICTTSII-PKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDI
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NP_001 RYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEI
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 PQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSIC
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NP_001 PPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTC
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 LPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVAL
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NP_001 SSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGI
240 250 260 270 280 290
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NP_001 RKVFAFLKH
300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]