Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5006, 459 aa
1>>>pF1KB5006 459 - 459 aa - 459 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1512+/-0.000963; mu= 14.0222+/- 0.058
mean_var=89.3801+/-17.917, 0's: 0 Z-trim(106.6): 65 B-trim: 13 in 2/50
Lambda= 0.135661
statistics sampled from 9037 (9102) to 9037 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8512.1 FKBP4 gene_id:2288|Hs108|chr12 ( 459) 2992 595.8 3e-170
CCDS4808.1 FKBP5 gene_id:2289|Hs108|chr6 ( 457) 1730 348.8 6.7e-96
CCDS54996.1 FKBP5 gene_id:2289|Hs108|chr6 ( 268) 897 185.7 5.2e-47
CCDS13014.1 FKBP1A gene_id:2280|Hs108|chr20 ( 108) 338 76.0 2.1e-14
CCDS1706.1 FKBP1B gene_id:2281|Hs108|chr2 ( 108) 322 72.9 1.8e-13
CCDS32961.1 FKBP8 gene_id:23770|Hs108|chr19 ( 413) 313 71.5 1.9e-12
CCDS77266.1 FKBP8 gene_id:23770|Hs108|chr19 ( 412) 311 71.1 2.5e-12
CCDS5439.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 ( 570) 300 69.0 1.4e-11
CCDS8063.1 FKBP2 gene_id:2286|Hs108|chr11 ( 142) 291 66.9 1.5e-11
CCDS9683.1 FKBP3 gene_id:2287|Hs108|chr14 ( 224) 287 66.2 3.9e-11
CCDS3801.1 PPID gene_id:5481|Hs108|chr4 ( 370) 290 66.9 3.9e-11
>>CCDS8512.1 FKBP4 gene_id:2288|Hs108|chr12 (459 aa)
initn: 2992 init1: 2992 opt: 2992 Z-score: 3170.0 bits: 595.8 E(32554): 3e-170
Smith-Waterman score: 2992; 100.0% identity (100.0% similar) in 459 aa overlap (1-459:1-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGW
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CCDS85 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 KIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPN
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CCDS85 KLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQYKKIVSWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQYKKIVSWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EYESSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLFRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EYESSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLFRRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EAHLAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EAHLAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB5 EENKAKAEASSGDHPTDTEMKEEQKSNTAGSQSQVETEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EENKAKAEASSGDHPTDTEMKEEQKSNTAGSQSQVETEA
430 440 450
>>CCDS4808.1 FKBP5 gene_id:2289|Hs108|chr6 (457 aa)
initn: 1729 init1: 1125 opt: 1730 Z-score: 1835.1 bits: 348.8 E(32554): 6.7e-96
Smith-Waterman score: 1730; 55.2% identity (80.6% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-450)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGW
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CCDS48 MTTDEGAKNNEESPTATVAEQGEDITSKKDRGVLKIVKRVGNGEETPMIGDKVYVHYKGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPP
: .: ::::: ::.. : :.::::.:::::::..:::: ::.::. :::::::::::: :
CCDS48 LSNGKKFDSSHDRNEPFVFSLGKGQVIKAWDIGVATMKKGEICHLLCKPEYAYGSAGSLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD
::: :::: ::.::..:::::: :::::::: . .::::..::::: ::. :::
CCDS48 KIPSNATLFFEIELLDFKGEDLF--EDGGIIRRTKRKGEGYSNPNEGATVEIHLEGRCGG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPN
..:: :.. : .::::. :.: :...:...:.. :. :.:: : :.:: .:: :: : ::
CCDS48 RMFDCRDVAFTVGEGEDHDIPIGIDKALEKMQREEQCILYLGPRYGFGEAGKPKFGIEPN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQYKKIVSWL
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CCDS48 AELIYEVTLKSFEKAKESWEMDTKEKLEQAAIVKEKGTVYFKGGKYMQAVIQYGKIVSWL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 EYESSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLFRRG
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CCDS48 EMEYGLSEKESKASESFLLAAFLNLAMCYLKLREYTKAVECCDKALGLDSANEKGLYRRG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EAHLAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAE
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CCDS48 EAQLLMNEFESAKGDFEKVLEVNPQNKAARLQISMCQKKAKEHNERDRRIYANMFKKFAE
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KB5 EENKAKAEASSGDHPTDTEMKEEQKSNTAGSQSQVETEA
.. : .:. . : . . : .: :..::. :
CCDS48 QDAKEEANKAMGKKTS------EGVTNEKGTDSQAMEEEKPEGHV
420 430 440 450
>>CCDS54996.1 FKBP5 gene_id:2289|Hs108|chr6 (268 aa)
initn: 905 init1: 618 opt: 897 Z-score: 957.5 bits: 185.7 E(32554): 5.2e-47
Smith-Waterman score: 897; 57.4% identity (79.8% similar) in 223 aa overlap (1-223:1-221)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGW
::..: .. . .: . .: ::. :.:.::::..:: :.: : :::::.:.::: :
CCDS54 MTTDEGAKNNEESPTATVAEQGEDITSKKDRGVLKIVKRVGNGEETPMIGDKVYVHYKGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPP
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CCDS54 LSNGKKFDSSHDRNEPFVFSLGKGQVIKAWDIGVATMKKGEICHLLCKPEYAYGSAGSLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD
::: :::: ::.::..:::::: : ::::::: . .::::..::::: ::. :::
CCDS54 KIPSNATLFFEIELLDFKGEDLFE--DGGIIRRTKRKGEGYSNPNEGATVEIHLEGRCGG
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPN
..:: :.. : .::::. :.: :...:...:.. :. :.:: :
CCDS54 RMFDCRDVAFTVGEGEDHDIPIGIDKALEKMQREEQCILYLGPRPKNPGRWIPKKNWSRL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQYKKIVSWL
CCDS54 PLSKRREPYTSRCVSPYAILSISKNLFKCW
240 250 260
>>CCDS13014.1 FKBP1A gene_id:2280|Hs108|chr20 (108 aa)
initn: 338 init1: 338 opt: 338 Z-score: 372.2 bits: 76.0 E(32554): 2.1e-14
Smith-Waterman score: 338; 52.0% identity (75.5% similar) in 98 aa overlap (41-138:11-108)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGWLLDGTKFDSS
: : .: :. ::::: : :: :::::
CCDS13 MGVQVETISPGDGRTFPKRGQTCVVHYTGMLEDGKKFDSS
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 LDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPPKIPPNATLVF
::. :.: ::: :::..:. ..: :.::. ..: .:.::::..: : :::.:::::
CCDS13 RDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVF
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 EVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKDKLFDQRELRF
.:::....
CCDS13 DVELLKLE
>>CCDS1706.1 FKBP1B gene_id:2281|Hs108|chr2 (108 aa)
initn: 322 init1: 322 opt: 322 Z-score: 355.2 bits: 72.9 E(32554): 1.8e-13
Smith-Waterman score: 322; 49.0% identity (73.5% similar) in 98 aa overlap (41-138:11-108)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGWLLDGTKFDSS
: : .: :. ::::: : .: :::::
CCDS17 MGVEIETISPGDGRTFPKKGQTCVVHYTGMLQNGKKFDSS
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 LDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPPKIPPNATLVF
::. :.: .:: ::::... . : :..:. ..:: :. :::..: : :::::::.:
CCDS17 RDRNKPFKFRIGKQEVIKGFEEGAAQMSLGQRAKLTCTPDVAYGATGHPGVIPPNATLIF
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 EVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKDKLFDQRELRF
.:::....
CCDS17 DVELLNLE
>>CCDS32961.1 FKBP8 gene_id:23770|Hs108|chr19 (413 aa)
initn: 391 init1: 165 opt: 313 Z-score: 337.0 bits: 71.5 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 313; 27.5% identity (60.7% similar) in 262 aa overlap (160-415:113-369)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD--KLFDQRE
: ..: .: .: : :. .. .. .. :
CCDS32 EPAPAPAPEEWLDILGNGLLRKKTLVPGPPGSSRPVKGQVVTVHLQTSLENGTRVQEEPE
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPNAELKYEL
: : .:. :. .:. .. :. :: ..: .: .: :... :::.: : :.
