Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0676
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0676, 1250 aa
1>>>pF1KA0676 1250 - 1250 aa - 1250 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0158+/-0.00099; mu= 15.2815+/- 0.060
mean_var=117.5199+/-23.810, 0's: 0 Z-trim(108.6): 84 B-trim: 317 in 1/52
Lambda= 0.118309
statistics sampled from 10219 (10304) to 10219 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16
Scan time: 5.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 8297 1428.1 0
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 6335 1093.2 0
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 5134 888.2 0
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 3434 598.0 4.4e-170
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 3137 547.3 8.1e-155
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 1926 340.6 1.3e-92
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX ( 632) 876 161.3 7.3e-39
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 561 107.5 1.3e-22
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 521 100.5 7.5e-21
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 521 100.5 7.6e-21
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 473 92.4 2.8e-18
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 476 93.1 3.5e-18
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 473 92.6 5.3e-18
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 471 92.2 5.8e-18
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 463 90.7 1e-17
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 457 89.7 1.9e-17
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 457 89.7 2.1e-17
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 457 89.8 3.4e-17
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 434 85.9 4.6e-16
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 415 82.6 4.3e-15
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 409 81.7 9.8e-15
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 384 77.4 1.7e-13
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 382 77.0 2.2e-13
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 379 76.5 3.1e-13
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 369 74.9 1.3e-12
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 356 72.6 4.8e-12
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 356 72.6 4.8e-12
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 339 69.8 4.7e-11
>>CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250 aa)
initn: 8297 init1: 8297 opt: 8297 Z-score: 7652.3 bits: 1428.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8297; 99.9% identity (99.9% similar) in 1250 aa overlap (1-1250:1-1250)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARVAPYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARVAPYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 HLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 MEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGCS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDENKDSLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDENKDSLIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 FKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSEASPLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSEASPLAS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIKDLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIKDLP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 KMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 TEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVVEGGSGEGQGSPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS43 TEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGKAPQESQVVVEGGSGEGQGSPS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTVDTDWCISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTVDTDWCISF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233 aa)
initn: 6335 init1: 6335 opt: 6335 Z-score: 5842.6 bits: 1093.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8136; 98.6% identity (98.6% similar) in 1250 aa overlap (1-1250:1-1233)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARVAPYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGHGRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARVAPYR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 ILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHGIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYLTVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 HLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGETFKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 MEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLPRDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADSSSV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 PAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 SWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 SVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 GVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 GEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSSLRAE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 DIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQYWGCS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDENKDSLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDENKDSLIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 FKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSEASPLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSE------
910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 DLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIKDLP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----------EALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIKDLP
960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 KMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 TEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVVEGGSGEGQGSPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS44 TEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGKAPQESQVVVEGGSGEGQGSPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTVDTDWCISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTVDTDWCISF
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG
1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266 aa)
initn: 4910 init1: 2367 opt: 5134 Z-score: 4734.5 bits: 888.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5166; 63.1% identity (83.7% similar) in 1286 aa overlap (1-1250:1-1266)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWLSPEEVLVANALWVTERANPFFVLQRRRGH----GRGGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
::..:::::.:::::.::::::.:.::::.:: : ::::.:::::::::::::::::
CCDS47 MWVNPEEVLLANALWITERANPYFILQRRKGHAGDGGGGGGLAGLLVGTLDVVLDSSARV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
::::::.:: :: ::::.:::.::::::.::::::.:::::::::..:.::::::.:::.
