Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5520
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5520, 334 aa
1>>>pF1KB5520 334 - 334 aa - 334 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0233+/-0.000699; mu= 10.7073+/- 0.042
mean_var=134.7575+/-27.198, 0's: 0 Z-trim(115.2): 56 B-trim: 829 in 1/51
Lambda= 0.110484
statistics sampled from 15721 (15777) to 15721 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.485), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 2084 342.6 2.6e-94
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 1573 261.1 6.8e-70
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 1033 175.1 6.7e-44
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 721 125.2 5e-29
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 573 101.7 7.3e-22
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 573 101.8 8.2e-22
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 420 77.4 1.9e-14
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 413 76.3 4e-14
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 394 73.2 3.4e-13
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 394 73.3 3.9e-13
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 394 73.3 4.2e-13
CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 368 69.1 5.5e-12
CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 ( 397) 369 69.3 5.9e-12
CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 397) 346 65.6 7.5e-11
CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 426) 346 65.7 7.9e-11
CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7 ( 223) 340 64.5 9.3e-11
>>CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 2156 init1: 2072 opt: 2084 Z-score: 1806.6 bits: 342.6 E(32554): 2.6e-94
Smith-Waterman score: 2084; 93.8% identity (96.6% similar) in 325 aa overlap (1-324:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
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CCDS59 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
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CCDS59 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDALAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDALAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPWDPLASAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPWDPLASAAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB5 VQREAAVE-QAQSETSLGARGQRGHKPRLGCCVLT
... . . : : : : .. .:.
CCDS59 LKEGGKRKKQKQREESKKKKSTKGNH
310 320
>>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (241 aa)
initn: 1573 init1: 1573 opt: 1573 Z-score: 1368.3 bits: 261.1 E(32554): 6.8e-70
Smith-Waterman score: 1573; 100.0% identity (100.0% similar) in 231 aa overlap (1-231:1-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDALAE
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CCDS47 GGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGKEQLLRLDN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPWDPLASAAG
CCDS47 K
>>CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 (309 aa)
initn: 766 init1: 465 opt: 1033 Z-score: 901.6 bits: 175.1 E(32554): 6.7e-44
Smith-Waterman score: 1033; 64.7% identity (83.9% similar) in 249 aa overlap (1-248:1-243)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
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CCDS14 MVDYYEVLGLQRYASPEDIKKAYHKVALKWHPDKNPENKEEAERKFKEVAEAYEVLSNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
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CCDS14 KRDIYDKYGTEGLNGGG---SHFDDECEYGFTFHKPDDVFKEIFHERDPFSFHFFEDSLE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 DFFGNRRGPR-GSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTS
:.. :: : :.:.: .: :::. : .: : :::.:::.:: ::::: ::::::: .
CCDS14 DLL-NRPGSSYGNRNRDAGYFFSTASEYPIF-EKFSSYDTGYTSQGSLGHEGLTSFSSLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDALA
: .::: :. :..:: :.::::.:.::.:.:. ::: :.:..:.: . .:.::.....:
CCDS14 FDNSGMDNYISVTTSDKIVNGRNINTKKIIESDQER-EAEDNGELTFFLVNSVANEEGFA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPWDPLASAA
.: : :.
CCDS14 KECSWRTQSFNNYSPNSHSSKHVSQYTFVDNDEGGISWVTSNRDPPIFSAGVKEGGKRKK
240 250 260 270 280 290
>>CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 (232 aa)
initn: 699 init1: 628 opt: 721 Z-score: 634.6 bits: 125.2 E(32554): 5e-29
Smith-Waterman score: 954; 63.1% identity (83.3% similar) in 233 aa overlap (1-231:1-222)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
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CCDS30 MANYYEVLGVQASASPEDIKKAYRKLALRWHPDKNPDNKEEAEKKFKLVSEAYEVLSDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPFE
::..::. : .. .:::... . :::. :.:::::.:.::::::: :::::.:...:
CCDS30 KRSLYDRAGCDSWRAGGGASTPYHSPFDTGYTFRNPEDIFREFFGGLDPFSFEFWDSP--
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSF
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CCDS30 --FNSDRGGRGHGLRG--AFSAGFGEFPAFMEAFSSFNM----LGCSG-GSHTTFSSTSF
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB5 GGSGMGN--FKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDAL
:::. :. :::. .::.:.::.:.:::::::::::::::::::::::.:.::
CCDS30 GGSSSGSSGFKSVMSSTEMINGHKVTTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSVTVNGKEQLKWM
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 AEERMRRGQNALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPWDPLASA
CCDS30 DSK
230
>>CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (277 aa)
initn: 778 init1: 392 opt: 573 Z-score: 506.0 bits: 101.7 E(32554): 7.3e-22
Smith-Waterman score: 810; 51.5% identity (69.8% similar) in 291 aa overlap (1-283:1-256)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
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CCDS46 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDS----PFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFE
::.:::.::.:::.: : : :. .. : : ::::.:..:::::::. :::. ..:.