CCDS32 LVFTLGD---CDVIQALDLSVPLMDVGETAMVTADSKYCYGPQGSRSPYIPPHAALCLEV
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQY----KKIVSWLEYE
::. . . ....:.. .. .: :....... . : .: : :.: . .
CCDS32 TLKTAVDGPDLEMLTGQERVALANRKRECGNAHYQRADFVLAANSYDLAIKAITSSAKVD
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLFRRGEAH
.: .:::: : :.. ::: .:::. . ::..::. .:: . .: :.:::.:..
CCDS32 MTF-EEEAQLLQ-LKVKCLNNLAASQLKLDHYRAALRSCSLVLEHQPDNIKALFRKGKVL
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAEEEN
... : .. .:.: :.::. ...:. .. : . : :: .:.
CCDS32 AQQGEYSEAIPILRAALKLEPSNKTIHAELSKLVKKHAAQRSTETALYRKMLGNPSRLPA
320 330 340 350 360 370
430 440 450
pF1KB5 KAKAEASSGDHPTDTEMKEEQKSNTAGSQSQVETEA
CCDS32 KCPGKGAWSIPWKWLFGATAVALGGVALSVVIAARN
380 390 400 410
>>CCDS77266.1 FKBP8 gene_id:23770|Hs108|chr19 (412 aa)
initn: 365 init1: 165 opt: 311 Z-score: 334.9 bits: 71.1 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 311; 27.5% identity (60.3% similar) in 262 aa overlap (160-415:113-368)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKD--KLFDQRE
: ..: .: .: : :. .. .. .. :
CCDS77 EPAPAPAPEEWLDILGNGLLRKKTLVPGPPGSSRPVKGQVVTVHLQTSLENGTRVQEEPE
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYAFGSVGKEKFQIPPNAELKYEL
: : .:. :. .:. .. :. :: ..: .: .: :. . :::.: : :.
CCDS77 LVFTLGD---CDVIQALDLSVPLMDVGETAMVTADSKYCYGPQGRSPY-IPPHAALCLEV
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 HLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKYKQALLQY----KKIVSWLEYE
::. . . ....:.. .. .: :....... . : .: : :.: . .
CCDS77 TLKTAVDGPDLEMLTGQERVALANRKRECGNAHYQRADFVLAANSYDLAIKAITSSAKVD
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKALELDSNNEKGLFRRGEAH
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CCDS77 MTF-EEEAQLLQ-LKVKCLNNLAASQLKLDHYRAALRSCSLVLEHQPDNIKALFRKGKVL
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LAVNDFELARADFQKVLQLYPNNKAAKTQLAVCQQRIRRQLAREKKLYANMFERLAEEEN
... : .. .:.: :.::. ...:. .. : . : :: .:.
CCDS77 AQQGEYSEAIPILRAALKLEPSNKTIHAELSKLVKKHAAQRSTETALYRKMLGNPSRLPA
320 330 340 350 360 370
430 440 450
pF1KB5 KAKAEASSGDHPTDTEMKEEQKSNTAGSQSQVETEA
CCDS77 KCPGKGAWSIPWKWLFGATAVALGGVALSVVIAARN
380 390 400 410
>>CCDS5439.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (570 aa)
initn: 266 init1: 226 opt: 300 Z-score: 321.1 bits: 69.0 E(32554): 1.4e-11
Smith-Waterman score: 301; 26.5% identity (58.9% similar) in 275 aa overlap (23-291:139-401)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDR
.:: ..:. ... . . . ...:
CCDS54 VKIPPKLAYGNEGVSGVIPPNSVLHFDVLLMDIWNSEDQVQIHTYFKPPSCPRTIQVSDF
110 120 130 140 150 160
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VFVHYTGWLLDGTKFDSSLDRKDKFSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYA
: ::.: .:::: :::: .: .. .: : .: . : .. : ::: :: : :
CCDS54 VRYHYNGTFLDGTLFDSSHNRMKTYDTYVGIGWLIPGMDKGLLGMCVGEKRIITIPPFLA
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160
pF1KB5 YGSAGSPPKIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGII----RRIQTRGEGYAKPNEGA
:: :. :: .:.:::.: :..... . .. .. .::. :. .:.