CCDS47 APYRILYQTPDSLVYWTIACGGSRKEITEHWEWLEQNLLQTLSIFENENDITTFVRGKIQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
::::: :: . . :.: ::::: .:... ::::: ::::::::::::::.::::::.:
CCDS47 GIIAEYNKINDVKEDDDTEKFKEAIVKFHRLFGMPEEEKLVNYYSCSYWKGKVPRQGWMY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
:..:::::::::.:.:..::..:::::.::::::::.:. :.:.::..: :::.::::.:
CCDS47 LSINHLCFYSFLMGREAKLVIRWVDITQLEKNATLLLPDVIKVSTRSSEHFFSVFLNINE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPH-RNISALKRDLDARAKNECYRATFR
::::::::::.:::::::.::: .:..::. : ...::::::::::::.: ::: ::
CCDS47 TFKLMEQLANIAMRQLLDNEGFEQDRSLPKLKRKSPKKVSALKRDLDARAKSERYRALFR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 LPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKA
::.::.:::::.:::::::::.:: ::::.:.:::::.::::. : ::::::::::::::
CCDS47 LPKDEKLDGHTDCTLWTPFNKMHILGQMFVSTNYICFTSKEENLCSLIIPLREVTIVEKA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA0 DSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQ------PGSIGSRK
::::::::::::::...:::::::::::::::::::::::.: :: :: .:
CCDS47 DSSSVLPSPLSISTRNRMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQQTTSKIYSDKEFAGSYNSSD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 ASVVD-PSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQ-SFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMED
: . ::. : .::... . :. . :: .. .. .:::.: :. .... :: :.
CCDS47 DEVYSRPSSLVSSSPQRSTSSDAD-----GERQFNLNGNSVPTATQTLMTMYRRRSP-EE
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 LGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNE
.. : ::: .::..:.::: :::.:.::::: ::: :::::::::.:::::::.::: ::
CCDS47 FNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 MVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRN
.:::::: .::::: :::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::
CCDS47 KATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAFQNEMGIAALRRVLTAYAFRN
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 PTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTR
:.:::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS47 PNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGVFEELAR
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 DFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVL
:..::: . ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::.:.:::::
CCDS47 DYVPQLYDCMQDLGVISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVL
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 DANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELL
:::...::.:.:.:::::.::::::.:.::.:. ::::::..:::.. .: :::::.:.
CCDS47 DANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPYPEVDIFRLI
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 KVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVF
..:::::...::. ::::::::::::::.::::.::.:::.: .. .:.:.:::.:: .:
CCDS47 RTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALF
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 KAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRM
::.::.: ::: : . :.::::::::::::: ::. .:: : :::::.:. .::.:.
CCDS47 KAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPYLEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 FRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLH-LP-PALSPEEAESALEAAH
:.::::: ::::::.:::.:.:. :::::::::.:::.: :: :. . .: .::.::..
CCDS47 FQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACHGDLTEKLKLLYKMHVLPEPSSDQDEPDSAFEATQ
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KA0 YFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMW
:: :: . : . ... :: :.... : . ..: : ..: . :.:::.:
CCDS47 YFFEDITPECTHVVG-LDSRSKQGADDGFVTV----SLKPDKG--KRANSQENRNYLRLW
960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 AKEKEAQKETIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVG
. :....... :::::.:: ::::::::.:::::::: ::.:::: :.:.::::.:::::
CCDS47 TPENKSKSKNAKDLPKLNQGQFIELCKTMYNMFSEDPNEQELYHATAAVTSLLLEIGEVG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 KKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAA-GDPQ---------AKAGGDT
: : :. ... . .. .: :: : : . :.: :. . :.
CCDS47 KLFVAQPAKEGGSGGS------GPSCHQGIPGVLFPKKGPGQPYVVESVEPLPASLAPDS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA0 HLGT-APQESQVVVEGGSGEGQGS-PSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGS-----LQCE
. . . : .. .: .: . .:. :.:.:::.:::: :::::::.:.:: :.::
CCDS47 EEHSLGGQMEDIKLEDSSPRDNGACSSMLISDDDTKDDSSMSSYSVLSAGSHEEDKLHCE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA0 DLADDTVLV-GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKI
:...::::: .:.. . : . ..: :: :.:::.:::.::: .::..:.: : . .:
CCDS47 DIGEDTVLVRSGQGTAALPR-STSLDRDWAITFEQFLASLLTEPALVKYFDKPVCMMARI
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1230 1240 1250
pF1KA0 KDQKKVE---RQFSTASDHEQPGVSG
. :... . ...:::.: ..::
CCDS47 TSAKNIRMMGKPLTSASDYEISAMSG
1250 1260
>>CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140 aa)
initn: 3735 init1: 2308 opt: 3434 Z-score: 3167.0 bits: 598.0 E(32554): 4.4e-170
Smith-Waterman score: 3667; 48.0% identity (72.9% similar) in 1247 aa overlap (1-1239:1-1124)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGRGGG-LTGLLVGTLDVVLDSSARVA
:::.:::::. ::: :::.... .:.::::::::.::: ::: :::.::.::::.::::
CCDS46 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGHGEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNARVA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 PYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIHG
:.::: :. :::: .:::.. .::..::.:::.:::.:::.::...::..:::::...