CCDS46 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGP-GFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFA-ELFD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 D--PFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTS
: :: .. . :: :: .: ::. :.:: :: ..
CCDS46 DLGPFSEL--QNRG-----SRHSGPFFTFSSSFP-------------------GH---SD
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FSSTSFGGS-GMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVA
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CCDS46 FSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVP
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DDDALAEERMRRGQN-ALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPW
:: ::. : :: :. .. .. .: . . : : :::.: :
CCDS46 DDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPL----DSDLSEDEDLQLAMAYSLSE
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330
pF1KB5 DPLASAAGVQREAAVEQAQSETSLGARGQRGHKPRLGCCVLT
CCDS46 MEAAGKKPADVF
270
>>CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (324 aa)
initn: 778 init1: 392 opt: 573 Z-score: 505.1 bits: 101.8 E(32554): 8.2e-22
Smith-Waterman score: 813; 46.9% identity (65.5% similar) in 339 aa overlap (1-321:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
:..:::.: : : :: .:::::::. ::.:::::::.::: ::.:::.:::::::::: .
CCDS24 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDS----PFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFE
::.:::.::.:::.: : : :. .. : : ::::.:..:::::::. :::. ..:.
CCDS24 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGP-GFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFA-ELFD
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 D--PFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTS
: :: .. . :: :: .: ::. :.:: :: ..
CCDS24 DLGPFSEL--QNRG-----SRHSGPFFTFSSSFP-------------------GH---SD
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FSSTSFGGS-GMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVA
:::.::. : : : :.:.:::: .:.::.:::.::.:::::::::::::::::.:::::
CCDS24 FSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVP
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KB5 DDDALAEERMRRGQN-ALPAQPAGLRPPKPPRPASL---------LRHA-PHCLSEEEGE
:: ::. : :: :. .. .. .: . . : : :. : . ::: :.
CCDS24 DDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAA
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB5 QDRPRAPGPWDPLASAAGVQREAAVEQAQSETSLGARGQRGHKPRLGCCVLT
.: : . : . . . . :. ::::.
CCDS24 GKKP--AGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQEGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL
270 280 290 300 310 320
>>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa)
initn: 474 init1: 181 opt: 420 Z-score: 373.0 bits: 77.4 E(32554): 1.9e-14
Smith-Waterman score: 443; 47.0% identity (69.5% similar) in 164 aa overlap (3-160:4-147)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDA
:::..::. : :: :.::.:::. ::..::::: : ::.:::..::::.::::
CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPG--AEEKFKEIAEAYDVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KKRDIYDKYGKEGL-----NGGGGGGSHFDSPFEFGFTFR-NPDDVFREFFGGRDPFSFD
.::.:.:.::.::: .::.:::.. : :..::. .: .: ::::::.::
CCDS12 RKREIFDRYGEEGLKGSGPSGGSGGGANGTS---FSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPF---
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FFEDPFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLT
. :::.: : .: .. . ::::: .::.. . :
CCDS12 ------DTFFGQRNGEEGM------DIDDPFSGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQ
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SFSSTSFGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVA
CCDS12 DPPVTHDLRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITF
170 180 190 200 210 220
>>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa)
initn: 274 init1: 200 opt: 413 Z-score: 367.0 bits: 76.3 E(32554): 4e-14
Smith-Waterman score: 433; 52.3% identity (69.5% similar) in 151 aa overlap (3-151:4-141)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDA
::: .::... :: ::::::::: :::.::::: .. .::.:::.::::::::::
CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKN--KSPQAEEKFKEVAEAYEVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KKRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFEDPF
:::.:::..:.:::.::.:: . . :.. : .: .: :::: .::
CCDS68 KKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTF-HGDPHATFAAFFGGSNPF---------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EDFFGNRRGP-RGSRS-RGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSS
: ::: : : : :. . :. :::: :: :
CCDS68 EIFFGRRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAF-GFSMNGYPRDRNSVGPSRLKQDPPVIHELRVS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TSFGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVADDDA
CCDS68 LEEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREGDETPNSI
170 180 190 200 210 220
>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa)
initn: 298 init1: 192 opt: 394 Z-score: 350.4 bits: 73.2 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 411; 31.5% identity (57.8% similar) in 289 aa overlap (3-281:4-258)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDA
:::..::. :. ..:::::::.:::.::::: : .::.:::..::::.::::
CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKE--PNAEEKFKEIAEAYDVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KKRDIYDKYGKEGLNGGGG--GGSHFDSPFEFGFTFR-NPDDVFREFFGGRDPFSFDFFE
::: .::.::.:::. ::: ::: . : .::. .: .: :::: .::..
CCDS35 KKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGS----FHYTFHGDPHATFASFFGGSNPFDI----
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
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