Result of FASTA (omim) for pFN21AB7016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7016, 835 aa
  1>>>pF1KB7016 835 - 835 aa - 835 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8146+/-0.000367; mu= 6.9334+/- 0.023
 mean_var=258.2060+/-52.469, 0's: 0 Z-trim(122.3): 148  B-trim: 516 in 1/56
 Lambda= 0.079816
 statistics sampled from 40004 (40200) to 40004 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.471), width:  16
 Scan time: 16.100

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005753 (OMIM: 601742) transcription intermediar ( 835) 5662 665.7 2.4e-190
XP_016856943 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u ( 638) 1172 148.5 8.7e-35
NP_148980 (OMIM: 188550,605769) E3 ubiquitin-prote (1110) 1172 148.8 1.3e-34
NP_056990 (OMIM: 188550,605769) E3 ubiquitin-prote (1127) 1172 148.8 1.3e-34
XP_005270994 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u (1134) 1172 148.8 1.3e-34
XP_011539870 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u (1150) 1172 148.8 1.3e-34
XP_005270993 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u (1151) 1172 148.8 1.3e-34
NP_056989 (OMIM: 188550,603406) transcription inte (1050)  949 123.1 6.7e-27
NP_003843 (OMIM: 188550,603406) transcription inte (1016)  944 122.5 9.7e-27
XP_011518827 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1020)  670 90.9 3.1e-17
XP_011518826 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1032)  670 90.9 3.1e-17
XP_011518812 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1364)  670 91.1 3.8e-17
XP_011518811 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1367)  670 91.1 3.8e-17
XP_011518810 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1385)  670 91.1 3.8e-17
XP_011518809 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1392)  670 91.1 3.8e-17
XP_011518806 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1392)  670 91.1 3.8e-17
XP_016874118 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1392)  670 91.1 3.8e-17
XP_006718460 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1392)  670 91.1 3.8e-17
XP_011518816 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1306)  637 87.2 5.1e-16
XP_016874119 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1306)  637 87.2 5.1e-16
XP_011518814 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1306)  637 87.2 5.1e-16
XP_011518815 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1306)  637 87.2 5.1e-16
XP_011518813 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1355)  630 86.5 9.1e-16
NP_055633 (OMIM: 612000) tripartite motif-containi (1216)  578 80.4 5.4e-14
XP_006718461 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518824 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518818 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518820 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518817 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518821 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518819 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_016874120 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_011518825 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1247)  578 80.4 5.4e-14
XP_016856942 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u ( 718)  396 59.2 7.5e-08
XP_011518829 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  ( 743)  392 58.8 1.1e-07
XP_011518828 (OMIM: 612000) PREDICTED: tripartite  (1001)  392 58.9 1.3e-07
XP_016856941 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 u ( 735)  361 55.2 1.2e-06
NP_112223 (OMIM: 616996) E3 ubiquitin-protein liga ( 755)  336 52.3 9.4e-06
XP_011514891 (OMIM: 616996) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 755)  336 52.3 9.4e-06
NP_079464 (OMIM: 609318) tripartite motif-containi ( 580)  303 48.4 0.00011
NP_001139107 (OMIM: 609318) tripartite motif-conta ( 562)  299 48.0 0.00015
XP_011540501 (OMIM: 609318) PREDICTED: tripartite  ( 476)  294 47.3 0.00019
NP_997279 (OMIM: 616923) RING finger protein 207 [ ( 634)  292 47.2 0.00028
XP_016856748 (OMIM: 616923) PREDICTED: RING finger ( 656)  292 47.2 0.00028


