Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3201
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3201, 346 aa
1>>>pF1KB3201 346 - 346 aa - 346 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8614+/-0.00123; mu= 3.3519+/- 0.070
mean_var=252.6720+/-59.705, 0's: 0 Z-trim(108.8): 660 B-trim: 96 in 1/49
Lambda= 0.080686
statistics sampled from 9636 (10442) to 9636 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 2320 283.7 1.6e-76
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 1732 215.0 5.2e-56
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 916 120.2 2.3e-27
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 908 119.2 4.3e-27
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 880 115.9 4.1e-26
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 855 113.0 3.1e-25
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 844 111.8 8.3e-25
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 834 111.1 3.1e-24
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 834 111.1 3.1e-24
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 834 111.1 3.1e-24
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 834 111.1 3.1e-24
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 827 110.3 5.4e-24
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 827 110.3 5.5e-24
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 827 110.3 5.6e-24
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 819 109.0 6.4e-24
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 764 102.6 6e-22
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 765 102.8 6.1e-22
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 765 102.8 6.2e-22
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 764 102.7 6.3e-22
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 764 102.7 6.4e-22
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 765 102.9 6.7e-22
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 755 101.7 1.3e-21
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 755 101.7 1.4e-21
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 752 101.4 1.8e-21
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 752 101.4 1.8e-21
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 727 98.3 1.1e-20
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 727 98.3 1.2e-20
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 727 98.3 1.2e-20
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 700 95.0 8e-20
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 695 94.5 1.4e-19
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 681 93.1 5.7e-19
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 675 92.1 6.6e-19
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 669 91.5 1.1e-18
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 668 91.3 1.2e-18
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 659 90.6 3.7e-18
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 650 89.2 4.8e-18
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 658 90.7 5.2e-18
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 658 90.8 5.5e-18
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 647 88.8 5.8e-18
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 651 89.6 6e-18
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 648 89.1 6.3e-18
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 651 89.6 6.6e-18
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 649 89.4 7.9e-18
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 649 89.5 8.2e-18
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 649 89.5 8.5e-18
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 631 87.1 2.5e-17
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 631 87.1 2.6e-17
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 627 86.7 4e-17
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 627 86.9 4.7e-17
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 634 88.2 4.7e-17
>>CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 (346 aa)
initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 1487.4 bits: 283.7 E(32554): 1.6e-76
Smith-Waterman score: 2320; 100.0% identity (100.0% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 CSLPDYVTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 CSLPDYVTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB3 PTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
310 320 330 340
>>CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 (253 aa)
initn: 1732 init1: 1732 opt: 1732 Z-score: 1119.0 bits: 215.0 E(32554): 5.2e-56
Smith-Waterman score: 1732; 100.0% identity (100.0% similar) in 253 aa overlap (94-346:1-253)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 METDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQ
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 GLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPEL
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PDYVTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPGPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PDYVTFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPGPTP
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340
pF1KB3 GCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
220 230 240 250
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 747 init1: 587 opt: 916 Z-score: 604.7 bits: 120.2 E(32554): 2.3e-27
Smith-Waterman score: 916; 46.6% identity (76.2% similar) in 294 aa overlap (12-303:4-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
..:.. .::: ...::::....:.:.::.:::.: . : :. ::.
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEME---GVPSTAI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB3 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSH-IKAYML
:::.::.::.::::. :::. .. .. :::.:. ::. . .. : : ::.:..
CCDS11 REISLLKELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 MTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYR
. :::. . :.: ..::::::.:::..: :..::::::::..:: : :.:::.::: :::
CCDS11 QLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 APELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPD
:::.:.:...: ..::.:..:::.::.. : ..::::..::: :::. ::::.:. ::
CCDS11 APEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MCSLPDYV-TFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNR
. .:::: .: .. :..: . ::.. :. ..: :::: :: :::.
CCDS11 VTQLPDYKGSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSS-
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB3 PGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
: :.:
CCDS11 PEPSPAARQYVLQRFRH
290 300
>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 (298 aa)
initn: 840 init1: 588 opt: 908 Z-score: 599.8 bits: 119.2 E(32554): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 908; 45.0% identity (76.5% similar) in 298 aa overlap (12-307:4-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
..:.. .::: ...:::::.: :...::.:::.: ..: :. ::.
CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETE---GVPSTAI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB3 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTP-SHIKAYML
:::.::.::.::::. :::.. .... :::.:.. ::. .. ..:. : ::.:..
