Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4249
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4249, 362 aa
1>>>pF1KB4249 362 - 362 aa - 362 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9388+/-0.00127; mu= 12.6373+/- 0.075
mean_var=130.7402+/-40.996, 0's: 0 Z-trim(101.8): 292 B-trim: 841 in 2/47
Lambda= 0.112168
statistics sampled from 6210 (6685) to 6210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 2422 404.3 8.1e-113
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 695 124.9 1.2e-28
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CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 624 113.4 3.3e-25
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 624 113.4 3.3e-25
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 618 112.4 6.1e-25
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 612 111.4 1.2e-24
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 608 110.8 1.9e-24
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 608 110.8 1.9e-24
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 573 105.1 9.8e-23
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 573 105.2 9.9e-23
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 570 104.6 1.3e-22
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 567 104.2 1.9e-22
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 560 103.0 4.2e-22
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 560 103.1 4.5e-22
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 559 102.9 4.8e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 558 102.7 5.2e-22
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 556 102.4 6.3e-22
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 556 102.4 6.4e-22
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 554 102.1 8.5e-22
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 549 101.2 1.4e-21
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 546 100.7 1.9e-21
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 542 100.1 3.1e-21
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 540 99.8 3.9e-21
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 539 99.6 4.4e-21
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 538 99.5 4.8e-21
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 538 99.5 5e-21
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 536 99.2 6.2e-21
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 524 97.2 2.4e-20
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 520 96.6 3.6e-20
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 520 96.6 3.7e-20
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 510 94.9 1.1e-19
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 506 94.3 1.8e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 506 94.3 1.8e-19
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 502 93.6 2.7e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 499 93.2 4e-19
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 494 92.4 6.8e-19
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 492 92.1 8.8e-19
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 489 91.5 1.2e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 488 91.4 1.5e-18
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 477 89.6 4.3e-18
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 475 89.3 5.9e-18
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 474 89.1 6.4e-18
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 473 89.0 7.3e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 467 88.0 1.5e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 467 88.0 1.5e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 467 88.0 1.5e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 467 88.0 1.5e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 467 88.0 1.5e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 467 88.0 1.5e-17
>>CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 (362 aa)
initn: 2422 init1: 2422 opt: 2422 Z-score: 2138.9 bits: 404.3 E(32554): 8.1e-113
Smith-Waterman score: 2422; 100.0% identity (100.0% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MDLHLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ANSVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TK
::
CCDS25 TK
>>CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 (404 aa)
initn: 636 init1: 362 opt: 695 Z-score: 627.9 bits: 124.9 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 695; 34.2% identity (68.8% similar) in 292 aa overlap (40-331:52-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 EPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVN
: :.:..: :. .::.:.. : .:. ::
CCDS89 DLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFAL---YLAMFVVGLVENLLVICVN
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70 80 90 100 110 120
pF1KB4 IQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHLIFSINLF
... . . ::::.::::: .::..:::.. .. : : ..:. :: .. .:..
CCDS89 WRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGSFSCRFTHYFYFVNMY
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130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDTYYLKTVTSA
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CCDS89 SSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVLSAIIPLPEVVHIQLVEGP
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASSDQEKHS
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CCDS89 ---EPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTACRLRQPGQPKSRR
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCLSLVHCC
.. .::.::..:::::::..:: . : : . :.: : :. : .:.:..::
CCDS89 HCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTH-ISLHCHLVHLLYFFYDVIDCFSMLHCV
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK
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CCDS89 INPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHSIIITKGDSQPAAAA
320 330 340 350 360 370
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 528 init1: 385 opt: 624 Z-score: 566.5 bits: 113.4 E(32554): 3.1e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:18-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
::. .. .. . .: .:::.:...::
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ---VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
.:.. .. ::.. ..::::.::: .::.:.:.: ... .::.:. ::..
CCDS31 LVVIVIYFYMKLKTVA---SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
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130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
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CCDS31 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
. .. ..: : : .:. : . . ::. :.. .::: :: :: . : :. .:..
CCDS31 IHRNVFFIENTNITVC-AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
. . .:.. : :::.. :. :. :.:... ..::.. : : ::. . :
CCDS31 KAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDT
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300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNY-RY--ELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSET
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CCDS31 AMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKM--STLSYR
290 300 310 320 330 340
360
pF1KB4 EYSALEQSTK
. . .:::
CCDS31 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
350
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
initn: 528 init1: 385 opt: 624 Z-score: 566.1 bits: 113.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:47-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
::. .. .. . .: .:::.:...::
CCDS82 DIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ---VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
.:.. .. ::.. ..::::.::: .::.:.:.: ... .::.:. ::..
