Result of FASTA (omim) for pFN21AB7287
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7287, 1251 aa
  1>>>pF1KB7287 1251 - 1251 aa - 1251 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5979+/-0.000488; mu= 17.4383+/- 0.030
 mean_var=144.3697+/-29.621, 0's: 0 Z-trim(112.8): 112  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.106742
 statistics sampled from 21692 (21804) to 21692 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.256), width:  16
 Scan time: 15.330

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001106 (OMIM: 103070) adenylate cyclase type 8  (1251) 8262 1285.8       0
XP_005250826 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate c (1221) 5330 834.2       0
XP_016868496 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate c ( 646) 4261 669.3 2.2e-191
XP_016868495 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate c (1155) 4261 669.6 3.3e-191
XP_006716564 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate c (1185) 4261 669.6 3.4e-191
NP_066939 (OMIM: 103072,610154,610154) adenylate c (1119) 2197 351.7 1.6e-95
XP_005249641 (OMIM: 103072,610154,610154) PREDICTE ( 979) 1883 303.3 5.1e-81
NP_899200 (OMIM: 600293,606703) adenylate cyclase  (1261) 1601 260.0 7.3e-68
XP_005247134 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden (1286) 1601 260.0 7.4e-68
XP_006719273 (OMIM: 600294,616287) PREDICTED: aden (1168) 1498 244.1 4.1e-63
NP_056085 (OMIM: 600294,616287) adenylate cyclase  (1168) 1498 244.1 4.1e-63
XP_016858679 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1098) 1491 243.0 8.3e-63
XP_006713546 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 919) 1386 226.8 5.4e-58
XP_016861128 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 920) 1386 226.8 5.4e-58
NP_001186571 (OMIM: 600293,606703) adenylate cycla ( 911) 1385 226.6   6e-58
XP_016861127 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 920) 1385 226.6   6e-58
XP_005247135 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 936) 1385 226.6 6.1e-58
XP_011510662 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 923) 1384 226.4 6.7e-58
XP_011510661 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 953) 1384 226.5 6.8e-58
XP_016874232 (OMIM: 600294,616287) PREDICTED: aden (1067) 1380 225.9 1.1e-57
XP_005249642 (OMIM: 103072,610154,610154) PREDICTE ( 563) 1183 195.3 9.8e-49
XP_006713547 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 845) 1165 192.7 8.9e-48
XP_016861129 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 845) 1165 192.7 8.9e-48
XP_011510663 (OMIM: 600293,606703) PREDICTED: aden ( 845) 1165 192.7 8.9e-48
NP_004027 (OMIM: 600291) adenylate cyclase type 3  (1144) 1140 189.0 1.6e-46
NP_001307542 (OMIM: 600291) adenylate cyclase type (1145) 1140 189.0 1.6e-46
XP_016858676 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1163) 1140 189.0 1.6e-46
XP_011530793 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1164) 1140 189.0 1.6e-46
NP_001268697 (OMIM: 103072,610154,610154) adenylat ( 338) 1117 184.9 7.9e-46
XP_016858682 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c ( 903) 1064 177.2 4.5e-43
XP_016858681 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c ( 904) 1064 177.2 4.5e-43
XP_011512244 (OMIM: 103071) PREDICTED: adenylate c (1045) 1000 167.4 4.6e-40
NP_065433 (OMIM: 103071) adenylate cyclase type 2  (1091) 1000 167.4 4.8e-40
XP_011530796 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1120)  980 164.3 4.1e-39
XP_016858678 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1139)  980 164.3 4.2e-39
XP_011530795 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1140)  980 164.3 4.2e-39
XP_016858677 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1149)  980 164.3 4.2e-39
XP_011530794 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1150)  980 164.3 4.2e-39
XP_016858675 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1166)  980 164.3 4.2e-39
