Result of FASTA (omim) for pFN21AB5010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5010, 619 aa
  1>>>pF1KB5010 619 - 619 aa - 619 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8405+/-0.000445; mu= 15.3476+/- 0.028
 mean_var=267.0944+/-54.813, 0's: 0 Z-trim(119.4): 2006  B-trim: 198 in 2/53
 Lambda= 0.078477
 statistics sampled from 31125 (33427) to 31125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time: 10.520

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001166139 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 619) 4438 516.5 1.1e-145
NP_078982 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 i ( 619) 4438 516.5 1.1e-145
NP_001166141 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 619) 4438 516.5 1.1e-145
NP_001166140 (OMIM: 617103) zinc finger protein 66 ( 642) 4438 516.5 1.1e-145
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1325 164.0 1.4e-39
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1325 164.0 1.4e-39
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1325 164.0 1.4e-39
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1325 164.1 1.4e-39
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1325 164.1 1.4e-39
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1325 164.1 1.4e-39
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1325 164.1 1.4e-39
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1325 164.1 1.4e-39
XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39
XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39
XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 1311 162.5 4.2e-39
XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
NP_003416 (OMIM: 194554) zinc finger protein 45 [H ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1311 162.5 4.3e-39
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1304 161.6 6.6e-39
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1304 161.7 7.3e-39
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1304 161.7 7.5e-39
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1304 161.7 7.5e-39
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1304 161.7 7.5e-39
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1304 161.7 7.5e-39
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1297 160.9 1.2e-38
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1279 158.7 4.6e-38
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1279 158.7 4.6e-38
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1279 158.9 5.2e-38
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1279 158.9 5.3e-38
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1279 158.9 5.3e-38
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1279 158.9 5.4e-38


>>NP_001166139 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 is  (619 aa)
 initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438  Z-score: 2736.5  bits: 516.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
              550       560       570       580       590       600

              610         
pF1KB5 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
       :::::::::::::::::::
NP_001 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
              610         

>>NP_078982 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 isofo  (619 aa)
 initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438  Z-score: 2736.5  bits: 516.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_078 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
              550       560       570       580       590       600

              610         
pF1KB5 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
       :::::::::::::::::::
NP_078 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
              610         

>>NP_001166141 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 is  (619 aa)
 initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438  Z-score: 2736.5  bits: 516.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
              550       560       570       580       590       600

              610         
pF1KB5 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
       :::::::::::::::::::
NP_001 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
              610         

>>NP_001166140 (OMIM: 617103) zinc finger protein 668 is  (642 aa)
 initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438  Z-score: 2736.4  bits: 516.5 E(85289): 1.1e-145
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:24-642)

                                      10        20        30       
pF1KB5                        MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRA
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSEPGMLGRKDVWVPRETPFTKAMEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRA
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB5 ARHAATHGPADCSEEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARHAATHGPADCSEEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAP
               70        80        90       100       110       120

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB5 ELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKI
              130       140       150       160       170       180

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB5 HQRGHTGERPYACADCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQRGHTGERPYACADCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERS
              190       200       210       220       230       240

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB5 HTGERPFLCSECGKSFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTGERPFLCSECGKSFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGE
              250       260       270       280       290       300

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB5 KPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFK
              310       320       330       340       350       360

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB5 CLQCDKTFVASWDLKRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLQCDKTFVASWDLKRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNAC
              370       380       390       400       410       420

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB5 GKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPA
              430       440       450       460       470       480

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 GLLGLPPESGGVMATQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLLGLPPESGGVMATQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFV
              490       500       510       520       530       540

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 CRECKETFSTMTLLRRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CRECKETFSTMTLLRRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHC
              550       560       570       580       590       600

       580       590       600       610         
pF1KB5 PKAFLSASDLRKHERTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKAFLSASDLRKHERTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
              610       620       630       640  

>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (616 aa)
 initn: 2526 init1: 1295 opt: 1325  Z-score: 831.8  bits: 164.0 E(85289): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 1450; 39.8% identity (63.4% similar) in 513 aa overlap (82-594:170-614)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB5 EVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKP
                                     .:: :  : ::.. .  :  : :.::::.:
NP_001 PERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERP
     140       150       160       170       180       190         

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB5 FPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACA
       . : :: . : .   :  :   :.:: :..:..: .... .. :  ::: ::::.:: :.
NP_001 YECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECS
     200       210       220       230       240       250         

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB5 DCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGK
       .:::::.  : : .:.:::.: .:: : .::::. .   : .: : ::::.:. :.::::
NP_001 ECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGK
     260       270       280       290       300       310         

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB5 SFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSD
       .::.::::: :::::...:::.:  :::.:::..   .:.:::.::::. : .::. ::.
NP_001 AFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQ
     320       330       340       350       360       370         

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB5 PSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDL
        . . .:.: : : ::: :..::: : . ..:..:.:.:::..:..: :: :.:  :  :
NP_001 STLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHL
     380       390       400       410       420       430         

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 KRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHE
        .:  .:.:..:..:..::.::.. .:::::.:.:.::.:..:: ::..:   . : .:.
NP_001 TQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQ
     440       450       460       470       480       490         

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB5 RTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMA
       : :     .:  : .    : :.     ..::                            
NP_001 RIH-----TGEKPYECNQCGRAF-----SQSS----------------------------
     500            510            520                             

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB5 TQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLL
              . .::   :   ..: :                    . : :: ..::  . :
NP_001 -------LLIEH---QRIHTKEKP--------------------YGCNECGKSFSHSSSL
                       530                           540       550 

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB5 RRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHE
        .:::.:   .:. : .::::: . . : .: : :.. .::.:  : :::  .:.: ::.
NP_001 SQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQ
             560       570       580       590       600       610 

             600       610         
pF1KB5 RTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
       :::                         
NP_001 RTHTG                       
                                   

>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (621 aa)
 initn: 2526 init1: 1295 opt: 1325  Z-score: 831.7  bits: 164.0 E(85289): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 1450; 39.8% identity (63.4% similar) in 513 aa overlap (82-594:175-619)

              60        70        80        90       100       110 
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        .:  .:.:..:..:..::.::.. .:::::.:.:.::.:..:: ::..:   . : .:.
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pF1KB5 EVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKP
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XP_016 -------LLIEH---QRIHTKEKP--------------------YGCNECGKSFSHSSSL
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>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1450; 39.8% identity (63.4% similar) in 513 aa overlap (82-594:212-656)

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pF1KB5 EVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKP
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        .:  .:.:..:..:..::.::.. .:::::.:.:.::.:..:: ::..:   . : .:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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