Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4535
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4535, 446 aa
1>>>pF1KB4535 446 - 446 aa - 446 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2728+/-0.000312; mu= 17.8107+/- 0.020
mean_var=67.0880+/-13.183, 0's: 0 Z-trim(116.7): 178 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.156586
statistics sampled from 27961 (28143) to 27961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 9.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 2999 686.2 4.5e-197
XP_011528272 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 451) 2908 665.7 7e-191
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 2201 506.0 9.1e-143
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 2110 485.4 1.4e-136
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 2110 485.4 1.4e-136
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 954 224.3 5.8e-58
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 906 213.5 1.1e-54
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 906 213.5 1.2e-54
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 889 209.6 1.4e-53
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 876 206.6 9.4e-53
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 876 206.6 1.1e-52
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 876 206.6 1.1e-52
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 876 206.6 1.1e-52
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 875 206.4 1.1e-52
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 876 206.7 1.2e-52
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 875 206.4 1.2e-52
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 875 206.4 1.2e-52
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 875 206.4 1.3e-52
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 875 206.4 1.3e-52
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 875 206.5 1.5e-52
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 873 206.0 1.8e-52
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 868 204.9 4e-52
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 857 202.4 2.3e-51
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 840 198.5 3.2e-50
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 840 198.5 3.2e-50
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 832 196.7 1.1e-49
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 832 196.7 1.1e-49
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 823 194.7 4.6e-49
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 821 194.2 6.3e-49
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 819 193.8 8.7e-49
XP_011528274 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 290) 806 190.7 4.3e-48
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 801 189.8 1.6e-47
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 800 189.5 1.6e-47
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 759 180.2 1.1e-44
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 729 173.3 7.5e-43
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 708 168.7 2.8e-41
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 708 168.7 3.1e-41
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 708 168.7 3.1e-41
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 708 168.7 3.5e-41
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 680 162.4 2.3e-39
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 671 160.3 9e-39
NP_001306146 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 is ( 512) 648 155.2 3.8e-37
NP_000490 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofo ( 512) 648 155.2 3.8e-37
NP_000095 (OMIM: 231300,600975,601771,604229) cyto ( 543) 627 150.4 1.1e-35
>>NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D6 (446 aa)
initn: 2999 init1: 2999 opt: 2999 Z-score: 3659.1 bits: 686.2 E(85289): 4.5e-197
Smith-Waterman score: 2999; 99.3% identity (99.8% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQA
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTG
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB4 QPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
::::::::::::::.:::::::::::
NP_001 QPRPSHHGVFAFLVSPSPYELCAVPR
430 440
>>XP_011528272 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cytochro (451 aa)
initn: 2908 init1: 2908 opt: 2908 Z-score: 3547.9 bits: 665.7 E(85289): 7e-191
Smith-Waterman score: 2908; 99.5% identity (99.8% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQA
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTG
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB4 QPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
:::::::::::::
XP_011 QPRPSHHGVFAFLDWLPLWALRDAAVQTPDQ
430 440 450
>>NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D6 is (497 aa)
initn: 2201 init1: 2201 opt: 2201 Z-score: 2684.1 bits: 506.0 E(85289): 9.1e-143
Smith-Waterman score: 2782; 88.9% identity (89.1% similar) in 478 aa overlap (20-446:20-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB4 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQG--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGVF
70 80 90 100 110 120
120
pF1KB4 -------------------------------------------------RPFRPNGLLDK