>>NP_005753 (OMIM: 601742) transcription intermediary fa  (835 aa)
 initn: 5662 init1: 5662 opt: 5662  Z-score: 3538.2  bits: 665.7 E(85289): 2.4e-190
Smith-Waterman score: 5662; 100.0% identity (100.0% similar) in 835 aa overlap (1-835:1-835)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKRSTAPSAAASASASAAASSPAGGGAEALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKRSTAPSAAASASASAAASSPAGGGAEALE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LLEHCGVCRERLRPEREPRLLPCLHSACSACLGPAAPAAANSSGDGGAAGDGTVVDCPVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLEHCGVCRERLRPEREPRLLPCLHSACSACLGPAAPAAANSSGDGGAAGDGTVVDCPVC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 KQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDANQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDANQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 HQRVKYTKDHTVRSTGPAKSRDGERTVYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HQRVKYTKDHTVRSTGPAKSRDGERTVYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 QYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAIL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 QIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEPHGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAERPGTNSTGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEPHGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAERPGTNSTGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 APMAPPRAPGPLSKQGSGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAEPHVSGVKRSRSGEGEVSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 APMAPPRAPGPLSKQGSGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAEPHVSGVKRSRSGEGEVSG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 LMRKVPRVSLERLDLDLTADSQPPVFKVFPGSTTEDYNLIVIERGAAAAATGQPGTAPAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LMRKVPRVSLERLDLDLTADSQPPVFKVFPGSTTEDYNLIVIERGAAAAATGQPGTAPAG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 TPGAPPLAGMAIVKEEETEAAIGAPPTATEGPETKPVLMALAEGPGAEGPRLASPSGSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TPGAPPLAGMAIVKEEETEAAIGAPPTATEGPETKPVLMALAEGPGAEGPRLASPSGSTS
              550       560       570       580       590       600

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pF1KB7 SGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDDSATICRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDVP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 GEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADSTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADSTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 HQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPPYSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830     
pF1KB7 DVQSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DVQSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP
              790       800       810       820       830     

>>XP_016856943 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 ubiqu  (638 aa)
 initn: 562 init1: 562 opt: 1172  Z-score: 745.5  bits: 148.5 E(85289): 8.7e-35
Smith-Waterman score: 1173; 40.3% identity (70.9% similar) in 447 aa overlap (5-433:68-510)

                                         10        20        30    
pF1KB7                           MAASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKRST
                                     :::.:..: .:.: . . : : :::   . 
XP_016 LTAVLVEEEEEEGGRAGAEGGAAGPDDGGVAAASSGSAQAASSPAASVGTGVAGGAVSTP
        40        50        60        70        80        90       

           40        50        60        70          80        90  
pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
XP_016 APAPASAPAPGPSAGPPPGPPAS---LLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
       100       110       120          130       140       150    

            100       110          120       130       140         
pF1KB7 GPAAPAAANSSGDGGAAGDGT---VVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDA
        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
XP_016 -PEPERQLSVPIPGGSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDNYFVKDTSEAPSSSDEKS
           160       170       180       190       200       210   

     150       160       170       180       190          200      
pF1KB7 NQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGPAKSRDGERT
       .: :::::::: :...::::.: ::.::.:::::::.:::: .:.   .. . . .:.: 
XP_016 EQVCTSCEDNASAVGFCVECGEWLCKTCIEAHQRVKFTKDHLIRKKEDVSESVGASGQRP
           220       230       240       250       260       270   

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB7 VYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDK
       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
XP_016 VFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEAFQNQKGAIENLLAKLLEK
           280       290       300       310       320       330   

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB7 HATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQE
       .  .. .. .:.. :..:....:::. ..:.::. ...:.::.:. :... ..::. .: 
XP_016 KNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQM
           340       350       360       370       380       390   

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
       .: .:.  .: .... .:.. :..::. : ..:::: ::.:: :::.. ::   :::   
XP_016 KLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLITFQLRHILKARCDPVPAA
           400       410       420       430       440       450   

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pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
       .: ..:. : . :.:..  .:..: :    :: . .  . ..::      ..:: ..   
XP_016 NGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTPNVVVGQVPPGTNHISKTPGQINLAQ
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pF1KB7 SGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAEPHVSGVKRSRSGEGEVSGLMRKVPRVSLERLDLD
                                                                   
XP_016 LRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRMQQPPAPVPTTTTTTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQ
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>>NP_148980 (OMIM: 188550,605769) E3 ubiquitin-protein l  (1110 aa)
 initn: 830 init1: 562 opt: 1172  Z-score: 742.4  bits: 148.8 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1177; 32.0% identity (60.5% similar) in 744 aa overlap (5-683:68-803)

