Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7240, 311 aa
1>>>pF1KB7240 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9477+/-0.00131; mu= 11.8753+/- 0.076
mean_var=136.6806+/-43.844, 0's: 0 Z-trim(101.5): 380 B-trim: 715 in 2/44
Lambda= 0.109704
statistics sampled from 6075 (6548) to 6075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 2031 333.9 9.8e-92
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1733 286.8 1.7e-77
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1400 234.0 1.1e-61
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1379 230.7 1.1e-60
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1362 228.0 7.4e-60
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1352 226.4 2.2e-59
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1340 224.5 8.5e-59
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1286 216.0 3.1e-56
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1271 213.6 1.6e-55
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1196 201.7 5.9e-52
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1138 192.5 3.5e-49
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1116 189.1 3.9e-48
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1101 186.7 2e-47
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1090 185.0 7.4e-47
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1088 184.6 8.4e-47
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1065 181.0 1e-45
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1061 180.4 1.6e-45
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1060 180.2 1.8e-45
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1057 179.7 2.5e-45
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1053 179.1 3.9e-45
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1052 178.9 4.3e-45
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1051 178.8 4.8e-45
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1040 177.0 1.6e-44
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1040 177.0 1.7e-44
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1039 176.9 1.8e-44
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1036 176.4 2.5e-44
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1035 176.2 2.8e-44
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1031 175.6 4.3e-44
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1026 174.8 7.6e-44
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1021 174.0 1.3e-43
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1018 173.5 1.8e-43
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1014 172.9 2.8e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1010 172.3 4.3e-43
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1007 171.8 6.1e-43
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1006 171.7 6.8e-43
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1004 171.3 8.6e-43
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1001 170.8 1.2e-42
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 999 170.5 1.5e-42
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 998 170.4 1.6e-42
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 994 169.7 2.5e-42
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 993 169.6 2.8e-42
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 991 169.3 3.5e-42
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 984 168.2 7.9e-42
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 983 168.0 8.4e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 983 168.0 8.7e-42
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 979 167.4 1.3e-41
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 979 167.4 1.3e-41
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 979 167.4 1.4e-41
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 977 167.1 1.7e-41
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 968 165.6 4.3e-41
>>CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 1760.4 bits: 333.9 E(32554): 9.8e-92
Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:::::::::::
CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
>>CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 (346 aa)
initn: 1775 init1: 1725 opt: 1733 Z-score: 1504.9 bits: 286.8 E(32554): 1.7e-77
Smith-Waterman score: 1733; 84.6% identity (94.2% similar) in 311 aa overlap (1-311:36-346)
10 20 30
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLL
:..::.: ::.:::.::.:. ::::::::.
CCDS66 QGITFLQKENNNTIHLNTMFFLSPAETHQRMAAENHSFVTKFILVGLTEKSELQLPLFLV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 FLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKN
:::::::::.::::: ::: :::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLGIYVVTVLGNLGMITLIGLSSHLHTPMYCFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 IISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYI
::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::::.:::::::::::: ::.
CCDS66 IISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAYDGYVAICSPLLYSIIISNKACFSLILVVYV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 IGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVP
:::.:::.: ::::::::::::.::::::::. .::::::: :.:.:::: ...:::::
CCDS66 IGLICASAHIGCMFRVQFCKFDVINHYFCDLISILKLSCSSTYINELLILIFSGINILVP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQ
::::: ::::::::::.:: ::::::::::::::. :: .::::::::::::::.:::::
CCDS66 SLTILSSYIFIIASILRIRYTEGRSKAFSTCSSHISAVSVFFGSAAFMYLQPSSVSSMDQ
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB7 GKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL
::::::::::.::::::::::::::::::.::: : .::.:
CCDS66 GKVSSVFYTIVVPMLNPLIYSLRNKDVHVALKKTLGKRTFL
310 320 330 340
>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1449 init1: 1195 opt: 1400 Z-score: 1220.6 bits: 234.0 E(32554): 1.1e-61
Smith-Waterman score: 1400; 65.6% identity (90.1% similar) in 314 aa overlap (1-311:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
: ..::: :::::::::...::.: :::.::: .:.::.:::::. :. :.::::::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
::: .:::::.:.:.:.:::::.:::..:::::: :::::.::: :.:.::.::..:::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGCMTQLFFFLFFVISECYMLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
:::.:::.::::.: .:...: : ...::.::. :..:::::.:. ::. ..::::.::
CCDS31 DRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
.::::.:::.: :::....: : ..::.::: ::: ::.::..:::::.::.::::::::
CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
::::..:. .:::::::::.. :: .::.:::::::::: .::::::::::::::::.:.
