Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5582, 374 aa
1>>>pF1KB5582 374 - 374 aa - 374 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5297+/-0.000417; mu= 15.7587+/- 0.026
mean_var=70.3724+/-14.195, 0's: 0 Z-trim(111.6): 49 B-trim: 88 in 2/48
Lambda= 0.152888
statistics sampled from 20150 (20199) to 20150 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 6.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000662 (OMIM: 103710) alcohol dehydrogenase cla ( 374) 2492 559.0 6.5e-159
NP_000659 (OMIM: 103720,103780) alcohol dehydrogen ( 375) 1652 373.7 3.9e-103
NP_000658 (OMIM: 103700) alcohol dehydrogenase 1A ( 375) 1642 371.5 1.8e-102
NP_000660 (OMIM: 103730,103780,168600) alcohol deh ( 375) 1628 368.4 1.5e-101
NP_001293100 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase ( 399) 1624 367.5 2.9e-101
NP_001293101 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase ( 399) 1624 367.5 2.9e-101
NP_000661 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase 4 i ( 380) 1623 367.3 3.3e-101
XP_016863203 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol deh ( 406) 1609 364.2 3e-100
XP_016863202 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol deh ( 406) 1609 364.2 3e-100
XP_016863204 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol deh ( 387) 1608 364.0 3.3e-100
NP_001095940 (OMIM: 103735) alcohol dehydrogenase ( 375) 1559 353.2 5.8e-97
NP_000664 (OMIM: 600086) alcohol dehydrogenase cla ( 386) 1546 350.3 4.3e-96
NP_000663 (OMIM: 103735) alcohol dehydrogenase 6 i ( 368) 1544 349.9 5.6e-96
NP_001159976 (OMIM: 600086) alcohol dehydrogenase ( 394) 1540 349.0 1.1e-95
NP_001273579 (OMIM: 103720,103780) alcohol dehydro ( 335) 1462 331.8 1.4e-90
XP_011529890 (OMIM: 103730,103780,168600) PREDICTE ( 341) 1434 325.6 1.1e-88
XP_011529891 (OMIM: 103730,103780,168600) PREDICTE ( 335) 1428 324.3 2.6e-88
NP_003095 (OMIM: 182500) sorbitol dehydrogenase [H ( 357) 155 43.5 0.00093
NP_057095 (OMIM: 608205) trans-2-enoyl-CoA reducta ( 373) 153 43.0 0.0013
XP_011539842 (OMIM: 608205) PREDICTED: trans-2-eno ( 431) 153 43.1 0.0015
NP_001123515 (OMIM: 123691) quinone oxidoreductase ( 295) 146 41.5 0.0031
XP_016855856 (OMIM: 123691) PREDICTED: quinone oxi ( 295) 146 41.5 0.0031
NP_001123514 (OMIM: 123691) quinone oxidoreductase ( 329) 146 41.5 0.0034
XP_011539049 (OMIM: 123691) PREDICTED: quinone oxi ( 329) 146 41.5 0.0034
NP_001880 (OMIM: 123691) quinone oxidoreductase is ( 329) 146 41.5 0.0034
XP_011539843 (OMIM: 608205) PREDICTED: trans-2-eno ( 364) 142 40.6 0.0069
XP_005245942 (OMIM: 608205) PREDICTED: trans-2-eno ( 401) 142 40.6 0.0075
XP_011539841 (OMIM: 608205) PREDICTED: trans-2-eno ( 459) 142 40.7 0.0084
>>NP_000662 (OMIM: 103710) alcohol dehydrogenase class-3 (374 aa)
initn: 2492 init1: 2492 opt: 2492 Z-score: 2974.0 bits: 559.0 E(85289): 6.5e-159
Smith-Waterman score: 2492; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSGADPEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSGADPEGC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRVTQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRVTQGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFGATEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFGATEC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 INPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 INPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB5 LMHSGKSIRTVVKI
::::::::::::::
NP_000 LMHSGKSIRTVVKI
370
>>NP_000659 (OMIM: 103720,103780) alcohol dehydrogenase (375 aa)
initn: 1658 init1: 1417 opt: 1652 Z-score: 1972.7 bits: 373.7 E(85289): 3.9e-103
Smith-Waterman score: 1652; 63.0% identity (87.1% similar) in 373 aa overlap (2-372:4-373)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSG--AD
:..:::::::: ::. ::.:::..:::::::.:::::..:...:::: ...:: .