CCDS46 PFRILLQVPGSQVYSPIACGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFDNKDDIASFVKGKVKA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 IIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLYL
.::::... . .:.: ::.:: .:.. .:..::.::::.:::: :::::::::::::
CCDS46 LIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSCCCWKGRVPRQGWLYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 TVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGET
..::::::::.::::..::: :::: .::....... ..::. :...: ::::::. :.
CCDS46 SINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQNKERDFSMFLNLDEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRLP
::.:::::....:.:::.: : : : .: . ::::.:::.:: .:: ::::
CCDS46 FKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLDPDLQEPSQ------ITKRDLEARAQNEFFRAFFRLP
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 RDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKADS
: :.: . ..:.:::::.. : :.:: :..::::::.:. :..:.:::::. .:: ..
CCDS46 RKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKIILPLREVVSIEKMED
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQP----GSIGSRKASVV
.:.:: :. .: .::..: : .:.::: ::. . :... ...: : . ::.:
CCDS46 TSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQVHANHPVHYDTSADDDMASLV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 DPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGA
:: . :. . : . :.. : : :. ::. : .. .. .
CCDS46 FHSTSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDA---LVTAFQQ-SGSQSPDSRMS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 KEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPG
.:..: :. :: :::: :::.:: : : :: ::::::::.:::::: : .....:::
CCDS46 REQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLWLLFSDAVTDLASHPG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 YYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYC
::..:::.: :: :.:::::::::::.::::::::: ::::::::::::: ::: ::::
CCDS46 YYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRRVLTAYAHRNPKIGYC
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 QAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQL
:.:::.::::::: .::::::::::.::::::::.: ::.:: :::..:::: . ::.:
CCDS46 QSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVDQSVFEELIKGHLPEL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 SEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQ
.:.:.::....:.:::::::::::.::.:::: .::::::.:::.:.:..::::.:: :.
CCDS46 AEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKAIFQLGLAVLEANAED
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 LLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEK
: . .:.:.:. .:.:.::.. :..: .::. .:..:....: .:: .:.. ::::
CCDS46 LCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPYPVTDISDLIRDSYEK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 FSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLA
:.. .:.::..:.:.:..:.:. :::.:..:.:.. .... :.::.:: .:: .:.
CCDS46 FGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPEDLEELYDLFKREHMM
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 SQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDE
: :: : ::.:.::: :: ::::::: :: .:: ..::.::.:: .:: : :::::.
CCDS46 SCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGAHTEILAERTFRLLDD
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 NKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSS
: :.::.:: ::. .. ::.:...::.:.::.::.:::: ::.. .
CCDS46 NMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHIPPAL---------------TENDRD
900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 EASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQK
::: . : . . : :. .: .. ::.. :.. :. .:
CCDS46 SQSPLRNPL-------LSTSRPLVF---------GKPNG-DAVDYQKQLKQMIKDLAKEK
940 950 960 970
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 E-TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKFSART
. : :.::::.:..::..:::::.:: ::: :.:::.:::::..:::.:::::.. :. .
CCDS46 DKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTLLLQIGEVGQRGSS-S
980 990 1000 1010 1020 1030
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA0 GRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVVEGGS
: ..:. :: . :: .:. .. .:: : .::.::.
CCDS46 GSCSQECG-EELRASAP----------------SPEDSVFADT--GKTPQDSQAF-----
1040 1050 1060 1070
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA0 GEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARIGGTV
: : .
