Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4321
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4321, 1004 aa
1>>>pF1KB4321 1004 - 1004 aa - 1004 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4147+/-0.00132; mu= 6.5269+/- 0.078
mean_var=308.7860+/-65.840, 0's: 0 Z-trim(108.1): 662 B-trim: 93 in 1/53
Lambda= 0.072987
statistics sampled from 9221 (9996) to 9221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 4.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 6820 733.8 4.2e-211
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 6820 733.8 4.3e-211
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 6797 731.4 2.3e-210
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 4068 444.0 7.2e-124
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 4045 441.6 3.8e-123
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 2456 273.9 6.1e-73
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3 (1130) 2296 257.5 1.1e-67
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 2207 248.1 7e-65
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 2057 232.3 3.9e-60
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 2004 226.7 1.9e-58
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 1984 224.6 8.1e-58
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 1896 215.3 5e-55
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 1880 213.6 1.6e-54
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 1880 213.7 1.7e-54
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 ( 495) 1856 210.7 6e-54
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 1816 206.9 1.7e-52
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 1793 204.5 9.1e-52
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 1756 200.6 1.4e-50
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 (1008) 1747 199.6 2.7e-50
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 1718 196.6 2.2e-49
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 1333 156.0 3.5e-37
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 279) 1245 146.1 9.9e-35
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1 ( 295) 1071 127.8 3.3e-29
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 (1022) 892 109.6 3.4e-23
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 771 96.5 1.5e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 771 96.5 1.5e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 771 96.5 1.5e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 771 96.5 1.5e-19
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 758 95.5 6.1e-19
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 758 95.5 6.1e-19
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 751 94.3 6.4e-19
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 751 94.4 6.5e-19
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 749 94.2 7.8e-19
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 748 94.1 8.1e-19
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 747 93.9 8.7e-19
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 745 93.8 1e-18
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 742 93.4 1.3e-18
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 742 93.5 1.4e-18
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 740 93.2 1.5e-18
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 732 92.4 2.7e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 718 90.8 6.7e-18
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 718 90.9 7.5e-18
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 716 90.7 8.1e-18
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 718 91.2 9.7e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 709 89.7 1e-17
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 718 91.3 1.1e-17
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 718 91.3 1.1e-17
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 718 91.3 1.2e-17
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 718 91.3 1.2e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 710 90.2 1.5e-17
>>CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004 aa)
initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820 Z-score: 3903.5 bits: 733.8 E(32554): 4.2e-211
Smith-Waterman score: 6820; 100.0% identity (100.0% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1004)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKI
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490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
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pF1KB4 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
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pF1KB4 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
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pF1KB4 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
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910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KB4 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
970 980 990 1000
>>CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038 aa)
initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820 Z-score: 3903.3 bits: 733.8 E(32554): 4.3e-211
Smith-Waterman score: 6820; 100.0% identity (100.0% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1004)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
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pF1KB4 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKI
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pF1KB4 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
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pF1KB4 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KB4 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKI
970 980 990 1000 1010 1020
CCDS75 MNSLQEMKVQLVNGMVPL
1030
>>CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037 aa)
initn: 3876 init1: 3876 opt: 6797 Z-score: 3890.3 bits: 731.4 E(32554): 2.3e-210
Smith-Waterman score: 6797; 99.8% identity (99.8% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1003)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS35 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
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CCDS35 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
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:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPV-FAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGR--
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 --------------------RCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
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pF1KB4 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
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pF1KB4 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
760 770 780 790 800 810
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pF1KB4 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
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pF1KB4 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKI
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CCDS35 MNSLQEMKVQLVNGMVPL
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20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
:: :..: . :. .::::::::::.:..
CCDS46 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
:.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:. ..:..:..::
CCDS46 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
:::::::::.: :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
CCDS46 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
:..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.
CCDS46 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
::..:.:: :::::.: ..::.:.::.::::::::::: :.:::::.. ::.:::::.