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                                     :::.:..: .:.: . . : : :::   . 
NP_148 LTAVLVEEEEEEGGRAGAEGGAAGPDDGGVAAASSGSAQAASSPAASVGTGVAGGAVSTP
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pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
NP_148 APAPASAPAPGPSAGPPPGPPAS---LLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
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pF1KB7 GPAAPAAANSSGDGGAAGDGT---VVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDA
        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
NP_148 -PEPERQLSVPIPGGSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDNYFVKDTSEAPSSSDEKS
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pF1KB7 NQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGPAKSRDGERT
       .: :::::::: :...::::.: ::.::.:::::::.:::: .:.   .. . . .:.: 
NP_148 EQVCTSCEDNASAVGFCVECGEWLCKTCIEAHQRVKFTKDHLIRKKEDVSESVGASGQRP
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pF1KB7 VYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDK
       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
NP_148 VFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEAFQNQKGAIENLLAKLLEK
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pF1KB7 HATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQE
       .  .. .. .:.. :..:....:::. ..:.::. ...:.::.:. :... ..::. .: 
NP_148 KNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQM
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pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
       .: .:.  .: .... .:.. :..::. : ..:::: ::.:: :::.. ::   :::   
NP_148 KLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLITFQLRHILKARCDPVPAA
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pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
       .: ..:. : . :.:..  .:..: :    :: . .  . ..::      ..:: ..   
NP_148 NGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTPNVVVGQVPPGTNHISKTPGQINLAQ
           460       470       480       490       500       510   

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pF1KB7 ---SGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAE-PHVSGVKRSRSGEGEVSGLMRKVPRV----
          .  .: . .:.   . .       :  : .. . ...  ..  . :... ::.    
NP_148 LRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRMQQPPAPVPTTTTTTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQ
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pF1KB7 SLERLDLDLTADSQPPVFKV------FPG---STTEDYNLIVIERGAAAAATGQPGTAPA
       ...: ...  :  :   ...      .::    .  .:...  .     .  :. :  :.
NP_148 TMQRGNMNCGA-FQAHQMRLAQNAARIPGIPRHSGPQYSMMQPHLQRQHSNPGHAGPFPV
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pF1KB7 GT-------PGAPPLAGMAIVKEEETEAAIGAP---PTATEGPETKPVLMALA----EGP
        .       : .:  : :: ...  :  .. :    :..:. ::. : :  .     :  
NP_148 VSVHNTTINPTSPTTATMANANRGPTSPSVTAIELIPSVTN-PENLPSLPDIPPIQLEDA
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pF1KB7 GAEG-----PRLASPSGSTSSGLEVVAPE-GTSAPGGGPGTLDDSATICR--VCQKPGDL
       :. .      :  : :    .   .. :  : :: . : . :..: :  :    .. :. 
NP_148 GSSSLDNLLSRYISGSHLPPQPTSTMNPSPGPSALSPGSSGLSNSHTPVRPPSTSSTGSR
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pF1KB7 VMCN-------QCEFCFHLDCHLPALQDVPG-EEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADS
         :.       .  . :. : .. . :. :: :.  ::.   . . : :::  :      
NP_148 GSCGSSGRTAEKTSLSFKSD-QVKVKQE-PGTEDEICSFSGGVKQEKTEDGRRSACMLSS
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pF1KB7 TGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQE
                                                                   
NP_148 PESSLTPPLSTNLHLESELDALASLENHVKIEPADMNESCKQSGLSSLVNGKSPIRSLMH
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>--
 initn: 384 init1: 282 opt: 396  Z-score: 259.5  bits: 59.4 E(85289): 1e-07
Smith-Waterman score: 396; 32.5% identity (61.6% similar) in 203 aa overlap (612-806:871-1070)

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pF1KB7 AEGPGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDD---SATICRVCQKPGDLV
                                     ::  :: :.  :   .   : :::. :::.
NP_148 EPADMNESCKQSGLSSLVNGKSPIRSLMHRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCAVCQNGGDLL
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pF1KB7 MCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADSTGVVAKLSP
        :..:   ::: ::.:.: . :. .: :..:. .   . :    .:. . .  ..  :::
NP_148 CCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKKGKTAQGLSP
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pF1KB7 ANQRKCERVLLALFCHEPC----RPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPP
       ..::::::.:: :.:::      .:.     .    . .:   .::. .. .::.: :  
NP_148 VDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPASIPNYYKIIKKP---MDLSTVKKKLQKKHSQH
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pF1KB7 YSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKADV-QSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPP
       :. :..:. ::  .::. ....:  ..: :.  ..  .:: ...: ..:  :.       
NP_148 YQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEADSEVAQAGKAVALYFEDKLTEIYSDRTFAPLPEFEQ
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pF1KB7 PMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP           
                                        