CCDS46 ---------------------------------------------------PEA-----A
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA0 DTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQFSTASDHEQPGVSG
. :: .:.:.::::.:::. ::::::: .:. :... : . ...:
CCDS46 ERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQYNLKTFEMSHQSQSELKL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
CCDS46 SNL
1140
>>CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155 aa)
initn: 3655 init1: 2308 opt: 3137 Z-score: 2893.0 bits: 547.3 E(32554): 8.1e-155
Smith-Waterman score: 3633; 47.4% identity (72.1% similar) in 1262 aa overlap (1-1239:1-1139)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGRGGG-LTGLLVGTLDVVLDSSARVA
:::.:::::. ::: :::.... .:.::::::::.::: ::: :::.::.::::.::::
CCDS82 MWLKPEEVLLKNALKLWVTQKSSCYFILQRRRGHGEGGGRLTGRLVGALDAVLDSNARVA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KA0 PYRILHQTQDSQVY---------------WTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFD
:.::: :. :::: :..: :.. .::..::.:::.:::.:::.::
CCDS82 PFRILLQVPGSQVYSPIACGELLNGSDVYWAIATGATLEEINQHWDWLEQNLLHTLSVFD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 SEEDITTFVKGKIHGIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSC
...::..:::::....::::... . .:.: ::.:: .:.. .:..::.::::.::::
CCDS82 NKDDIASFVKGKVKALIAEETSSRLAEQEEEPEKFREALVKFEARFNFPEAEKLVTYYSC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 SYWKGRVPRQGWLYLTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTR
:::::::::::::..::::::::.::::..::: :::: .::....... ..::. :.
CCDS82 CCWKGRVPRQGWLYLSINHLCFYSFFLGKELKLVVPWVDIQKLERTSNVFLTDTIRITTQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 DQELFFSMFLNIGETFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLD
..: ::::::. :.::.:::::....:.:::.: : : : .: . ::::.
CCDS82 NKERDFSMFLNLDEVFKVMEQLADVTLRRLLDNEVFDLDPDLQEPSQ------ITKRDLE
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 ARAKNECYRATFRLPRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHL
:::.:: .:: ::::: :.: . ..:.:::::.. : :.:: :..::::::.:. :..
CCDS82 ARAQNEFFRAFFRLPRKEKLHAVVDCSLWTPFSRCHTTGRMFASDSYICFASREDGCCKI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 IIPLREVTIVEKADSSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQP
:.:::::. .:: ...:.:: :. .: .::..: : .:.::: ::. . :... ...:
CCDS82 ILPLREVVSIEKMEDTSLLPHPIIVSIRSKVAFQFIELRDRDSLVEALLARLKQVHANHP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KA0 ----GSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKL
: . ::.: :: . :. . : . :.. : : :.
CCDS82 VHYDTSADDDMASLVFHSTSMCSDHRFGDLEMMSSQNSEESEKEKSPLMHPDA---LVTA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 FQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELW
::. : .. .. ..:..: :. :: :::: :::.:: : : :: ::::::::.::
CCDS82 FQQ-SGSQSPDSRMSREQIKISLWNDHFVEYGRTVCMFRTEKIRKLVAMGIPESLRGRLW
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRR
:::: : .....:::::..:::.: :: :.:::::::::::.::::::::: :::::::
CCDS82 LLFSDAVTDLASHPGYYGNLVEESLGKCCLVTEEIERDLHRSLPEHPAFQNETGIAALRR
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 VLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVD
:::::: ::: :::::.:::.::::::: .::::::::::.::::::::.: ::.:: ::
CCDS82 VLTAYAHRNPKIGYCQSMNILTSVLLLYTKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNHRVIGAQVD
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 QGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKV
:..:::: . ::.:.:.:.::....:.:::::::::::.::.:::: .::::::.:::.
