Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5093
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5093, 951 aa
1>>>pF1KB5093 951 - 951 aa - 951 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5967+/-0.00121; mu= 21.6227+/- 0.072
mean_var=146.2194+/-34.855, 0's: 0 Z-trim(105.7): 224 B-trim: 512 in 1/48
Lambda= 0.106065
statistics sampled from 8305 (8562) to 8305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 6343 984.0 0
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 1748 280.8 8.2e-75
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 1676 269.8 1.8e-71
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 1558 251.7 4.7e-66
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 1171 192.5 3e-48
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 1041 172.6 3e-42
CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 969 161.6 6e-39
CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 685 118.1 6.9e-26
CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 682 117.5 8.7e-26
CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 651 112.8 2.4e-24
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 592 103.7 1.1e-21
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 592 103.7 1.2e-21
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 533 94.7 6e-19
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 533 94.7 6.1e-19
CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 531 94.4 8.1e-19
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 514 91.7 4.4e-18
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 514 91.7 4.4e-18
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 481 86.7 1.5e-16
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 459 83.3 1.5e-15
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 423 77.5 5.1e-14
CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 426 78.4 5.8e-14
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 420 77.2 8.3e-14
CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 420 77.5 1.1e-13
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 419 77.4 1.2e-13
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 416 76.7 1.5e-13
CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 416 76.9 1.6e-13
CCDS3846.1 TLR3 gene_id:7098|Hs108|chr4 ( 904) 417 77.1 1.7e-13
CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1 ( 713) 407 75.5 4.2e-13
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 401 74.5 7.5e-13
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 399 74.1 8.1e-13
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 395 73.6 1.4e-12
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 396 74.0 1.7e-12
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 393 73.3 1.9e-12
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 389 72.6 2.6e-12
CCDS14721.1 BGN gene_id:633|Hs108|chrX ( 368) 385 71.7 2.9e-12
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 387 72.3 3e-12
CCDS55124.1 LRRD1 gene_id:401387|Hs108|chr7 ( 860) 382 71.8 6.7e-12
CCDS54226.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 510) 376 70.5 9.2e-12
CCDS12300.1 PODNL1 gene_id:79883|Hs108|chr19 ( 512) 376 70.5 9.3e-12
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 375 71.0 2e-11
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 375 71.0 2e-11
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 375 71.0 2e-11
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 371 70.4 3e-11
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 368 69.7 3.3e-11
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 368 69.8 3.4e-11
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 364 69.2 5.7e-11
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 363 69.1 6.3e-11
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1495) 361 68.9 8.6e-11
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1537) 361 68.9 8.7e-11
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 360 68.7 9.6e-11
>>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa)
initn: 6343 init1: 6343 opt: 6343 Z-score: 5256.4 bits: 984.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6343; 100.0% identity (100.0% similar) in 951 aa overlap (1-951:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLNTEDNSLQDHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KB5 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
910 920 930 940 950
>>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (907 aa)
initn: 2687 init1: 1688 opt: 1748 Z-score: 1456.6 bits: 280.8 E(32554): 8.2e-75
Smith-Waterman score: 2731; 50.9% identity (76.0% similar) in 845 aa overlap (5-832:10-854)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRR----VDCSGKGLTAV
:.: .: :. ::. ::. : . : :. : : :::: ::. .
CCDS90 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
: .::.::. ::.:::::.:: . . .. :::::.:::: :..: :..:: ::::
CCDS90 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
CCDS90 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
. .: .:::.::::::: :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
CCDS90 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
:::::: ::: ::..: .:::::::::.: ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
CCDS90 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
:..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:.. :..::::
CCDS90 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
:: ..:::::. :. :..:.:..:.::.:: ::: :.::: :.:. : : :: ::.:
CCDS90 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
: . .::.: : :.::: ::.::..:::.:: :. .....: .:. . .:::::::
CCDS90 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
:: :.. ..... ::: .: .. : . : .. . : . :.. .:
CCDS90 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
:.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..:: : :: :.: : . ::.::.:.
CCDS90 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
. :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS90 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
::..:.: : . .....: :: : : . . ::. ..:.:::::::.: ::
CCDS90 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: . . ::.::.: :.:::::. :
CCDS90 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810
pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
::::.::. ::. ::::..: . :. ::::::::.::..:::.:::: :....
