Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9515
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9515, 511 aa
  1>>>pF1KB9515 511 - 511 aa - 511 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8940+/-0.000948; mu= 14.4875+/- 0.057
 mean_var=67.0193+/-13.365, 0's: 0 Z-trim(104.2): 29  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.156666
 statistics sampled from 7775 (7803) to 7775 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.24), width:  16
 Scan time:  2.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 511) 3444 787.7       0
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 521) 3048 698.2 5.7e-201
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10        ( 515) 2925 670.4 1.3e-192
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 502) 2810 644.4 8.5e-185
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 512) 2780 637.6 9.6e-183
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10         ( 524) 2696 618.7 5.1e-177
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10        ( 525) 2696 618.7 5.1e-177
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 521) 2596 596.1 3.2e-170
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 469) 2195 505.4 5.6e-143
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8          ( 309)  708 169.3 5.7e-42
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16         ( 307)  698 167.0 2.7e-41
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5          ( 309)  697 166.8 3.2e-41
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12         ( 323)  691 165.4 8.5e-41
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11         ( 330)  691 165.4 8.7e-41
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12        ( 337)  691 165.4 8.8e-41
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11        ( 341)  691 165.4 8.9e-41
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2         ( 327)  682 163.4 3.5e-40
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9           ( 305)  676 162.0 8.4e-40
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9          ( 342)  675 161.8 1.1e-39
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11         ( 286)  643 154.6 1.4e-37
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19         ( 499)  634 152.6 9.6e-37
CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9          ( 283)  494 120.9 1.9e-27
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4          ( 753)  338 85.7 1.9e-16
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX          ( 591)  316 80.7 4.9e-15
CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX          ( 653)  316 80.8 5.3e-15


>>CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4              (511 aa)
 initn: 3444 init1: 3444 opt: 3444  Z-score: 4205.5  bits: 787.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3444; 100.0% identity (100.0% similar) in 511 aa overlap (1-511:1-511)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510 
pF1KB9 PSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
              490       500       510 

>>CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4              (521 aa)
 initn: 3029 init1: 3029 opt: 3048  Z-score: 3721.6  bits: 698.2 E(32554): 5.7e-201
Smith-Waterman score: 3414; 98.1% identity (98.1% similar) in 521 aa overlap (1-511:1-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
              370       380       390       400       410       420

              430       440                 450       460       470
pF1KB9 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
       :::::::::::::::::::::::::::          :::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510 
pF1KB9 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
              490       500       510       520 

>>CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10             (515 aa)
 initn: 2884 init1: 2323 opt: 2925  Z-score: 3571.4  bits: 670.4 E(32554): 1.3e-192
Smith-Waterman score: 2925; 84.2% identity (95.0% similar) in 501 aa overlap (4-503:13-512)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB9          MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM
                   :    :    .:::::::::::.::::..:::: :: ::::.:: ::.
CCDS44 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
       ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
       :::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL
       ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.:
CCDS44 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY
       :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS44 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380        390       400       410
pF1KB9 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF
       ::::::::::::::::::.::::::: .: :: :: ..::::::.:::::::::::::::
CCDS44 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDVGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KB9 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
       :::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::.:::: :.: ::::::::::::
CCDS44 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSAIRGFSPPHRICSFEEAKGLDRIN
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510 
pF1KB9 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       ::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: ..        
CCDS44 ERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ     
              490        500       510          

>>CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8              (502 aa)
 initn: 2664 init1: 2172 opt: 2810  Z-score: 3431.1  bits: 644.4 E(32554): 8.5e-185
Smith-Waterman score: 2810; 80.9% identity (95.0% similar) in 498 aa overlap (11-508:8-502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
                 :::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS59    MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
                  10        20        30         40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS59 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS59 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       .:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS59 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       :::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS59 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
       ::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::
CCDS59 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV
        360       370        380        390       400       410    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAM
       :::::::::: :: :::::::::...::.::: :::: :::::.::::::::::::.:..
CCDS59 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRINERMPPRKDSI
          420       430       440       450       460       470    

              490       500       510 
pF1KB9 PSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
        . . ..:...: .  .. .:.. .  :   
CCDS59 HAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS   
          480       490       500     

>>CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8              (512 aa)
 initn: 2655 init1: 2172 opt: 2780  Z-score: 3394.3  bits: 637.6 E(32554): 9.6e-183
Smith-Waterman score: 2780; 79.3% identity (93.1% similar) in 508 aa overlap (11-508:8-512)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
                 :::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS34    MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
                  10        20        30         40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS34 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS34 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       .:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS34 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       :::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS34 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
        300       310       320       330       340       350      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
       ::::::::::::::::: :.... .:.:.. :::.::::::::::::::::.::.:::::
CCDS34 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEA-EGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSILRQESESV
        360       370        380        390       400       410    

              430       440                 450       460       470
pF1KB9 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEEAKGLDRIN
       :::::::::: :: :::::::::...:          :.::: :::: :::::.::::::
CCDS34 LTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEEARGLDRIN
          420       430       440       450       460       470    

              480       490       500       510 
pF1KB9 ERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       ::::::.:.. . . ..:...: .  .. .:.. .  :   
CCDS34 ERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS   
          480       490       500       510     

>>CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10              (524 aa)
 initn: 2852 init1: 2659 opt: 2696  Z-score: 3291.6  bits: 618.7 E(32554): 5.1e-177
Smith-Waterman score: 2895; 82.8% identity (93.2% similar) in 511 aa overlap (4-503:13-521)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB9          MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM
                   :    :    .:::::::::::.::::..:::: :: ::::.:: ::.
CCDS73 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
       ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
       :::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL
       ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.:
CCDS73 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY
       :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS73 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380        390       400       410
pF1KB9 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF
       ::::::::::::::::::.::::::: .: :: ::: .::::::.:::::::::::::::
CCDS73 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDG-SAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF
              370       380       390        400       410         