NP_148 EEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKSDERPVHIK
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>>NP_056990 (OMIM: 188550,605769) E3 ubiquitin-protein l  (1127 aa)
 initn: 916 init1: 562 opt: 1172  Z-score: 742.4  bits: 148.8 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1177; 32.0% identity (60.5% similar) in 744 aa overlap (5-683:68-803)

                                         10        20        30    
pF1KB7                           MAASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKRST
                                     :::.:..: .:.: . . : : :::   . 
NP_056 LTAVLVEEEEEEGGRAGAEGGAAGPDDGGVAAASSGSAQAASSPAASVGTGVAGGAVSTP
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           40        50        60        70          80        90  
pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
NP_056 APAPASAPAPGPSAGPPPGPPAS---LLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
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pF1KB7 GPAAPAAANSSGDGGAAGDGT---VVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDA
        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
NP_056 -PEPERQLSVPIPGGSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDNYFVKDTSEAPSSSDEKS
           160       170       180       190       200       210   

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pF1KB7 NQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGPAKSRDGERT
       .: :::::::: :...::::.: ::.::.:::::::.:::: .:.   .. . . .:.: 
NP_056 EQVCTSCEDNASAVGFCVECGEWLCKTCIEAHQRVKFTKDHLIRKKEDVSESVGASGQRP
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KB7 VYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDK
       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
NP_056 VFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEAFQNQKGAIENLLAKLLEK
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pF1KB7 HATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQE
       .  .. .. .:.. :..:....:::. ..:.::. ...:.::.:. :... ..::. .: 
NP_056 KNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQM
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pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
       .: .:.  .: .... .:.. :..::. : ..:::: ::.:: :::.. ::   :::   
NP_056 KLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLITFQLRHILKARCDPVPAA
           400       410       420       430       440       450   

         390       400       410          420             430      
pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
       .: ..:. : . :.:..  .:..: :    :: . .  . ..::      ..:: ..   
NP_056 NGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTPNVVVGQVPPGTNHISKTPGQINLAQ
           460       470       480       490       500       510   

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pF1KB7 ---SGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAE-PHVSGVKRSRSGEGEVSGLMRKVPRV----
          .  .: . .:.   . .       :  : .. . ...  ..  . :... ::.    
NP_056 LRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRMQQPPAPVPTTTTTTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQ
           520       530       540       550       560       570   

      490       500             510          520       530         
pF1KB7 SLERLDLDLTADSQPPVFKV------FPG---STTEDYNLIVIERGAAAAATGQPGTAPA
       ...: ...  :  :   ...      .::    .  .:...  .     .  :. :  :.
NP_056 TMQRGNMNCGA-FQAHQMRLAQNAARIPGIPRHSGPQYSMMQPHLQRQHSNPGHAGPFPV
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pF1KB7 GT-------PGAPPLAGMAIVKEEETEAAIGAP---PTATEGPETKPVLMALA----EGP
        .       : .:  : :: ...  :  .. :    :..:. ::. : :  .     :  
NP_056 VSVHNTTINPTSPTTATMANANRGPTSPSVTAIELIPSVTN-PENLPSLPDIPPIQLEDA
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pF1KB7 GAEG-----PRLASPSGSTSSGLEVVAPE-GTSAPGGGPGTLDDSATICR--VCQKPGDL
       :. .      :  : :    .   .. :  : :: . : . :..: :  :    .. :. 
NP_056 GSSSLDNLLSRYISGSHLPPQPTSTMNPSPGPSALSPGSSGLSNSHTPVRPPSTSSTGSR
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pF1KB7 VMCN-------QCEFCFHLDCHLPALQDVPG-EEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADS
         :.       .  . :. : .. . :. :: :.  ::.   . . : :::  :      
NP_056 GSCGSSGRTAEKTSLSFKSD-QVKVKQE-PGTEDEICSFSGGVKQEKTEDGRRSACMLSS
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pF1KB7 TGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPCRPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQE
                                                                   
NP_056 PESSLTPPLSTNLHLESELDALASLENHVKIEPADMNESCKQSGLSSLVNGKSPIRSLMH
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>--
 initn: 383 init1: 282 opt: 361  Z-score: 237.7  bits: 55.4 E(85289): 1.7e-06
Smith-Waterman score: 368; 32.3% identity (57.3% similar) in 220 aa overlap (612-806:871-1087)