CCDS54 YGEDGDGKDIPGQASLVFDVALLDLHNPKDSISIENKVVPENCERISQSGDFLRYHYNGT
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 IVEVAL--EGYYKDKLFDQRELRFEIGEGENLDLPYGLERAIQRMEKGEHSIVYLKPSYA
... .: .: ... :: ::.: . : :..... . ::. . . : .
CCDS54 LLDGTLFDSSYSRNRTFDTY-----IGQGYVI--P-GMDEGLLGVCIGEKRRIVVPPHLG
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 FGSVGKEKFQIPPNAELKYELHLKSFEKAKESWEMNSEEKLEQSTIVKERGTVYFKEGKY
.: :. .:: .: : ...:. .:.. ..: ..:. : . ......: :.: .:
CCDS54 YGEEGRG--NIPGSAVLVFDIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPDCSVLSKKGD-YLKY-HY
350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KQALLQYKKIVSWLEYESSFSNEEAQKAQALRLASHLNLAMCHLKLQAFSAAIESCNKAL
. .::
CCDS54 NASLLDGTLLDSTWNLGKTYNIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKRTVIIPPHLGYGEAG
400 410 420 430 440 450
>>CCDS8063.1 FKBP2 gene_id:2286|Hs108|chr11 (142 aa)
initn: 323 init1: 291 opt: 291 Z-score: 320.7 bits: 66.9 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 291; 51.7% identity (75.3% similar) in 89 aa overlap (50-138:49-137)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 MEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVHYTGWLLDGTKFDSSLDRKDKFSF
:: . .:::: : :::.::::: ... : :
CCDS80 VATATGAEGKRKLQIGVKKRVDHCPIKSRKGDVLHMHYTGKLEDGTEFDSSLPQNQPFVF
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 DLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKPEYAYGSAGSPPKIPPNATLVFEVELFEFKG
.:: :.:::.:: .. : :: ... : .:: :.::::: .:::::::::....
CCDS80 SLGTGQVIKGWDQGLLGMCEGEKRKLVIPSELGYGERGAPPKIPGGATLVFEVELLKIER
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 EDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKDKLFDQRELRFEIGEGENLD
CCDS80 RTEL
140
>>CCDS9683.1 FKBP3 gene_id:2287|Hs108|chr14 (224 aa)
initn: 296 init1: 139 opt: 287 Z-score: 313.5 bits: 66.2 E(32554): 3.9e-11
Smith-Waterman score: 287; 45.8% identity (66.9% similar) in 118 aa overlap (27-136:109-222)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTAEEMKATESGAQSAPLPMEGVDISPKQDEGVLKVIKREGTGTEMPMIGDRVFVH
:: ..::: .: :..: :: :
CCDS96 SKVSEQVKNVKLNEDKPKETKSEETLDEGPPKYTKSVLK----KGDKTNFPKKGDVVHCW
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90 100
pF1KB5 YTGWLLDGTKFDSSLD---RKDK----FSFDLGKGEVIKAWDIAIATMKVGEVCHITCKP
::: : ::: ::.... .: : .:: .: :.::..:: :. ::. :: .. .:
CCDS96 YTGTLQDGTVFDTNIQTSAKKKKNAKPLSFKVGVGKVIRGWDEALLTMSKGEKARLEIEP
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 EYAYGSAGSPP-KIPPNATLVFEVELFEFKGEDLTEEEDGGIIRRIQTRGEGYAKPNEGA
:.:::. :.: :::::: :.::::: .
CCDS96 EWAYGKKGQPDAKIPPNAKLTFEVELVDID
200 210 220
459 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:42:51 2016 done: Thu Nov 3 15:42:51 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]