CCDS82 LVVIVIYFYMKLKTVA---SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
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CCDS82 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
. .. ..: : : .:. : . . ::. :.. .::: :: :: . : :. .:..
CCDS82 IHRNVFFIENTNITVC-AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
. . .:.. : :::.. :. :. :.:... ..::.. : : ::. . :
CCDS82 KAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNY-RY--ELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSET
:. .: :.. . :.::..:.:..... :: .:.: . : .....:. . : .:
CCDS82 AMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKM--STLSYR
320 330 340 350 360
360
pF1KB4 EYSALEQSTK
. . .:::
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 528 init1: 385 opt: 624 Z-score: 566.0 bits: 113.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 624; 31.8% identity (66.2% similar) in 340 aa overlap (34-362:53-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 HLFDYSEPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANS
::. .. .. . .: .:::.:...::
CCDS82 DIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNS
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ---VVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVT
.:.. .. ::.. ..::::.::: .::.:.:.: ... .::.:. ::..
CCDS82 LVVIVIYFYMKLKTVA---SVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
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pF1KB4 HLIFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
:.::..:.:.:::.:.::::.:.. .. : .: .:.::..:::: .:::
CCDS82 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
. .. ..: : : .:. : . . ::. :.. .::: :: :: . : :. .:..
CCDS82 IHRNVFFIENTNITVC-AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALK
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290
pF1KB4 ASSDQEKHSSR-----KIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFT
. . .:.. : :::.. :. :. :.:... ..::.. : : ::. . :
CCDS82 KAYEIQKNKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIR-DCRIADIVDT
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ALHVTQCLSLVHCCVNPVLYSFINRNY-RY--ELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSET
:. .: :.. . :.::..:.:..... :: .:.: . : .....:. . : .:
CCDS82 AMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKM--STLSYR
320 330 340 350 360 370
360
pF1KB4 EYSALEQSTK
. . .:::
CCDS82 PSDNVSSSTKKPAPCFEVE
380 390
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360
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CCDS24 SGHTSTTL
360
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
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CCDS24 LGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKV--NGWIFGTFLCKV
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CCDS24 VSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVK-FVCLGCWGLSMNLSLP-
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CCDS24 FFLFRQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAK-WRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTL
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pF1KB4 SASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHV
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CCDS24 FKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDA
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CCDS24 TEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSN
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>>CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 (352 aa)
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CCDS46 LVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN--WYFGNFLCKAVHVI
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CCDS46 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPD--FI
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CCDS46 FANVSEADDRYICDRFYPNDL---WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSK
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CCDS46 GHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEAL
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pF1KB4 SLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK
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CCDS46 AFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHA-LTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSF
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CCDS46 HSS
350
>>CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 (356 aa)
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CCDS33 SIPLPLLQIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVGNG
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CCDS33 LVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVAN--WYFGNFLCKAVHVI
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CCDS33 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPD--FI
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pF1KB4 KTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASS
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CCDS33 FANVSEADDRYICDRFYPNDL---WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSK
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 DQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCL
..:... : ...:..:::::.... .: : .:. : :..:... . .:. :
CCDS33 GHQKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEAL
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pF1KB4 SLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK
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CCDS33 AFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHA-LTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSF
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CCDS33 HSS
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
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CCDS77 VIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYSIICFVGLLGN
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pF1KB4 SVVVWVNIQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHL
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CCDS77 GLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAK--SWVFGVHFCKLIFA
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pF1KB4 IFSINLFGSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKK--MVRRVVCILVWLLAFCVSLPDT
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CCDS77 IYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILATVLSIPEL
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pF1KB4 YYLKTVTSASNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAIS
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CCDS77 LYSDLQRSSSEQAMRC-SLITEHV--EAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLVIIRTLL
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pF1KB4 ASSDQEKHSSRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVT
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CCDS77 QARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLNIAYDVT
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pF1KB4 QCLSLVHCCVNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQS
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CCDS77 YSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRRSSMSVEAE
310 320 330 340 350 360
362 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:31:42 2016 done: Thu Nov 3 21:31:43 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]