Result of FASTA (omim) for
pFN21ASDA0587
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0587, 1134 aa
1>>>pF1KSDA0587 1134 - 1134 aa - 1134 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5418+/-0.000582; mu= 21.0502+/- 0.036
mean_var=66.3997+/-13.062, 0's: 0 Z-trim(105.3): 34 B-trim: 96 in 1/49
Lambda= 0.157395
statistics sampled from 13515 (13523) to 13515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 14.620
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_995314 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 (1134) 7370 1683.7 0
XP_006712263 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associa (1132) 7342 1677.3 0
NP_038464 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 (1128) 7300 1667.8 0
XP_006712264 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associa (1126) 7272 1661.4 0
NP_005328 (OMIM: 141180) nck-associated protein 1- (1127) 4570 1047.9 0
NP_001171905 (OMIM: 141180) nck-associated protein (1077) 4379 1004.5 0
>>NP_995314 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 isof (1134 aa)
initn: 7370 init1: 7370 opt: 7370 Z-score: 9035.2 bits: 1683.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7370; 100.0% identity (100.0% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1134)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
1090 1100 1110 1120 1130
>>XP_006712263 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associated (1132 aa)
initn: 6848 init1: 6848 opt: 7342 Z-score: 9000.8 bits: 1677.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7342; 99.8% identity (99.8% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1132)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SAVKFIVRKFPAVETRNNN--LAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
>>NP_038464 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 isof (1128 aa)
initn: 7107 init1: 7107 opt: 7300 Z-score: 8949.3 bits: 1667.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7300; 99.5% identity (99.5% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1128)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_038 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKK------ACGDPKAKPSYLIDKNLE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
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10 20 30 40 50 60
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:. . :.::::::::::::: :.: :.::::: .:.:::.:: .:..:..:
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..:.: .::: ...::..:.:. ...::.::.. :. :: .:::::::.::: ::::::
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:.:: :::..:::.:..:::::.:::....::::::.:. .::.:: :::: :: .:
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. :::::...:..::::. ::: ::.:..: ::.::.... ::: .:.:::.::::::::
NP_005 FARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKAVSGALLSLHFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSLIS
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pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
: .:.:::.:::: :::::...::.:::.::.:::: ::... .:::: ::.: ..
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pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
:.:..:...::..:::: ...::.::. ::.: :: .....:..: .::.::: :.:::
NP_005 LIREDVLQVHKVTEDLFSSLKGYGKRVADIKESKEHVIANSGQFHCQRRQFLRMAVKELE
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pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPK-KSADDFIDKHIAELIFYME
:::.:.::::::::::.:::::: :::. ::.::..:. : :. .:. :. ::::.: .:
NP_005 TVLADEPGLLGPKALFAFMALSFIRDEVTWLVRHTENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLE
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD ELRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVK
.:. ::.. :.:.:..:::. :::.::....::::::::.:::::::::. ..::..:
NP_005 GIRSLVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSILSSLNLK
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pF1KSD QVEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEML
::..:: :.: :.:::::::::::::.:: : : .. .:.:.:: :.::..:.::. ..:
NP_005 QVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSRMLDSVEKLL
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pF1KSD VETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGD
::::::: :::. : ::::: . :: .. ::.:::::.:.::. ::::.:::: :. .
NP_005 VETSDLSTFCFHLRIFEKMFAMTLEESAMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKN
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pF1KSD RSLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQ--TGK
..: :: ::.:.:::. : . .::.:: .::.:::::::: :::.: :::..:: : .
