Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5418, 484 aa
1>>>pF1KB5418 484 - 484 aa - 484 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9557+/-0.00062; mu= -25.4884+/- 0.038
mean_var=619.7555+/-142.128, 0's: 0 Z-trim(114.3): 350 B-trim: 1085 in 1/56
Lambda= 0.051519
statistics sampled from 23765 (24122) to 23765 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 7.330
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004062 (OMIM: 601951) dual specificity protein ( 484) 3371 266.5 1.2e-70
NP_001155879 (OMIM: 601951) dual specificity prote ( 526) 3371 266.6 1.2e-70
NP_065717 (OMIM: 607969) dual specificity protein ( 481) 2639 212.1 2.8e-54
XP_005244935 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 497) 1847 153.3 1.5e-36
NP_003984 (OMIM: 602989) dual specificity protein ( 498) 1840 152.7 2.1e-36
XP_011507445 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 498) 1835 152.4 2.8e-36
NP_001281267 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 499) 1828 151.9 4e-36
NP_003983 (OMIM: 602990) dual specificity protein ( 490) 1642 138.0 5.7e-32
XP_016877399 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 1642 138.0 5.7e-32
XP_016877398 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 490) 1642 138.0 5.7e-32
NP_001123500 (OMIM: 602990) dual specificity prote ( 638) 1642 138.1 6.9e-32
XP_016877396 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 655) 1642 138.1 7e-32
XP_005254208 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 652) 1604 135.3 5e-31
XP_016877395 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 669) 1604 135.3 5.1e-31
XP_011519508 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 642) 1468 125.2 5.4e-28
XP_011519511 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 659) 1468 125.2 5.5e-28
XP_016877397 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 508) 1430 122.3 3.2e-27
XP_011519507 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 656) 1430 122.4 3.9e-27
XP_016877394 (OMIM: 602990) PREDICTED: dual specif ( 673) 1430 122.4 4e-27
NP_001281268 (OMIM: 602989) dual specificity prote ( 271) 1284 111.2 3.8e-24
XP_016855732 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 886 81.6 2.9e-15
XP_016855730 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 886 81.6 2.9e-15
XP_016855731 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 886 81.6 2.9e-15
XP_011507449 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 886 81.6 2.9e-15
XP_016855733 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 252) 886 81.6 2.9e-15
XP_011507446 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specif ( 279) 790 74.5 4.4e-13
NP_003574 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 528) 451 49.5 2.7e-05
XP_016875521 (OMIM: 603496) PREDICTED: dual specif ( 528) 451 49.5 2.7e-05
NP_006473 (OMIM: 603496) dual specificity tyrosine ( 601) 451 49.6 2.9e-05
NP_003836 (OMIM: 609181) dual specificity tyrosine ( 520) 425 47.6 0.0001
XP_011508363 (OMIM: 603497) PREDICTED: dual specif ( 553) 424 47.5 0.00011
NP_001004023 (OMIM: 603497) dual specificity tyros ( 568) 424 47.6 0.00011
XP_005273372 (OMIM: 603497) PREDICTED: dual specif ( 568) 424 47.6 0.00011
NP_003573 (OMIM: 603497) dual specificity tyrosine ( 588) 424 47.6 0.00012
XP_016865019 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 617) 378 44.2 0.0013
XP_016865020 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 617) 378 44.2 0.0013
XP_016865018 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 619) 378 44.2 0.0013
XP_016865015 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 378 44.2 0.0013
XP_016865014 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 378 44.2 0.0013
XP_016865013 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 634) 378 44.2 0.0013
NP_006474 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 589) 374 43.9 0.0015
NP_006475 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 601) 374 43.9 0.0016
XP_005259455 (OMIM: 604556,615812) PREDICTED: dual ( 629) 374 43.9 0.0016
NP_004705 (OMIM: 604556,615812) dual specificity t ( 629) 374 43.9 0.0016
XP_016865037 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 307) 337 40.8 0.0064
XP_016865025 (OMIM: 608459) PREDICTED: cyclin-depe ( 538) 340 41.3 0.0083
>>NP_004062 (OMIM: 601951) dual specificity protein kina (484 aa)
initn: 3371 init1: 3371 opt: 3371 Z-score: 1389.5 bits: 266.5 E(85289): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 3371; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:1-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 YTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 EHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLL
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KKSI
::::
NP_004 KKSI
>>NP_001155879 (OMIM: 601951) dual specificity protein k (526 aa)
initn: 3371 init1: 3371 opt: 3371 Z-score: 1389.1 bits: 266.6 E(85289): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 3371; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:43-526)