CCDS82 QSVFEELIKGHLPELAEHMNDLSALASVSLSWFLTLFLSIMPLESAVNVVDCFFYDGIKA
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 ILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPP
:.:..::::.:: :.: . .:.:.:. .:.:.::.. :..: .::. .:..:....:
CCDS82 IFQLGLAVLEANAEDLCSSKDDGQALMILSRFLDHIKNEDSPGPPVGSHHAFFSDDQEPY
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA0 AEVDIFELLKVSYEKFSSLRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIE
.:: .:.. :::::.. .:.::..:.:.:..:.:. :::.:..:.:.. .... :
CCDS82 PVTDISDLIRDSYEKFGDQSVEQIEHLRYKHRIRVLQGHEDTTKQNVLRVVIPEVSILPE
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 ELEDLYMVFKAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGS
.::.:: .:: .:. : :: : ::.:.::: :: ::::::: :: .:: ..::.::.
CCDS82 DLEELYDLFKREHMMSCYWEQPRPMASRHDPSRPYAEQYRIDARQFAHLFQLVSPWTCGA
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 HTPLLAGRMFRLLDENKDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAE
:: .:: : :::::.: :.::.:: ::. .. ::.:...::.:.::.::.::::
CCDS82 HTEILAERTFRLLDDNMDQLIEFKAFVSCLDIMYNGEMNEKIKLLYRLHIPPAL------
900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 SALEAAHYFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDY
::.. . ::: . : . . : :. .: .. ::
CCDS82 ---------TENDRDSQSPLRNPL-------LSTSRPLVF---------GKPNG-DAVDY
950 960 970
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 RHYLRMWAKEKEAQKE-TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASL
.. :.. :. .:. : :.::::.:..::..:::::.:: ::: :.:::.:::::..:
CCDS82 QKQLKQMIKDLAKEKDKTEKELPKMSQREFIQFCKTLYSMFHEDPEENDLYQAIATVTTL
980 990 1000 1010 1020 1030
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA0 LLRIGEVGKKFSARTGRKPRDCATEEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHL
::.:::::.. :. .: ..:. :: . :: .:. .. .::
CCDS82 LLQIGEVGQRGSS-SGSCSQECG-EELRASAP----------------SPEDSVFADT--
1040 1050 1060 1070
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA0 GTAPQESQVVVEGGSGEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLV
: .::.::.
CCDS82 GKTPQDSQAF--------------------------------------------------
1080
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA0 GGEACSPTARIGGTVDTDWCISFEQILASILTESVLVNFFEKRVDIGLKIKDQKKVERQF
: : .. :: .:.:.::::.:::. ::::::: .:. :... : . ..
CCDS82 ------PEA-----AERDWTVSLEHILASLLTEQSLVNFFEKPLDMKSKLENAKINQYNL
1090 1100 1110 1120 1130
1240 1250
pF1KA0 STASDHEQPGVSG
.:
CCDS82 KTFEMSHQSQSELKLSNL
1140 1150
>>CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120 aa)
initn: 3620 init1: 1876 opt: 1926 Z-score: 1776.1 bits: 340.6 E(32554): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 3605; 51.8% identity (77.6% similar) in 1114 aa overlap (1-1102:1-1073)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGR--GGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
:::.:::::. ::: :. ::.: .::::::::.:. ::::::::::::: ::::.:.:
CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGGGLTGLLVGTLDSVLDSTAKV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
::.:::::: ::::: ..:::..:.::::::.:::.:...:::.:::.::::.::.:::.
CCDS14 APFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGKIR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
:.::::.:. . : :: ::.:: ::..: ::.:: ::::.:::::::::::: :::::
CCDS14 GLIAEEGKHCFAKED-DPEKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGWLY
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
:..: : :::::::.:..:...: ....:::...... :::.: .. .. .:::::.:..
CCDS14 LSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHINQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRL
:. ::::::: :.:.:.:.: : .: .: :.. :: :. ::..: . : :::
CCDS14 TYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDNDPVLYNPLQ------ITKRGLENRAHSEQFNAFFRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKAD
:. : : : ::.::.... :.: ::.:::::::.. . : .::::::: ..:..
CCDS14 PKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAIDKTN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPS
.:: . . :: :.: .: : ..:: . :: .. . . : : .: : . .. . :
CCDS14 DSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDI-STELAISSES
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 TESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEK
:: :... : .. :.: : :.. . : ..:. .:. .. .: :..: :::
CCDS14 TE----PSDNFE-----VQSLTS-QRECSKTVNT--EALMTVFHPQN-LETLNSKMLKEK
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 MKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYA
:::.::.: : : :::: :.:: ::: ::..::::.::::::.::::: :.:.:.: ::.