XP_006711988 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1167)  980 164.3 4.2e-39
XP_011530792 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1185)  980 164.3 4.3e-39
XP_011530791 (OMIM: 600291) PREDICTED: adenylate c (1186)  980 164.3 4.3e-39
XP_016878388 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c ( 723)  964 161.7 1.7e-38
NP_001272986 (OMIM: 600385) adenylate cyclase type ( 734)  964 161.7 1.7e-38
XP_016878387 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c ( 734)  964 161.7 1.7e-38
XP_016878384 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c (1080)  964 161.8 2.2e-38
NP_001105 (OMIM: 600385) adenylate cyclase type 7  (1080)  964 161.8 2.2e-38
XP_011521138 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c (1086)  964 161.8 2.2e-38
XP_011521137 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c (1086)  964 161.8 2.2e-38
XP_011521139 (OMIM: 600385) PREDICTED: adenylate c (1086)  964 161.8 2.2e-38


>>NP_001106 (OMIM: 103070) adenylate cyclase type 8 [Hom  (1251 aa)
 initn: 8262 init1: 8262 opt: 8262  Z-score: 6883.1  bits: 1285.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8262; 100.0% identity (100.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1251)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MELSDVRCLTGSEELYTIHPTPPAGDGRSASRPQRLLWQTAVRHITEQRFIHGHRGGSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MELSDVRCLTGSEELYTIHPTPPAGDGRSASRPQRLLWQTAVRHITEQRFIHGHRGGSGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 GSGGSGKASDPAGGGPNHHAPQLSGDSALPLYSLGPGERAHSTCGTKVFPERSGSGSASG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSGGSGKASDPAGGGPNHHAPQLSGDSALPLYSLGPGERAHSTCGTKVFPERSGSGSASG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 SGGGGDLGFLHLDCAPSNSDFFLNGGYSYRGVIFPTLRNSFKSRDLERLYQRYFLGQRRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGGGGDLGFLHLDCAPSNSDFFLNGGYSYRGVIFPTLRNSFKSRDLERLYQRYFLGQRRK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SEVVMNVLDVLTKLTLLVLHLSLASAPMDPLKGILLGFFTGIEVVICALVVVRKDTTSHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEVVMNVLDVLTKLTLLVLHLSLASAPMDPLKGILLGFFTGIEVVICALVVVRKDTTSHT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 YLQYSGVVTWVAMTTQILAAGLGYGLLGDGIGYVLFTLFATYSMLPLPLTWAILAGLGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLQYSGVVTWVAMTTQILAAGLGYGLLGDGIGYVLFTLFATYSMLPLPLTWAILAGLGTS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LLQVILQVVIPRLAVISINQVVAQAVLFMCMNTAGIFISYLSDRAQRQAFLETRRCVEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLQVILQVVIPRLAVISINQVVAQAVLFMCMNTAGIFISYLSDRAQRQAFLETRRCVEAR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LRLETENQRQERLVLSVLPRFVVLEMINDMTNVEDEHLQHQFHRIYIHRYENVSILFADV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRLETENQRQERLVLSVLPRFVVLEMINDMTNVEDEHLQHQFHRIYIHRYENVSILFADV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 KGFTNLSTTLSAQELVRMLNELFARFDRLAHEHHCLRIKILGDCYYCVSGLPEPRQDHAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGFTNLSTTLSAQELVRMLNELFARFDRLAHEHHCLRIKILGDCYYCVSGLPEPRQDHAH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 CCVEMGLSMIKTIRYVRSRTKHDVDMRIGIHSGSVLCGVLGLRKWQFDVWSWDVDIANKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CCVEMGLSMIKTIRYVRSRTKHDVDMRIGIHSGSVLCGVLGLRKWQFDVWSWDVDIANKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 ESGGIPGRIHISKATLDCLNGDYNVEEGHGKERNEFLRKHNIETYLIKQPEDSLLSLPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESGGIPGRIHISKATLDCLNGDYNVEEGHGKERNEFLRKHNIETYLIKQPEDSLLSLPED
