Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5225
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5225, 701 aa
1>>>pF1KB5225 701 - 701 aa - 701 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.9801+/-0.000499; mu= -38.4884+/- 0.031
mean_var=851.9375+/-175.490, 0's: 0 Z-trim(125.1): 221 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.043941
statistics sampled from 47820 (48086) to 47820 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.564), width: 16
Scan time: 15.660
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 982 77.8 1.8e-13
NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating pro ( 803) 982 77.8 1.8e-13
XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 835) 982 77.8 1.8e-13
XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 836) 891 72.1 1e-11
XP_011544178 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 872) 891 72.1 1e-11
NP_001006635 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating ( 881) 891 72.1 1e-11
XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 885) 891 72.1 1.1e-11
XP_011544176 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 912) 891 72.1 1.1e-11
XP_011544175 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase- ( 913) 891 72.1 1.1e-11
NP_443180 (OMIM: 614902) rho GTPase-activating pro (1126) 427 42.7 0.0091
>>XP_016878879 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (794 aa)
initn: 1548 init1: 722 opt: 982 Z-score: 363.0 bits: 77.8 E(85289): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 1703; 42.0% identity (65.3% similar) in 772 aa overlap (2-697:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
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XP_016 MKKQFNRMKQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
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XP_016 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
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XP_016 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHR
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XP_016 ------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR
180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB5 RSLSSLDTALAELRENHGQ-------ADHS------P-----SMTATHFPR-----VYGV
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XP_016 KALAVLEKTLPEMRAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGT
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 SLATHLQELGREIALPIEACVMMLLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEE
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XP_016 PLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDE
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 FCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENL
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XP_016 FYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNF
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTPSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVG
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XP_016 VNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAAAT--SVHVVA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB5 VVEALIQSADTLFPGDINFNVSGLFSAVTL----------QDTVSDRLASEELPSTAVPT
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XP_016 VIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVME
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KB5 PATTPAPAPAPAPAPAPALASAATKERTESEVP-----PRPA--SPKVTRSPPETAA-PV
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XP_016 GDLVKKESP-PKPKD-PVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPS
530 540 550 560 570
560 570 580 590
pF1KB5 EDMARRT-KRPAPA--RPTMPPPQVSGSRSS------PPA----PPL----PPGS-----
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XP_016 PHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQP
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 -GSPGTPQAL--PRRLVGS--SLRAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPAS
:.:..:. : ::: .: ..::. ::: ::: : . .: : .: .: :
XP_016 PGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMH---TKPNSQGPPNPM-AL
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700
pF1KB5 PSPVSLSNPAQVDLGAATAEGGAPEAISGVPTPPAIPPQ-------PRPRSLASETN
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XP_016 PSEHGLEQPSHTP----------PQ----TPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETA
700 710 720 730 740
XP_016 QPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDV
750 760 770 780 790
>>NP_060524 (OMIM: 608293) rho GTPase-activating protein (803 aa)
initn: 1541 init1: 722 opt: 982 Z-score: 362.9 bits: 77.8 E(85289): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 1725; 42.7% identity (66.2% similar) in 749 aa overlap (2-697:1-702)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
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NP_060 MKKQFNRMKQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
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NP_060 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::.. ::: :
NP_060 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHR
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NP_060 ------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RSLSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMM
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NP_060 KALAVLEKTLPEMRAHQDKWAEKPA---------FGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVML
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 LLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
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NP_060 LLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMT
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NP_060 MTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMT
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420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVGVVEALIQSADTLFPGDINFNVSG
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NP_060 PSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAAAT--SVHVVAVIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSE
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480 490 500 510 520
pF1KB5 LFSAVTL----------QDTVSDRLASEELPSTAVPTPATTPAPAPAPAPAPAPALASAA
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NP_060 AFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVMEGDLVKKESP-PKPKD-PVSAAVP
460 470 480 490 500 510
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pF1KB5 TKERTESEVP-----PRPA--SPKVTRSPPETAA-PVEDMARRT-KRPAPA--RPTMPPP
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NP_060 APGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPSPHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPP
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610
pF1KB5 QVSGSRSS------PPA----PPL----PPGS------GSPGTPQAL--PRRLVGS--SL
:..:: ::. :: :: . :.:..:. : ::: .: .
