Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7011
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7011, 1045 aa
1>>>pF1KB7011 1045 - 1045 aa - 1045 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9648+/-0.000427; mu= -0.2701+/- 0.027
mean_var=257.2856+/-52.629, 0's: 0 Z-trim(118.6): 452 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.079959
statistics sampled from 31205 (31719) to 31205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 16.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005757 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleckstr (1045) 6988 820.5 0
XP_016875801 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1045) 6988 820.5 0
XP_011519348 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1076) 5080 600.4 1.8e-170
NP_001273768 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleck (1076) 5080 600.4 1.8e-170
XP_016875802 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1025) 4699 556.4 2.9e-157
NP_919253 (OMIM: 300628,310700) FERM domain-contai ( 714) 1459 182.6 7.1e-45
XP_016885436 (OMIM: 300628,310700) PREDICTED: FERM ( 698) 1398 175.5 9.1e-43
NP_001293122 (OMIM: 300628,310700) FERM domain-con ( 699) 1134 145.1 1.3e-33
XP_016885437 (OMIM: 300628,310700) PREDICTED: FERM ( 629) 1089 139.8 4.5e-32
XP_016881133 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 847) 958 124.8 2e-27
XP_016881149 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 750) 954 124.3 2.5e-27
XP_016881111 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 925) 954 124.4 3e-27
XP_016881142 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 789) 952 124.1 3.1e-27
XP_016881138 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 816) 952 124.1 3.2e-27
XP_016881144 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 779) 951 124.0 3.3e-27
XP_016881131 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 865) 949 123.8 4.2e-27
XP_016881128 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 873) 949 123.8 4.3e-27
XP_016881118 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 900) 949 123.8 4.4e-27
XP_016881119 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 900) 949 123.8 4.4e-27
XP_016881147 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 764) 947 123.5 4.5e-27
XP_016881141 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 791) 947 123.5 4.6e-27
NP_036439 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein 3 i (1087) 949 123.8 5.1e-27
XP_016865847 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li ( 870) 944 123.2 6.3e-27
XP_016865843 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li (1036) 945 123.4 6.7e-27
XP_011533830 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li ( 953) 944 123.2 6.8e-27
XP_016881130 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 820) 941 122.8 7.7e-27
XP_011523939 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 847) 941 122.8 7.9e-27
XP_016881127 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 830) 940 122.7 8.4e-27
XP_016881135 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 838) 940 122.7 8.5e-27
XP_016881124 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 842) 940 122.7 8.5e-27
XP_016881123 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 842) 940 122.7 8.5e-27
XP_016881132 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 850) 940 122.7 8.6e-27
XP_016881120 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 853) 940 122.7 8.6e-27
NP_001268463 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein ( 865) 940 122.7 8.7e-27
XP_016881129 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 869) 940 122.7 8.7e-27
XP_016881115 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 871) 940 122.7 8.7e-27
XP_016881113 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 875) 940 122.7 8.8e-27
XP_016881126 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 877) 940 122.7 8.8e-27
XP_016881112 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 879) 940 122.7 8.8e-27
XP_011523936 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 881) 940 122.7 8.8e-27
NP_001268462 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein ( 883) 940 122.7 8.8e-27
XP_016881125 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 883) 940 122.7 8.8e-27
XP_016881110 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 888) 940 122.7 8.9e-27
XP_016881109 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 890) 940 122.7 8.9e-27
XP_016881122 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 891) 940 122.7 8.9e-27
XP_016881121 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 891) 940 122.7 8.9e-27
XP_016881108 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 896) 940 122.7 8.9e-27
XP_011523934 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 902) 940 122.8 9e-27
XP_016881107 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 904) 940 122.8 9e-27
XP_016881117 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 906) 940 122.8 9e-27
>>NP_005757 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleckstrin d (1045 aa)
initn: 6988 init1: 6988 opt: 6988 Z-score: 4371.3 bits: 820.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6988; 99.9% identity (100.0% similar) in 1045 aa overlap (1-1045:1-1045)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYKQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 LFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KB7 MEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
:::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
1030 1040
>>XP_016875801 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGEF an (1045 aa)
initn: 6988 init1: 6988 opt: 6988 Z-score: 4371.3 bits: 820.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6988; 99.9% identity (100.0% similar) in 1045 aa overlap (1-1045:1-1045)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYKQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
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XP_016 MEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
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NP_001 ASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSLERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSI
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NP_001 ENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERWMEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 KLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRDFCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPK
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XP_016 PVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQFERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLE
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XP_016 QASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDKAYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQ
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pF1KB7 STVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLKEIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLKEIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVM
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pF1KB7 LKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRRLENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLH
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XP_016 LKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRRLENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLH
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pF1KB7 RLMHYNQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEITEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDL
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLMHYKQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEITEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDL
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pF1KB7 IGIDNLVVPGR-------------------------------EFIRLGSLSKLSGKGLQQ
::::::::::: ::::::::::::::::::
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pF1KB7 RMFFLFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RMFFLFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIV
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pF1KB7 AASSRSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AASSRSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSAS
820 830 840 850 860 870
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pF1KB7 RTSLERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVF
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XP_016 RTSLERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVF
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pF1KB7 TNFCLFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYT
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XP_016 TNFCLFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYT
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pF1KB7 FERWMEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FERWMEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 TPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRAPGKVLLDA
.. .:.:.:::.:. : : :.. ::.:..
NP_919 MLHLKVQFLDDSQKIFVVDQKSSGKALFNL
10 20 30
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pF1KB7 VCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFFPPDHTQLQ
:.::::.: .:::::: .:. .:::.:::::.::.. ::..: ::.::::: : .:.
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