CCDS90 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
:... .::.:
CCDS90 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
850 860 870 880 890 900
>>CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (967 aa)
initn: 2229 init1: 1613 opt: 1676 Z-score: 1396.7 bits: 269.8 E(32554): 1.8e-71
Smith-Waterman score: 2647; 47.5% identity (72.3% similar) in 918 aa overlap (1-892:1-907)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPGPLGL----LC--FLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR---RVDCSGKGLTAV
::.: :: :: . : :.: : .: : ::: :. : .::: ::.::
CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDGIMLSADCSELGLSAV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
: :. .: ::.::::.:.: :... :::::.:.:: :: : .:.::: ::.:
CCDS30 PGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
:::::: .:.::. : .::::::::: :. ::: ::::: .:::::::::.:::.::.
CCDS30 LQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
:.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.::::::::::.:. :. : :.:: ::::::
CCDS30 ALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
::::.: ::: ::..: :.:::::.:.:..::. :: :::::.:::.::::..::: ::
CCDS30 LNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
:. : ::.: . :: .:.::.: ::. :: :::: . : .:...::. ::.:.::
CCDS30 FQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
.:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..: ::. : ::. :::: : :. :: .::.:
CCDS30 HNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFST
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
: ...::.. :.::..: ::.:: .::: ::. :..:.. .: .:: : ::::::::
CCDS30 LHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCC
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB5 AFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-Q
. : :. .. ..:: :.:. . : .. : :: :. . .
CCDS30 PYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPH
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 IIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLF
..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :.... : ::.::.::. . :: :.
CCDS30 PSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFV
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 IGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLL
.: :. .: . :: :.:. .::...:.:.:.: :::: ::...:::::..::....::
CCDS30 VGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 MLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF
::.:. :.:.. . ::: : . :...: . : .:. .:: :::.:::::::.
CCDS30 TLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPY
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 --PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIF
: :. .:::::.::..::. ::..: : ::::.: . :. . .:..:::::::
CCDS30 APPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIF
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 TNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKL
.. ...:::::.::: .. . ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..:
CCDS30 ADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL--
790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 LKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKH
::. ..:. . . .: ::.. .: . : . : :. .: .
CCDS30 --RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG---
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KB5 LIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQS
..... :.... :::.:
CCDS30 -LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGG
900 910 920 930 940
>>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (915 aa)
initn: 2172 init1: 1556 opt: 1558 Z-score: 1299.4 bits: 251.7 E(32554): 4.7e-66
Smith-Waterman score: 2515; 47.8% identity (73.8% similar) in 855 aa overlap (55-892:12-855)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 APPLCAAPCSCDGDRRVDCSGKGLTAVPEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLE
.: . .: :.::::.:.: :... :::
CCDS14 MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLE
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 ELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLTLQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSV
::.:.:: :: : .:.::: ::.: :::::: .:.::. : .::::::::: :. :
CCDS14 ELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLV
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 PEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLV
:: ::::: .:::::::::.:::.::. :.:::.:::.:::::.:: :::.:: ::.:::
CCDS14 PERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLV
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 VLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIP
:::::::.:. :. : :.:: ::::::::::.: ::: ::..: :.:::::.:.:..::
CCDS14 VLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIP
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 DGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESL
. :: :::::.:::.::::..::: :::. : ::.: . :: .:.::.: ::. :: :
CCDS14 EKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEIL
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 TLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGT
::: . : .:...::. ::.:.::.:.:..:::.. :. ::::.::.:.:..: :
CCDS14 TLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADT
290 300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 FQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGN
:. : ::. :::: : :. :: .::.:: ...::.. :.::..: ::.:: .::: ::
CCDS14 FSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGN
350 360 370 380 390 400
450 460 470 480 490
pF1KB5 FKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSY----ANLNTEDNSLQDHSVA-----
. :..:.. .: .:: : :::::::: . : :. .. ..:: :.:. .