              420       430       440                 450       460
pF1KB9 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSF
       :::::::::::::::::::::::::::.::.::::::          :.:::: :.: ::
CCDS73 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF
     420       430       440       450       460       470         

              470       480       490       500       510 
pF1KB9 EEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       ::::::::::::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: ..        
CCDS73 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ     
     480       490       500        510       520         

>>CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10             (525 aa)
 initn: 2874 init1: 2322 opt: 2696  Z-score: 3291.6  bits: 618.7 E(32554): 5.1e-177
Smith-Waterman score: 2895; 82.6% identity (93.2% similar) in 511 aa overlap (4-503:13-522)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB9          MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM
                   :    :    .:::::::::::.::::..:::: :: ::::.:: ::.
CCDS44 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
       ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
       :::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL
       ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.:
CCDS44 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY
       :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.:::::::::::::
CCDS44 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT
              310       320       330       340       350       360

             360       370       380        390       400       410
pF1KB9 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF
       ::::::::::::::::::.::::::: .: :: :: ..::::::.:::::::::::::::
CCDS44 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDVGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440                 450       460
pF1KB9 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSF
       :::::::::::::::::::::::::::.::.::::::          :.:::: :.: ::
CCDS44 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF
              430       440       450       460       470       480

              470       480       490       500       510 
pF1KB9 EEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       ::::::::::::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: ..        
CCDS44 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ     
              490       500        510       520          

>>CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8              (521 aa)
 initn: 2819 init1: 2174 opt: 2596  Z-score: 3169.5  bits: 596.1 E(32554): 3.2e-170
Smith-Waterman score: 2769; 78.3% identity (91.7% similar) in 516 aa overlap (11-508:8-521)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
                 :::::::.:::::::..::: ::::.: :::.::.:: ::.::::::: :
CCDS59    MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFEN-GKPKVDVLKNHLVKEGRLEEEV
                  10        20        30         40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::.::..::.::::::.....:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS59 ALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNTRYLFLGDYV
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::::.
CCDS59 DRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYSEQVYDACME
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       .:::::::::.::::::::::.::::..:::::::::: ::::.::.::.::::: ::.:
CCDS59 TFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLLWSDPSEDYG
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       :::: ::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS59 NEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQATGFP
        240       250       260       270       280       290      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
        300       310       320       330       340       350      

              370       380               390       400       410  
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFD--------GATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSV
       ::::::::::::::::: :.... :        :.:.. :::.::::::::::::::::.
CCDS59 VTEMLVNVLNICSDDELISDDEAEDHYIPSYQKGSTTV-RKEIIRNKIRAIGKMARVFSI
        360       370       380       390        400       410     

            420       430       440                 450       460  
pF1KB9 LREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSFEE
       ::.::::::::::::::: :: :::::::::...:          :.::: :::: ::::
CCDS59 LRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFEE
         420       430       440       450       460       470     

            470       480       490       500       510 
pF1KB9 AKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       :.::::::::::::.:.. . . ..:...: .  .. .:.. .  :   
CCDS59 ARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS   
         480       490       500       510       520    

>>CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4              (469 aa)
 initn: 2183 init1: 2183 opt: 2195  Z-score: 2680.4  bits: 505.4 E(32554): 5.6e-143
Smith-Waterman score: 3041; 91.8% identity (91.8% similar) in 511 aa overlap (1-511:1-469)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEK
       ::::::::::::::::::                                          
CCDS47 SLITIFSAPNYLDVYNNK------------------------------------------
              310                                                  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESV
      320       330       340       350       360       370        

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAM
      380       390       400       410       420       430        

              490       500       510 
pF1KB9 PSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
      440       450       460         

>>CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8               (309 aa)
 initn: 773 init1: 410 opt: 708  Z-score: 867.0  bits: 169.3 E(32554): 5.7e-42
Smith-Waterman score: 768; 44.5% identity (69.4% similar) in 281 aa overlap (62-338:28-293)

              40        50        60        70         80        90
pF1KB9 KEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGAS-ILRQEKNLLDIDAPVTVCGD
                                     .: . : :. :: .:.:. ..  :::::::
CCDS60    MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGD
                  10        20        30        40        50       

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 IHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGN
       .:::: :::.::..::.  .: :::.::::::::.:.: :  : :::. ::. . .::::
CCDS60 VHGQFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGN
        60        70        80        90       100       110       

              160       170        180       190       200         
pF1KB9 HECRHLTEYFTFKQECKIKYSE-RVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTL
       :: :..:. . : .::  ::..  :.    : :: :::.::.. :..:.:::::: :.::
CCDS60 HESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTL
       120       130       140       150       160       170       

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB9 DDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFL
       : :: :::..: :  :::::.::::: .: :.   .        :: .: ..   . : .
CCDS60 DHIRALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDP-DDRGGWGISP-------RGAGYTFGQD-ISETF
       180       190       200        210              220         

     270        280       290       300       310       320        
pF1KB9 QHNNLLSIL-RAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNV
       .: : :... :::.    ::   .        ...::::::::    .:.::... ....
CCDS60 NHANGLTLVSRAHQLVMEGYNWCHDR------NVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTL
      230       240       250             260       270       280  

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB9 -MNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGA
        ... ::. .:                                                 
CCDS60 KYSFLQFDPAPRRGEPHVTRRTPDYFL                                 
            290       300                                          




511 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 00:09:41 2016 done: Fri Nov  4 00:09:42 2016
 Total Scan time:  2.930 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com