NP_005 HGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLEICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTRKQRQTPR
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pF1KSD KGEPEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSH
::::::.:::.:: :::: .:::.:::: :.:: ...:.: .. :.:::. : :::.::
NP_005 KGEPERDKPGAESHRKNRSIVTNMDKLHLNLTELALTMNHVYSFSVFEHTIFPSEYLSSH
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pF1KSD LEIRFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQ
:: :....:: .. :: .::::..:::::..:.::. .::. ... : .::. :.:::
NP_005 LEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFIQSLAQFLGADASRVIRNALLQ
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pF1KSD QTQHLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYS
::: ::: :: :::.::::::::.::::.:.: : :::.:::.:: :.: .:.:::.:
NP_005 QTQPLDSCGEQTITTLYTNWYLESLLRQASSGTIILSPAMQAFVSLPREGEQNFSAEEFS
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pF1KSD DISEMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMA
::::::.:.:::::::::::::.::::..::..:::::::::.:.:.:.:..:.::: ::
NP_005 DISEMRALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMA
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pF1KSD ALFKRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETD
.:. .:.....:::::::::::::::..:::.::.:.: : :::.. :: .:. . .::
NP_005 SLLPQLTGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIECLKEFVTPDTD
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pF1KSD MKVAMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLA
.::.....::.::::. :.::::::.:... :... :::::::.::::..:.::::: ::
NP_005 IKVTLSIFELASAAGVGCDIDPALVAAIANLKADTSSPEEEYKVACLLLIFLAVSLPLLA
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pF1KSD SNVMSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQ
.. : :: .:. ::::::.::: :..:::::... .:: .:::::..:: :::..::
NP_005 TDPSSFYSIEKDGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTLYNKNIETHLKEFLVVASVSLLQLGQ
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pF1KSD ETDKTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
:::: ::::::. ::. ..:.:: :::.:.::::::::::::::. : .
NP_005 ETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRAFHLN
1080 1090 1100 1110 1120
>>NP_001171905 (OMIM: 141180) nck-associated protein 1-l (1077 aa)
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pF1KSD TRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLESAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKE
.: ..:.: .::: ...::..:.:. ...:
NP_001 MEPSLKYINKKFPNIDVRNSTQHLGPVHRE
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pF1KSD KSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTIDVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTT
:.::.. :. :: .:::::::.::: :::::::.:: :::..:::.:..:::::.:::.
NP_001 KAEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDACQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTS
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD LMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDREYPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKS
...::::::.:. .::.:: :::: :: .: . :::::...:..::::. ::: ::.:.
NP_001 VILLLSRIEDRRILIGMYNCAHEMLHGHGDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKA
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD LSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLISAPSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWI
.: ::.::.... ::: .:.:::.:::::::: : .:.:::.:::: :::::...::.::
NP_001 VSGALLSLHFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSLISNPPAMINPANSDTMACEYLSVEVMERWI
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD IFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLSLFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRIN
:.::.:::: ::... .:::: ::.: ..:.:..:...::..:::: ...::.::.
NP_001 IIGFLLCHGCLNSNSQCQKLWKLCLQGSLYITLIREDVLQVHKVTEDLFSSLKGYGKRVA
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD DIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELATVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEI
::.: :: .....:..: .::.::: :.::: :::.:.::::::::::.:::::: :::.
NP_001 DIKESKEHVIANSGQFHCQRRQFLRMAVKELETVLADEPGLLGPKALFAFMALSFIRDEV
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KSD IWLLRHADNMPK-KSADDFIDKHIAELIFYMEELRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVV
::.::..:. : :. .:. :. ::::.: .: .:. ::.. :.:.:..:::. :::.:
NP_001 TWLVRHTENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLEGIRSLVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALV
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD LNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQVEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSK
:....::::::::.:::::::::. ..::..:::..:: :.: :.:::::::::::::.:
NP_001 LSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSILSSLNLKQVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAK
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD ASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLVETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPS
: : : .. .:.:.:: :.::..:.::. ..:::::::: :::. : ::::: . :: .
NP_001 APLHLHENPDLAKVMNLIVFHSRMLDSVEKLLVETSDLSTFCFHLRIFEKMFAMTLEESA
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KSD QSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDRSLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQ
. ::.:::::.:.::. ::::.:::: :. ...: :: ::.:.:::. : . .::.::
NP_001 MLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKNHGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLEICAEQ
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KSD CTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQ--TGKKGEPEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLH
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NP_001 RNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTRKQRQTPRKGEPERDKPGAESHRKNRSIVTNMDKLH
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NP_001 TSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMASLLPQLTGAENVLKRMTIIGVILSFRAM
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NP_001 ANLKADTSSPEEEYKVACLLLIFLAVSLPLLATDPSSFYSIEKDGYNNNIHCLTKAIIQV
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1134 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]