:::::::::::
NP_000 LARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKSLEQWVTEEAACLCAAFANHSGRPFRPNGLLDK
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130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLCIVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_000 LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLRIVVA
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
430 440 450 460 470 480
430 440
pF1KB4 FAFLVTPSPYELCAVPR
:::::.:::::::::::
NP_000 FAFLVSPSPYELCAVPR
490
>>XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cytochro (491 aa)
initn: 2110 init1: 2110 opt: 2110 Z-score: 2573.1 bits: 485.4 E(85289): 1.4e-136
Smith-Waterman score: 2691; 88.8% identity (88.8% similar) in 465 aa overlap (20-433:20-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB4 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQG--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGVF
70 80 90 100 110 120
120
pF1KB4 -------------------------------------------------RPFRPNGLLDK
:::::::::::
XP_011 LARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKSLEQWVTEEAACLCAAFANHSGRPFRPNGLLDK
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLCIVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_011 LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLRIVVA
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
430 440 450 460 470 480
430 440
pF1KB4 FAFLVTPSPYELCAVPR
::::
XP_011 FAFLGCCCTDP
490
>>XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cytochro (502 aa)
initn: 2110 init1: 2110 opt: 2110 Z-score: 2573.0 bits: 485.4 E(85289): 1.4e-136
Smith-Waterman score: 2691; 88.8% identity (88.8% similar) in 465 aa overlap (20-433:20-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB4 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQG--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGVF
70 80 90 100 110 120
120
pF1KB4 -------------------------------------------------RPFRPNGLLDK
:::::::::::
XP_011 LARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKSLEQWVTEEAACLCAAFANHSGRPFRPNGLLDK
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKV
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_011 LRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLRIVVA
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVI
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHF
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGV
430 440 450 460 470 480
430 440
pF1KB4 FAFLVTPSPYELCAVPR
::::
XP_011 FAFLDWLPLWALRDAAVQTPDQ
490 500
>>NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo sap (502 aa)
initn: 1023 init1: 628 opt: 954 Z-score: 1161.6 bits: 224.3 E(85289): 5.8e-58
Smith-Waterman score: 1075; 38.4% identity (64.9% similar) in 479 aa overlap (16-446:28-501)
10 20 30 40
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLH
::: .:...::. ::::: :: :::..
NP_000 MLAAMGSLAAALWAVVHPRTLLLGTVAFLLAADFLKRRR--PKNYPPGPWRLPFLGNFFL
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50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VDFQNTPYCFDQLRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQ
:::... . . ...:..:::.:. .:...:: ..:::. .. ..:: .:. .
NP_000 VDFEQSHLEVQLFVKKYGNLFSLELGDISAVLITGLPLIKEALIHMDQNFGNRPVTPMRE
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110 120
pF1KB4 IL----------------------------GFGPRS-------------------QGRPF
. :.: .: .:.::
NP_000 HIFKKNGLIMSSGQAWKEQRRFTLTALRNFGLGKKSLEERIQEEAQHLTEAIKEENGQPF
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130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVP-VLL
:. ...::::.: :.: :.::::.: : .:: : .: :.. .. :. : ..
NP_000 DPHFKINNAVSNIICSITFGERFEYQDSWFQQLLKLLDEVTYLEASKTCQLYNVFPWIMK
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFN
.:. .. : . ..... .:: :.::. ::. .:.: :: : ::: :::.
NP_000 FLPGPHQTLFSNWKKLKLFVSHMIDKHRKDWNPAET-RDFIDAYLKEMSKHTGNPTSSFH
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQA
.::: . ::: :: :::::: :.:: : :.:..:..:: ::: :::: ..: . .
NP_000 EENLICSTLDLFFAGTETTSTTLRWALLYMALYPEIQEKVQAEIDRVIGQGQQPSTAARE
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEK
::::.::::::::.:.:.::.: . .. : . :...:::: ..:::... .: . :
NP_000 SMPYTNAVIHEVQRMGNIIPLNVPREVTVDTTLAGYHLPKGTMILTNLTALHRDPTEWAT
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTG
: :.:.:::. .:.: : :::.::: :.:::::: ::: :::.:::::.:.:.: :..
NP_000 PDTFNPDHFLE-NGQFKKREAFMPFSIGKRACLGEQLARTELFIFFTSLMQKFTFRPPNN
420 430 440 450 460 470
430 440
pF1KB4 QPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
. . : . ... ..: ..:::::.
NP_000 E-KLSLKFRMGITISPVSHRLCAVPQV
480 490 500
>>NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U1 [H (544 aa)
initn: 1030 init1: 693 opt: 906 Z-score: 1102.5 bits: 213.5 E(85289): 1.1e-54
Smith-Waterman score: 940; 38.2% identity (65.3% similar) in 432 aa overlap (60-441:109-539)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 AARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCFDQLRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVRE
.: : .:..::. .. ::::. . .:::
NP_898 PFLRRRSWLSSRTRAAGIDPSVIGPQVLLAHLARVYGSIFSFFIGHYLVVVLSDFHSVRE
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90 100 110
pF1KB4 ALVTHGEDTADRPPVPITQILG---------FGP--RSQ-------------GR------
::: ..: .::: ::. .:. .:: :.: :.