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pF1KB7 AEGPGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDD---SATICRVCQKPGDLV
                                     ::  :: :.  :   .   : :::. :::.
NP_056 EPADMNESCKQSGLSSLVNGKSPIRSLMHRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCAVCQNGGDLL
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pF1KB7 MCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADSTGVVAKLSP
        :..:   ::: ::.:.: . :. .: :..:. .   . :    .:. . .  ..  :::
NP_056 CCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKKGKTAQGLSP
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pF1KB7 ANQRKCERVLLALFCHEPC----RPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPP
       ..::::::.:: :.:::      .:.     .    . .:   .::. .. .::.: :  
NP_056 VDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPASIPNYYKIIKKP---MDLSTVKKKLQKKHSQH
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pF1KB7 YSSPQEFAQDVGRMFK---QFN---KLTEDKADVQSI----------IG--LQRFFETRM
       :. :..:. ::  .::   .::   :...  ::.: :           :  .  .:: ..
NP_056 YQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEMMKVVQVYADTQEINLKADSEVAQAGKAVALYFEDKL
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pF1KB7 NEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP           
       .: ..:  :.                                        
NP_056 TEIYSDRTFAPLPEFEQEEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKSDERPVHIK
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>>XP_005270994 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 ubiqu  (1134 aa)
 initn: 830 init1: 562 opt: 1172  Z-score: 742.3  bits: 148.8 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1173; 40.3% identity (70.9% similar) in 447 aa overlap (5-433:68-510)

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                                     :::.:..: .:.: . . : : :::   . 
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pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
XP_005 APAPASAPAPGPSAGPPPGPPAS---LLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
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pF1KB7 GPAAPAAANSSGDGGAAGDGT---VVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDA
        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
XP_005 -PEPERQLSVPIPGGSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDNYFVKDTSEAPSSSDEKS
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pF1KB7 NQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGPAKSRDGERT
       .: :::::::: :...::::.: ::.::.:::::::.:::: .:.   .. . . .:.: 
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pF1KB7 VYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDK
       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
XP_005 VFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEAFQNQKGAIENLLAKLLEK
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pF1KB7 HATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQE
       .  .. .. .:.. :..:....:::. ..:.::. ...:.::.:. :... ..::. .: 
XP_005 KNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQM
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pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
       .: .:.  .: .... .:.. :..::. : ..:::: ::.:: :::.. ::   :::   
XP_005 KLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLITFQLRHILKARCDPVPAA
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pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
       .: ..:. : . :.:..  .:..: :    :: . .  . ..::      ..:: ..   
XP_005 NGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTPNVVVGQVPPGTNHISKTPGQINLAQ
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pF1KB7 SGSSQPMEVQEGYGFGSGDDPYSSAEPHVSGVKRSRSGEGEVSGLMRKVPRVSLERLDLD
                                                                   
XP_005 LRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRMQQPPAPVPTTTTTTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQ
           520       530       540       550       560       570   

>--
 initn: 425 init1: 282 opt: 396  Z-score: 259.4  bits: 59.4 E(85289): 1e-07
Smith-Waterman score: 396; 32.5% identity (61.6% similar) in 203 aa overlap (612-806:895-1094)

             590       600       610       620          630        
pF1KB7 AEGPGAEGPRLASPSGSTSSGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDD---SATICRVCQKPGDLV
                                     ::  :: :.  :   .   : :::. :::.
XP_005 EPADMNESCKQSGLSSLVNGKSPIRSLMHRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCAVCQNGGDLL
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pF1KB7 MCNQCEFCFHLDCHLPALQDVPGEEWSCSLCHVLPDLKEEDGSLSLDGADSTGVVAKLSP
        :..:   ::: ::.:.: . :. .: :..:. .   . :    .:. . .  ..  :::
XP_005 CCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKKGKTAQGLSP
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pF1KB7 ANQRKCERVLLALFCHEPC----RPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPP
       ..::::::.:: :.:::      .:.     .    . .:   .::. .. .::.: :  
XP_005 VDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPASIPNYYKIIKKP---MDLSTVKKKLQKKHSQH
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pF1KB7 YSSPQEFAQDVGRMFKQFNKLTEDKADV-QSIIGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPP
       :. :..:. ::  .::. ....:  ..: :.  ..  .:: ...: ..:  :.       
XP_005 YQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEADSEVAQAGKAVALYFEDKLTEIYSDRTFAPLPEFEQ
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pF1KB7 PMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP           
                                        
