Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7135
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7135, 321 aa
1>>>pF1KB7135 321 - 321 aa - 321 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4204+/-0.0005; mu= 15.5370+/- 0.031
mean_var=94.5997+/-23.452, 0's: 0 Z-trim(108.9): 311 B-trim: 1990 in 2/47
Lambda= 0.131865
statistics sampled from 16555 (17042) to 16555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 7.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1033 207.4 3.1e-53
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1033 207.4 3.1e-53
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1033 207.4 3.1e-53
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1033 207.4 3.2e-53
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1003 201.7 1.6e-51
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 998 200.8 3.2e-51
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 998 200.8 3.2e-51
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 998 200.8 3.2e-51
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 992 199.6 6.9e-51
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 992 199.6 7e-51
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 983 197.9 2.3e-50
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 973 196.0 8.3e-50
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 967 194.9 1.9e-49
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 966 194.7 2.1e-49
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 953 192.2 1.2e-48
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 935 188.8 1.3e-47
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 932 188.2 1.9e-47
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 925 186.9 4.8e-47
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 925 186.9 5e-47
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 894 181.0 2.8e-45
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 559 117.2 4.4e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 492 104.5 3.1e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 250 58.5 2.2e-08
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 203 49.5 1.1e-05
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 199 48.8 2e-05
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 199 48.8 2e-05
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 199 48.8 2.1e-05
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 199 48.8 2.1e-05
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 199 48.8 2.1e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 197 48.5 2.9e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 194 47.8 3.7e-05
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 195 48.1 3.7e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 190 47.1 6.1e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 186 46.4 0.00012
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 186 46.4 0.00012
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 184 45.9 0.00014
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 183 45.8 0.00019
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 183 45.9 0.0002
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 182 45.6 0.0002
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 180 45.1 0.00022
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 180 45.1 0.00022
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 180 45.1 0.00023
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 180 45.2 0.00024
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349) 180 45.2 0.00024
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349) 180 45.2 0.00024
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 180 45.2 0.00025
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 180 45.2 0.00025
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 180 45.3 0.00028
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 180 45.3 0.00028
NP_004358 (OMIM: 601835) C-C chemokine receptor ty ( 374) 179 45.0 0.00029
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVF-FVGSECLLLAAMA
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pF1KB7 TCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKE
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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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pF1KB7 AVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:.: .
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KB7 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVF-FVGSECLLLAAMA
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pF1KB7 YDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFC
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pF1KB7 DIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFS
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pF1KB7 TCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKE
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XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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300 310 320
pF1KB7 AVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:.: .
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 STCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIK
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pF1KB7 EAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
.:.. .
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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: ::....::..::.: . : :::..:. :. :. ::.::::..
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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::::::. ..:::.. :.::.:: :.:::..:...::.:.:: :::::.::.::.:..:.
NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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pF1KB7 AVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:. .. :.
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
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XP_011 WQKL--LWK--FSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 1011 init1: 985 opt: 998 Z-score: 1040.6 bits: 200.8 E(85289): 3.2e-51
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pF1KB7 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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NP_036 WQKL--LWK--FSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 1011 init1: 985 opt: 998 Z-score: 1040.6 bits: 200.8 E(85289): 3.2e-51
Smith-Waterman score: 998; 47.6% identity (77.4% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
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pF1KB7 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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310 320
pF1KB7 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
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XP_011 WQKL--LWK--FSGLTSKLAT
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 1014 init1: 842 opt: 992 Z-score: 1034.6 bits: 199.6 E(85289): 6.9e-51
Smith-Waterman score: 992; 47.7% identity (78.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 1008 init1: 982 opt: 992 Z-score: 1034.5 bits: 199.6 E(85289): 7e-51
Smith-Waterman score: 992; 45.8% identity (78.4% similar) in 306 aa overlap (5-309:8-311)
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KB7 PMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGS-ECLLLA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLY-FVLALGTTECVLLV
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
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300 310
321 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:10:12 2016 done: Fri Nov 4 05:10:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]