Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7135
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7135, 321 aa
1>>>pF1KB7135 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1396+/-0.00122; mu= 11.3869+/- 0.072
mean_var=156.8555+/-50.065, 0's: 0 Z-trim(102.9): 398 B-trim: 820 in 2/48
Lambda= 0.102406
statistics sampled from 6655 (7175) to 6655 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 2118 325.7 3.1e-89
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1067 170.4 1.8e-42
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1067 170.4 1.8e-42
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1063 169.8 2.5e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1061 169.5 3.2e-42
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1052 168.2 7.8e-42
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1046 167.3 1.5e-41
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 1046 167.3 1.5e-41
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1045 167.1 1.6e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1042 166.7 2.2e-41
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1037 166.0 4e-41
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1033 165.4 5.5e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1033 165.4 5.5e-41
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1033 165.4 5.5e-41
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1033 165.4 5.8e-41
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 1029 164.8 8.3e-41
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1028 164.6 9.2e-41
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 1025 164.2 1.3e-40
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1024 164.0 1.4e-40
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1023 163.9 1.5e-40
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1022 163.7 1.7e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1022 163.7 1.7e-40
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1019 163.3 2.3e-40
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1019 163.3 2.3e-40
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1019 163.4 2.5e-40
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1017 163.0 2.8e-40
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1016 162.8 3.1e-40
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1009 161.8 6.5e-40
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 1009 161.8 6.6e-40
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1005 161.2 9.6e-40
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1003 160.9 1.2e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1003 160.9 1.2e-39
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1000 160.5 1.6e-39
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 998 160.2 2e-39
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 997 160.0 2.2e-39
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 992 159.3 3.6e-39
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 992 159.3 3.6e-39
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 992 159.3 3.7e-39
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 990 159.0 4.5e-39
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 987 158.6 6.1e-39
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 985 158.3 7.5e-39
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 984 158.1 8.2e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 983 158.0 9.2e-39
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 983 158.0 9.2e-39
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 983 158.0 9.2e-39
CCDS11023.1 OR3A1 gene_id:4994|Hs108|chr17 ( 315) 981 157.7 1.1e-38
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 981 157.7 1.1e-38
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 980 157.5 1.2e-38
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 979 157.4 1.4e-38
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 979 157.4 1.5e-38
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 2118 init1: 2118 opt: 2118 Z-score: 1715.5 bits: 325.7 E(32554): 3.1e-89
Smith-Waterman score: 2118; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:::::::::::::::::::::
CCDS46 VKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
310 320
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1113 init1: 1051 opt: 1067 Z-score: 876.1 bits: 170.4 E(32554): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 1067; 49.5% identity (80.3% similar) in 305 aa overlap (4-307:24-328)
10 20 30 40
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLG
.: : .:::..::::.:.:.:. ::..:.. :. :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQ
::. :: . : ::::::.::: :. . :: .:.:...::: ..::. :..:
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 LFAFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHT
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CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 VLTFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYIC
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CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSV
:. :::.: :.::::::::::::::..:.. :: : : :.:: ..: .:::::.: :..
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KB7 VTPMLNPIIYTLRNKDIKEAV-KTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:::.:::..:.:::::.. :. :..:.:
CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 (346 aa)
initn: 1161 init1: 1067 opt: 1067 Z-score: 876.0 bits: 170.4 E(32554): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 1067; 49.8% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:33-339)
10 20 30
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTI
:: .: .:.:::...:.:. :::..:: .
CCDS35 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 FFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKK
.. :. : :: :.:. :. : .::::::.:::::.:.:::::.:..: :.. ..:..:
CCDS35 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
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100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWA
:::..::..:. . . . ..::.:::.::::.:.:::::::::.:.. :: :.:: :
CCDS35 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
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160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTP
: :.:...::::. ::::::: :... :.: :: : :.. ..: : . :..
CCDS35 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
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pF1KB7 FLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKK
.: : .::. :.:.::::. .:::.::::::..: .:.::::::.: :..: : . .
CCDS35 LLLIFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KB7 DRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
:..... :.::.::::::::.::::..::::: . :.
