Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7361
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7361, 309 aa
1>>>pF1KB7361 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7773+/-0.00122; mu= 13.0170+/- 0.071
mean_var=219.2131+/-82.927, 0's: 0 Z-trim(102.6): 411 B-trim: 388 in 1/49
Lambda= 0.086625
statistics sampled from 6511 (7030) to 6511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 ( 309) 1995 263.1 1.9e-70
CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 ( 321) 1105 151.9 5.9e-37
CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 ( 311) 1032 142.8 3.2e-34
CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 ( 312) 1020 141.3 9.1e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 888 124.8 8.6e-29
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 865 121.9 6.2e-28
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 859 121.2 1e-27
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 854 120.6 1.6e-27
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 851 120.2 2.1e-27
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 847 119.7 2.9e-27
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 843 119.2 4.3e-27
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 826 117.1 1.9e-26
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 823 116.7 2.4e-26
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 820 116.3 3.1e-26
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 818 116.1 3.6e-26
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 817 115.9 4e-26
CCDS31188.1 OR13A1 gene_id:79290|Hs108|chr10 ( 328) 815 115.7 4.8e-26
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 812 115.3 6.1e-26
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 811 115.2 6.7e-26
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 810 115.0 7.1e-26
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 810 115.1 7.2e-26
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 808 114.8 8.6e-26
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 808 114.8 8.7e-26
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 808 114.8 8.7e-26
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 807 114.8 1e-25
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 805 114.4 1.1e-25
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 805 114.4 1.1e-25
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 804 114.3 1.2e-25
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 803 114.2 1.3e-25
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 803 114.2 1.3e-25
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 803 114.3 1.4e-25
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 799 113.7 1.9e-25
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 798 113.6 2.1e-25
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 798 113.6 2.1e-25
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 797 113.4 2.2e-25
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 796 113.3 2.5e-25
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 795 113.3 2.8e-25
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 794 113.1 2.9e-25
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 792 112.8 3.4e-25
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 792 112.8 3.5e-25
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 791 112.7 3.8e-25
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 789 112.4 4.5e-25
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 788 112.3 4.9e-25
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 788 112.3 4.9e-25
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 788 112.4 5.1e-25
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 786 112.1 5.8e-25
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 785 111.9 6.3e-25
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 784 111.8 6.9e-25
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 783 111.7 7.5e-25
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 783 111.7 7.7e-25
>>CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1995 init1: 1995 opt: 1995 Z-score: 1378.2 bits: 263.1 E(32554): 1.9e-70
Smith-Waterman score: 1995; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PHLLVVLFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVALGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHLLVVLFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVALGM
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LIKGKLTKK
:::::::::
CCDS31 LIKGKLTKK
>>CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 926 init1: 926 opt: 1105 Z-score: 777.0 bits: 151.9 E(32554): 5.9e-37
Smith-Waterman score: 1105; 51.8% identity (83.0% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
:.::: .. :.::::: .... :::...::. :: :: ::.::: : :.:..::.:.:.:
CCDS34 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
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CCDS34 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
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CCDS34 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
:.: ..:: ..: :::: ... : :.: :...:...:::: .:::.::..:..: ::
CCDS34 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 PHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVAL-
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CCDS34 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 GMLIKGKLTKK
:: : .: ..
CCDS34 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
310 320
>>CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1031 init1: 852 opt: 1032 Z-score: 727.8 bits: 142.8 E(32554): 3.2e-34
Smith-Waterman score: 1032; 52.9% identity (78.2% similar) in 312 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
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CCDS31 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAVLVGNLLIIAVITLDQHLHTPMYFF
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pF1KB7 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
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CCDS31 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
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pF1KB7 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
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CCDS31 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSSVIHQFFRDIP
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pF1KB7 QLLA-ISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSIC
..:: .:: : .. :. . .. : . :::...:.: ..:::: .::: ....::.: :
CCDS31 HVLALVSC-EVFFVEFLTLALSSCLVLGCFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVAL
:.:.:. :::.::..: : : ... :: : ::.. ::.::: .:::::::::: ::.:.
CCDS31 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
240 250 260 270 280 290
300
pF1KB7 G-MLIKGKLTKK
...: . .:
CCDS31 WRLFVKIYFLQK
300 310
>>CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1039 init1: 846 opt: 1020 Z-score: 719.7 bits: 141.3 E(32554): 9.1e-34
Smith-Waterman score: 1020; 50.0% identity (75.0% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
: : : : ::.:: :: .. :::: :...:: .::::.::. .:: : :: :.:::
CCDS31 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
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pF1KB7 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
:.:::.:: : ::::.: : .:::. ...:: :::.::::.. . .:::.::.:. ::
CCDS31 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
:.:.:.:::: ::.. :.: . .: : : . : :::..::.: .: ::..::::::::
CCDS31 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
.:: .:::... :. ... . . ::: :: .:.:.:::: .: ..::.: :.
CCDS31 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 PHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVALG
::.::: .:::. .::.: . . : ..: ::...:: ::::::::::: ::::.
CCDS31 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 MLIKGKLTKK
..:
CCDS31 KIMKRIFYSENV
310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 898 init1: 746 opt: 888 Z-score: 630.4 bits: 124.8 E(32554): 8.6e-29
Smith-Waterman score: 888; 43.1% identity (75.8% similar) in 297 aa overlap (3-298:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVY
: : .::::..:::. ... .: .:.: :.:.: ::.:::. :. : :::::.:
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSF
.:: ::.:.:.: . ..:. ... : ...:::..::: :.: .. ...: :::..:..
CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCD
::: :::.::.:.::... : : :. : : : .:.::. :: : .::.:... ::::
CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 IPQLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSI
:: :: .::... . :.::. .: . . :. :...:. ..::. .: :.::. ::.:
CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CLPHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVA
: :: .: :: ......:..: : : ..::.:... : .:::::.:::: :: :
CCDS46 CASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 LGMLIKGKLTKK
.
CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
310 320
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 818 init1: 684 opt: 865 Z-score: 614.9 bits: 121.9 E(32554): 6.2e-28
Smith-Waterman score: 865; 43.5% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (3-306:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MANLTIVTEFILMGFST-NKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPV
: :::.::.:..::. . .. : .::: ::: .::::::::..: : :..:.
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YFFLKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMS
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