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 IVKESVSSSDRRNSGATFTEGSWSPELPFDNIVGKQNTLAALTRNSINLLPNHLAQALHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVKESVSSSDRRNSGATFTEGSWSPELPFDNIVGKQNTLAALTRNSINLLPNHLAQALHV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 QSGPEEINKRIEHTIDLRSGDKLRREHIKPFSLMFKDSSLEHKYSQMRDEVFKSNLVCAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSGPEEINKRIEHTIDLRSGDKLRREHIKPFSLMFKDSSLEHKYSQMRDEVFKSNLVCAF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 IVLLFITAIQSLLPSSRVMPMTIQFSILIMLHSALVLITTAEDYKCLPLILRKTCCWINE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVLLFITAIQSLLPSSRVMPMTIQFSILIMLHSALVLITTAEDYKCLPLILRKTCCWINE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 TYLARNVIIFASILINFLGAILNILWCDFDKSIPLKNLTFNSSAVFTDICSYPEYFVFTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYLARNVIIFASILINFLGAILNILWCDFDKSIPLKNLTFNSSAVFTDICSYPEYFVFTG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 VLAMVTCAVFLRLNSVLKLAVLLIMIAIYALLTETVYAGLFLRYDNLNHSGEDFLGTKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLAMVTCAVFLRLNSVLKLAVLLIMIAIYALLTETVYAGLFLRYDNLNHSGEDFLGTKEV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 SLLLMAMFLLAVFYHGQQLEYTARLDFLWRVQAKEEINEMKELREHNENMLRNILPSHVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLLLMAMFLLAVFYHGQQLEYTARLDFLWRVQAKEEINEMKELREHNENMLRNILPSHVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 RHFLEKDRDNEELYSQSYDAVGVMFASIPGFADFYSQTEMNNQGVECLRLLNEIIADFDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHFLEKDRDNEELYSQSYDAVGVMFASIPGFADFYSQTEMNNQGVECLRLLNEIIADFDE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB7 LLGEDRFQDIEKIKTIGSTYMAVSGLSPEKQQCEDKWGHLCALADFSLALTESIQEINKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLGEDRFQDIEKIKTIGSTYMAVSGLSPEKQQCEDKWGHLCALADFSLALTESIQEINKH
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB7 SFNNFELRIGISHGSVVAGVIGAKKPQYDIWGKTVNLASRMDSTGVSGRIQVPEETYLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFNNFELRIGISHGSVVAGVIGAKKPQYDIWGKTVNLASRMDSTGVSGRIQVPEETYLIL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB7 KDQGFAFDYRGEIYVKGISEQEGKIKTYFLLGRVQPNPFILPPRRLPGQYSLAAVVLGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDQGFAFDYRGEIYVKGISEQEGKIKTYFLLGRVQPNPFILPPRRLPGQYSLAAVVLGLV
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             1210      1220      1230      1240      1250 
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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>>XP_005250826 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate cycla  (1221 aa)
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Smith-Waterman score: 7978; 97.6% identity (97.6% similar) in 1251 aa overlap (1-1251:1-1221)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 TYLARNVIIFASILINFLGAILNI------------------------------YFVFTG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLLLMAMFLLAVFYHGQQLEYTARLDFLWRVQAKEEINEMKELREHNENMLRNILPSHVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 QSLNRQRQKQLLNENNNTGIIKGHYNRRTLLSPSGTEPGAQAEGTDKSDLP
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>>XP_016868496 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate cycla  (646 aa)
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRLETENQRQERLVLSVLPRFVVLEMINDMTNVEDEHLQHQFHRIYIHRYENVSILFADV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGFTNLSTTLSAQELVRMLNELFARFDRLAHEHHCLRIKILGDCYYCVSGLPEPRQDHAH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CCVEMGLSMIKTIRYVRSRTKHDVDMRIGIHSGSVLCGVLGLRKWQFDVWSWDVDIANKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ESGGIPGRIHISKATLDCLNGDYNVEEGHGKERNEFLRKHNIETYLIKQPEDSLLSLPED
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pF1KB7 IVKESVSSSDRRNSGATFTEGSWSPELPFDNIVGKQNTLAALTRNSINLLPNHLAQALHV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
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pF1KB7 QSGPEEINKRIEHTIDLRSGDKLRREHIKPFSLMFKDSSLEHKYSQMRDEVFKSNLVCAF

>>XP_016868495 (OMIM: 103070) PREDICTED: adenylate cycla  (1155 aa)
 initn: 6968 init1: 4261 opt: 4261  Z-score: 3553.7  bits: 669.6 E(85289): 3.3e-191
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NP_066 C----IFI---VVLIYSVAQGCVVGCLPWAW----SSKPNSSLVVLSSGGQRTALPTLPC
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       :...     :..::   :  :.  :..:..   :::.:: .::.:: ..:....  :. .