CCDS14 MKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMATNPDYYT
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 ELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAM
:.::.: : .::::::::::.::.:::::::.. ::.::::::::::.::: :::::::
CCDS14 EVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAM
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 NIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEK
::.:::::::..::::::::::.::::::::.: :..::::::..:::: :: ::::.:.
CCDS14 NILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGALVDQAVFEELIRDHLPQLTEH
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 MQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLG
: :. .::.:::::::::.::.:.:::: .::::::.:::.:::..::.:: :...::
CCDS14 MTDMTFFSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKAILQLGLAILDYNLDKLLT
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 CSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKVSYEKFSS
:.:..::.: :.:..:::.::.: : . . .:. ..::: .:.. : ::...
CCDS14 CKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRESNEKYGN
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LRAEDIEQMRFKQRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDIGFSIEELEDLYMVFKAKHLASQY
.: :::..:: ..:: :::.::.:.:..:.:.. :. .:..::..::..:: . . : :
CCDS14 IRYEDIHSMRCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVKLSLQELDELYVIFKKELFLSCY
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KA0 W--GCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRELFASLTPWACGSHTPLLAGRMFRLLDEN
: :: . ..::::::::::.:: .::: :. :.::: ... :: :::::::
CCDS14 WCLGCP--VLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRALYHLLSPWAHSANKDSLALWTFRLLDEN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KA0 KDSLINFKEFVTGMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLPPALSPEEAESALEAAHYFTEDSSSE
.: ::::::: .... ::.:..:::::.:.:::.::: . ....: :.
CCDS14 SDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTEVKSKDA------------SK
880 890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA0 ASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKE
.. :... :.. . . . : .:.:. : ... ::: .. : . :: .: : ..:
CCDS14 GDELSKEELLYFS-QLHVSKPANEKEAE-SAKHSPEKGKGKIDIQAYLSQWQDELFKKEE
930 940 950 960 970
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 TIKDLPKMNQEQFIELCKTLYNMFSEDPMEQDLYHAIATVASLLLRIGEVGKKF----SA
.:::::.::: :::.. :::::.: ::: :..::.:::.:.:::::. :::.:. :.
CCDS14 NIKDLPRMNQSQFIQFSKTLYNLFHEDPEEESLYQAIAVVTSLLLRMEEVGRKLHSPTSS
980 990 1000 1010 1020 1030
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA0 RTGRKPRDCAT--EEDEPPAPELHQDAARELQPPAAGDPQAKAGGDTHLGTAPQESQVVV
: . :.. .: . .:..: . :
CCDS14 AKGFSGTVCGSGGPSEEKTGSHLEKDPCSFREEPQWSFAFEQILASLLNEPALVRFFEKP
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA0 EGGSGEGQGSPSQLLSDDETKDDMSMSSYSVVSTGSLQCEDLADDTVLVGGEACSPTARI
CCDS14 IDVKAKLENARISQLRSRTKM
1100 1110 1120
>>CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (632 aa)
initn: 2085 init1: 830 opt: 876 Z-score: 811.2 bits: 161.3 E(32554): 7.3e-39
Smith-Waterman score: 2280; 56.0% identity (80.1% similar) in 639 aa overlap (1-635:1-614)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MWLSPEEVLVANAL--WVTERANPFFVLQRRRGHGR--GGGLTGLLVGTLDVVLDSSARV
:::.:::::. ::: :. ::.: .::::::::.:. ::::::::::::: ::::.:.:
CCDS14 MWLKPEEVLLKNALKLWLMERSNDYFVLQRRRGYGEEGGGGLTGLLVGTLDSVLDSTAKV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 APYRILHQTQDSQVYWTVACGSSRKEITKHWEWLENNLLQTLSIFDSEEDITTFVKGKIH
::.:::::: ::::: ..:::..:.::::::.:::.:...:::.:::.::::.::.:::.