NP_000 MSTAGKVIKCKAAVLWEVKKPFSIEDVEVAPPKAYEVRIKMVAVGICHTDDHVVSGNLVT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGCFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRV
: .:::::::.:::::::::::: .: :: ::::. ::::.:. : ::..: : : .
NP_000 P---LPVILGHEAAGIVESVGEGVTTVKPGDKVIPLFTPQCGKCRVCKNPESNYCLKNDL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TQGKGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGI
. .: . ::: ::::.:: : :..::::::.:::: . .::::: .::.::::.:::.
NP_000 GNPRGTLQDGTRRFTCRGKPIHHFLGTSTFSQYTVVDENAVAKIDAASPLEKVCLIGCGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 STGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFG
:::::.:::.::. :::.:::::::::::...::::.:::.:::.:::::::::.:::.:
NP_000 STGYGSAVNVAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGAARIIAVDINKDKFAKAKELG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAA
:::::::::..::::::: ::::::::.::: :: . .: :.: ::.. :.::.:::
NP_000 ATECINPQDYKKPIQEVLKEMTDGGVDFSFEVIGRLDTMMASLLCCHEACGTSVIVGVPP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFDEIN
...... :. :.:::::::...::.:: :..::::...:.::...: ..:: : :..::
NP_000 ASQNLSINPMLLLTGRTWKGAVYGGFKSKEGIPKLVADFMAKKFSLDALITHVLPFEKIN
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB5 KAFELMHSGKSIRTVVKI
..:.:.:::::::::.
NP_000 EGFDLLHSGKSIRTVLTF
360 370
>>NP_000658 (OMIM: 103700) alcohol dehydrogenase 1A [Hom (375 aa)
initn: 1648 init1: 1409 opt: 1642 Z-score: 1960.7 bits: 371.5 E(85289): 1.8e-102
Smith-Waterman score: 1642; 63.8% identity (86.3% similar) in 373 aa overlap (2-372:4-373)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSGA--D
:..:::::::: :: ::.::::.:::::::::::::..:...: :: ...::.
NP_000 MSTAGKVIKCKAAVLWELKKPFSIEEVEVAPPKAHEVRIKMVAVGICGTDDHVVSGTMVT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGCFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRV
: .:::::::.:::::::::::: .: :: :::: :::::.:..: ::..: : : :
NP_000 P---LPVILGHEAAGIVESVGEGVTTVKPGDKVIPLAIPQCGKCRICKNPESNYCLKNDV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TQGKGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGI
.. .: . ::::::::. : : :..: ::::.:::: . .::::: .::.::::.:::.
NP_000 SNPQGTLQDGTSRFTCRRKPIHHFLGISTFSQYTVVDENAVAKIDAASPLEKVCLIGCGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 STGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFG
:::::.:::.::. :::.:::::::::::..:::::.:::.:::.:::::::::.:::.:
NP_000 STGYGSAVNVAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAIMGCKAAGAARIIAVDINKDKFAKAKELG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAA
:::::::::..::::::: ::::::::.::: :: . .: :.: ::.. :.::.:::
NP_000 ATECINPQDYKKPIQEVLKEMTDGGVDFSFEVIGRLDTMMASLLCCHEACGTSVIVGVPP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFDEIN
...... :. :.:::::::. .::.:: : :::::...:.::...: ..:: : :..::
NP_000 DSQNLSMNPMLLLTGRTWKGAILGGFKSKECVPKLVADFMAKKFSLDALITHVLPFEKIN
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB5 KAFELMHSGKSIRTVVKI
..:.:.::::::::..