NP_898 ALVQQAEVFSDRPRVPLISIVTKEKGVVFAHYGPVWRQQRKFSHSTLRHFGLGKLSLEPK
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120 130 140 150 160
pF1KB4 ------------------PFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEG
:: : .....::::.: :: :.::.: . .: ..: . ..:
NP_898 IIEEFKYVKAEMQKHGEDPFCPFSIISNAVSNIICSLCFGQRFDYTNSEFKKMLGFMSRG
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170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKVLR-FQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDL
:. . ..: : : ..: : :: ..: . . : ... .:. . : . :.:.
NP_898 LEICLNSQVLLVNICPWLYYLPFGPFKELRQIEKDITSFLKKIIKDHQESLD-RENPQDF
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230 240 250 260 270
pF1KB4 TEAFLAEMEKA-KGNPESSFNDENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRR
. .: .::. :.: .:::..: : ...::: :: ::...: : :: : :.::::..
NP_898 IDMYLLHMEEERKNNSNSSFDEEYLFYIIGDLFIAGTDTTTNSLLWCLLYMSLNPDVQEK
320 330 340 350 360 370
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pF1KB4 VQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIP
:..::. ::: : : . :.:.:::: :.: ::::. .:::.. ::::.. .::. ::
NP_898 VHEEIERVIGANRAPSLTDKAQMPYTEATIMEVQRLTVVVPLAIPHMTSENTVLQGYTIP
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 KGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLAR
::: .. :: :: .: :.:::: :.:..::: ::...: :.:.::. :.:.:.:: ::.
NP_898 KGTLILPNLWSVHRDPAIWEKPEDFYPNRFLDDQGQLIKKETFIPFGIGKRVCMGEQLAK
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pF1KB4 MELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
:::::.:.::.: :.:..: . .: : :.. ..: :...
NP_898 MELFLMFVSLMQSFAFALPEDSKKPLLTGRFGLTLAPHPFNITISRR
500 510 520 530 540
>>XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cytochro (562 aa)
initn: 1006 init1: 693 opt: 906 Z-score: 1102.3 bits: 213.5 E(85289): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 906; 42.6% identity (72.8% similar) in 324 aa overlap (120-441:235-557)
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 ALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRPFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDP
:: : .....::::.: :: :.::.: .
XP_005 HFGLGKLSLEPKIIEEFKYVKAEMQKHGEDPFCPFSIISNAVSNIICSLCFGQRFDYTNS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 RFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKVLR-FQKAFLTQLDELLTEHR
.: ..: . ..::. . ..: : : ..: : :: ..: . . : ... .:.
XP_005 EFKKMLGFMSRGLEICLNSQVLLVNICPWLYYLPFGPFKELRQIEKDITSFLKKIIKDHQ
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 MTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKA-KGNPESSFNDENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGL
. : . :.:. . .: .::. :.: .:::..: : ...::: :: ::...: : :
XP_005 ESLD-RENPQDFIDMYLLHMEEERKNNSNSSFDEEYLFYIIGDLFIAGTDTTTNSLLWCL
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMT
: : :.::::..:..::. ::: : : . :.:.:::: :.: ::::. .:::.. :::
XP_005 LYMSLNPDVQEKVHEEIERVIGANRAPSLTDKAQMPYTEATIMEVQRLTVVVPLAIPHMT
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 SRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSA
:.. .::. ::::: .. :: :: .: :.:::: :.:..::: ::...: :.:.::.
XP_005 SENTVLQGYTIPKGTLILPNLWSVHRDPAIWEKPEDFYPNRFLDDQGQLIKKETFIPFGI
450 460 470 480 490 500
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pF1KB4 GRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
:.:.:.:: ::.:::::.:.::.: :.:..: . .: : :.. ..: :...
