Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4163
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4163, 939 aa
1>>>pF1KB4163 939 - 939 aa - 939 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1527+/-0.000475; mu= 7.8979+/- 0.030
mean_var=148.8058+/-31.283, 0's: 0 Z-trim(114.0): 64 B-trim: 492 in 1/49
Lambda= 0.105139
statistics sampled from 23621 (23685) to 23621 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 14.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_663782 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 939) 6060 932.0 0
NP_001118 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 949) 5880 904.7 0
NP_001273 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit beta ( 937) 5195 800.8 0
XP_016879773 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 937) 5195 800.8 0
XP_011522757 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 4868 751.2 5.4e-216
XP_016879775 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 4868 751.2 5.4e-216
NP_001159491 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit b ( 919) 4613 712.5 2.4e-204
XP_011522753 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 969) 4464 689.9 1.6e-197
XP_005257994 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 3880 601.3 7.4e-171
XP_005257995 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 3880 601.3 7.4e-171
NP_001025177 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit b ( 951) 3880 601.3 7.4e-171
XP_011522752 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 3880 601.3 7.6e-171
XP_011522750 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 3880 601.3 7.6e-171
XP_011522751 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 3880 601.3 7.6e-171
XP_016879776 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 3865 599.0 2.9e-170
XP_005257998 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 3865 599.0 2.9e-170
XP_016879774 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 894) 3553 551.7 6e-156
XP_011522754 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 3553 551.7 6.2e-156
XP_011522755 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 3553 551.7 6.2e-156
XP_011522756 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 3553 551.7 6.2e-156
NP_006585 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex subun ( 739) 1001 164.6 1.7e-39
NP_001240781 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 739) 1001 164.6 1.7e-39
XP_016855577 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 700) 982 161.7 1.2e-38
NP_001240782 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 640) 778 130.7 2.3e-29
XP_011538825 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 664) 748 126.2 5.6e-28
XP_011538826 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 664) 748 126.2 5.6e-28
XP_016855578 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 635) 744 125.5 8.2e-28
XP_016855582 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 405) 735 124.1 1.4e-27
XP_016878129 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple (1058) 722 122.3 1.3e-26
NP_001265440 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1050) 634 109.0 1.3e-22
XP_016855579 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 571) 593 102.6 5.9e-21
NP_001295241 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 571) 593 102.6 5.9e-21
NP_004635 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta (1082) 548 95.9 1.2e-18
NP_001265441 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1101) 548 95.9 1.2e-18
XP_016878130 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple ( 629) 540 94.6 1.7e-18
XP_005248676 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 ( 871) 533 93.6 4.6e-18
XP_016865490 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1004) 533 93.6 5.2e-18
NP_001258698 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex su (1045) 533 93.6 5.4e-18
XP_005248675 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1053) 533 93.6 5.5e-18
NP_003655 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subun (1094) 533 93.6 5.6e-18
XP_016855581 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 414) 312 59.9 3e-08
XP_011538830 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 414) 312 59.9 3e-08
XP_016855580 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 542) 283 55.6 8e-07
XP_011538827 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 646) 283 55.6 9.4e-07
NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 977) 263 52.7 1.1e-05
XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 994) 263 52.7 1.1e-05
NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 955) 261 52.4 1.3e-05
XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 972) 261 52.4 1.3e-05
NP_001137533 (OMIM: 600959) coatomer subunit beta ( 953) 257 51.8 2e-05
NP_057535 (OMIM: 600959) coatomer subunit beta [Ho ( 953) 257 51.8 2e-05
>>NP_663782 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta-1 i (939 aa)
initn: 6060 init1: 6060 opt: 6060 Z-score: 4975.6 bits: 932.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6060; 100.0% identity (100.0% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAM
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pF1KB4 KAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 KAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
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pF1KB4 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
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850 860 870 880 890 900
pF1KB4 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
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910 920 930
pF1KB4 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
910 920 930
>>NP_001118 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta-1 i (949 aa)
initn: 4431 init1: 4289 opt: 5880 Z-score: 4827.9 bits: 904.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6020; 98.9% identity (98.9% similar) in 949 aa overlap (1-939:1-949)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
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pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
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pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
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pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
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pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
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pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
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pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 GGLDSL-------IGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGLDSLMGDEPEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK
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pF1KB4 AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQ
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pF1KB4 VHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGK
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pF1KB4 MDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930
pF1KB4 KLTNGIWVLAELRIQPGNPSCT---LSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
910 920 930 940
>>NP_001273 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit beta iso (937 aa)
initn: 5198 init1: 3615 opt: 5195 Z-score: 4266.5 bits: 800.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5195; 84.1% identity (95.1% similar) in 941 aa overlap (1-939:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
NP_001 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
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::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
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::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
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....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
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::::::.: . :. :.. .:. : ..:::.:::.:..:.: :.::::::::::
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:::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::..::::::::.::.