NP_060 GHPGGQSSSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPI
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 RAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNPAQVDLGAATAEGGA
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NP_060 QAPNHPPPQPPTQATPLMH---TKPNSQGPPNPM-ALPSEHGLEQPSHTP----------
640 650 660 670
680 690 700
pF1KB5 PEAISGVPTPPAIPPQ-------PRPRSLASETN
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NP_060 PQ----TPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETAQPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVP
680 690 700 710 720 730
>>XP_011544180 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (835 aa)
initn: 1548 init1: 722 opt: 982 Z-score: 362.7 bits: 77.8 E(85289): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 1703; 42.0% identity (65.3% similar) in 772 aa overlap (2-697:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
::.:..::.:::. ..::. : .: :.:::::.:.::. .. :. :::: ::.:::
XP_011 MKKQFNRMKQLANQ-TVGRA-EKTEVLSEDLLQIERRLDTVRSICHHSHKRLVACFQGQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLARILAEFEMTLE
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XP_011 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::.. ::: :
XP_011 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
120 130 140 150 160 170
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pF1KB5 SHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIRLLEIQADYHR
.:..::::: .: :::::.:. ::.:.:..:: :...:. ::: ::::::
XP_011 ------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVTLLEAQADYHR
180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KB5 RSLSSLDTALAELRENHGQ-------ADHS------P-----SMTATHFPR-----VYGV
..:. :. .: :.: ..:. .:. : :.. :. . ..:.
XP_011 KALAVLEKTLPEMRAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLDKWAEKPAFGT
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 SLATHLQELGREIALPIEACVMMLLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQTMASDPHSLEE
: ::.. :::::::::::::.:: :::::::::..:::: ::.:: .. . :.:
XP_011 PLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDE
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 FCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQEVCSRLPPENL
: ::::::::::::::::::::::::.::..: ..::... .:: : ..:..:::.:.
XP_011 FYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWRTCQKLPPQNF
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pF1KB5 SNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTPSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDAASVSSIQVVG
:.:::.::::.::. ..::::::::::::::::::: ..:: :.. ::. :..::.
XP_011 VNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAAAT--SVHVVA
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB5 VVEALIQSADTLFPGDINFNVSGLFSAVTL----------QDTVSDRLASEELPSTAVPT
:.: .:: :: .:: ...:::: : .: .:. : : .. : ::
XP_011 VIEPIIQHADWFFPEEVEFNVSEAFVPLTTPSSNHSFHTGNDSDSGTLERKRPASMAVME
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KB5 PATTPAPAPAPAPAPAPALASAATKERTESEVP-----PRPA--SPKVTRSPPETAA-PV
. .: : : :. :.. . :..:.. :. : : ... . :..:: :
XP_011 GDLVKKESP-PKPKD-PVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAAAGSHQLSMGQPHNAAGPS
530 540 550 560 570
560 570 580 590
pF1KB5 EDMARRT-KRPAPA--RPTMPPPQVSGSRSS------PPA----PPL----PPGS-----
::. :.:::: .: ::: :..:: ::. :: :: .
XP_011 PHTLRRAVKKPAPAPPKPGNPPPGHPGGQSSSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQP
580 590 600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 -GSPGTPQAL--PRRLVGS--SLRAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPAS
:.:..:. : ::: .: ..::. ::: ::: : . .: : .: .: :
XP_011 PGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPPPQPPTQATPLMH---TKPNSQGPPNPM-AL
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700
pF1KB5 PSPVSLSNPAQVDLGAATAEGGAPEAISGVPTPPAIPPQ-------PRPRSLASETN
:: .: .:... :. .::::. :: : :..::
XP_011 PSEHGLEQPSHTP----------PQ----TPTPPSTPPLGKQNPSLPAPQTLAGGNPETA
700 710 720 730 740
XP_011 QPHAGTLPRPRPVPKPRNRPSVPPPPQPPGVHSAGDSSLTNTAPTASKIVTDSNSRVSEP
750 760 770 780 790 800
>>XP_011544179 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (836 aa)
initn: 1337 init1: 722 opt: 891 Z-score: 331.5 bits: 72.1 E(85289): 1e-11
Smith-Waterman score: 1329; 39.0% identity (62.5% similar) in 662 aa overlap (81-691:1-632)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KRLQACLQGQSGADMDKRVKKLPLMALSTTMAESFKELDPDSSMGKALEMSCAIQNQLAR
: :. .:. :: .:: :: .::::
XP_011 MQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLAL
10 20
120 130 140 150 160
pF1KB5 ILAEFEMTLERDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-
:.. :. .:.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::..
XP_011 ELSQHEVFVEKEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNF
30 40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QGLGGSPGSHSHTTMANKVETLKEEEEELKRKVEQCRDEYLADLYHFVTKEDSYANYFIR
::: : .:..::::: .: :::::.:. ::.:.:..:: :...:.
XP_011 QGL---P---------SKIDTLKEEMDEAGNKVEQCKDQLAADMYNFMAKEGEYGKFFVT
90 100 110 120 130
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pF1KB5 LLEIQADYHRRSLSSLDTALAELRENHGQ-------ADHS------P-----SMTATHFP
::: ::::::..:. :. .: :.: ..:. .:. : :.. :.