CCDS88 REISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 MTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYR
. :::: . :.: .:::::::.:::.. .:..::::::::..:: : :.:::.::: :::
CCDS88 QLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 APELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPD
:::.:.: ..:...::.:..:::.::.. : ..::::..::: :::.::::: : ::
CCDS88 APEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MCSLPDYV-TFKSFPGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNR
. :.::: .: .. . .. .: .:.. .. ..: ::.: :: .:..
CCDS88 VTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB3 PGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
:.: .:
CCDS88 TKPVPHLRL
290
>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 (292 aa)
initn: 766 init1: 528 opt: 880 Z-score: 582.3 bits: 115.9 E(32554): 4.1e-26
Smith-Waterman score: 880; 45.6% identity (74.5% similar) in 294 aa overlap (10-301:2-292)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
..::::. .::: ..::.::....:..:::.:...: .: :. .::
CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDE---GVPSSAL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLM
::: ::.::.: ::. : :.. ....:::.: . ::. . . . : : .:.....
CCDS47 REICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRA
:.:: . :.. .:::::::.:::...:: :::::::::..:: : : :. .::: :::
CCDS47 LLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB3 PELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELL-LRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPD
:..::::..:....:::..:::.::: :..::.. ::: :::. ::::::::::.
CCDS47 PDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MCSLPDYVTFKSFPGIP-LHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNR
: .:::: . .:. : .. . ::.:.:. :: ::.: .::. :::.
CCDS47 MTKLPDYKPYPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB3 PGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALAIKRKRTEALEQGGLPKKLIF
:
CCDS47 CPP
290
>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 843 init1: 543 opt: 855 Z-score: 566.5 bits: 113.0 E(32554): 3.1e-25
Smith-Waterman score: 855; 45.2% identity (76.9% similar) in 290 aa overlap (12-297:4-289)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTAL
: :.. .::: ...:::.: :.:.:.::.:::.: .:: ..:. ::.
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRL--ESE-EEGVPSTAI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB3 REIKLLQELSHPNIIGLLDAFGHKSNISLVFDFMETDLEVIIKD--NSLVLTPSHIKAYM
:::.::.:: ::::..: :.. . : . :.:.:. ::. . . . . : .:.:.
CCDS44 REISLLKELRHPNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 LMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENGVLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWY
. :::. . :.. .:::::::.:::.:..:..::::::::..:: : :.:::.::: ::
CCDS44 YQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLRVPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWP
:.::.:.:. :.. ::.:..: :.::: . :.. :::..::: :::..::::..: ::
CCDS44 RSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DMCSLPDYV-TFKSF-PGIPLHHIFSAAGDDLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFS
.. :: :: :: .. :: :. . .. :::.. .....: ::.. .::. ::.
CCDS44 EVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHV-KNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
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.
CCDS44 DLDNQIKKM
290
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CCDS35 PELTELPDYNKISFKEQVPMPLEEVLPDVSPQALDLLGQFLLYPPHQRIAASKALLHQYF
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. : :. .:: :
CCDS35 FTAPLPAHPSELPIPQRLGGPAPKAHPGPPHIHDFHVDRPLEESLLNPELIRPFILEG
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. .::.. .. . : ::.: ..:: .:: . : : .. :. :... ::.
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pF1KB3 IKRKRTEALEQGGLPKKLIF
.:: . .:::
CCDS44 VKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
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10 20 30
pF1KB3 MALDVKSRAKRYEKLDFLGEGQFATVYKARD
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CCDS81 KPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSD
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10 20 30
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390 400 410 420 430 440
40 50 60 70 80
pF1KB3 KNTNQIVAIKKIKLGHRSEAKDGINRTALREIKLLQELSHPNIIGLLDAF--GHKSNISL
:.:..:::.:..:. . :.:. :.::::. . . .::::. . . .. ..: .
CCDS44 KKTDEIVALKRLKM---EKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTVREIVVGSNMDKIYI
450 460 470 480 490
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 VFDFMETDLEVIIKDNSLVLTPSHIKAYMLMTLQGLEYLHQHWILHRDLKPNNLLLDENG
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CCDS44 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHAG
500 510 520 530 540 550
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 VLKLADFGLAKSFGSPNRAYTHQVVTRWYRAPELLFGARMYGVGVDMWAVGCILAELLLR
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CCDS44 ILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLTQ
560 570 580 590 600 610
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 VPFLPGDSDLDQLTRIFETLGTPTEEQWPDMCSLP--DYVTFKSFPGIPLHHIFSAA-GD
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CCDS44 KPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLSD
620 630 640 650 660 670
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 DLLDLIQGLFLFNPCARITATQALKMKYFSNRPGPTPGCQLPRPNCPVETLKEQSNPALA
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CCDS44 QGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMF--PTWPAKS--EQQR----
680 690 700 710 720 730
330 340
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CCDS44 VKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]