NP_000 EGFDLLHSGKSIRTILMF
360 370
>>NP_000660 (OMIM: 103730,103780,168600) alcohol dehydro (375 aa)
initn: 1634 init1: 1395 opt: 1628 Z-score: 1944.1 bits: 368.4 E(85289): 1.5e-101
Smith-Waterman score: 1628; 63.0% identity (86.9% similar) in 373 aa overlap (2-372:4-373)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSG--AD
:..:::::::: :: ::.::::.:::::::::::::..:...:..: ...:: .
NP_000 MSTAGKVIKCKAAVLWELKKPFSIEEVEVAPPKAHEVRIKMVAAGICRSDEHVVSGNLVT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGCFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRV
: .:::::::.:::::::::::: .: :: ::::. ::::.:..: ::..: : : .
NP_000 P---LPVILGHEAAGIVESVGEGVTTVKPGDKVIPLFTPQCGKCRICKNPESNYCLKNDL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TQGKGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGI
. .: . ::: ::::.:: : :..:.::::.:::: . .::::: .::.::::.:::.
NP_000 GNPRGTLQDGTRRFTCSGKPIHHFVGVSTFSQYTVVDENAVAKIDAASPLEKVCLIGCGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 STGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAKEFG
:::::.::..::. :::.:::::::::::.:.::::.:::.:::.:::::::::.:::.:
NP_000 STGYGSAVKVAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSVVMGCKAAGAARIIAVDINKDKFAKAKELG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVGVAA
:::::::::..::::::: ::::::::.::: :: . .: :.: ::.. :.::.:::
NP_000 ATECINPQDYKKPIQEVLKEMTDGGVDFSFEVIGRLDTMMASLLCCHEACGTSVIVGVPP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFDEIN
...... :. :.:::::::. :::.:: :::::::...:.::...: ..:. : :..::
NP_000 DSQNLSINPMLLLTGRTWKGAIFGGFKSKESVPKLVADFMAKKFSLDALITNILPFEKIN
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB5 KAFELMHSGKSIRTVVKI
..:.:..::::::::.
NP_000 EGFDLLRSGKSIRTVLTF
360 370
>>NP_001293100 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase 4 is (399 aa)
initn: 1629 init1: 1102 opt: 1624 Z-score: 1938.9 bits: 367.5 E(85289): 2.9e-101
Smith-Waterman score: 1624; 62.6% identity (85.6% similar) in 374 aa overlap (4-372:25-397)
10 20 30
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKI
.:::::::.:::::::: :::.::::::::::::.:
NP_001 MLVRGPHFELQRCKTHLFSSNYLTQVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IATAVCHTDAYTLSGADPEG-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCG
:::..::::: :. . :: ::::.:::.::::::.: :::..: :: ::::: : :
NP_001 IATSLCHTDA-TVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCR
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ECKFCLNPKTNLCQKIRVTQG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVAD
.:::::.: :::: :: .. . :: : ::::::::: . :..::::::.::::.:
NP_001 KCKFCLSPLTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSD
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVA
:..:::: : :..:::::::.:::::::.:.::. :::.:::::::::::...::::.:
NP_001 INLAKIDDDANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GASRIIGVDINKDKFARAKEFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKV
:::::::.:::..::..:: .:::.:.::.:. ::::::.::.: ::::....: :. ..
NP_001 GASRIIGIDINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSET
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSE
:.:::. ::: . .::::... .. : .:. ::: .:: :::::::.:.::::..
NP_001 MKAALDCTTAGWGSCTFIGVAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB5 YMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFELMHSGKSIRTVVKI
: .::...: .:::.: ::.:..::.::..:::.::..