XP_005 EEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKSDERPVHIK
            1110      1120      1130    

>>XP_011539870 (OMIM: 188550,605769) PREDICTED: E3 ubiqu  (1150 aa)
 initn: 916 init1: 562 opt: 1172  Z-score: 742.3  bits: 148.8 E(85289): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 1173; 40.3% identity (70.9% similar) in 447 aa overlap (5-433:68-510)

                                         10        20        30    
pF1KB7                           MAASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKRST
                                     :::.:..: .:.: . . : : :::   . 
XP_011 LTAVLVEEEEEEGGRAGAEGGAAGPDDGGVAAASSGSAQAASSPAASVGTGVAGGAVSTP
        40        50        60        70        80        90       

           40        50        60        70          80        90  
pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
XP_011 APAPASAPAPGPSAGPPPGPPAS---LLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
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            100       110          120       130       140         
pF1KB7 GPAAPAAANSSGDGGAAGDGT---VVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDA
        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
XP_011 -PEPERQLSVPIPGGSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDNYFVKDTSEAPSSSDEKS
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pF1KB7 NQCCTSCEDNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGPAKSRDGERT
       .: :::::::: :...::::.: ::.::.:::::::.:::: .:.   .. . . .:.: 
XP_011 EQVCTSCEDNASAVGFCVECGEWLCKTCIEAHQRVKFTKDHLIRKKEDVSESVGASGQRP
           220       230       240       250       260       270   

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pF1KB7 VYCNVHKHEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDK
       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
XP_011 VFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEAFQNQKGAIENLLAKLLEK
           280       290       300       310       320       330   