10 20 30
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PERRGSPLRGDLLGFQNVREPSSCGETLSGMRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 RDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 CQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAY
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 QICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSAT
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 YDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAM
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 MERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERL
440 450 460 470 480 490
460 470 480
pF1KB5 FDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI
500 510 520
>>NP_065717 (OMIM: 607969) dual specificity protein kina (481 aa)
initn: 2160 init1: 2160 opt: 2639 Z-score: 1095.5 bits: 212.1 E(85289): 2.8e-54
Smith-Waterman score: 2639; 79.1% identity (90.7% similar) in 484 aa overlap (1-482:1-480)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKD-WDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHS-KMCDSHYLE
:::::::.:::::... : . ..:. ::::..:::::.:::..:: .:. : : ::::
NP_065 MRHSKRTHCPDWDSRESWGHESYRG--SHKRKRRSHSSTQENRHCKPHHQFKESDCHYLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHR
.::.::.::..:::.::::::: .: : : .:: :: :. : :::: :: ::: : : :
NP_065 ARSLNERDYRDRRYVDEYRNDYCEGYVPRHYHRDIESGYRIHCSKSSVRSRRSSPKRK-R
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 IHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVEC
.: .::. :..:::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_065 NRHCSSHQ-SRSKSHRRKRSRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLGEGAFGKVVEC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHIC
::: : :::::::::: :: ::::::::::::::.:::::.::::::::::.::::.:
NP_065 IDHGMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPNSVFRCVQMLEWFDHHGHVC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 IVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQ
:::::::::::::::::.::::..::::.::::::.:.:::: ::::::::::::::::.
NP_065 IVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRQMAYQICQSINFLHHNKLTHTDLKPENILFVK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQ
:::. :: :.::::::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SDYVVKYNSKMKRDERTLKNTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLD
::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:.::::::::::::::..::
NP_065 PCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPQHMIQKTRKRKYFHHNQLD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 WDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFD
::::::::::: ::::::::::: .: :::.::::...::::::..:::: :::.:::::
NP_065 WDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPTQRITLDEALQHPFFD
420 430 440 450 460 470
480
pF1KB5 LLKKSI
::::
NP_065 LLKKK
480
>>XP_005244935 (OMIM: 602989) PREDICTED: dual specificit (497 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1847 Z-score: 777.2 bits: 153.3 E(85289): 1.5e-36
Smith-Waterman score: 1847; 55.6% identity (81.1% similar) in 486 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR
: : .: . . .. ..:: . ..::.:: ::... : . . ::....::
XP_005 MPHPRRYHSSERGSRGSYREHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRRRRE----DSYHVRSR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 SINEKD----YHSRRYIDEYR-NDYTQGCEPGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKS
: .... ..::: :: :::.. .. . :.. :. . .:: :: ::: .
XP_005 SYDDRSSDRRVYDRRYCGSYRRNDYSRDRGDAYYDTDYRHSYEYQRENSSYRSQRSSRR-
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 KHRIHHSTSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKV
::: .. :. :...:: .:..::::: ::::: . :: :. :::::.:::::.::.:
XP_005 KHRRRRRRSRTFSRSSSHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGRV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHG
:.:.::. :: .::.::.:::..: :::: ::.:::..: ::.. ::::..::..::
XP_005 VQCVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 HICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENIL
:.:: ::::::::.::.:.:..::. . ..:.::.:.:..:.:::.::::::::::::::
XP_005 HMCISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENIL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALG
::.::: .:: . :::::.. . ..::::::::.: :::::.::::::::::::: ::
XP_005 FVNSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 WSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHD
:::::::::::::..:::.:::.: :::..::::::::::::.:..::.::::.:::..
XP_005 WSQPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 RLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHP
::::::..:::::: . ::::.... :. ::..:::::..::::.::::.:: :::.::
XP_005 RLDWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHP
420 430 440 450 460 470
480
pF1KB5 FFDLLKKSI
:: :.
XP_005 FFARLRAEPPNKLWDSSRDISR
480 490
>>NP_003984 (OMIM: 602989) dual specificity protein kina (498 aa)
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