NP_001 YKNKKFNLDALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSVRTILIF
360 370 380 390
>>NP_001293101 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase 4 is (399 aa)
initn: 1629 init1: 1102 opt: 1624 Z-score: 1938.9 bits: 367.5 E(85289): 2.9e-101
Smith-Waterman score: 1624; 62.6% identity (85.6% similar) in 374 aa overlap (4-372:25-397)
10 20 30
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKI
.:::::::.:::::::: :::.::::::::::::.:
NP_001 MLVRGPHFELQRCKTHLFSSNYLTQVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IATAVCHTDAYTLSGADPEG-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCG
:::..::::: :. . :: ::::.:::.::::::.: :::..: :: ::::: : :
NP_001 IATSLCHTDA-TVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCR
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ECKFCLNPKTNLCQKIRVTQG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVAD
.:::::.: :::: :: .. . :: : ::::::::: . :..::::::.::::.:
NP_001 KCKFCLSPLTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSD
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVA
:..:::: : :..:::::::.:::::::.:.::. :::.:::::::::::...::::.:
NP_001 INLAKIDDDANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GASRIIGVDINKDKFARAKEFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKV
:::::::.:::..::..:: .:::.:.::.:. ::::::.::.: ::::....: :. ..
NP_001 GASRIIGIDINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSET
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSE
:.:::. ::: . .::::... .. : .:. ::: .:: :::::::.:.::::..
NP_001 MKAALDCTTAGWGSCTFIGVAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB5 YMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFELMHSGKSIRTVVKI
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NP_001 YKNKKFNLDALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSVRTILIF
360 370 380 390
>>NP_000661 (OMIM: 103740) alcohol dehydrogenase 4 isofo (380 aa)
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Smith-Waterman score: 1623; 62.6% identity (85.6% similar) in 374 aa overlap (4-372:6-378)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSGADPE
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NP_000 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDA-TVIDSKFE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 G-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRVT
: ::::.:::.::::::.: :::..: :: ::::: : : .:::::.: :::: ::
NP_000 GLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 QG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLG
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NP_000 KSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 CGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAK
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NP_000 CGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVG
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NP_000 ALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIG
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300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFD
:::... .. : .:. ::: .:: :::::::.:.::::..: .::...: .:::.: ::
NP_000 VAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFD
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB5 EINKAFELMHSGKSIRTVVKI
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NP_000 KISEAFDLMNQGKSVRTILIF
360 370 380
>>XP_016863203 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol dehydro (406 aa)
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Smith-Waterman score: 1609; 62.8% identity (85.2% similar) in 371 aa overlap (4-369:25-394)
10 20 30
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKI
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XP_016 MLVRGPHFELQRCKTHLFSSNYLTQVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IATAVCHTDAYTLSGADPEG-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCG
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XP_016 IATSLCHTDA-TVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCR
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ECKFCLNPKTNLCQKIRVTQG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVAD
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XP_016 KCKFCLSPLTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSD
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160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVA
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XP_016 INLAKIDDDANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GASRIIGVDINKDKFARAKEFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKV
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XP_016 GASRIIGIDINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSET
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSE
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XP_016 MKAALDCTTAGWGSCTFIGVAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB5 YMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFELMHSGKSIRTVVKI
: .::...: .:::.: ::.:..::.::..::: :
XP_016 YKNKKFNLDALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSYRRSENSDYSKTKT
360 370 380 390 400
>>XP_016863202 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol dehydro (406 aa)
initn: 1614 init1: 1087 opt: 1609 Z-score: 1920.9 bits: 364.2 E(85289): 3e-100
Smith-Waterman score: 1609; 62.8% identity (85.2% similar) in 371 aa overlap (4-369:25-394)
10 20 30
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKI
.:::::::.:::::::: :::.::::::::::::.:
XP_016 MLVRGPHFELQRCKTHLFSSNYLTQVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 IATAVCHTDAYTLSGADPEG-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCG
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XP_016 IATSLCHTDA-TVIDSKFEGLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCR
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pF1KB5 ECKFCLNPKTNLCQKIRVTQG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVAD
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XP_016 KCKFCLSPLTNLCGKISNLKSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSD
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160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ISVAKIDPLAPLDKVCLLGCGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVA
:..:::: : :..:::::::.:::::::.:.::. :::.:::::::::::...::::.:
XP_016 INLAKIDDDANLERVCLLGCGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAA
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220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GASRIIGVDINKDKFARAKEFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKV
:::::::.:::..::..:: .:::.:.::.:. ::::::.::.: ::::....: :. ..