CCDS14 LALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLG
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 ----QEKGTADAANVTSTLENEEHS-QIIIHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFL
: .. : :: :. . . ..:.:. : :::::::. :: :::.:: : :
CCDS14 LLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVL
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600
pF1KB5 VALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFG
.... : ::.::.::. . :: :. .: :. .: . :: :.:. .::...:.:.:.:
CCDS14 LSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 IWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLA
:::: ::...:::::..::....:: ::.:. :.:.. . ::: : . :...:
CCDS14 ARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGC
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 FLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF--PTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTK
. : .:. .:: :::.:::::::. : :. .:::::.::..::. ::..: : :
CCDS14 LALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIK
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 LYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTL
:::.: . :. . .:..:::::::.. ...:::::.::: .. . ..:: .::: :
CCDS14 LYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLL
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 IFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGM
. .::::::::.::..:::.:..: ::. ..:. . . .: ::.. .:
CCDS14 VVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL----RRLRPRAGDSGPLAYAAAGELEKS---SCDS
770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 YSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRPEGYWSDCGTQSAHSD
. : . : :. .: . ..... :.... :::.:
CCDS14 TQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG----LETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEG
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950
pF1KB5 YADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
CCDS14 NHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
880 890 900 910
>>CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (835 aa)
initn: 2075 init1: 1076 opt: 1171 Z-score: 979.8 bits: 192.5 E(32554): 3e-48
Smith-Waterman score: 2254; 45.0% identity (68.8% similar) in 845 aa overlap (5-832:10-782)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRR----VDCSGKGLTAV
:.: .: :. ::. ::. : . : :. : : :::: ::. .
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
: .::.::. ::.:::::.:: . . .. :::::.:::: :..: :..:: ::::
CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
::::::. ::.::...: .::::
CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSL-------------------------------------
130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
:::::.:.::...::::: .:::::
CCDS61 -----------------------------------HLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
:::::: ::: ::..: .:::::::::.: ::. :: ::: : :::.::::..::: ::
CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
:..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:.. :..::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
:: ..:::::. :. :..:.:..:.::.:: ::: :.::: :.:. : : :: ::.:
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
: . .::.: : :.::: ::.::..:::.:: :. .....: .:. . .:::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520
pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
:: :.. ..... ::: .: .. : . : .. . : . :.. .:
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
:.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..:: : :: :.: : . ::.::.:.
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
470 480 490 500 510 520
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
. :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
::..:.: : . .....: :: : : . . ::. ..:.:::::::.: ::
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
590 600 610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: . . ::.::.: :.:::::. :
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
650 660 670 680 690 700
770 780 790 800 810
pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
::::.::. ::. ::::..: . :. ::::::::.::..:::.:::: :....
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
710 720 730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
:... .::.:
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
770 780 790 800 810 820
>>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (883 aa)
initn: 1941 init1: 1013 opt: 1041 Z-score: 872.0 bits: 172.6 E(32554): 3e-42
Smith-Waterman score: 2575; 49.0% identity (73.8% similar) in 845 aa overlap (5-832:10-830)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDRR----VDCSGKGLTAV
:.: .: :. ::. ::. : . : :. : : :::: ::. .
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT
: .::.::. ::.:::::.:: . . .. :::::.:::: :..: :..:: ::::
CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH
::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::.
CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD
. .: .:::.::::::: :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .:::::
CCDS61 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA
:::::: ::: ::..: .:::: :.::::..::: ::
CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRSA
250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS
:..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:.. :..::::
CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT
:: ..:::::. :. :..:.:..:.::.:: ::: :.::: :.:. : : :: ::.:
CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC
: . .::.: : :.::: ::.::..:::.:: :. .....: .:. . .:::::::
CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB5 AFWGCDSYANLNTE----DNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH---
:: :.. ..... ::: .: .. : . : .. . : . :.. .:
CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS
:.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..:: : :: :.: : . ::.::.:.
CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV
. :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::..
CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET
::..:.: : . .....: :: : : . . ::. ..:.:::::::.: ::
CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC
..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: . . ::.::.: :.:::::. :
CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810
pF1KB5 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV--
::::.::. ::. ::::..: . :. ::::::::.::..:::.:::: :....
CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV
760 770 780 790 800 810
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS
:... .::.:
CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
820 830 840 850 860 870
>>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (828 aa)
initn: 1583 init1: 967 opt: 969 Z-score: 812.8 bits: 161.6 E(32554): 6e-39
Smith-Waterman score: 1926; 42.9% identity (71.1% similar) in 750 aa overlap (160-892:30-768)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKI
:. :.:::. . .: :. : :. :..
CCDS30 MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHL
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPS
: :: ::..: :: .: :.::.. .. . . : .:..::::::.: ::: ::..:
CCDS30 SHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGR
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMV
:.:::::.:.:..::. :: :::::.:::.::::..::: :::. : ::.: . :: .
CCDS30 LQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDI
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNGCHALEE
:.::.: ::. :: :::: . : .:...::. ::.:.::.:.:..:::.. :. :::
CCDS30 QEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEE
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSFNELTSFP
:.::.:.:..: ::. : ::. :::: : :. :: .::.:: ...::.. :.::..:
CCDS30 IGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLP
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSY----ANLNTE
::.:: .::: ::. :..:.. .: .:: : :::::::: . : :. .. ..:
CCDS30 LAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQWEAE
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530
pF1KB5 DNSLQDHSVA---------QEKGTADAANVTSTLENEEHS-QIIIHCTPSTGAFKPCEYL
: :.:. . : .. : :: :. . . ..:.:. : :::::::
CCDS30 DLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEMEDSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYL
360 370 380 390 400 410
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASC-TSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGIL
. :: :::.:: : :.... : ::.::.::. . :: :. .: :. .: . :: :.:
CCDS30 FESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLL
420 430 440 450 460 470
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 TFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNG
. .::...:.:.:.: :::: ::...:::::..::....:: ::.:. :.:.. . :
CCDS30 ASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYG
480 490 500 510 520 530
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 KSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPF--PTGETPSLGFTVTLVL
:: : . :...: . : .:. .:: :::.:::::::. : :. .:::::.::.
CCDS30 KSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVM
540 550 560 570 580 590
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 LNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLI
.::. ::..: : ::::.: . :. . .:..:::::::.. ...:::::.::: ..
CCDS30 MNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASML
600 610 620 630 640 650
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 TAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISS
. ..:: .::: :. .::::::::.::..:::.:..: ::. ..:. . .
CCDS30 GLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDL----RRLRPRAGDSGPLAYA
660 670 680 690 700 710
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 QGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQRP
.: ::.. .: . : . : :. .: . ..... :.... :::.:
CCDS30 AAGELEKS---SCDSTQALVAFSDVDLILEASEAGRPPG----LETYGFPSVTLISCQQP
720 730 740 750 760
900 910 920 930 940 950
pF1KB5 EGYWSDCGTQSAHSDYADEEDSFVSDSSDQVQACGRACFYQSRGFPLVRYAYNLPRVKD
CCDS30 GAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV
770 780 790 800 810 820
>>CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 (764 aa)
initn: 730 init1: 384 opt: 685 Z-score: 578.3 bits: 118.1 E(32554): 6.9e-26
Smith-Waterman score: 685; 25.8% identity (60.7% similar) in 670 aa overlap (165-811:44-688)
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 RLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVHPLSNLPTLQALTLALNKISSIPD
. ..: : :. :.: : ... .::.
CCDS98 DLPRDLGGMGCSSPPCECHQEEDFRVTCKDIQRIPSLP----PSTQTLKLIETHLRTIPS
20 30 40 50 60
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 FAFTNLSSLVVLHLHNN-KIRSLSQHCFDGLDNLETLDL-NYNNLGEF-PQAIKALPSLK
::.:: .. ... . ...: .: : .:... ... : :: . :.:.: :: ::
CCDS98 HAFSNLPNISRIYVSIDVTLQQLESHSFYNLSKVTHIEIRNTRNLTYIDPDALKELPLLK
70 80 90 100 110 120
260 270 280 290 300
pF1KB5 ELGFHSNSISVIPD-GAFDGNPLLRTIHLYDNP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIR----G
::. .......:: .. .. ... ::: .. . .::..: . ..:... :
CCDS98 FLGIFNTGLKMFPDLTKVYSTDIFFILEITDNPYMTSIPVNAFQGLCN-ETLTLKLYNNG
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSI--PNNLCQEQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNG
. :: . ..:: .:... :. .: .. . . . ::.: ... ::: .:
CCDS98 FTSVQGYA-FNGT-KLDAVYLNKNKYLTVIDKDAFGGVYSGPSLLDVSQTSVTALPS-KG
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 CHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSR-NLIHEIHSRAFATLGPITNLDVSF
. :.:. . :: . .:. .:: .: :.: .: . : :: . : .. :.