NP_066 GRSYEPI--VAILL---FSCALALHARQVDIRLRLDYLWAAQAEEEREDMEKVKLDNRRI
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NP_066 LFNLLPAHVAQHFLMSNPRNMDLYYQSYSQVGVMFASIPNFNDFYIELDGNNMGVECLRL
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        . . ..::: .:.:.: ::.::. : ::::::::..:::::::.:::.:::::::::.:
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NP_899 LLPQPRSASEGIWWTVFFIYTIYTLLPVRMRAAVLSGVLLSALHLAIALRTNAQDQFLLK
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NP_899 RHVAMEMKADI-NAKQEDM--MFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTL
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pF1KB7 TKHDVDMRIGIHSGSVLCGVLGLRKWQFDVWSWDVDIANKLESGGIPGRIHISKATLDCL
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NP_899 TGVNVNMRVGIHSGRVHCGVLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGKAGRIHITKATLNYL
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pF1KB7 NGDYNVEEGHGKERNEFLRKHNIETYLIKQPEDSLLSLPEDIVKESVSSSDR-RNSGATF
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NP_899 NGDYEVEPGCGGERNAYLKEHSIETFLILR---CTQKRKEE--KAMIAKMNRQRTNSIGH
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pF1KB7 TEGSWSPELPFDNIVGKQNTLAALTRNSINLLPNHLAQALHVQSGPE-EINKRIEHTIDL
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NP_899 NPPHWGAERPFYNHLGGNQVSKEMKRMGFEDPKDKNAQE---SANPEDEVDEFLGRAIDA
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pF1KB7 RSGDKLRREHIKPFSLMFKDSSLEHKYSQMRDEVFKSNLVCAFIVLLFITAIQ-SLLPSS
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NP_899 RSIDRLRSEHVRKFLLTFREPDLEKKYSKQVDDRFGAYVACASLVFLFICFVQITIVPHS
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pF1KB7 RVMPMTIQFSILIMLHSALVLITTAEDYKCLPLI---LRKTCCWINETYLARNVIIFASI
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NP_899 IFM-LSFYLTCSLLL-TLVVFVSVI--YSCVKLFPSPLQTLSRKIVRSKMNSTLVGVFTI
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pF1KB7 LINFLGAILNILWCDF---------DKSIPLKNLT---FNSSAVFTDI------------
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NP_899 TLVFLAAFVNMFTCNSRDLLGCLAQEHNISASQVNACHVAESAVNYSLGDEQGFCGSPWP
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pF1KB7 -CSYPEYFVFTGVLAMVTCAVFLRLNSVLKLAVLLIMIAIYALLTETVYAGLFLRYDNLN
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NP_899 NCNFPEYFTYSVLLSLLACSVFLQISCIGKLVLMLAIELIYVLIVEVPGVTLFDNADLLV
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pF1KB7 HSGE-DFL--GT------------KEVSLLLMAMFLLAVFYHGQQLEYTARLDFLWRVQA
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NP_899 TANAIDFFNNGTSQCPEHATKVALKVVTPIIISVFVLALYLHAQQVESTARLDFLWKLQA
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pF1KB7 KEEINEMKELREHNENMLRNILPSHVARHFLEKDRDNEELYSQSYDAVGVMFASIPGFAD
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NP_899 TEEKEEMEELQAYNRRLLHNILPKDVAAHFLARERRNDELYYQSCECVAVMFASIANFSE
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