XP_016 GASRIIGIDINSEKFVKAKALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSET
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 MRAALEACHKGWGVSVVVGVAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSE
:.:::. ::: . .::::... .. : .:. ::: .:: :::::::.:.::::..
XP_016 MKAALDCTTAGWGSCTFIGVAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB5 YMSKKIKVDEFVTHNLSFDEINKAFELMHSGKSIRTVVKI
: .::...: .:::.: ::.:..::.::..::: :
XP_016 YKNKKFNLDALVTHTLPFDKISEAFDLMNQGKSYRRSENSDYSKTKT
360 370 380 390 400
>>XP_016863204 (OMIM: 103740) PREDICTED: alcohol dehydro (387 aa)
initn: 1613 init1: 1087 opt: 1608 Z-score: 1920.0 bits: 364.0 E(85289): 3.3e-100
Smith-Waterman score: 1608; 62.8% identity (85.2% similar) in 371 aa overlap (4-369:6-375)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MANEVIKCKAAVAWEAGKPLSIEEIEVAPPKAHEVRIKIIATAVCHTDAYTLSGADPE
.:::::::.:::::::: :::.::::::::::::.::::..::::: :. . :
XP_016 MGTKGKVIKCKAAIAWEAGKPLCIEEVEVAPPKAHEVRIQIIATSLCHTDA-TVIDSKFE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 G-CFPVILGHEGAGIVESVGEGVTKLKAGDTVIPLYIPQCGECKFCLNPKTNLCQKIRVT
: ::::.:::.::::::.: :::..: :: ::::: : : .:::::.: :::: ::
XP_016 GLAFPVIVGHEAAGIVESIGPGVTNVKPGDKVIPLYAPLCRKCKFCLSPLTNLCGKISNL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QG----KGLMPDGTSRFTCKGKTILHYMGTSTFSEYTVVADISVAKIDPLAPLDKVCLLG
.. . :: : ::::::::: . :..::::::.::::.::..:::: : :..:::::
XP_016 KSPASDQQLMEDKTSRFTCKGKPVYHFFGTSTFSQYTVVSDINLAKIDDDANLERVCLLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 CGISTGYGAAVNTAKLEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCKVAGASRIIGVDINKDKFARAK
::.:::::::.:.::. :::.:::::::::::...::::.::::::::.:::..::..::
XP_016 CGFSTGYGAAINNAKVTPGSTCAVFGLGGVGLSAVMGCKAAGASRIIGIDINSEKFVKAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EFGATECINPQDFSKPIQEVLIEMTDGGVDYSFECIGNVKVMRAALEACHKGWGVSVVVG
.:::.:.::.:. ::::::.::.: ::::....: :. ..:.:::. ::: . .:
XP_016 ALGATDCLNPRDLHKPIQEVIIELTKGGVDFALDCAGGSETMKAALDCTTAGWGSCTFIG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VAASGEEIATRPFQLVTGRTWKGTAFGGWKSVESVPKLVSEYMSKKIKVDEFVTHNLSFD
:::... .. : .:. ::: .:: :::::::.:.::::..: .::...: .:::.: ::
XP_016 VAAGSKGLTIFPEELIIGRTINGTFFGGWKSVDSIPKLVTDYKNKKFNLDALVTHTLPFD
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB5 EINKAFELMHSGKSIRTVVKI
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360 370 380
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]