Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5010
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5010, 619 aa
1>>>pF1KB5010 619 - 619 aa - 619 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7232+/-0.000998; mu= 15.6186+/- 0.060
mean_var=219.0621+/-44.961, 0's: 0 Z-trim(112.7): 935 B-trim: 5 in 1/49
Lambda= 0.086654
statistics sampled from 12375 (13392) to 12375 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.736), E-opt: 0.2 (0.411), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10701.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 ( 619) 4438 568.1 1.2e-161
CCDS54003.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 ( 642) 4438 568.1 1.2e-161
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1407 189.3 1.5e-47
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1407 189.3 1.5e-47
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1325 178.9 1.7e-44
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1325 179.0 1.7e-44
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1325 179.0 1.8e-44
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1325 179.0 1.8e-44
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1324 179.0 2.2e-44
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1315 177.7 4.1e-44
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1313 177.4 4.6e-44
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1311 177.3 6e-44
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1306 176.7 9.4e-44
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1304 176.3 1.1e-43
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1304 176.4 1.1e-43
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1297 175.5 1.9e-43
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1293 174.8 2.3e-43
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1287 174.3 4.8e-43
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1283 173.7 6.4e-43
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1281 173.4 7.6e-43
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1279 173.1 8.2e-43
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1279 173.1 8.3e-43
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1279 173.3 9.6e-43
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1275 172.8 1.4e-42
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1275 172.9 1.5e-42
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1273 172.6 1.8e-42
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1273 172.6 1.8e-42
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1271 172.2 1.8e-42
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1271 172.2 1.9e-42
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1266 171.5 2.6e-42
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1264 171.2 2.9e-42
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1268 172.1 3.2e-42
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1265 171.6 3.4e-42
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1265 171.6 3.4e-42
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1263 171.4 4.5e-42
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1263 171.4 4.5e-42
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1259 170.7 4.9e-42
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1259 170.7 5e-42
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1259 170.7 5.2e-42
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1259 170.8 5.5e-42
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1258 170.7 6.1e-42
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1258 170.7 6.3e-42
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1257 170.6 6.9e-42
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1260 171.3 7.1e-42
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1252 169.7 8e-42
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1251 169.6 9.4e-42
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1253 170.1 1e-41
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1253 170.1 1e-41
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1253 170.1 1e-41
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1253 170.2 1e-41
>>CCDS10701.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 (619 aa)
initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438 Z-score: 3015.7 bits: 568.1 E(32554): 1.2e-161
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRAARHAATHGPADCSEEVAEVKPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAPELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPYACADCGKSFADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSECGKSFSRSSSLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVASWDLKRHALVHSG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMATQWQVVGMT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTMTLLRRHERSHPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLRKHERTHPVPMGT
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB5 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
:::::::::::::::::::
CCDS10 PTPLEPLVALLGMPEEGPA
610
>>CCDS54003.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 (642 aa)
initn: 4438 init1: 4438 opt: 4438 Z-score: 3015.5 bits: 568.1 E(32554): 1.2e-161
Smith-Waterman score: 4438; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:24-642)
10 20 30