XP_005 GKRVCMGEQLAKMELFLMFVSLMQSFAFALPEDSKKPLLTGRFGLTLAPHPFNITISRR
510 520 530 540 550 560
>>NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isoform 2 (443 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB4 MGLEALVPLAMIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDFQNTPYCF
:: : .....:. ..:..: .. :::: ::: .:: :... .. :
NP_085 MLASGLLLVALLACLTVMVLMSVWQQRKSR--GKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEHI--CD
10 20 30 40 50
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pF1KB4 DQLRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRS-Q
. .. : .:: .. . ..:..:. : :. .. . .: . :: .
NP_085 SIMKVSQGVAFSNGERAKQLLRF-AIATLRDFGV--GKRGIEERIQEESGFLIEAIRSTH
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 GRPFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEES---GFLREVLN
: . :. .:...:::::.:.. : ::.:.: .:: ::.. .. : : : :...
NP_085 GANIDPTFFLSRTVSNVISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLSMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 AVPVLLHIPALAGKVLRFQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGN
.: . :.:. ..... ... . . . ... : :: . :.:. ..:: .:.. . :
NP_085 SV--MKHLPGPQQQAFKLLQGLEDFIAKKVEHNQRTLDP-NSPQDFIDSFLIHMQEEEKN
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 PESSFNDENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRP
:.. : .:: . . .:: :: :.:::: .:.::.. ::.:. .:..::: :::. :.:
NP_085 PNTEFYLKNLMMSTLNLFIAGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 EMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKD
.. :...::: :::::.:::::..:..... ...: . . : .:::: .. :.:::.:
NP_085 KFEDRTKMPYMEAVIHEIQRFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRD
300 310 320 330 340 350
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pF1KB4 EAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHF-
. . .: :.:.:::: .:.: : .::.::: :.: :.:: :::::::::::...:.:
NP_085 PSFFSNPQDFNPQHFLDDKGQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFR
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KB4 --SFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAVPR
: . : .: ::: . : : . .::
NP_085 LKSSQSPKDIDVSPKHVVFATI--PRNYTMSFLPR
420 430 440
>>XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vitamin (386 aa)
initn: 904 init1: 843 opt: 876 Z-score: 1068.1 bits: 206.6 E(85289): 9.4e-53
Smith-Waterman score: 876; 43.1% identity (70.8% similar) in 332 aa overlap (117-446:58-386)
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 VREALVTHGEDTADRPPVPITQILGFGPRSQGRPFRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEY
.:::: . :. .::::. . :.:: :
XP_016 SFRYFGYGQKSFESKILEETKFFNDAIETYKGRPFDFKQLITNAVSNITNLIIFGERFTY
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 DDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLREVLNAVPVLLHIPALAGKVLRFQKAFLTQ--LDELL
.: : ....: .:... .. . :: : . .: . : :..: .. :..:.
XP_016 EDTDFQHMIELFSENVELAASASVFLYNAFPWIGILPFGKHQQL-FRNAAVVYDFLSRLI
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 TEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEKAKGNPESSFNDENLCIVVADLFSAGMVTTSTTLA
. .. : : :. ...:.: ::...:..: :.:. ::: . :..:. :: ::...:
XP_016 EKASVNRKP-QLPQHFVDAYLDEMDQGKNDPSSTFSKENLIFSVGELIIAGTETTTNVLR
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 WGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDVIGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVT
:..:.: :.:..: .::.::: ..: .: :. .:::: ::.::: :: .:::::.
XP_016 WAILFMALYPNIQGQVQKEIDLIMGPNGKPSWDDKCKMPYTEAVLHEVLRFCNIVPLGIF
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 HMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITNLSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFVKPEAFLP
: ::.: :.:. ::::::.:::: :: :: :. : ::::.:::..:.:.: ::..:
XP_016 HATSEDAVVRGYSIPKGTTVITNLYSVHFDEKYWRDPEVFHPERFLDSSGYFAKKEALVP
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 FSAGRRACLGEPLARMELFLFFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVTPSPYELCAV
:: ::: :::: :::::.:::::.:::.: . : . :. . ... . :.:: .::
XP_016 FSLGRRHCLGEHLARMEMFLFFTALLQRFHLHFPH-ELVPDLKPRLGMTLQPQPYLICAE
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 PR
:
XP_016 RR
446 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:02:44 2016 done: Fri Nov 4 03:02:46 2016
Total Scan time: 9.730 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]