CCDS98 LEHLKEL-IARNT-WTLKKLP----LSLSFLHLTRADLSYPSHCCAFKNQKKIRGILESL
250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 NELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAFWGCDSYANL
: ....: : : :. :. : . :: . : : . : . :.
CCDS98 MCNES----SMQSLRQRKSVNA--LNSPLHQEYEENLGDSIVGYKEKS-KFQDTHNNAHY
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530
pF1KB5 -----NTEDNSL---QDHSVAQEKGT-ADAANVTSTLENEEHSQIIIHCTPSTGAFKPCE
. ::. . :. . ::. : .. :. .. .... :::.. :.:::
CCDS98 YVFFEEQEDEIIGFGQELKNPQEETLQAFDSHYDYTICGDSEDMV---CTPKSDEFNPCE
360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 YLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGI
..: ..:..:::. :.::. :..:.: ..: .: .... .. ... ::.: .
CCDS98 DIMGYKFLRIVVWFVSLLALLGNVFVLLILLTSHYKLNVPRFLMCNLAFADFCMGMYLLL
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 LTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKN
.. .: . ... . .: :.:: ::..:::..::.:: ... : . :.:: . :.
CCDS98 IASVDLYTHSEYYNHAIDWQTGPGCNTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWYAITFAMRL
470 480 490 500 510 520
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 GKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETP-SLGFTVTLVL
.. .:.. . . ... . . .:: . :. .:::. : ::: .:.. : ..
CCDS98 DRKIRLRHACAIMVGGWVCCFLLALLPLVGISSYAKVSICLPMDT-ETPLALAYIVFVLT
530 540 550 560 570 580
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 LNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMI-KHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPL
:: .::... :.:.: .... . . ..... : :..: ::::. : . :..:.... .
CCDS98 LNIVAFVIVCCCYVKIYITVRNPQYNPGDKDTKIAKRMAVLIFTDFICMAPISFYALSAI
590 600 610 620 630 640
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 ITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSIS
.. :. : . ..:.:: .: :: ::..:. :..:
CCDS98 LNKPLITVSNSKILLVLFYPLNSCANPFLYAIFTKAFQRDVFILLSKFGICKRQAQAYRG
650 660 670 680 690 700
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 SQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKSHSCPALAVASCQR
CCDS98 QRVPPKNSTDIQVQKVTHEMRQGLHNMEDVYELIENSHLTPKKQGQISEEYMQTVL
710 720 730 740 750 760
>>CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (669 aa)
initn: 673 init1: 355 opt: 682 Z-score: 576.4 bits: 117.5 E(32554): 8.7e-26
Smith-Waterman score: 734; 26.8% identity (61.2% similar) in 590 aa overlap (252-815:50-614)
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYD
:: : ... :: :::.: :. :.. .
CCDS18 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ
20 30 40 50 60 70
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 NP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQ
: : . ..: :: :: . :. :. :: : .. ....::
CCDS18 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKAN------NL--------LYINPEAFQNLPN----
80 90 100 110 120
350 360 370 380 390
pF1KB5 EQKMLRTLDLSYNNIRDLPSFNGCHALEEISL--QRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLS-
:. : .: ..:. ::. . :.:... : ..: : .:.. .:.: .: :.::
CCDS18 ----LQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSD
130 140 150 160 170
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 RNLIHEIHSRAF-ATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDF
: ..:. . .: .. ::. ::.: ... :.:. ::..:..:. ....::. . . .
CCDS18 NNNLEELPNDVFHGASGPVI-LDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKL
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500
pF1KB5 VNLRSLSVPYAYQCCAF--WG---------CDSYANLNTEDNSL-----QDHSVAQEKGT
: : :. : .:::: : :.. . : : . . : :.:... .