CCDS46 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
:: ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
CCDS46 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
:::.:.: : ::::::::.. : ::::. . :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
CCDS46 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
:::::::::::.::::::.:: ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
CCDS46 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KB4 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..: .::: ..::::::::::::::
CCDS46 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCCECGCGRASS
. ::.:::::.:
CCDS46 TNSRKFEFETSPDCMYYFNAV
520 530
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30 40 50 60 70 80
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.:.: :::. ::.:.::: ..: :::. :
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CCDS46 EMDEHNRPIHTYQVCNVMEPNQNNWLRTNWISRDAAQKIYVEMKFTLRDCNSIPWVLGTC
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150 160 170 180 190 200
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CCDS46 KGFYLAFQDIGACIALVSVRVFYKKCPFTVRNLAMFPDTIPRVDSSSLVEVRGSCVKSAE
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. ::..:.:.:.::::.:.:.:..:::: .:.:..:::::.:: .:.::::::
CCDS46 ERDTPKLYCGADGDWLVPLGRCICSTGYEEIEGSCHACRPGFYKAFAGNTKCSKCPPHSL
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:. ::.. : ::: ::: :.:::.::::::::::::.. :.:::...::: ::.::::::
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:..: . ::::. .. ::.::: .:..::..:: :.::...:...:.::::::::.:::
CCDS46 DLTYSVICKKCGLDTSQCEDCGGGLRFIPRHTGLINNSVIVLDFVSHVNYTFEIEAMNGV
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:.:: . . .....:::.: ::: . :.: ..:::.:::: : :: ::.:::::.
CCDS46 SELSFSPKPFTAITVTTDQDAPSLIGVVRKDWASQNSIALSWQAPAFSNGAILDYEIKYY
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::..: .:. .:: .. :::::. :::.::.:::.::. .:..::::: .
CCDS46 EKEHEQLTYSSTRSKAPSVIITGLKPATKYVFHIRVRTATGYSGYSQKFEFETGDETSDM
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pF1KB4 SSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVV-IGVLLSGSCCECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYS
...:.:: :::.... : ::... . :..: : : :
CCDS46 AAEQGQILVIATAAVGGFTLLVILTLFFLITGRC-------------------QW---YI
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pF1KB4 KAKQDPEEEKM-HFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGA
:::. ::.. :..:::...::..::::: :::::. :::::::::. : : :::::::
CCDS46 KAKMKSEEKRRNHLQNGHLRFPGIKTYIDPDTYEDPSLAVHEFAKEIDPSRIRIERVIGA
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pF1KB4 GEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVV
:::::::::::: :::::.:::::::: :. ..:::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS46 GEFGEVCSGRLKTPGKREIPVAIKTLKGGHMDRQRRDFLREASIMGQFDHPNIIRLEGVV
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750 760
pF1KB4 TK------------------------------------------SKPVMIVTEYMENGSL
:: ..:::::.::::::::
CCDS46 TKRSFPAIGVEAFCPSFLRAGFLNSIQAPHPVPGGGSLPPRIPAGRPVMIVVEYMENGSL
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pF1KB4 DTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGL
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CCDS46 DSFLRKHDGHFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
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pF1KB4 SRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWE
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CCDS46 SRVLEDDPEAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAYRKFSSASDAWSYGIVMWEVMSYGERPYWE
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pF1KB4 MTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSS
:.::::: ..:::::::.:: :::.:.:::: ::::::: :::: .::..:::::::::.
CCDS46 MSNQDVILSIEEGYRLPAPMGCPASLHQLMLHCWQKERNHRPKFTDIVSFLDKLIRNPSA
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pF1KB4 LKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYR---SVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVA
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CCDS46 LHTLVE-----DILVMPESPGEVPEYPLFVTVGDWLDSIKMGQYKNNFVAAGFTTFDLIS
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1000
pF1KB4 QVTLE
.....
CCDS46 RMSIDDIRRIGVILIGHQRRIVSSIQTLRLHMMHIQEKGFHV
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pF1KB4 SGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRA--P--LWTCLLLCAALRTLLASPSN
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CCDS22 MAPARGRLPPALWV-VTAAAAAATCVSAARG
10 20 30
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pF1KB4 EVNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWIS
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CCDS22 EVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEVDESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVP
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 NEGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAA
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CCDS22 RDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKETFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAA
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pF1KB4 DESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRH
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CCDS22 DESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRGFYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LAVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKN
::.: ...::::::.:.:: :.:: :: . :::.::::::::::::::.:.:::::.