CCDS31 CSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LKKML---QRRTLL
:.: : :::...
CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
>>CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1404 init1: 1174 opt: 1379 Z-score: 1202.6 bits: 230.7 E(32554): 1.1e-60
Smith-Waterman score: 1379; 65.3% identity (89.5% similar) in 314 aa overlap (1-311:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
: ..::: :::::::::...::.. :::.::: ::.::.:::::. ::. :.::::::::
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFRQPLFFLFLVIYIVTMVGNLGLITLFGLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
::: .:::::.:.:.:.:::::.:::..::::: :::.:.::: :.:.::.::..:::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISNVGCMTRLFFFLFFVISECYMLTSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
:::.:::.::::.: .:...: : ...::.::. :..:::::.:. ::. ..::::.::
CCDS31 DRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
.::::.:::.: :::....: : . :: ::: ::: ::.::..:::::.::.::::::::
CCDS31 ILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGTNITVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
::::..:. .:::::::::.. :: .::.:::::::::: .::::::::::::::::.:.
CCDS31 CSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSS-GSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290
310
pF1KB7 LKKML---QRRTLL
:.: : :::...
CCDS31 LRKALIKIQRRNIF
300 310
>>CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1416 init1: 1354 opt: 1362 Z-score: 1188.1 bits: 228.0 E(32554): 7.4e-60
Smith-Waterman score: 1362; 64.8% identity (88.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
:..::.: ::.::::::..:: .:.:::.::::.::::::::::. ::: :.::::::::
CCDS84 MAAENSSFVTQFILAGLTDQPGVQIPLFFLFLGFYVVTVVGNLGLITLIRLNSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
.:: .:::::::.:.:::::::..:: .:: ::: :::::.::: :...: .:.::::
CCDS84 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
:::.:::.:::: : .: ..:: :.:::: .:.. : .::.::. : :: .:.:::.::
CCDS84 DRYVAICNPLLYMVTMSPQVCFLLLLGVYGMGFAGAMAHTACMMGVTFCANNLVNHYMCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
.::::. .:.: :::.:... : ...: ::..::. :: .:..::.:: :::::::::::
CCDS84 ILPLLECACTSTYVNELVVFVVVGIDIGVPTVTIFISYALILSSIFHIDSTEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
::::..:: .::::.:::::.: :. .:.::::::.::: .::::::::::::::::.:.
CCDS84 CSSHIIAVSLFFGSGAFMYLKPFSLLAMNQGKVSSLFYTTVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:::.:..
CCDS84 LKKILNKNAFS
310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1346 init1: 1346 opt: 1352 Z-score: 1179.6 bits: 226.4 E(32554): 2.2e-59
Smith-Waterman score: 1352; 64.6% identity (88.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
:. :: : ...:.: ::..: :::::::::::::::::::::::: :: .: ::::::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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250 260 270 280 290 300
310
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:.:.:
CCDS31 LRKVLVGK
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10 20 30 40
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CCDS31 LKLPYCEH-LISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
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CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
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CCDS31 FFLFNLSLIDFCFSTTITPKMLMSFVSRKNIISFTGCMTQLFFFCFFVVSESFILSAMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYTVTMSCQVCLLLLLGAYGMGFAGAMAHTGSIMNLTFCADNLVNHFMCD
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CCDS31 CSSHIIVVSLFFGSGAFMYLKPLSILPLEQGKVSSLFYTIIVPVLNPLIYSLRNKDVKVA
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pF1KB7 LKKMLQRRTLL
:.. : :.
CCDS31 LRRTLGRKIFS
300 310
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CCDS31 YFLSSLSFLDFCYSSVITPKMLSGFLCRDRSISYSGCMIQLFFFCVCVISECYMLAAMAC
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CCDS31 DRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFCD
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CCDS31 IVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFST
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CCDS31 CSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRNA
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CCDS31 LMKLLRRKISLSPG
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CCDS31 FFLFNLSFIDLCYSCVFTPKMLNDFVSE-SIISYVGCMTQLFFFCFFVNSECYVLVSMAY
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CCDS31 WGSHIIAVALFFGSGTFTYLTTSFPGSMNHGRFASVFYTNVVPMLNPSIYSLRNKDDKLA
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CCDS31 LGKTLKRVLF
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311 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]