CCDS18 VALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNK-SILRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNES
240 250 260 270 280 290
510 520 530 540 550
pF1KB5 ADAANVTSTLENEEH---SQII-IHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFN
. . . : . .. .... . :.:. ::.::: ..: ..:. .::: ..:. :
CCDS18 SYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGN
300 310 320 330 340 350
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 LLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGS
..:.. .: .: .... .. ..: .::: ... .: . ... ...: :.::.
CCDS18 IIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGA
360 370 380 390 400 410
620 630 640 650 660 670
pF1KB5 GCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVA
:: .:::..::.:: ... : :.:: . :. . .:.. . ..... : .:
CCDS18 GCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAA
420 430 440 450 460 470
680 690 700 710 720 730
pF1KB5 GCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKED
. ::.: . : .:::. : ....:..:: :::... : ..: .... .
CCDS18 ALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPN
480 490 500 510 520 530
740 750 760 770 780 790
pF1KB5 L-SENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPAC
. : .:.. . :..: ::::. . . :..::... . . :. : . ..: :. .:
CCDS18 IVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSC
540 550 560 570 580 590
800 810 820 830 840 850
pF1KB5 LNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNL
:: ::..:. .:..:. .:
CCDS18 ANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTS
600 610 620 630 640 650
>>CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (695 aa)
initn: 671 init1: 355 opt: 651 Z-score: 550.6 bits: 112.8 E(32554): 2.4e-24
Smith-Waterman score: 748; 27.5% identity (62.0% similar) in 600 aa overlap (252-815:50-640)
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DGLDNLETLDLNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYD
:: : ... :: :::.: :. :.. .
CCDS18 HRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQ
20 30 40 50 60 70
290 300 310 320 330
pF1KB5 NP-LSFVGNSAFHNLSDLHSLVIRGASMV-----QQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIP
: : . ..: :: :: . :. :. . . : :: .:. : ...: :. .:
CCDS18 NDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP---NLQYLLISNTGIKHLP
80 90 100 110 120 130
340 350 360 370 380
pF1KB5 N--NLCQEQKMLRTLDLSYN-NIRDLP--SFNGCHALEEISL--QRNQIYQIKEGTFQGL
. .. . ::.: ::.. : ::. . :: : ..: . : ..: : .:.. .:.:
CCDS18 DVHKIHSLQKVL--LDIQDNINIHTIERNSFVGL-SFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT
140 150 160 170 180 190
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 ISLRILDLS-RNLIHEIHSRAF-ATLGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFK
.: :.:: : ..:. . .: .. ::. ::.: ... :.:. ::..:..:. ....
CCDS18 -QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVI-LDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYN
200 210 220 230 240 250
450 460 470 480 490
pF1KB5 LKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCCAF--WG---------CDSYANLNTEDNSL-----Q
::. . . .: : :. : .:::: : :.. . : : . . :
CCDS18 LKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNK-SILRQEVDYMTQARGQ
260 270 280 290 300 310
500 510 520 530 540
pF1KB5 DHSVAQEKGTADAANVTSTLENEEH---SQII-IHCTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVW
:.:... .. . . : . .. .... . :.:. ::.::: ..: ..:. .:
CCDS18 RSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIW
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 FIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLISVSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFA
:: ..:. :..:.. .: .: .... .. ..: .::: ... .: . ...
CCDS18 FISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYH
380 390 400 410 420 430
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 EFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATVERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAA
...: :.::.:: .:::..::.:: ... : :.:: . :. . .:.. .
CCDS18 NYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVM
440 450 460 470 480 490
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGETPSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYT
..... : .:. ::.: . : .:::. : ....:..:: :::... :
CCDS18 VMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYI
500 510 520 530 540 550
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 KLYCNLEKEDL-SENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFCPVAFFSFAPLITAISISPEIMKSV
..: .... .. : .:.. . :..: ::::. . . :..::... . . :. : .
CCDS18 HIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKIL
560 570 580 590 600 610
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 TLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRVTKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDC
..: :. .: :: ::..:. .:..:. .:
CCDS18 LVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNG
620 630 640 650 660 670
951 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:59:14 2016 done: Thu Nov 3 15:59:15 2016
Total Scan time: 3.770 Total Display time: 0.340
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]