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pF1KB7 HATLQKSTKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQE
       .  .. .. .:.. :..:....:::. ..:.::. ...:.::.:. :... ..::. .: 
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pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
       .: .:.  .: .... .:.. :..::. : ..:::: ::.:: :::.. ::   :::   
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pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
       .: ..:. : . :.:..  .:..: :    :: . .  . ..::      ..:: ..   
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       ..::::::.:: :.:::      .:.     .    . .:   .::. .. .::.: :  
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       :. :..:. ::  .::   .::   :...  ::.: :           :  .  .:: ..
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pF1KB7 NEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP           
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pF1KB7 APSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCRERL--RPEREPRLLPCLHSACSACL
       ::. :.. . . .:. : :  :    ::. :.::.. :  : : ::.::::::: :  ::
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        :      .    ::. ::     :. ::::.:.: . :.:.:::..:..   ... . .
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       :.: :::.: : ::::.:: ::::::::  ::.:.:::::.: .::.  . .:. .: .:
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XP_005 KNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINKKGKSLLQQLENVTKERQM
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pF1KB7 RLERQHWTMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVDPVEP-
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pF1KB7 HGEMKFQWDLNAWTKSAEAFGKIVAER---PGTNSTGPAPMAPP------RAPGPLSKQG
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>--
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pF1KB7 ANQRKCERVLLALFCHEPC----RPLHQLATDSTFSLDQPGGTLDLTLIRARLQEKLSPP
       ..::::::.:: :.:::      .:.     .    . .:   .::. .. .::.: :  
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pF1KB7 YSSPQEFAQDVGRMFK---QFN---KLTEDKADVQSI----------IG--LQRFFETRM
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XP_005 YQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEMMKVVQVYADTQEINLKADSEVAQAGKAVALYFEDKL
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pF1KB7 NEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP           
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>>NP_056989 (OMIM: 188550,603406) transcription intermed  (1050 aa)
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NP_056 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGP------------SAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAA
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pF1KB7 ALELLEHCGVCRERLRPEREPRLLPCLHSACSACLG-------------------PAAPA
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NP_056 RLNLLDTCAVCHQNIQS-RAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPA
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pF1KB7 AANS-SGDGGAAGDGTVVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDANQCCTSCE
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NP_056 PGSPVSGSSPFATQVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCE
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pF1KB7 DNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGP-AKSRDGERTVYCNVHK
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NP_056 DNAEANGFCVECVEWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHK
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pF1KB7 HEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKS
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        ..... : .:.. ::.:. :.:.::. .: :.::.:..:... ..... .. .: .:. 
NP_056 GNQIQNRIIEVNQNQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQ
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pF1KB7 TMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVD--PVEPHGEMKF
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NP_056 EVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVT-NNTIQF
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pF1KB7 QWDLNAWTKSAEAFGKIVAERPGTNSTGPAPMAPPRAP--GPLSKQGSGSSQPMEVQEGY
       . : . :...   .:..: :   ..     :. : . :     :.  :: :. .  .   
NP_056 HCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQ-----PQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPT
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        .. ..   .  . .: . ... . .    ::    ::..    . ... .. :: .  :
NP_056 QISLAQLRLQHMQQQVMAQRQQVQRRPAPVGLPN--PRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINF
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pF1KB7 PGSTTEDYNLIVIERGAAAA-ATGQPGTAPAGTPGAPPLAGMA--IVKEEETEAAIGAPP
        . . .  . ..  .        .:     :  :.   .: .:   .:. .  .. :.: 
NP_056 QNHSPKPNGPVLPPHPQQLRYPPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPS
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       : :..  . :   ... . : .:  ..::  . ::      : : :    .   .: :.:
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       :    . .:  ..   .: .   .   . :  .   ::     ..  : : ..  ..: :
NP_056 IMLDNIVRKDTNIDH-GQPRPPSNRTVQSPNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSAS-S
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       . .  :.:  .:  ::.  . ..: ....  :: : ..:  .    . : :         
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NP_056 EESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRSDAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWL
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>--
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NP_056 PQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRSDAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQ
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        :    :    .:. .   : :::. :.:. :..:   :::.::.:.: . :. :: :..
NP_056 KSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTF
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       :. :  :... . :. : . .   . :.: ::.: ..:::::.:: :.:::       :.
NP_056 CRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLV-KLTPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPV
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          . :    . .:   .::. :. ::::  :  ::.:..:. :   .:..  ...:  .
NP_056 PLTVPDYYKIIKNP---MDLSTIKKRLQEDYSM-YSKPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDS
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pF1KB7 DVQSI-IGLQRFFETRMNEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP    
       .: .  : :. .::  ... . . .:                                  
NP_056 EVANAGIKLENYFEELLKNLYPEKRFPKPEFRNESEDNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIE
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              :.::.:::..::::.:            :.:::.   : .  . .:  :: : 
NP_003 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGP------------SAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAA
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        :.::. :.::.. ..  : :.::::::: :. ::                    : .::
NP_003 RLNLLDTCAVCHQNIQS-RAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPA
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pF1KB7 AANS-SGDGGAAGDGTVVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDANQCCTSCE
        ..  ::..  : .  :. ::::.:.:  . :..:.:..:.    .. .. .:: :::::
NP_003 PGSPVSGSSPFATQVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCE
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pF1KB7 DNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGP-AKSRDGERTVYCNVHK
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NP_003 DNAEANGFCVECVEWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHK
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pF1KB7 HEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKS
       .: : :.::.:: ::::::::  ::.:.:::.:.: .::. .. .:. .: .:   .. .
NP_003 KEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFT
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pF1KB7 TKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHW
        ..... : .:.. ::.:. :.:.::. .: :.::.:..:... ..... .. .: .:. 
NP_003 GNQIQNRIIEVNQNQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQ
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pF1KB7 TMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVD--PVEPHGEMKF
        .. ..:. ::...:..::. : ..:::: ::.:: ..:.. :.   :  ::  .. ..:
NP_003 EVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVT-NNTIQF
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       . : . :...   .:..: :    .:           ::  :. ..              
NP_003 HCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLA
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NP_003 LAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYDGKAFGSPMIDLSSPVGGSYN
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NP_003 LPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQSPNSSVPSPGLAGPVTMTSVH
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          .  . ...:.         :..... .  ::.:           ::           
NP_003 PPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPIRIKQENSGPPENYDFPVVIV
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                  .:. ::      : . : :..:   :.  .. .. :  ::  .:...  
NP_003 KQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRSDAPDSTGDQPGLHQDNSSNG
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pF1KB7 ----------------------------CRVCQKPGDLVMCNQCEFCFHLDCHLPALQDV
                                   : :::. :.:. :..:   :::.::.:.: . 
NP_003 KSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNF
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pF1KB7 PGEEWSCSLCHVL--PDLKEE-DG-SLSLDGADSTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHE
       :. :: :..:. :  :... . :. : . .   . :.: ::.: ..:::::.:: :    
NP_003 PSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLV-KLTPIDKRKCERLLLFLYCHE
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       : : :   . :.       .. .    ...:  ...:: :..  ...:..:..:..    
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