CCDS14 APFRILHQTPDSQVYLSIACGANREEITKHWDWLEQNIMKTLSVFDSNEDITNFVQGKIR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 GIIAEENKNLQPQGDEDPGKFKEAELKMRKQFGMPEGEKLVNYYSCSYWKGRVPRQGWLY
:.::::.:. . : :: ::.:: ::..: ::.:: ::::.:::::::::::: :::::
CCDS14 GLIAEEGKHCFAKED-DPEKFREALLKFEKCFGLPEKEKLVTYYSCSYWKGRVPCQGWLY
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LTVNHLCFYSFLLGKEVSLVVQWVDITRLEKNATLLFPESIRVDTRDQELFFSMFLNIGE
:..: : :::::::.:..:...: ....:::...... :::.: .. .. .:::::.:..
CCDS14 LSTNFLSFYSFLLGSEIKLIISWDEVSKLEKTSNVILTESIHVCSQGENHYFSMFLHINQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 TFKLMEQLANLAMRQLLDSEGFLEDKALPRPIRPHRNISALKRDLDARAKNECYRATFRL
:. ::::::: :.:.:.:.: : .: .: :.. :: :. ::..: . : :::
CCDS14 TYLLMEQLANYAIRRLFDKETFDNDPVLYNPLQ------ITKRGLENRAHSEQFNAFFRL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PRDERLDGHTSCTLWTPFNKLHIPGQMFISNNYICFASKEEDACHLIIPLREVTIVEKAD
:. : : : ::.::.... :.: ::.:::::::.. . : .::::::: ..:..
CCDS14 PKGESLKEVHECFLWVPFSHFNTHGKMCISENYICFASQDGNQCSVIIPLREVLAIDKTN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 SSSVLPSPLSISTKSKMTFLFANLKDRDFLVQRISDFLQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPS
.:: . . :: :.: .: : ..:: . :: .. . . : : .: : . .. . :
CCDS14 DSS---KSVIISIKGKTAFRFHEVKDFEQLVAKLR-LRCGAASTQYHDI-STELAISSES
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 TESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQGLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEK
:: :... : .. :.: : :.. . : ..:. .:. .. .: :..: :::
CCDS14 TE----PSDNFE-----VQSLTS-QRECSKTVNT--EALMTVFHPQN-LETLNSKMLKEK
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 MKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYA
:::.::.: : : :::: :.:: ::: ::..::::.::::::.::::: :.:.:.: ::.
CCDS14 MKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFSGAVNDMATNPDYYT
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 ELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAM
:.::.: : .::::::::::.::.:::::::.. ::.::::::::::.::: :::::::
CCDS14 EVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQSDTGISALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAM
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 NIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEK
::.:::::::..::::::::::.::::::::.: :..:.
CCDS14 NILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLPDYFNRRIIGSDDFMPLVRIQGQCVIGEK
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 MQDLGVISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLG
>>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 (749 aa)
initn: 457 init1: 191 opt: 561 Z-score: 519.5 bits: 107.5 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 589; 28.6% identity (57.2% similar) in 570 aa overlap (424-932:32-581)
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 LQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQ
.:..::: . .. : .:. ..
CCDS14 SGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFR--VYKEEGDEPGS
10 20 30 40 50
460 470 480 490 500
pF1KA0 GLLKLFQKNSP-MEDLGAKGAKEKMKEESWHIHF-FEYGR----------GVCMYRTAKT
.:: ::: ::: : .... :. :. : ... .: . :. :
CCDS14 SLLA----NSPLMED-----APQRLR---WQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKL
60 70 80 90 100
510 520 530 540 550 560
pF1KA0 RALVLKGIPESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSM
:.::: :::...: .::. .::: .. . : :.:..:.. ..:...::.:: :.:
CCDS14 RSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTM
110 120 130 140 150 160
570 580 590 600 610
pF1KA0 PEHPAFQN--ELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVAL
: . : . .:. ::::: : :. : :::::. ..:.. :::. ::.:::.. :.
