Result of FASTA (omim) for pFN21AB5513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5513, 700 aa
  1>>>pF1KB5513 700 - 700 aa - 700 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2304+/-0.000399; mu= 20.8093+/- 0.025
 mean_var=80.6271+/-15.758, 0's: 0 Z-trim(112.0): 134  B-trim: 0 in 0/58
 Lambda= 0.142835
 statistics sampled from 20571 (20724) to 20571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time: 10.940

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subun ( 700) 4732 985.5       0
NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic su ( 622) 4207 877.3       0
NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalyti ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 3179 665.5 1.9e-190
XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 c ( 447) 3009 630.3 4.8e-180
NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] ( 739) 2642 554.9 4.1e-157
XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11  ( 740) 2642 554.9 4.1e-157
XP_011512577 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11  ( 743) 2642 554.9 4.1e-157
XP_011512576 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11  ( 744) 2642 554.9 4.1e-157
XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11  ( 724) 2571 540.2  1e-152
NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform  ( 729) 2496 524.8 4.6e-148
NP_006606 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 1 [Homo ( 690) 2440 513.2 1.3e-144
XP_011542319 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 721) 2409 506.9 1.1e-142
XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11  ( 650) 2301 484.6 5.3e-136
NP_001306605 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 3 [H ( 627) 1985 419.4 2.1e-116
XP_011542321 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 658) 1954 413.1 1.8e-114
XP_016855588 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 495) 1696 359.8 1.5e-98
XP_011542322 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 526) 1665 353.4 1.3e-96
XP_011531165 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14  ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
NP_001138594 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 1 [ ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_011531167 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14  ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_011531166 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14  ( 684) 1608 341.8 5.3e-93
XP_016881846 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 699) 1538 327.4 1.2e-88
XP_016881847 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 698) 1505 320.6 1.3e-86
XP_016881845 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 702) 1467 312.7   3e-84
XP_016881854 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 503) 1362 291.0 7.7e-78
XP_016881852 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 565) 1362 291.0 8.4e-78
XP_016881851 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 590) 1362 291.0 8.7e-78
XP_016881850 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 604) 1362 291.0 8.8e-78
XP_016881849 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 652) 1362 291.1 9.4e-78
XP_016881848 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 676) 1362 291.1 9.6e-78
NP_653292 (OMIM: 608839) calpain-12 [Homo sapiens] ( 719) 1362 291.1   1e-77
XP_016881844 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12  ( 723) 1362 291.1   1e-77
NP_057536 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 2 [Homo ( 664) 1144 246.1 3.2e-64
XP_011542320 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 695) 1144 246.2 3.3e-64
XP_011531168 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14  ( 508) 1008 218.0 7.1e-56
NP_001308199 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 2 [ ( 508) 1008 218.0 7.1e-56
XP_016855587 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 693)  925 201.0 1.3e-50
XP_011531465 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 433)  903 196.3   2e-49
XP_016860755 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 665)  903 196.5 2.8e-49
XP_016860754 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 669)  903 196.5 2.8e-49
NP_653176 (OMIM: 610228) calpain-13 [Homo sapiens] ( 669)  903 196.5 2.8e-49
XP_011531463 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 669)  903 196.5 2.8e-49
XP_016860753 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 669)  903 196.5 2.8e-49
XP_011531462 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 669)  903 196.5 2.8e-49
XP_011531461 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13  ( 669)  903 196.5 2.8e-49
NP_077320 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform  ( 815)  886 193.1 3.7e-48


>>NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subunit i  (700 aa)
 initn: 4732 init1: 4732 opt: 4732  Z-score: 5269.6  bits: 985.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4732; 99.7% identity (99.7% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-700)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSAL
       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 LEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 MDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 KMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 EYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 LAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYIL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 WTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700
pF1KB5 NFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
              670       680       690       700

>>NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subuni  (622 aa)
 initn: 4207 init1: 4207 opt: 4207  Z-score: 4685.6  bits: 877.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4207; 99.7% identity (99.7% similar) in 621 aa overlap (80-700:2-622)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB5 SFPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                              MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
                                            10        20        30 

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB5 AIASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
       :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
              40        50        60        70        80        90 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB5 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_001 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQ
             100       110       120       130       140       150 

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB5 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
             160       170       180       190       200       210 

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB5 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
             220       230       240       250       260       270 

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB5 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLV
             280       290       300       310       320       330 

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB5 GLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLR
             340       350       360       370       380       390 