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::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.::::::::::::::::::::
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....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
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:::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::..::::::::.::.
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::.:
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:.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.....:: .. : : :::.:::.:::
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::::::::::::::. : . ::.:::::::::::::::.: .:. :.. .:.
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pF1KB4 APIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLT
: ..:::.:::.:..:.: :.:::::::::::.::::::::::::.. : : :....:
XP_011 AVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFT
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pF1KB4 NKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNL
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:::::::::::::: : ::..::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::..
XP_011 QVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADT
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pF1KB4 ASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEV
.:::::..:..:.::::::::::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::
XP_011 VSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEV
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930
pF1KB4 SQHVYQAYETILKN
::..::.:..::::
XP_011 SQYIYQVYDSILKN
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pF1KB4 EKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMA
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pF1KB4 VNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAK
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XP_016 VNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAK
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pF1KB4 LHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKL
:::::::.::::::::.:.:::.:::::::::::::::::.::::.:::::::::.::::
XP_016 LHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKL
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pF1KB4 LTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFM
:::::::::::::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 LTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFL
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pF1KB4 EMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVK
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XP_016 ELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVK
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pF1KB4 YNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQS
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:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::.::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::::::::::
XP_016 MIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVL
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:.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.....:: .. : : :::.:::.:::
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::::::::::::::. : . ::.:::::::::::::::.: .:. :.. .:.
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570 580 590 600 610 620
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pF1KB4 APIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLT
: ..:::.:::.:..:.: :.:::::::::::.::::::::::::.. : : :....:
XP_016 AVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFT
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::::: :::::::::.::::. :..:: .:.:: :::....::::.:.: ::::::::::
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:::::::::::::: : ::..::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::..
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.:::::..:..:.::::::::::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::
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930
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::..::.:..::::
XP_016 SQYIYQVYDSILKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
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:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
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::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
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:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
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::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
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pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
XP_011 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
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::::::.: . :. :.. .:. : ..:::.:::.:..:.: :.::::::::::
XP_011 GGLDSLVGQS-FIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLP
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pF1KB4 AMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPL
:.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::. :..:: .:.::
XP_011 AVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPL
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pF1KB4 SPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQV-------------------------------
:::....::::.:.: ::::::::::::
XP_011 MPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVKSKENNWMDTSGRENANIMEKGIQAPFKVRK
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pF1KB4 -AVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAA
:::::::::::: : ::..::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...
XP_011 VAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTV
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pF1KB4 SSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVS
:::::..:..:.::::::::::::::::::::::.:::::::::::. ::::::::::::
XP_011 SSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVS
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930
pF1KB4 QHVYQAYETILKN
:..::.:..::::
XP_011 QYIYQVYDSILKN
960
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pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
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pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
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pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
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XP_005 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
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pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
XP_005 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
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pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
XP_005 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
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pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
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XP_005 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
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pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_005 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
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::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
XP_005 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
XP_005 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
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pF1KB4 GGLDSLIG-------------GTNFVAP--PTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTL
::::::.: : .:. :.. .:. : ..:::.:::.:..:.:
XP_005 GGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMA
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pF1KB4 SGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFG
:.:::::::::::.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::
XP_005 PGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFG
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pF1KB4 LAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLH
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XP_005 VIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLN
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pF1KB4 ILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEG
.::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::
XP_005 VLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEG
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pF1KB4 QDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
XP_005 QDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
900 910 920 930 940 950
>>XP_005257995 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 complex su (951 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]