CCDS22 LAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEERDTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 GTCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPS
.: .:. ::.:..: : :..:::::.. :. .: :. .:.: :::. :::::::
CCDS22 DACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSAAPAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPS
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 APRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQS
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CCDS22 APVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDITYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQT
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 GLKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGK
.: ..:.....:::: ::.: :::::::::::: :. . ::.:::::::: :. ... .
CCDS22 SLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSDLSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQER
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pF1KB4 IAKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQET-SYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVF
...:.:: ::::..::::::::::::.:::.: ::. .:. : :. ::::.. :::
CCDS22 AGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEKDKEMQSYSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVF
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 QIRARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGS
:.::::.:: : ::. .: :: : : : ... .:...: ...
CCDS22 QVRARTSAGCGRFSQAMEVETGKPR--PRYDTRTIVWICLTLITGLVVLLLLL-------
520 530 540 550 560
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pF1KB4 CCECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHI-------------KL
.: : :::::: :: .:::::..::. ::
CCDS22 -----------ICKKRH------CGYSKAFQDSDEEKMHYQNGQAPPPVFLPLHHPPGKL
570 580 590 600
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pF1KB4 PGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPV
: . : .:::::.:..: . :..::::: : ::..::.:. :::: :::..::.:..::
CCDS22 PEPQFYAEPHTYEEPGRAGRSFTREIEASRIHIEKIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQRDVPV
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 AIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTF
:::.::.::::.::::::.::::::::::::::.::::::... .:::::::::::::::
CCDS22 AIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGSLDTF
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 LKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRV
:. .:::::..::::::::..:::.::::.:::::::::::.:..:::::::::::::::
CCDS22 LRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKVSDFGLSRV
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTN
:::::.::::: ::::::::::::::::: :.:::::::.:.:::::..:::::::.:::
CCDS22 LEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGERPYWNMTN
790 800 810 820 830 840
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pF1KB4 QDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKT
.:::..::::::::.:: :: ::.:::::::.:.: .::.:..::..:: :::.: ::..
CCDS22 RDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALIRSPESLRA
850 860 870 880 890 900
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pF1KB4 LVNAS-CR----VSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQ
...: : : . . .. :.:. .::.::..:.:::: . : .::::. :
CCDS22 TATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFAAGGYSSLGMVLR
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 VTLE
CCDS22 MNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGPRRHL
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>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
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CCDS29 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
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80 90 100 110 120 130
pF1KB4 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
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CCDS29 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
:::::::::.: :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
CCDS29 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
:..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.
CCDS29 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
160 170 180 190 200 210
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pF1KB4 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
::..:.:: :::::.: ..::.:.::.::::::::::: :.:::::.. ::.:::::.
CCDS29 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
:: ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
CCDS29 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
:::.:.: : ::::::::.. : ::::. . :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
CCDS29 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
:::::::::::.::::::.:: ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
CCDS29 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540
pF1KB4 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..: .::: ..::::::::::::::
CCDS29 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCCECGCGRASS
. ::.:::::.: : . :...::. .::.:..:..:::.::: ::. ::
CCDS29 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI---------GRF--
520 530 540 550 560
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pF1KB4 LCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAK
::: :.:. .:...:: :::.::::.:::.::::::::.::::::::
CCDS29 ------------CGY-KSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAK
570 580 590 600 610
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pF1KB4 EIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIM
:..:. :.:..:.::::::::::::::::.:.:. :::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIM
620 630 640 650 660 670
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pF1KB4 GQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGM
:::::::::.::::::::::::::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::
CCDS29 GQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGM
680 690 700 710 720 730
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pF1KB4 KYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS29 KYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPE
740 750 760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 AIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALY
:::.:::::::::::::::.:::.::::::::::.::::::::.:::::: :::::::::
CCDS29 AIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALY
800 810 820 830 840 850
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 QLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYR
:::::::::.::.::::..::..::::::::.::: ...:. : :::: ..: . ..:
CCDS29 QLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFR
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