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB5 EVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDISEDD
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pF1KB5 IDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSDGS
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pF1KB5 GKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIVAR
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pF1KB5 FADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
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>>NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic su  (714 aa)
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NP_005 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
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pF1KB5 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
       :: .:..::.:.::: :::: ::.::::::. ..::::. ::::::::::::::::::::
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pF1KB5 IASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
       :::::::. .: :::: .: ::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.::::
NP_005 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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pF1KB5 AEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQK
       :::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::: .: : .:..:: :
NP_005 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
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pF1KB5 ALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE
       ::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:.  :.. .:::.::::::
NP_005 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
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pF1KB5 VEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
       ::::: :.:.   ::..:: ::..:  . ::::::::: ::.:...::::::::::.: :
NP_005 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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pF1KB5 DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDG--ESGCTFL
        : .::. : ..:.:::::::::::::: :::.:::. :.:.: :. .. :  ::::.:.
NP_005 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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pF1KB5 VGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINL
       ..:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: ::  .::...:::.: .: ::. ::::
NP_005 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
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pF1KB5 REVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-SE
       ::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.:    .::.:.::: . .. ::
NP_005 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
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pF1KB5 DDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSD
       ..::..:. :: :::::: :::. ::.::: :...:..:... :::.:.:. ::...: :
NP_005 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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pF1KB5 GSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIV
       :.::::: :: :::..:..: .:.:..:.:.::.:..:::: :.: ::::.  .:...:.
NP_005 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
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pF1KB5 ARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL 
       .:... .: .:::::: :::::::.:..:: :: .  :.. .::..:: .... 
NP_005 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
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>>XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain-  (714 aa)
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pF1KB5 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
       :: .:..::.:.::: :::: ::.::::::. ..::::. ::::::::::::::::::::
XP_006 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
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pF1KB5 IASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
       :::::::. .: :::: .: ::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.::::
XP_006 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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pF1KB5 AEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYESKKPPPNLFKIIQK
       :::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::: .: : .:..:: :
XP_006 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
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pF1KB5 ALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE
       ::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:.  :.. .:::.::::::
XP_006 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
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pF1KB5 VEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
       ::::: :.:.   ::..:: ::..:  . ::::::::: ::.:...::::::::::.: :
XP_006 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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pF1KB5 DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDG--ESGCTFL
        : .::. : ..:.:::::::::::::: :::.:::. :.:.: :. .. :  ::::.:.
XP_006 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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pF1KB5 VGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINL
       ..:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: ::  .::...:::.: .: ::. ::::
XP_006 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
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pF1KB5 REVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-SE
       ::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.:    .::.:.::: . .. ::
XP_006 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
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pF1KB5 DDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSD
       ..::..:. :: :::::: :::. ::.::: :...:..:... :::.:.:. ::...: :
XP_006 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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pF1KB5 GSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIV
       :.::::: :: :::..:..: .:.:..:.:.::.:..:::: :.: ::::.  .:...:.
XP_006 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
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pF1KB5 ARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL 
       .:... .: .:::::: :::::::.:..:: :: .  :.. .::..:: .... 
XP_006 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
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>>NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic  (714 aa)
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pF1KB5           MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPS
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NP_001 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
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pF1KB5 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
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NP_001 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
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pF1KB5 IASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
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NP_001 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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NP_001 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
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>>XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 catal  (447 aa)
 initn: 3009 init1: 3009 opt: 3009  Z-score: 3353.4  bits: 630.3 E(85289): 4.8e-180
Smith-Waterman score: 3009; 99.3% identity (99.5% similar) in 439 aa overlap (1-439:1-439)

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       :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEI
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       ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSAL
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
XP_011 LEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQR
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pF1KB5 KMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPG
       :::::::::::::::::::                                         
XP_011 KMGEDMHTIGFGIYEVPEEEKTESGKR                                 
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>>NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens]      (739 aa)
 initn: 2651 init1: 1673 opt: 2642  Z-score: 2941.7  bits: 554.9 E(85289): 4.1e-157
Smith-Waterman score: 2642; 52.7% identity (81.6% similar) in 697 aa overlap (3-695:37-733)