CCDS14 PSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAI
170 180 190 200 210 220
620 630 640 650 660 670
pF1KA0 CERMLP-DYYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLS
: .:: .:..: ..:. .:: ....: ..::.:.. .:. . .: :.: :::: : :
CCDS14 IEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFAS
230 240 250 260 270 280
680 690 700 710 720
pF1KA0 VMPFESAVVIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE-----------------
:. .. . : : ::::: .:..:..:..: . :.:. .
CCDS14 VVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDA
290 300 310 320 330 340
730 740 750 760 770
pF1KA0 ----GEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKV----SYE
: :: . : : .:. : . :: :.... . . . .: .: . .
CCDS14 ELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRK----HLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQR
350 360 370 380 390 400
780 790 800 810 820
pF1KA0 KFSSLRA-----EDIEQMRFK--QRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIP-VDIGFSIEELEDLY
. :.. : .:.: .. : .. ... .:... : :.: . .: :: :
CCDS14 RKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILR-VARHFQCTDPKNCSVELTPDY
410 420 430 440 450 460
830 840 850 860 870
pF1KA0 MVFKAKHLASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRE----LFASLTPWAC--GS
. . .. .: .:::. :: .: .:.. : ::. ..: : :
CCDS14 SMESHQRDHENYVACSRSHR-RRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGE
470 480 490 500 510 520
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 HTPL---LAGRMFRLLDE-NKDSLINFKEFVT-GMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLP-PAL
. : . ... ..::: .:. : . :: :.. . .: : ::.:.. : :.:
CCDS14 LNGLRGWFPAKFVEVLDERSKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSL
530 540 550 560 570 580
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 SPEEAESALEAAHYFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKG
CCDS14 LGGACHPWLFIEEAAGREVERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNV
590 600 610 620 630 640
>>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (336 aa)
initn: 495 init1: 172 opt: 521 Z-score: 487.8 bits: 100.5 E(32554): 7.5e-21
Smith-Waterman score: 521; 38.8% identity (69.0% similar) in 232 aa overlap (490-715:52-278)
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 QKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWL
: :: ::.: : ::.: :...:.
CCDS95 DFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRTVKR--YVRKGVPLEHRARVWM
30 40 50 60 70
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEE-IERDLHRSMPEHPAFQNELGIA---A
..::: .: .:::: .:.. :. . :. :. ::.:..:.. :.. .
CCDS95 VLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQ---GERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRT
80 90 100 110 120 130
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLY-GSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVG
: :: ::. .: .::::.::.... :.: ..:::.:::: :: :.:::::. ..:
CCDS95 LYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILPDYYSPAMLG
140 150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 ALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLS-WFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFY
.:: .. ::.: :: .. :. :::. .. .: ::. ::....: :... : ::.:
CCDS95 LKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFN
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSS
:: :.:..:::... ..: .:
CCDS95 EGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQKIFSEPGSL
260 270 280 290 300 310
>>CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 495 init1: 172 opt: 521 Z-score: 487.7 bits: 100.5 E(32554): 7.6e-21
Smith-Waterman score: 521; 38.8% identity (69.0% similar) in 232 aa overlap (490-715:52-278)
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 QKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWL
: :: ::.: : ::.: :...:.
CCDS66 DFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRTVKR--YVRKGVPLEHRARVWM
30 40 50 60 70
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 LFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEE-IERDLHRSMPEHPAFQNELGIA---A
..::: .: .:::: .:.. :. . :. :. ::.:..:.. :.. .
CCDS66 VLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQ---GERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRT
80 90 100 110 120 130
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 LRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLY-GSEEEAFWLLVALCERMLPDYYNTRVVG
: :: ::. .: .::::.::.... :.: ..:::.:::: :: :.:::::. ..:
CCDS66 LYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILPDYYSPAMLG
140 150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 ALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGVISSISLS-WFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFY
.:: .. ::.: :: .. :. :::. .. .: ::. ::....: :... : ::.:
CCDS66 LKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFN
200 210 220 230 240 250
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 EGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSS
:: :.:..:::... ..: .:
CCDS66 EGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQVCGAARGSV
260 270 280 290 300 310
1250 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 00:56:22 2016 done: Fri Nov 4 00:56:23 2016
Total Scan time: 5.130 Total Display time: 0.470
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]