CCDS35 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
310 320 330 340
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1098 init1: 1047 opt: 1063 Z-score: 873.3 bits: 169.8 E(32554): 2.5e-42
Smith-Waterman score: 1063; 52.6% identity (79.5% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
::. :.:.. ::..::::.: .:: :::.::.: :. ::: : .:: : : : ::::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFVFFVGSECLLLAAMAY
.::. :. .:::: ::.:.: :::.::.::..::..:.:.:.:: .:. .:::::.:
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQL-AASCWAAGFLNSVVHTVLTFCLPFCGNNQINYFFC
:::.::::::::::.... .: : ::.: : :: :.: : :.: ::: ..::...:::
CCDS30 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAAC-ACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTILRIQSSEGRRKAFS
:: :.: :. ... ..:... ::: :.: :..::: :::.::.: :: :: :.::
CCDS30 DISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPMLNPIIYTLRNKDIKE
:::::: .: . :. : : :.:: ..:. ..: :.:: :...::..::.::.::::..:
CCDS30 TCASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKS
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 AVK-TIGSKWQPPISSLDSKLTY
:.. :::. . :
CCDS30 ALRRTIGQTFYPLS
300 310
>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 (327 aa)
initn: 1061 init1: 1061 opt: 1061 Z-score: 871.5 bits: 169.5 E(32554): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1061; 51.3% identity (76.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:16-325)
10 20 30 40
pF1KB7 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILI
:: : : .::::.:::: .. : .:: .:.. :. ::.::. .
CCDS31 MIFPSHDSQAFTSVDMEVGNCTILTEFILLGFSADSQWQPILFGVFLMLYLITLSGNMTL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ILTTVTDPHLHTPMYYFLGNLAFIDICYTTSNVPQMMVHLLSKKKSISYVGCVVQLFAFV
.. :: :::::::.:.:::.:.:. ::. .:.... .:. : :: .:: .:::
CCDS31 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 FFVGSECLLLAAMAYDRYIAICNPLRYSVILSKVLCNQLAASCWAAGFLNSVVHTVLTFC
. .:: :::::::::. :::::: :: .: .::. :.:. . .::::...::. ::
CCDS31 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 LPFCGNNQINYFFCDIPPLLILSCGNTSVNELALLSTGVFIGWTPFLCIVLSYICIISTI
: :::.: :..:::: :::. .:: :: : : .::.. : . .: :..::. :. .:
CCDS31 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LRIQSSEGRRKAFSTCASHLAIVFLFYGSAIFTYVRPISTYSLKKDRLVSVLYSVVTPML
:::.:. ::.:::::::::: :.::::: .: : :: :::::..:......:.:..:.:
CCDS31 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320
pF1KB7 NPIIYTLRNKDIKEAVKTIGSKWQPPISSLDSKLTY
::.::.::::::::: . . ::
CCDS31 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
310 320
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1066 init1: 1037 opt: 1052 Z-score: 864.5 bits: 168.2 E(32554): 7.8e-42
Smith-Waterman score: 1052; 51.6% identity (76.1% similar) in 306 aa overlap (5-310:4-309)
10 20 30 40 50 60
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CCDS34 IQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFST
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310 320
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.: .: :
CCDS34 LKRTIQKTVPMEI
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CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
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10 20 30 40
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CCDS31 IIILIFLDSRLHTPMYFFLRNLSFADLCFSTSIVPQVLVHFLVKRKTISFYGCMTQIIVF
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CCDS31 LLVGCTECALLAVMSYDRYVAVCKPLYYSTIMTQRVCLWLSFRSWASGALVSLVDTSFTF
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CCDS31 HLPYWGQNIINHYFCEPPALLKLASIDTYSTEMAIFSMGVVILLAPVSLILGSYWNIIST
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CCDS31 VIQMQSGEGRLKAFSTCGSHLIVVVLFYGSGIFTYMRPNSKTTKELDKMISVFYTAVTPM
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CCDS31 LNPIIYSLRNKDVKGALRKLVGRKCFSHRQ
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CCDS41 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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.. .
CCDS41 LQKMLLKCTVFQQQ
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CCDS31 MLESNYTMPTEFLFVGFTDYLPLRVTLFLVFLLVYTLTMVGNILLIILVNINSSLQIPMY
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