                                           10        20        30  
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NP_008 PSLPESAESLDGSQEDKPRGSCAEPTFTDTGMVAHINNSRLKAKGVGQHDNAQNFGNQSF
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pF1KB5 EALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGA
       : ::  ::. : ::.:: ::: ::.::::.::: :.....: :.:: .:  .: ::. : 
NP_008 EELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLGPNSKNVQNISWQRPKDIINNPLFIMDGI
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pF1KB5 TRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEV
       . :::::: ::::::::::.:::   ..: :::: .: :..:::::::::.::.:.::.:
NP_008 SPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQSFKKNYAGIFHFQIWQFGQWVNV
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pF1KB5 VVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIA
       :::::::::. .:.::::.: ::::::::::::::..: :::::::.: ::.::::::.:
NP_008 VVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLEDFTGGVA
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pF1KB5 EWYESKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEV
       . .. ..:: ::.....::....::.::::..:: .. :..: . ::.:::::::: ..:
NP_008 QSFQLQRPPQNLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDV
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pF1KB5 ESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFL
       .  :... :::.:::::..::.: :.:.   :. .  . . .: .. ::::::::..:::
NP_008 HYRGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFL
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pF1KB5 RHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLE
        ... :::::::::::..:  . :. : ..:.:::::.::::::.:.::: :::. :.: 
NP_008 NNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYWHTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLP
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pF1KB5 EEDEDEEDGESG---CTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLS
       : :. :.:.:..   :: ::.:.::. :. :..: ...:::: .: ::.:...  ..::.
NP_008 EGDDPEDDAEGNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLK
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pF1KB5 KNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADY
       :.::   . .  :. : : ::: ....:::::::..::::::..:.:: .:::.::... 
NP_008 KEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSES
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pF1KB5 QAVDDEIEAN-LEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIK
         .:.   :. :.:  .::::.:. : .::  .:::  ::...::: .: :.  : ...:
NP_008 WELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFK
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pF1KB5 SDGFSIETCKIMVDMLDSDGSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMR
       . ::....:. :....:.:::::::: :: ::: :..:.. :.:: : :.:::.::::::
NP_008 TKGFGLDACRCMINLMDKDGSGKLGLLEFKILWKKLKKWMDIFRECDQDHSGTLNSYEMR
        610       620       630       640       650       660      

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pF1KB5 KALEEAGFKMPCQLHQVIVARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIE
        ..:.::.:.  .. ::.:::.:::.::::::.:. :..::.:.: .:  .::.::: : 
NP_008 LVIEKAGIKLNNKVMQVLVARYADDDLIIDFDSFISCFLRLKTMFTFFLTMDPKNTGHIC
        670       680       690       700       710       720      

      690       700 
pF1KB5 LDLISWLCFSVL 
       :.: .::      
NP_008 LSLEQWLQMTMWG
        730         

>>XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 isof  (740 aa)
 initn: 2651 init1: 1673 opt: 2642  Z-score: 2941.7  bits: 554.9 E(85289): 4.1e-157
Smith-Waterman score: 2642; 52.7% identity (81.6% similar) in 697 aa overlap (3-695:38-734)

                                           10        20        30  
pF1KB5                             MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDY
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XP_006 SLPESAESLDGSQEDKPRGSCAAEPTFTDTGMVAHINNSRLKAKGVGQHDNAQNFGNQSF
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pF1KB5 EALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGA
       : ::  ::. : ::.:: ::: ::.::::.::: :.....: :.:: .:  .: ::. : 
XP_006 EELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLGPNSKNVQNISWQRPKDIINNPLFIMDGI
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pF1KB5 TRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEEILARVVPLNQCFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEV
       . :::::: ::::::::::.:::   ..: :::: .: :..:::::::::.::.:.::.:
XP_006 SPTDICQGILGDCWLLAAIGSLTTCPKLLYRVVPRGQSFKKNYAGIFHFQIWQFGQWVNV
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pF1KB5 VVDDRLPTKDGELLFVHSAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIA
       :::::::::. .:.::::.: ::::::::::::::..: :::::::.: ::.::::::.:
XP_006 VVDDRLPTKNDKLVFVHSTERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLEDFTGGVA
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pF1KB5 EWYESKKPPPNLFKIIQKALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEV
       . .. ..:: ::.....::....::.::::..:: .. :..: . ::.:::::::: ..:
XP_006 QSFQLQRPPQNLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDV
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pF1KB5 ESNGSLQKLIRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFL
       .  :... :::.:::::..::.: :.:.   :. .  . . .: .. ::::::::..:::
XP_006 HYRGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQLLHKTEDGEFWMSYQDFL
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            340       350       360       370       380       390  
pF1KB5 RHYSRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLE
        ... :::::::::::..:  . :. : ..:.:::::.::::::.:.::: :::. :.: 
XP_006 NNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYWHTTFYEGSWRRGSSAGGCRNHPGTFWTNPQFKISLP
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pF1KB5 EEDEDEEDGESG---CTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLS
       : :. :.:.:..   :: ::.:.::. :. :..: ...:::: .: ::.:...  ..::.
XP_006 EGDDPEDDAEGNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQGAQLQTIGFVLYAVPKEFQNIQDVHLK
       430       440       450       460       470       480       

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pF1KB5 KNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADY
       :.::   . .  :. : : ::: ....:::::::..::::::..:.:: .:::.::... 
XP_006 KEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFTEKHSES
       490       500       510       520       530       540       

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pF1KB5 QAVDDEIEAN-LEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIK
         .:.   :. :.:  .::::.:. : .::  .:::  ::...::: .: :.  : ...:
XP_006 WELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAIKFKSFK
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