Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7137
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7137, 328 aa
1>>>pF1KB7137 328 - 328 aa - 328 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1178+/-0.00052; mu= 16.9778+/- 0.032
mean_var=137.9596+/-42.510, 0's: 0 Z-trim(108.5): 286 B-trim: 925 in 1/48
Lambda= 0.109194
statistics sampled from 16136 (16571) to 16136 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 6.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 1122 189.3 9e-48
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 955 163.0 7.7e-40
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 938 160.3 4.8e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 938 160.3 4.8e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 900 154.3 3.1e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 879 151.0 3.1e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 868 149.3 1e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 862 148.3 1.9e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 841 145.0 1.9e-34
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 839 144.7 2.4e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 829 143.1 7.2e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 827 142.8 8.9e-34
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 812 140.5 4.6e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 799 138.4 1.9e-32
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 792 137.3 4.1e-32
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 792 137.3 4.1e-32
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 792 137.3 4.1e-32
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 785 136.2 8.7e-32
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 764 132.9 8.9e-31
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 740 129.1 1.2e-29
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 491 89.9 7.7e-18
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 479 88.0 2.9e-17
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 232 49.3 1.8e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 232 49.3 1.8e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 228 48.6 2.6e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 228 48.6 2.7e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 228 48.6 2.7e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 228 48.6 2.7e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 214 46.3 0.00011
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 201 44.2 0.00043
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 201 44.2 0.00045
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 201 44.3 0.00048
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 201 44.3 0.00048
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 201 44.4 0.0005
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 200 44.1 0.00051
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 201 44.4 0.00051
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 199 43.9 0.00055
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 198 43.8 0.00062
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 197 43.7 0.00075
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 197 43.7 0.00078
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 190 42.4 0.0014
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 190 42.4 0.0014
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 190 42.4 0.0014
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 188 42.3 0.0021
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 185 41.7 0.0025
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 185 41.8 0.0026
XP_006724506 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 187 42.4 0.0027
XP_006724927 (OMIM: 300525) PREDICTED: P2Y purinoc ( 548) 187 42.4 0.0027
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 184 41.5 0.0028
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 184 41.6 0.003
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 1173 init1: 1111 opt: 1122 Z-score: 978.6 bits: 189.3 E(85289): 9e-48
Smith-Waterman score: 1122; 50.0% identity (84.3% similar) in 306 aa overlap (23-328:2-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_001 MLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLF
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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NP_001 IMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFII
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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NP_001 VAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVT
220 230 240 250 260 270
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
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NP_001 PTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 955; 45.2% identity (78.2% similar) in 312 aa overlap (13-322:3-314)
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pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMS--NQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALT
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pF1KB7 GNVLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQ
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XP_011 GNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQ
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pF1KB7 LYFLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHT
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pF1KB7 GLMLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGF
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XP_011 LLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMH
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IVSSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTV
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XP_011 ITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 LSPTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
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XP_011 VTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 961 init1: 936 opt: 938 Z-score: 821.9 bits: 160.3 E(85289): 4.8e-39
Smith-Waterman score: 938; 45.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (22-322:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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XP_011 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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XP_011 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
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310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
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XP_011 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 961 init1: 936 opt: 938 Z-score: 821.9 bits: 160.3 E(85289): 4.8e-39
Smith-Waterman score: 938; 45.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (22-322:4-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGN
10 20 30 40
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pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_036 LLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMY
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
:. .. . .::.:::::...:.::::::.. :.. .:. :....:.. .:. .:: :
NP_036 FVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLL
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pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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NP_036 MAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHIT
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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NP_036 CTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVT
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pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
: :::.::.:::. .:.::.:.
NP_036 PMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 910 init1: 887 opt: 900 Z-score: 789.6 bits: 154.3 E(85289): 3.1e-37
Smith-Waterman score: 900; 45.0% identity (75.3% similar) in 300 aa overlap (23-322:6-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
: : .: ::: :::. :. ::. :: .: .:. :
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWN
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pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_001 LSLIVLIRMDSHLHTPMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYF
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
... . :: :.:.::::::::::.:: :::.:: ..: .. .... . . .. :
NP_001 IFSTMGLSESCLMTAMAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGA
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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NP_001 LLQLHFCGSNVIRHFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIG
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
::.:. .: ::.:::.::.::::.: ..::. ...:.: :: :.. ...:...:::.
NP_001 ISIMKITSAKGRSKAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVI
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pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
: ::::::.:::::.: ::..:
NP_001 PMLNPLIYSLRNKEIKDALKRLQKRKCC
290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 928 init1: 873 opt: 879 Z-score: 771.6 bits: 151.0 E(85289): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 879; 45.2% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (23-323:7-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
: :::::::: :: .:: .. :: :: ::. : ::
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_006 IGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFY
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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NP_006 FFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
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NP_006 AFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFIL
170 180 190 200 210 220
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NP_006 LSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFI
230 240 250 260 270 280
310 320
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NP_006 PVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 893 init1: 868 opt: 868 Z-score: 762.3 bits: 149.3 E(85289): 1e-35
Smith-Waterman score: 868; 43.0% identity (76.1% similar) in 293 aa overlap (30-322:15-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_001 LFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLY
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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NP_001 FVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSF
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NP_001 TFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIV
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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NP_001 RAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVT
230 240 250 260 270 280
310 320
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NP_001 PSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 885 init1: 857 opt: 862 Z-score: 757.2 bits: 148.3 E(85289): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 862; 42.6% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (21-323:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGN
10 20 30 40
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pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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NP_009 TLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIF
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pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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NP_009 IFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPS
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pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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NP_009 TLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAIT
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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NP_009 WAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGT
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pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
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NP_009 PSLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
290 300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 864 init1: 836 opt: 841 Z-score: 739.5 bits: 145.0 E(85289): 1.9e-34
Smith-Waterman score: 841; 42.6% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (21-316:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGN
10 20 30 40
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pF1KB7 VLITLAITFNPGLHAPMYFFLLNLATMDIICTSSIMPKALASLVSEESSISYGGCMAQLY
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XP_011 TLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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XP_011 IFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVNGVMIVLADAFYGIVNFLMTIASYGFIV
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XP_011 TLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAIT
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 SSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTVLS
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XP_011 WAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGT
230 240 250 260 270 280
310 320
pF1KB7 PTLNPLIYTLRNKEVKAALRKLFPFFRN
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XP_011 PSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
290 300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 835 init1: 835 opt: 839 Z-score: 737.6 bits: 144.7 E(85289): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 839; 43.8% identity (77.3% similar) in 299 aa overlap (23-319:5-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKLWMESHLIVPETRPSPRMMSNQTLVTEFILQGFSEHPEYRVFLFSCFLFLYSGALTGN
: : .:::.: :... : ...:: :: .:. .. ::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGN
10 20 30 40
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NP_003 LGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLTWAASSELLLLTVMAYDRYAAICHPLHYSSMMSKVFCSGLATAVWLLCAVNTAIHTGL
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NP_003 FFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB7 MLRLDFCGPNVIIHFFCEVPPLLLLSCSSTYVN-GVMIVLADAFYGIVNFLMTI-ASYGF
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NP_003 VSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGV--NIVGTLLVILSSYSY
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pF1KB7 IVSSILKVKTAWGRQKAFSTCSSHLTVVCMYYTAVFYAYISPVSGYSAGKSKLAGLLYTV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]