pF1KB5 MEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSEPGMLGRKDVWVPRETPFTKAMEVEAAEARSPAPGYKRSGRRYKCLSCTKTFPNAPRA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ARHAATHGPADCSEEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARHAATHGPADCSEEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYACPLCPKAYKTAP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 ELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELRSHGRSHTGEKPFPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 HQRGHTGERPYACADCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQRGHTGERPYACADCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERS
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HTGERPFLCSECGKSFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTGERPFLCSECGKSFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPFLCPRCGRMFSDPSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 CLQCDKTFVASWDLKRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CLQCDKTFVASWDLKRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNAC
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKSFVVSSSLRKHERTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPA
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 GLLGLPPESGGVMATQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLLGLPPESGGVMATQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 CRECKETFSTMTLLRRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CRECKETFSTMTLLRRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHC
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610
pF1KB5 PKAFLSASDLRKHERTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PKAFLSASDLRKHERTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
610 620 630 640
>>CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (742 aa)
initn: 1170 init1: 1170 opt: 1407 Z-score: 967.0 bits: 189.3 E(32554): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 1424; 38.2% identity (64.9% similar) in 516 aa overlap (81-594:161-642)
60 70 80 90 100
pF1KB5 EEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYAC--PLCPKAYKTAPELRSHGRSHTG
:.:: : : ::.. : .:.. :.:::
CCDS32 CAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRYRPSIRTQERDHTG
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 EKPFPCPECGRRFMQPVCLRVHLASHAGELPFRCAHCPKAYGALSKLKIHQRGHTGERPY
:::. : ::. :. .: :.. :.:. ..: : ::. ..: ::.: ::::.::
CCDS32 EKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLYLIHERTHTGEKPY
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ACADCGKSFADPSVFRKHRRTHAGLRPYSCERCGKAYAELKDLRNHERSHTGERPFLCSE
: .:::::. .... :.:::.: .:: : .: ::. .. . ::::: ::.:. :.:
CCDS32 ECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHERSHMGEKPYQCKE
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 CGKSFSRSSSLTCHQRIHAAQKPYRCPACGKGFTQLSSYQSHERTHSGEKPFLCPRCGRM
:::.:. .::: :.: :...:::.: :.:.. : :.:.: : .:::.:. : ::.
CCDS32 CGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSGERPYKCKICGKG
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FSDPSSFRRHQRAHEGVKPYHCEKCGKDFRQPADLAMHRRVHTGDRPFKCLQCDKTFVAS
: . .::. :...: : : :.:..::: : ... .:.:.:::..:..: :: :.: ..
CCDS32 FYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPYECKQCGKAFRSA
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 WDLKRHALVHSGQRPFRCEECGRAFAERASLTKHSRVHSGERPFHCNACGKSFVVSSSLR
.:. :. .:.:..:..:.:::.:: . : :.:.:.::.:..:. :::.: . :.
CCDS32 SQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVKHLQ
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KHERTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGG
::::.. . .: ... : . .: . :. :
CCDS32 IHERTEKHIR---MPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKP------------
500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 VMATQWQVVGMTVEHVECQDAGVREAPGPLEGAGEAGGEEADEKPPQFVCRECKETFSTM
::.. : .: .. .. ::: . :..: ..: .
CCDS32 ---------------YECNQCG--KAFRCCNSLRYHERTHTGEKP--YECKQCGKAFRSA
540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 TLLRRHERSHPELRPFPCTQCGKSFSDRAGLRKHSRTHSSVRPYTCPHCPKAFLSASDLR
. :: :::.: .:. : ::::.:: ..::::.:::.. .:: : .: ::: :::.:.
CCDS32 SHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASNLQ
580 590 600 610 620 630
590 600 610
pF1KB5 KHERTHPVPMGTPTPLEPLVALLGMPEEGPA
:::::
CCDS32 MHERTHTGEKPYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTSAKILQIHAR
640 650 660 670 680 690
>>CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (745 aa)
initn: 1170 init1: 1170 opt: 1407 Z-score: 967.0 bits: 189.3 E(32554): 1.5e-47
Smith-Waterman score: 1424; 38.2% identity (64.9% similar) in 516 aa overlap (81-594:164-645)
60 70 80 90 100
pF1KB5 EEVAEVKPKPETEAKAEEASGEKVSGSAAKPRPYAC--PLCPKAYKTAPELRSHGRSHTG
:.:: : : ::.. : .:.. :.:::
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CCDS74 RTHTG
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CCDS12 RTHTG
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pF1KB5 RTHRSSEAAGVPPAQELVVGLALPVGVAGESSAAPAAGAGLGDPPAGLLGLPPESGGVMA
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CCDS54 RIH-----TGEKPYECNQCGRAF-----SQSS----------------------------
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CCDS54 -------LLIEH---QRIHTKEKP--------------------YGCNECGKSFSHSSSL
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CCDS54 SQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQ
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CCDS54 RTHTG
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CCDS45 CSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEK---------PYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTG
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CCDS45 KCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLE
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