XP_011 LLEAQADYHRKALAVLEKTLPEMRAHQGSPLNPLACVDEVWCRCSVPLQLLGSLSWCHLD
140 150 160 170 180 190
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pF1KB5 R-----VYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMMLLSEGMKEEGLFRLAAGASVLKRLKQT
. ..:. : ::.. :::::::::::::.:: :::::::::..:::: ::.:: .
XP_011 KWAEKPAFGTPLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAA
200 210 220 230 240 250
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pF1KB5 MASDPHSLEEFCSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFDLYDDWMRAASLKEPGARLQALQE
. . :.:: ::::::::::::::::::::::::.::..: ..::... .:: : .
XP_011 LDCSTSHLDEFYSDPHAVAGALKSYLRELPEPLMTFNLYEEWTQVASVQDQDKKLQDLWR
260 270 280 290 300 310
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pF1KB5 VCSRLPPENLSNLRYLMKFLARLAEEQEVNKMTPSNIAIVLGPNLLWPPEKEGDQAQLDA
.:..:::.:. :.:::.::::.::. ..::::::::::::::::::: ..:: :.. :
XP_011 TCQKLPPQNFVNFRYLIKFLAKLAQTSDVNKMTPSNIAIVLGPNLLWA-RNEGTLAEMAA
320 330 340 350 360 370
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.. : :: . . . : ..: .: . .:: .: : .
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. .::: : :. . .:: . : :. .:: . .. : . :.:
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>>XP_011544177 (OMIM: 608293) PREDICTED: rho GTPase-acti (885 aa)
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pF1KB5 MMKRQLHRMRQLAQTGSLGRTPETAEFLGEDLLQVEQRLEPAKRAAHNIHKRLQACLQGQ
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pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
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XP_011 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
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pF1KB5 RDVLQPLSRLSEEELPAILKHKKSLQKLVSDWNTLKSRLSQATKNSGSS-QGLGGSPGSH
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XP_011 KEIVDPLYGIAEVEIPNIQKQRKQLARLVLDWDSVRARWNQAHKSSGTNFQGL---P---
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XP_011 PLEEHLKRSGREIALPIEACVMLLLETGMKEEGLFRIGAGASKLKKLKAALDCSTSHLDE
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:. . :. : : : . .::: : :. . .:: . : :.
XP_011 ESSSGGGTVPSSAGILEQGP--SPGDGSPPKPKDPVSAAVPAPGRNNSQIASGQNQPQAA
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pF1KB5 VGSSLRAPTVPPPLPPTPPQPARRQSRRSPASPSPASPGPASPSPVSLSNPAQVDLGAAT
.:: . .. : . :.: . ::. .:.:: : :..: : ..: :. .
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. : . . : : ::. :.:
XP_011 SSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPP
690 700 710 720 730 740
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::.:..::.:::. ..::. : .: :.:::::.:.::. .. :. :::: ::.:::
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:.: ..: ::::: ::. .: :. .:. :: .:: :: .:::: :.. :. .:
XP_011 HGTDAERRHKKLPLTALAQNMQEASTQLE-DSLLGKMLETCGDAENQLALELSQHEVFVE
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.....:: ..: :.: : :..:.: .:: ::.....: .:: :.::.. ::: :
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.:..::::: .: :::::.:. ::.:.:..:: :...:. ::: ::::::
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..:. :. .: :.: ..:. .:. : :.. :. . ..:.
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: ::::::::::::::::::::::::.::..: ..::... .:: : ..:..:::.:.
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:.:::.::::.::. ..::::::::::::::::::: ..:: :.. ::. :..::.
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:.: .:: :: .:: ...:::: : .: .:. : : .. : ::
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. . . : ..: .: . .:: .: : .: : .. .
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. : . . : : ::. :.:
XP_011 SSGTSQHPPSLSPKPPTRSPSPPTQHTGQPPGQPSAPSQLSAPRRYSSSLSPIQAPNHPP
690 700 710 720 730 740
>>NP_443180 (OMIM: 614902) rho GTPase-activating protein (1126 aa)
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pF1KB5 LSSLDTALAELRENHGQADHSPSMTATHFPRVYGVSLATHLQELGREIALPIEACVMMLL
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NP_443 PRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLSNSGQDVPQVLRCCSEFIE
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..:. . :..::.. .: ..::.. . :. :. : : .: :.:.. : :.::::.:
NP_443 AHGVVD-GIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDIHSVSSLCKLYFRELPNP
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NP_443 LLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEYLLRHLARMARHSANTSM
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NP_443 HARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSV----VVEFLLTHVDVLF-SD-T
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NP_443 FTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGS-CPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPTEPTTPKAPASPA
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]